简介：Anincreasingnumberofstructuralhomologysearchtools,mostlybasedonprofilestochasticcontext-freegrammars(SCFGs)havebeenrecentlydevelopedforthenon-codingRNAgeneidentification.SCFGscanincludestatisticalbiasesthatoftenoccurinRNAsequences,necessarytoprofilespecificRNAstructuresforstructuralhomologysearch.Inthispaper,asuccinctstochasticgrammarmodelisintroducedforRNAthathascompetitivesearcheffectiveness.Moreimportantly,theprofilingmodelcanbeeasilyextendedtoincludepseudoknots,structuresthatarebeyondthecapabilityofprofileSCFGs.Inaddition,themodelallowsheuristicstobeexploited,resultinginasignificantspeed-upfortheCYKalgorithm-basedsearch.

简介：SmallRNA(sRNA)-mediatedpost-transcriptionalregulationdiffersfromprotein-mediatedregulation.Throughbasepairing,sRNAcanregulatethetargetmRNAinacatalyticorstoichiometricmanner.Sometheoreticalmodelswerebuiltforcomparisonoftheprotein-mediatedandsRNA-mediatedmodesinthesteady-statebehaviorsandnoiseproperties.ManyexperimentsdemonstratedthatasinglesRNAcanregulateseveralmRNAs,whichcausescrosstalkbetweenthetargets.Here,wefocusonsomemodelsinwhichtwotargetmRNAsaresilencedbythesamesRNAtodiscusstheircrosstalkfeatures.Additionally,thesequence-functionrelationshipofsRNAanditsroleinthekineticprocessofbase-pairinghavebeenhighlightedinmodelbuilding.

简介：摘要环状RNA为由外显子或内含子反向剪接形式闭合环状非编码RNA。临床越多研究证实，环状RNA本身高度保守，普遍存在各种真种真核细胞基因组之中，并且稳定表达在细胞质内。环状RNA为微小RNA海绵吸附miRNA或者RNA相关蛋白结合而形成的复合物，对基因转录进行调节。肿瘤组织环状RNA发现可有效的提示可能在肿瘤发生、发展以及侵袭方面发挥调控作用，则十分有希望成为肿瘤诊断、治疗潜在的靶标。本文主要对环状RNA种类、主要特点、在肿瘤中的生物学作用进行总结，望能够为临床环状RNA和肿瘤之间的诊断提供依据。

简介：摘要环状RNA(circRNA)是由前体mRNA反向剪接形成的具有封闭结构的环状分子，可充当微小RNA(miRNA)"海绵"，与蛋白质、RNA结合形成复合物，发挥调控宿主基因表达、蛋白翻译的功能，在生理学和病理生理学中具有重要意义。多种眼科疾病中均存在特异性circRNA的异常表达，其通过"海绵"作用调控靶基因表达可引起多种眼部细胞功能异常，导致新生血管形成、血管渗漏、炎症反应、视网膜神经退行性变、晶状体混浊、肿瘤生长等病理改变，在眼病的发生和发展中可能起重要作用。本文就近年来circRNA在眼科疾病中的表达特点及其在眼病病理过程中介导的基因调控网络进行综述，探讨circRNA作为眼科疾病生物标志物及新型治疗靶点的意义。

简介：摘要线粒体疾病受线粒体DNA和核基因组的双重调控，对线粒体DNA的变异解读一直充满挑战，本文将美国贝勒医学院临床医学遗传诊断室于2020年发表的线粒体信使RNA（mRNA）变异分类标准进行解读，以期为我国临床医生提供线粒体mRNA变异解读的最新依据。

简介：目的为探索提高库血丙型肝炎病毒(HCV)的检出率.方法采用逆转录套式聚合酶链反应(RT-PCR)技术,检测4530份抗-HCV阴性的库血HCV-RNA.结果4530份库血中HCV-RNA阳性55份,阳性率1.21%,其中个体献血者血液2110份,HCV-RNA阳性40份,阳性率1.90%;无偿献血者血液2420份,HCV-RNA阳性15份,阳性率0.62%.结论RT-PCR可用于检测库血HCV-RNA,以减少因输血造成HCV感染.

