简介:摘要目的探讨MassARRAY基因分型技术应用于新生儿遗传代谢病诊断的准确性、时效性及可行性。方法回顾性研究。收集2016年12月至2020年1月在浙江省新生儿筛查中心应用串联质谱筛查的疑似阳性患儿7 922例,采用MassARRAY技术进行27种遗传代谢病的常见变异位点检测,通过Sanger或二代测序验证并进一步寻找潜在变异。结果共1 408份样本送检MassARRAY,307例确诊为遗传代谢病患儿,其中高苯丙氨酸血症检出率最高,其次为原发性肉碱缺乏症、短链酰基辅酶A脱氢酶缺乏症和甲基丙二酸血症。经Sanger测序验证100%(307/307)符合。287例检测为携带者,49.1%(141/287)经Sanger测序确认为携带者,以SLC22A5、MCCC1基因为主。50.8%(146/287)还检测到另一个等位基因变异,以PAH、PTS和ACADS基因为主。814例未发现变异,对其中158例复查后串联质谱特征性指标持续阳性、尿有机酸及其他生化检测等异常的样本进行二代测序,38%(60/158)检测到2个等位基因变异。最终确诊513例遗传代谢病患者,MassARRAY的总检出率为59.8%(307/513)。结论MassARRAY技术可作为新生儿遗传代谢病的早期分子筛查方法,在高苯丙氨酸血症、原发性肉碱缺乏症等热点变异集中的疾病中检出率较高,后期需不断优化新的疾病基因和变异位点从而进一步提升其潜在应用价值。
简介:摘要人巨细胞病毒(human cytomegalovirus, HCMV)是一种普遍存在于人群中的疱疹病毒,一旦感染后可导致终生携带。在正常人群中,感染HCMV后多表现为无症状的潜伏感染。但是在免疫功能低下的人群中,潜伏的HCMV可被激活,并且引起诸多严重疾病甚至死亡。转化生长因子-β (TGF-β)是众多细胞通路的强大调节剂,其在炎症反应和细胞分化中具有重要作用,在病毒感染中也起着重要的免疫调节作用,其经典的Smad信号通路参与调控许多细胞活动,包括细胞生长、细胞分化、细胞凋亡等。本文将对近年来人巨细胞病毒感染与TGF-β及其Smad信号通路相关性的研究进展作一综述。
简介:摘要目的分析门诊流感样疾病患儿呼吸道病毒感染情况及流行病学特征,为本地区流感样疾病患儿的防治提供依据。方法采集2021年7月至2022年3月因流感样疾病在浙江大学医学院附属儿童医院发热门诊就诊患儿的鼻咽拭子标本,采用逆转录聚合酶链反应法(RT-PCR)对6种呼吸道病毒核酸进行检测。收集患儿一般信息(性别和年龄),按性别和年龄(0~<6个月、6~<12个月、1~<3岁、3~<6岁和≥6岁)分组,采用χ²检验对各组间进行统计学分析,探究呼吸道病毒流行规律。结果1 609例流感样疾病患儿标本共检出呼吸道病毒739例(45.9%,739/1 609),其中单纯感染检出651例(40.5%,651/1 609),多重感染检出88例(5.5%,88/1 609)。呼吸道合胞病毒(RSV)检出率居首位,为18.6%(300/1 609),其次是乙型流感病毒(FluB)为11.9%(192/1 609)、腺病毒(ADV)为8.3%(134/1 609)、副流感病毒3型(PIV-3)为7.6%(123/1 609)、副流感病毒1型(PIV-1)为4.9%(79/1 609)、甲型流感病毒(FluA)为0.4%(6/1 609)。多重感染形式为双重或三重感染,双重感染81例(92.0%,81/88),最常见是ADV+RSV(22.7%,20/88),三重感染7例(8.0%,7/88)。各年龄组间病毒检出率差异有统计学意义(χ²=17.078,P=0.002),以3~<6岁组病毒检出率最高(49.7%,286/575)。单一病毒感染检出中,FluB以≥6岁组患儿检出率最高(26.6%,98/369),RSV 和PIV-1以3~<6岁组患儿检出率最高(20.0%,115/575;5.9%,34/575);每月病毒总检出率从7月26.8%(37/138)升至次年1月63.0%(58/92),2月和3月下降至46.1%(106/230)和26.8%(37/138)。RSV在8—11月检出率最高,FluB在12月至次年3月检出率最高,ADV在12月和次年1月检出率上升,PIV-3在10—12月检出率上升;PIV-1检出率无明显波动,FluA散在检出。结论流感样疾病患儿呼吸道病毒感染以RSV为主,大多数呼吸道病毒以单纯感染形式存在,多重感染以双重感染多见。FluB、RSV 和PIV-1感染呈现一定的年龄分布特征,尤其在3岁以上的患儿感染率更高。呼吸道病毒感染流行特征呈现出夏季到秋冬季逐渐流行达到高峰,春季转而流行下降的特征。RSV在秋季相对流行,FluB在冬春季流行,ADV和PIV-3在冬季不同程度流行,PIV-1则持续低水平流行,FluA未呈现流行特征。
