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  • 简介:异源四倍体花生(ArachishypogaeaL.)包含两套基因组,分别来自二倍体祖先A.duranensis(A基因组)和A.ipaensis(B基因组)。相对于二倍体,异源四倍体SNP的鉴定和分析面临更多挑战,因为在SNP的鉴定和分析过程中,通常需要同时分析两套基因组中相同位点的DNA序列。本研究以12个花生品种和2个二倍体祖先为材料,通过扩增子重测序EST和GSS(各100条序列)开发SNP。结果显示共检测出18个EST-SNPs和44个genomic-SNPs,出现频率分别为1SNP/2557bp和1SNP/1011bp。为了进一步评估和应用所开发的SNP,采用高分辨率溶解曲线方法对96个花生品种进行SNP基因分型。EST-SNP在供试品种中的多态性信息量介于0.021~0.413,平均为0.172。Genomic-SNP的多态性信息量介于0.08~0.478,平均为0.249。本研究表明采用扩增子测序和HRM方法能够从异源四倍体花生中准确鉴定SNP,且所开发的SNP信息量丰富,能够用于花生遗传育种研究。

  • 标签: 花生 单核苷酸多态 扩增子 高分辨率溶解曲线
  • 简介:摘要骨髓炎目前仍是困扰骨科医师的一大难题。大量研究表明,遗传因素可能在骨髓炎的发病中起重要作用。单核苷多态性(SNPs)作为第3代遗传标记,在骨髓炎遗传易感性方面的研究越来越受关注。对骨髓炎易感性基因的单核苷多态性进行深入研究,有助于探索骨髓炎预防、诊断和治疗的新策略。本文就目前基因SNPs与骨髓炎易感性的研究进展作一综述。

  • 标签: 骨髓炎 基因 遗传 多态性,单核苷酸 疾病易感性
  • 简介:摘要目的探讨结直肠癌组织中,烟酰胺腺嘌呤二核苷(NAD+)依赖的组蛋白去乙酰化6(SIRT6)表达水平与结直肠癌患者临床病理特征及预后的关系。方法收集浙江大学附属邵逸夫医院德清院区肛肠外科2010年1月至2017年12月124例结直肠癌根治性切除术后石蜡标本,采用免疫组织化学方法检测标本中SIRT6的表达水平,分为高表达(++)、低表达(+)及阴性(-)3组。采用χ2检验分析SIRT6表达水平与患者临床病理特征的相关性;采用Log-rank检验分析SIRT6蛋白表达水平与肠癌患者预后的相关性;采用单因素及多因素COX回归分析方法分析影响结直肠癌患者预后的独立危险因素。结果124例患者标本中SIRT6高表达(++)54例(43.5%)、低表达(+)50例(40.3%)、阴性(-)20例(16.1%)。组间比较显示,SIRT6表达水平越低,其临床病理特征更偏晚期;生存分析显示,高表达组5年总体生存率(OS)为91.3%,低表达组5年OS为70.5%,阴性组5年OS为57.0%,随着SIRT6表达水平降低,患者OS及无复发生存率(RFS)呈显著降低趋势(P<0.05),差异有统计学意义;多因素COX回归分析表明,SIRT6低或阴性表达是影响结直肠癌患者OS及RFS独立危险因素[OS:风险比(HR)=2.764,95%可信区间(CI):1.223~6.244,P<0.05;HR=4.015,95%CI:1.250~12.893,P<0.05;RFS:HR=1.558,95%CI:1.942~10.700,P<0.05;HR:2.647,95%CI:1.400~5.004,P<0.01],差异均有统计学意义;亚组分析TNM Ⅱ/Ⅲ期患者显示,术后辅助化疗可显著提高SIRT6高及低表达患者OS及RFS (P<0.05),差异有统计学意义,而对阴性表达患者无显著改善作用(P>0.05)。结论SIRT6在结直肠癌组织中表达水平可作为预后的判断依据之一,SIRT6蛋白表达水平具有指导术后辅助治疗价值。