简介：随着大量生物领域科研人员进入植物RNA研究领域，开展RNA研究，使得以RNA为终产物的基因组研究取得突破性进展，新的RNA基因不断增加，RNA的新功能不断被发现。但由于RNA的不稳定性，使得RNA操作远比DNA操作困难，且尚有大量未知的RNA及其功能等待人们去探索、研究．而这些研究又都基于高质量RNA的提取。因此，根据笔者自身实验经验，及在查阅大量相关文献的基础上。针对植物总RNA提取的一些关键影响因素、消除对策、RNA检测方法及RNA保存方法上进行了系统的阐述，旨在为高质量植物组织总RNA的制备提供理论参考，为RNA分子生物学实验后续研究提供理论支撑。

简介：检测胰腺组织mRNA的表达已经成为研究胰腺疾病的重要手段，但由于胰腺组织富含RNase，抽提胰腺总RNA是分子生物学实验的难点之一。为此，本实验旨在探讨提取胰腺总RNA的理想方法。

简介：利用雄性不育系做母本生产杂交一代种子,为改善作物的生产提供了十分有利的条件.细胞质雄性不育(CMS)和由光周期(PGMS)/温度诱导(TGMS)的不育性极大地促进了作物杂交育种的发展.越来越多的研究表明非编码ncRNA分子与植物雄性不育有关,如水稻的PGMS和TGMS与ncRNA密切相关.在CMS中,线粒体ORF影响小孢子发育而导致CMS发生的机制仍然不明确.高通量测序使得在全基因组范围内发现和验证这些调控分子及其靶基因,并阐述它们与CMS的相关性成为可能.植物线粒体DNA中的ncRNA以及其可能诱导的CMS的机理是当前研究的热点,但目前尚没有证据表明ncRNA与CMS有关,还需要转基因等遗传方法来进行验证.在本文中,我们总结了最近关于ncRNA与植物CMS关系的相关研究,希望能够提高对控制植物CMS的ncRNA介导的调控途径的理解.深入了解植物CMS可为促进CMS在农作物育种的利用提供技术支撑.

简介：动脉粥样硬化是各种损伤刺激作用于动脉管壁引起的,涉及多细胞、多因素、多环节的全身性疾病,其发病机制至今未完全阐明。微小RNA（miRNA）是一类在进化上高度保守的非编码小分子单链RNA（约22个碱基）,在转录后水平负性调控基因表达。

简介：摘要目的基于生物信息学方法挖掘胆道闭锁(BA)差异表达基因(DEGs)并初步构建微小RNA(miRNA)-信使RNA(mRNA)调控网络，探索其在BA中的分子调控机制。方法从基因表达综合数据库(GEO)下载数据集GSE46960，利用GEO2R在线工具分析BA和正常肝组织之间的DEGs，利用注释、可视化和富集发现数据库(DAVID6.8)对DEGs进行富集和功能注释。基于蛋白质互作数据库(STRING11.0)和Cytoscape_v3.7.1软件构建蛋白质相互作用(PPI)网络，分析其关键基因。通过人类miRNA疾病数据库(HMDD_V3.2)查询与BA相关且经过验证的miRNA，并利用miRNA目标预测数据库(miRDB)预测其靶基因。将预测的靶基因和GSE46960中的差异表达基因求得交集，获得miRNA、mRNA相互作用关系。利用Cytoscape软件构建miRNA-mRNA调控网络图。结果从GSE46960数据集中共获得565个DEGs，其中352个为上调基因，213个为下调基因。其中上调的DEGs显著富集于细胞外基质受体相互作用、黏着斑激酶、阿米巴病通路、磷酸酰肌醇3激酶/蛋白激酶B(PI3K/Akt)信号通路中，下调的DEGs显著富集于新陈代谢、抗生素的生物合成、视黄醇代谢通路中。根据PPI网络，筛选出10个关键基因。在DEGs基础上成功构建了BA miRNA-mRNA分子调控网络。结论通过生物信息学筛选出的DEGs及构建的miRNA-mRNA调控网络有助于全面了解BA发生的分子机制，为探索联合miRNA及DEGs作为临床诊断及治疗的分子靶点提供了新方向。