简介:摘要目的分析肠道沙门菌肠道亚种非A~F群血清型分离株的耐药性、分子流行病学和毒力基因分布情况,以明确其流行特点,为临床诊疗提供流行病学依据。方法针对浙江大学医学院附属儿童医院2017—2020年收集的11株肠道沙门菌肠道亚种非A~F群血清型分离株,进行血清分型及抗菌药物敏感性试验,并进行全基因组测序,进而对测序结果进行血清型、多位点序列分型和毒力基因分析。结果本院肠道沙门菌肠道亚种非A~F群血清型分离株检出率较低,占比1.13%。11株菌株中,包含长湾尼血清型3株,非丁伏斯血清型2株,汪兹沃思、波摩那、凯杜古、厄班那、浦那、库马西血清型各1株。11株非A~F群肠道沙门菌肠道亚种分离株中除2株多重耐药株外,其余菌株对绝大多数抗菌药物均敏感,且最低抑菌浓度(MIC)均处于较低水平。11株菌共检测出9种ST型,3株长湾尼血清型菌株均为ST3918,其他分离株分别为不同的ST型。通过核心基因组构建进化树显示3株长湾尼血清型菌株亲缘关系紧密。11株菌株共检测出毒力基因103种,包含分泌系统相关基因78种,黏附相关基因21种,镁吸收相关基因2种,抗菌肽耐药性相关基因1种,伤寒毒素相关基因1种。结论本院肠道沙门菌肠道亚种非A~F群血清型分离株的检出率较低,对常见抗菌药物敏感性较高,ST型及亲缘关系呈多样性分布。临床实验室应关注肠道沙门菌肠道亚种非A~F群血清型分离株的检出,并持续关注其耐药性和毒力基因变化。
简介:摘要目的探讨国际协作的新生儿筛查数据平台Region 4 Stork(R4S)系统联合切值法分析应用于新生儿极长链酰基辅酶A脱氢酶缺乏症(VLCADD)串联质谱筛查的可行性。方法回顾性分析2013年10月至2018年7月浙江省新生儿疾病筛查中心2 040 072名新生儿应用串联质谱技术筛查的数据,使用R4S系统对其中依据传统切值法判别疑似VLCADD阳性的910例样本原始数据进一步分析,以临床诊断及ACADL基因检测结果为依据,统计比较两者的筛查效率。结果切值法判读的疑似VLCADD阳性910例数据经R4S系统进一步分析后,阳性判读减至238例(含9例确诊阳性),确诊患儿ACADL基因测序共发现16种不同变异。假阳性率由0.44‰(901/2 040 072)降至0.11‰(229/2 040 072),阳性预测值由0.99%(9/910)增至3.78%(9/238),筛查特异度由99.96%(2 039 162/2 040 063)增至99.99%(2 039 834/2 040 063)。切值法单独应用与联合R4S系统分析两者阳性率有统计学差异(χ²=393.5,P<0.05)。结论R4S系统联合切值法应用于串联质谱VLCADD新生儿筛查可显著提高筛查性能,降低假阳性率,具有一定的临床应用价值。
简介:摘要TORCH指一组病原体,包含弓形虫、风疹病毒、巨细胞病毒、单纯疱疹病毒等,孕妇感染此类病原体后可通过胎盘或产道感染胎儿或者新生儿,可能导致流产、早产、畸胎、死胎、宫内发育迟缓、新生儿多器官损害等不良预后。对于多数孕期TORCH感染,目前尚缺乏有效的治疗手段,加强孕前、产前TORCH感染监测至关重要。TORCH实验室检测在其中发挥着重要作用,但TORCH检测流程的规范化、检验结果的正确解读尚需形成共识性意见。本文基于TORCH检测方法特点,针对不同病原体的感染特点、感染类型,从实验室角度对TORCH规范化检测与临床应用给出了共识性意见。
简介:摘要目的构建人巨细胞病毒(human cytomegalovirus, HCMV)转录的长链非编码RNA4.9(long non-coding RNA4.9, lncRNA4.9)干扰慢病毒载体。方法设计并合成3条以lncRNA4.9为靶点的干扰序列,构建穿梭质粒GV248和目的干扰序列的重组质粒,测序验证序列,将重组质粒与骨架质粒pHelper1.0、pHelper2.0共转染293T细胞,收集病毒颗粒并检测拷贝数。将干扰慢病毒载体转染THP-1细胞,观察荧光表达量,通过real-time RT-PCR法检测干扰效率。结果构建的3组慢病毒干扰载体(LV1、LV2、LV3),LV2和LV3具有干扰效率,LV2组干扰效率最高。结论成功构建lncRNA4.9干扰慢病毒载体,为后续进一步研究lncRNA4.9的功能奠定了基础。