  • 标签: 结直肠癌 预后
  • 简介:摘要目的探讨低密度脂蛋白受体相关蛋白5(LRP5)基因的两个SNP位点(rs901823和rs3736228)多态性与儿童糖皮质激素性骨质疏松症(glucocorticoids-induced osteoporosis,GIOP)的相关性。方法选择2015年1月至2020年12月在北京爱育华妇儿医院和首都医科大学附属北京儿童医院就诊的87例GIOP患儿作为研究对象,并纳入同期在本院应用糖皮质激素治疗但骨量正常的100例患儿作为对照组。采用毛细管电泳和片段分析(SNaPshot)技术对SNP位点rs901823(T>C)、rs3736228(C>T)进行基因分型,采用定量实时荧光定量聚合链式反应检测法测定LPR5基因mRNA的相对表达量。结果对于LRP5基因rs901823位点,GIOP组和对照组的TT、TC、CC基因型分布差异有统计学意义(χ2=14.176,P=0.001)。相对于TT基因型,TC和CC基因型携带者发生GIOP的风险均更高(P<0.05)。对于rs3736228位点,GIOP组和对照组的的CC、CT、TT基因型分布差异有统计学意义(χ2=9.597,P=0.008)。与CC携带者相比,CT基因型携带者发生GIOP的风险显著增加(P<0.05)。GIOP组和对照组的rs901823位点T、C等位基因频率分布差异有统计学意义(χ2=17.298,P<0.001),rs3736228位点的C、T等位基因频率分布差异也有统计学意义(χ2=9.356,P=0.002)。GIOP患儿的LRP5基因mRNA相对表达量为(1.34±0.26),显著低于对照组的LRP5基因mRNA表达量(3.06±0.42)(t=8.248,P<0.001)。在GIOP患儿中,rs901823位点TT、TC、CC基因型患者的LRP5基因mRNA相对表达量两两比较差异有统计学意义(P<0.001);rs901823位点CC、CT、TT基因型患者的LRP5基因mRNA相对表达量两两比较结果显示,TT组和CT组间差异无统计学意义(P>0.05),但CC组的表达量显著高于CT组和TT组(P<0.05)。结论LRP5基因的rs901823和rs3736228多态性与GIOP的发生具有相关性,可作为预测患儿GIOP的遗传标志。

  • 标签: 糖皮质激素性骨质疏松症 LRP5 基因 单核苷酸多态性
  • 简介:【摘要】目的:试析慢性乙肝治疗过程中核苷核苷类药物治疗产生的耐药性及患者反应

  • 标签: 核苷酸 核苷 慢性乙型肝炎
  • 简介:【摘要】目的:探讨核苷核苷类药物治疗慢性乙型肝炎的长期性疗效。方法:选取2019年10月至2021年2月在我院收治的88例治疗慢性乙型肝炎患者进行研究,通过随机数字的方法分为对照组和观察组,每组44例,对照组接受干扰素治疗,而观察组接受核苷类药物治疗,对比两组患者治疗有效率和身体质量情况。结果:观察组患者治疗有效率为100.00%,对照组患者治疗有效率为79.55%(9/44),观察组患者治疗有效率明显高于对照组,差异有统计学意义(P<0.05);观察组身体不良反应情况出现几率低于对照组,身体免疫恢复功能和活动情况均高于对照组,所以,观察组身体质量总分观察组高于对照组,P<0.05。结论:对于慢性乙型肝长期性炎患者采用核苷核苷类药物治疗,提高治疗有效率,改善身体机制,减少不良反应发生,促进免疫恢复,值得应用与广泛推广。