简介：摘要目的探讨环状RNA-7(circularRNA, ciRS)-7在食管鳞癌细胞放疗抵抗中的作用及生物学机制。方法采用慢病毒转染食管鳞癌细胞系KYSE410和KYSE510构建ciRS-7敲降细胞系(分为正常对照组和sh#1组、sh#2组)。不同剂量射线(2 Gy组、4 Gy组、8 Gy组)照射上述细胞，收集各组细胞染色，流式细胞术检测活细胞比例。双荧光素酶报告系统检测ciRS-7与微小RNA(microRNA，miR)-7的调控关系；KYSE410细胞分正常组、ciRS-7敲降组，RT-qPCR检测miR-7表达。shRNA转染KYSE410细胞，分为干扰组(正常对照组、敲降ciRS-7组);过表达组(ciRS-7和miR-7同时过表达组、阴性对照组、miR-7过表达组),蛋白质印迹法检测各组中B细胞淋巴瘤/白血病-2蛋白(bcl-2)的表达。两组间比较采用独立样本的t检验，以P<0.05为差异有统计学意义。结果KYSE410细胞sh#1组(0.36±0.03)、sh#2组(0.37±0.12)ciRS-7表达量低于正常对照组(1.00±0.01, t＝24.460、8.910, P<0.05); KYSE510细胞sh#1组(0.40±0.08)、sh#2组(0.34±0.08)ciRS-7表达量低于正常对照组(1.00±0.08, t＝8.514、9.550, P<0.05)，差异均有统计学意义。4 Gy射线照射后，KYSE410细胞sh#1组[(37.00±3.07)%]、sh#2组[(39.50±0.70)%]活细胞比例低于正常对照组[(63.50±6.36)%, t＝7.400、5.301, P<0.05]; KYSE510细胞sh#1组[(39.00±8.48)%]、sh#2组[(39.50±0.70)%]活细胞比例低于正常对照组[(73.50±6.36)%, t＝4.600、7.509, P<0.05]。8 Gy射线照射后，KYSE410细胞sh#1组[(22.50±3.53)%]、sh#2组[(39.50±0.70)%]活细胞比例低于正常对照组[(50.50±2.12)%, t＝9.604、11.800, P<0.05]; KYSE510细胞sh#1组[(33.00±2.82)%]、sh#2组[(31.00±2.82)%]活细胞比例低于正常对照组[(60.50±2.12)%, t＝11.000、11.800, P<0.05]，差异均有统计学意义。KYSE410细胞过表达ciRS-7组(1.00±0.23)的miR-7表达低于正常对照组(0.54±0.08, t＝3.191, P<0.05),双荧光素酶报告系统证实ciRS-7吸附结合miR-7。同时过表达miR-7及ciRS-7组的bcl-2表达高于过表达miR-7组(0.59±0.11, t＝6.013, P<0.05)、敲降ciRS-7组(0.83±0.08, t＝3.717, P<0.05),差异均有统计学意义。结论ciRS-7通过靶向miR-7促进食管鳞癌细胞的放疗抵抗。

简介：摘要目的探讨长链非编码RNA(lncRNA) HOX转录反义RNA(HOTAIR)对乳腺癌细胞增殖的影响及其机制。方法收集2013年8月到2018年1月新乡市中心医院120例乳腺癌和癌旁组织，采用荧光定量聚合酶链反应(PCR)分析lncRNA HOTAIR表达水平。在乳腺癌细胞株MCF-7细胞株中建立lncRNA HOTAIR敲降细胞株(lnc HOTAIR KD组)和对照细胞株(lncRNA对照组)，采用细胞计数试剂盒(CCK-8)试剂盒和5-乙炔基-2’脱氧尿嘧啶核苷(EdU)染色分析两组细胞的增殖能力；采用异种移植瘤模型分析细胞在体内的增殖能力。采用生物信息学分和双荧光素酶报告基因分析lncRNA HOTAIR作用靶点。组间数据比较采用t检验。结果与癌旁组织(1.09±0.19)比较，乳腺癌组织中lncRNA HOTAIR表达水平(2.98±0.21)显著升高，差异有统计学意义(t＝3.011，P<0.05)。与lncRNA对照组(1.10±0.10)比较，Lnc HOTAIR KD组乳腺癌细胞增殖能力(0.25±0.05)明显下降，差异有统计学意义(t＝2.510，P<0.05)。与lncRNA对照组EdU阳性率[(87.34±9.12)%]比较，Lnc HOTAIR KD组乳腺癌细胞EdU阳性率[(28.13±7.10)%]增殖能力明显下降，差异有统计学意义(t＝3.918，P<0.05)。体内异种成瘤模型显示lnc HOTAIR KD组乳腺癌细胞增殖能力较LncRNA对照组显著下降，差异有统计学意义(F＝2.109，P<0.05)。生物信息学研究显示lncRNA HOTAIR能与微小RNA(miRNA，miR)-126结合，进而调节CXC趋化因子受体4(CXCR4)表达水平。结论lncRNA HOTAIR通过靶向作用于miR-126/CXCR4轴进而调节着乳腺癌细胞增殖。

简介：摘要目的探讨β-分泌酶反义核糖核酸(BACE1-AS)对血管紧张素Ⅱ(Ang Ⅱ)诱导的心肌细胞损伤的影响及其机制。方法Ang Ⅱ处理H9c2心肌细胞(购自中国科学院上海细胞库)建立心肌细胞损伤模型，H9c2心肌细胞培养液中加入Ang Ⅱ建立心肌细胞损伤模型(Ang Ⅱ组)，同时将正常培养的心肌细胞作为对照(Con组)。分别将干扰对照序列(si-NC)、干扰BACE1-AS序列(si-BACE1-AS)、抑制剂阴性对照序列(anti-miR-NC)、Ang Ⅱ＋si-BACE1-AS与miR-137抑制剂(anti-miR-137)转染至心肌细胞，加入含有浓度为1 μmol/L Ang Ⅱ的培养液继续培养48 h，分别记作Ang Ⅱ＋si-NC、Ang Ⅱ＋si-BACE1-AS、Ang Ⅱ＋si-BACE1-AS＋anti-miR-NC、Ang Ⅱ＋si-BACE1-AS＋anti-miR-137组。采用实时荧光定量聚合酶链反应(RT-qPCR)检测BACE1-AS、微小RNA-137(miR-137)的表达水平；检测乳酸脱氢酶(LDH)、丙二醛(MDA)和超氧化物歧化酶(SOD)含量；流式细胞术检测细胞凋亡率；双荧光素酶报告实验检测BACE1-AS和miR-137的靶向关系；蛋白质印迹法(Western blot)检测B淋巴细胞瘤-2(bcl-2)和bcl-2相关X蛋白(bax)表达。两组间比较采用t检验，多组间比较采用单因素方差分析，组间两两比较采用SNK-q检验。结果与Ang Ⅱ＋si-NC组比较，Ang Ⅱ＋si-BACE1-AS组凋亡率显著降低[(14.83±2.28)%比(27.84±1.54)%，t＝28.137，P<0.05]，bax蛋白水平显著降低(0.64±0.10比0.97±0.02，t＝40.627，P<0.05)，bcl-2蛋白水平显著升高(0.68±0.05比0.33±0.04，t＝19.032，P<0.05)，差异均有统计学意义。双荧光素酶报告实验证实BACE1-AS可靶向结合miR-137。Ang Ⅱ＋si-BACE1-AS＋anti-miR-137组miR-137、SOD和bcl-2水平低于Ang Ⅱ＋si-BACE1-AS＋anti-miR-NC组(0.36±0.11比0.99±0.01、21.18±1.66比32.85±2.98、0.38±0.08比0.68±0.04，t＝17.111、10.263、10.062，P<0.05)，LDH、MDA、凋亡率和bax水平高于Ang Ⅱ＋si-BACE1-AS＋anti-miR-NC组(377.03±2.75比323.52±20.71、30.80±2.56比18.06±0.58、23.04±2.55比14.80±0.35、0.88±0.04比0.63±0.05，t＝7.684、14.561、9.604、11.713，P<0.05)，差异均有统计学意义。结论敲低BACE1-AS表达可通过上调miR-137的表达来减轻Ang Ⅱ诱导的心肌细胞损伤。