  • 标签: 核苷酸类药物 慢性乙型肝炎 治疗疗效 身体状况
  • 简介:【摘要】目的 对于慢性乙型肝炎疾病采取核苷以及核苷类药物进行治疗的长期性做一讨论。方法 现在核苷以及核苷类药物已经成为临床用于慢性乙型肝炎疾病治疗的常见药物,普遍认为乙型肝炎病毒复制属于肝损伤以及疾病进展的主要因素,所以慢性乙型肝炎疾病的治疗目的为最大化持续抑制乙型肝炎病毒复制,本文对于以慢性乙型肝炎疾病接受核苷以及核苷类药物长时间治疗的必要性进行研究。结果对于慢性乙型肝炎疾病采取核苷以及核苷类药物长期治疗,能够显著改善病人的肝脏组织学、逆转肝硬化以及肝纤维化,降低肝细胞癌的出现。结论 临床中选择核苷以及核苷类药物长期治疗慢性乙型肝炎的效果确切。

  • 标签: 慢性乙型肝炎 核苷以及核苷酸类药物 长期性
  • 简介:目的探讨bcl-xl反义寡核苷(ASODN)在裸鼠人鼻咽癌移植瘤细胞中的吸收和分布。方法应用流式细胞仪检测MCF和PPSC;用荧光显微镜观察ASODN在移植瘤细胞内的定位和分布。结果流式细胞仪检测结果显示,对照组、ASODN组和ASODN/Lip组MCF值分别为0.22±0.25,1.76±0.56和2.04±0.67;PPSC的平均值分别为(1.30±0.40)%,(45.5±8.63)%和(50.6±4.75)%,后两组与对照组比较差异有显著意义,ASODN组和ASODN/Lip组比较均无显著性差异(P<0.05),荧光显微镜观察到ASODN主要分布在细胞浆和细胞核内。结论裸鼠移植瘤鼻咽癌细胞可有效地摄取ASODN,且ASODN主要分布在细胞浆和细胞核内。在本实验条件下未观察到脂质体促进ASODN向细胞内转运,只是可能改变了ASODN的分布,主要分布在细胞核内。

  • 标签: BCL-XL反义寡核苷酸 鼻咽癌 瘤细胞 癌移植 ASODN 脂质体
  • 简介:摘要目的探讨肿瘤坏死因子α(TNF-α)基因G308A单核苷多态性与儿童肥胖、代谢紊乱的关系。方法选取2015年1月至2019年12月本院儿科收治的肥胖儿童620例作为研究对象,分为代谢非健康组(n=267)和代谢健康组(n=353),另选本院同期体检健康儿童260名作为对照组。检测TNF-α基因G308A单核苷多态性,并比较各组儿童的血清TNF-α水平、肥胖指标和糖脂代谢指标。结果代谢非健康组和代谢健康组的体重指数(BMI)、腰围、臀围和血清TNF-α比较差异无统计学意义(P>0.05),但均显著高于对照组(P<0.05)。3组的空腹血糖(FPG)、总胆固醇(TC)水平比较差异无统计学意义(P>0.05)。代谢非健康组和代谢健康组儿童的空腹胰岛素(FINS)、空腹胰升糖素(FGC)、HbA1C、三酰甘油(TG)、低密度脂蛋白胆固醇(LDL-C)水平显著高于对照组,且代谢非健康组显著高于代谢健康组(P<0.05),而高密度脂蛋白胆固醇(HDL-C)显著低于对照组,且代谢非健康组显著低于代谢健康组(P<0.05)。代谢非健康组和代谢健康组中GG基因型频率、等位基因G频率均显著低于对照组,代谢非健康组显著低于代谢健康组,而AA、GA基因型频率、等位基因A频率均显著高于对照组,代谢非健康组显著高于代谢健康组(P<0.05)。AA型、GA型、GG型3组TNF-α、FPG、TC比较,差异无统计学意义(P>0.05)。AA型与GA型BMI、腰围、臀围、FINS、FGC、HbA1C、TG、HDL-C、LDL-C比较,差异无统计学意义(P>0.05),2组与GG型比较差异有统计学意义(P<0.05)。Pearson相关分析结果表明,TNF-α水平与肥胖指标BMI、腰围、臀围及代谢指标FPG、FINS、FGC、HbA1C、TC、TG、LDL-C呈正相关(P<0.05);而与HDL-C呈负相关(P<0.05)。结论TNF-α基因G308A单核苷多态性与儿童肥胖、代谢紊乱的发生有关。