简介：摘要目的观察长链非编码RNA(lncRNA)锌指蛋白667反义RNA1(ZNF667-AS1)下调微小RNA(miRNA，miR)-296对胶质瘤细胞U87MG侵袭、转移的影响。方法双荧光素酶鉴定ZNF667-AS1与miR-296的靶向关系。实验分为对照组、空载体质粒组、sh-ZNF667-AS1组、sh-ZNF667-AS1＋阴性对照组、sh-ZNF667-AS1＋miR-296 mimic组。空载体质粒组转染pEGFPN1空载体，sh-ZNF667-AS1组转染pEGFPN1-sh-ZNF667-AS1，质粒转染成功后，在sh-ZNF667-AS1组基础上，sh-ZNF667-AS1＋阴性对照组转染miR-296 mimic NC，sh-ZNF667-AS1＋miR-296 mimic组转染miR-296 mimic。实时定量反转录聚合酶链反应(RT-qPCR)检测细胞中ZNF667-AS1、miR-296水平；细胞计数试剂盒(CCK-8)检测细胞增殖；Transwell检测细胞侵袭和迁移；蛋白质免疫印迹实验检测细胞中迁移侵袭抑制蛋白(MIIP)、高迁移率族蛋白1(HMGB1)蛋白水平。多组间比较行单因素方差分析，进一步两两比较行SNK-q法。结果生物信息学软件(Starbase)分析显示ZNF667-AS1序列上存在miR-296潜在结合位点，且经荧光素酶实验验证，miR-296与ZNF667-AS1呈正相关(P<0.05)。0 h各组细胞吸光度(A450)值差异无统计学意义(F＝1.071，P>0.05)，12、24、36、48 h各组细胞A450值比较，差异有统计学意义(F＝17.238、93.997、48.271、60.646，P<0.05)。细胞处理48 h，对照组、空载体质粒组、sh-ZNF667-AS1组、sh-ZNF667-AS1＋阴性对照组、sh-ZNF667-AS1＋miR-296 mimic组中ZNF667-AS1水平分别为1.01±0.12、0.98±0.14、0.44±0.09、0.46±0.07、0.76±0.12；miR-296水平分别为1.01±0.14、1.02±0.13、0.39±0.06、0.42±0.05、0.72±0.09；侵袭细胞数量分别为(83.25±6.05)、(84.37±8.76)、(39.49±4.15)、(42.15±7.42)、(63.18±7.13)个；迁移细胞数量分别为(126.60±8.79)、(124.49±9.12)、(76.16±6.48)、(79.44±12.15)、(118.18±6.86)个，且差异有统计学意义(F＝36.498、55.130、58.771、47.314，P<0.05)。结论降低ZNF667-AS1表达可下调miR-296表达抑制胶质瘤细胞U87MG侵袭、转移，而过表达miR-296可逆转上述过程。

简介：阶段和磁电机在合金R(Co_(1-x)Sn_x)的热量的效果有x=的_20，0.025，0.050，0.075，和0.100被X光检查衍射分析和磁化测量调查。在RCo_2的Sn的替换是有限的。为RCo_2的合金的立方的MgCu_2-typestructure被X光检查粉末衍射证实，留下的合金主要由RCo_2阶段组成了，与一些RCo_3和R_5Sn_3杂质阶段一起。Theimpurity阶段随Sn内容的增加增加。合金的T_c不对为Dy(Co_(1-x)Sn_x)的Sn替换很敏感_2和Tb(Co_(1-x)Sn_x)_2inGd(Co_(1-x)Sn_x)_2，居里温度显著地增加。最大的磁性的熵在合金Dy(Co_(1-x)Sn_x)改变_2(x=0，0.025，0.050，0.075)是5.78，5.43，3.88，并且2.98J·kg~(-1)·K~(-1),分别地，并且那些在Tb(Co_(1-x)Sn_x)_2(x=0，0.025)是3.44，and2.29J·kg~(-1)·K~(-1)分别地0-2.0T在应用的地里变化。