  • 标签: 肿瘤坏死因子α G308A 多态性,单核苷酸 儿童 代谢紊乱
  • 作者: 朱丽芬 张慧敏 杜绮婷 孙筱放 刘维强
  • 学科: 医药卫生 >
  • 创建时间:2022-12-13
  • 出处:《中华医学遗传学杂志》 2022年第06期
  • 机构:广州医科大学附属第三医院妇产科 广东省产科重大疾病重点实验室,广州 510150,广州医科大学附属第三医院产前诊断科,广州 510150,广州医科大学附属第三医院妇产科 广东省产科重大疾病重点实验室,广州 510150 深圳市龙岗区妇幼保健院中心实验室,深圳 518172
  • 简介:摘要目的对早、中孕期自然流产组织标本进行基于单核苷多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)探针的染色体微阵列分析(chromosomal microarray analysis, CMA),在更深层次基因组水平探讨与流产可能相关的遗传学原因。方法回顾性分析本院961例孕20周前孕妇自然流产标本的CMA检测结果。结果(1)流产标本染色体总异常率为54.44%(515/946),包括单条染色体异常39.53%、两条染色体异常2.22%、多染色体异常0.42%、三倍体及超、亚三倍体4.86%、拷贝数异常(copy number variants, CNV)4.33%、纯合区域(regions of homozygosity, ROH)0.74%、嵌合体2.22%及异源性嵌合(chimera) 0.11%;(2)对41例CNV分析,致病及可能致病性CNV达85.36%,检出临床意义不确定CNV12.20%和可能良性CNV2.44%;(3)7例ROH中2例为全基因组纯合,2例为16号染色体短臂末端大片段纯合,1例为整个21号染色体完全纯合,提示单亲二体可能。结论染色体异常是导致流产的重要因素,应用含SNP探针的CMA技术可以额外增加异常检出率,更好地为自然流产患者在再次妊娠前进行生育风险评估并提供指导。

  • 标签: 流产 单核苷酸多态性 染色体微阵列分析技术 遗传学因素
  • 简介:摘要目的探讨丝聚蛋白(FLG)基因单核苷多态性(SNPs)与儿童支气管哮喘(哮喘)的发生及相关临床指标的关系。方法本研究为病例-对照研究。采用非随机抽样方法,选取2019年3月至2021年3月北部战区总医院诊治的101例哮喘患儿为病例组,同期在北部战区总医院体检正常的健康儿童77名为对照组。应用SNaPshot测序技术检测FLG基因rs11204981、rs1933064和rs146466242位点SNPs并分析单体型,探讨病例组和对照组3个位点SNPs/单体型对儿童哮喘易感性的影响,同时测定嗜粒细胞百分比(EOS%)、免疫球蛋白E(IgE)、呼出气一氧化氮(FeNO)和肺功能。结果(1)FLG基因rs11204981、rs1933064和rs146466242位点基因型及等位基因在病例组和对照组间的分布差异均无统计学意义(P值均>0.05)。(2)FLG基因3个位点SNPs与病情严重程度和有无湿疹史病例组间的分布差异均无统计学意义(P值均>0.05)。(3)FLG基因rs11204981位点携带次要等位基因的G/A和G/G基因型EOS%高于A/A基因型,G/A基因型IgE高于A/A基因型,差异均有统计学意义(P值均<0.05);rs146466242位点T/A基因型EOS%、IgE高于T/T基因型,T/A基因型最高呼气流量占预计值百分比(PEF%pred)低于T/T基因型,差异均有统计学意义(P值均<0.05);rs1933064位点不同基因型间EOS%、IgE、FeNO及肺功能差异无统计学意义(P>0.05)。(4)FLG基因rs11204981、rs1933064和rs146466242位点共构成3种单体型,单体型与罹患哮喘的风险差异无统计学意义(P>0.05)。结论FLG基因rs11204981、rs1933064和rs146466242位点并非为儿童哮喘及合并湿疹史儿童哮喘的易感位点,其构成的单体型与儿童罹患哮喘无相关性;rs11204981和rs146466242位点携带次要等位基因可能与EOS%和IgE的升高有关。