简介：【摘要】结核病是一种慢性传染病， T-SPOT.TB在结核诊治过程中有着重要价值，本综述拟对其在对于肺结核、肺外结核诊断、对于病情的评估及其与免疫状态的相关性进行相关综述。

简介：摘要目的探讨狼毒提取物对结核病患者的耐多药结核杆菌（multipledrugsresistantbacillustuberculosis,MDR-TB）感染小鼠免疫功能的调节作用。方法采用MDR-TB菌液灌胃制备小鼠MDR-TB感染模型，将30只健康雄性小鼠随机分为3组，每组10只，正常组、模型组和狼毒提取物组，采用ELISA法检测小鼠血清中与结核细胞免疫密切相关的细胞因子IFN-γ、IL-4、IL-10、IL-12含量的变化。结果狼毒提取物组小鼠血清中的IFN-γ含量为1.94±0.59pg/mL、IL-4为6.15±1.44pg/mL、IL-10为12.54±3.78pg/mL、IL-12为2.89±0.75pg/mL，与模型组比较，IFN-γ、IL-12含量明显升高，IL-4、IL-10含量明显下降（P<0.05）。结论狼毒提取物可明显增强小鼠的细胞免疫功能，为临床应用治疗耐多药结核病提供了理论依据。

简介：摘要目的探讨晚期艾滋病合并肺结核（AIDS/TB）双重感染患者不同抗结核疗程的临床效果。方法选取90例CD4+小于200个/μl的艾滋病合并肺结核感染患者，随机分成三组，每组30例，第一组按2HRZE/4HR方案抗结核治疗，第二组按2HRZE/7HR方案抗结核治疗，第三组按2HRZE/10HRE方案抗结核治疗，三组病人均在抗结核治疗2～4周同时给予抗艾滋病毒治疗(HAART)，观察三组患者抗结核疗效、抗病毒疗效及结核病复发率。结果三组患者抗结核治疗5个月末和6个月末痰菌阴性率均达到100%；三组患者抗结核2个月末、6个月末胸片吸收率比较，无统计学差异(P＞0.05)。完成结核疗程后1年，第一组复发率为6.7%，第二组和第三组复发率为3.3%，三组复发率比较，均无统计学差异(P=0.781)。三组患者的药物不良反应发生率分别为26.7%、23.3%、23.3%，差异无统计学意义(P＞0.05)。经HAART后三组患者的CD4+T细胞均上升（P=0.000）；三组患者的CD4+T细胞在不同时间点的差异无统计学意义（P=0.204）。结论对于晚期艾滋病合并继发性肺结核的患者，抗结核的疗程不需要延长，可以像普通肺结核患者一样按照2HRZE/4HR方案治疗。

简介：摘要目的探讨TB型子宫内膜治疗仪(子宫热球系统)治疗月经过多的临床效果、安全性及并发症。了解治疗后子宫内膜病理学改变。方法选择50例功能失调性子宫出血病人，用TB型子宫内膜治疗仪进行治疗，观察术中、术后反应及并发症，统计其治疗显效率、有效率；选择10例因子宫良性病变行全子宫切除术病人，术前或术中用热球进行治疗，了解治疗时子宫周围热度，治疗后子宫内膜的治疗深度、病理组织学改变。结果TB型子宫内膜治疗仪治疗月经过多可致子宫性闭经和月经减少，显效率为84%，总有效率为96%；3例（6%）术中出现重度腹痛，3例（6%）术后出现阴道大流血，对症治疗后好转，无其他并发症。结论热球治疗功能性子宫出血引起的月经过多效果显著，安全性高。