  • 标签: 哮喘 儿童 FLG基因 基因多态性
  • 简介:摘要缺血性脑血管病是一种多基因遗传病,是遗传因素和环境因素共同作用的复杂性疾病,其发病有明显的家族倾向,并与种族相关。随着基因组计划的完成及分子遗传学的发展,从基因水平探讨其发病机制成为医学界关注的热点。目前已发现多种与缺血性脑血管病相关的基因多态,本文就近几年研究热门的几种与缺血性脑血管病相关的基因多态性的研究进行综述。

  • 标签: 缺血性脑血管病 基因多态性 分子遗传学 单核苷酸多态性
  • 简介:目的建立以TaqMan探针实时荧光PCR技术为基础的核苷结合寡聚化结构域样受体3(Nucleotide-bindingoligomerizationdomain,LeucinerichRepeatandPyrindomaincontaining,NLRP3)基因单核苷多态性(Singlenucleotidepolymorphism,SNP)检测方法。方法以20份健康人血液样本为对象,选择NLRP3基因的两个SNP位点(rs3806265和rs35829419),针对每个位点分别设计1对PCR引物和2条TaqMan探针,进行实时荧光PCR扩增,对SNP位点进行分型。用常规PCR和基因测序的方法对TaqMan探针实时荧光PCR分型的结果进行验证。结果用建立的TaqMan探针实时荧光PCR分型法对20份样本进行检测,其中rs3806265位点发现TT基因型3份,TC基因型8份,CC基因型9份;rs35829419位点发现CC基因型20份,无AC和AA基因型。分型结果与常规PCR及基因测序分型方法完全一致。结论基于TaqMan探针技术的实时荧光PCR方法简单、快速,可实现对NLRP3基因位点的分型检测。

  • 标签: TAQMAN探针 实时荧光PCR 单核苷酸多态性 NOD样受体蛋白3
  • 简介:目的验证包载反雄激素受体基因三螺旋形成寡核苷(TFO)的聚乙二醇-聚乳酸聚乙醇共聚物(PEGPLGA)纳米粒子(TFO—NPs)对前列腺癌细胞的生长抑制作用。方法采用改良自乳化溶剂挥发法制备TFO—NPs并进行体外物化表征。将TFO—NPs、脂质体包载的TFO(TFO—Lip)和裸TFO分别转染体外培养的LNCaP细胞,倒置荧光显微镜观察转染效率,MTT法检测细胞增殖活性,RT—PCR和Westernblot方法检测AR基因表达。结果TFO-NPs平均粒径128nm,载药量为1.02%,包封率为72.28%,在体外具有缓释作用。LNCaP细胞对TFO—NPs和TFO-Lip的摄取率显著高于裸TFO。TFO—NPs和TFO—Lip对LNCaP细胞的抑制率分别为(54.5%±6.2%)和(50.6%±6.1%)显著高于裸TFO,(7.8%±0.8%)(均P〈0.05)。TFO—NPs和TFO—Lip处理组LNCaP细胞的雄激素受体表达水平显著低于裸TFO处理组。TFO—NPs和TFO—Lip处理组的转染效率、细胞抑制率和雄激素受体表达水平差异均无显著性。结论成功制备了TFO—NPs,为反基因治疗前列腺癌的研究提供了有效基因载体。

  • 标签: 前列腺癌 聚乙二醇-聚乳酸聚乙醇酸共聚物 纳米粒 三螺旋形成寡聚核苷酸 雄激素受体
  • 简介:本研究探讨基因芯片在儿童白血病8种常见融合基因检测中的应用。采用多重巢式RT-PCR结合寡核苷芯片方法对84例临床收集的白血病标本进行融合基因检测。结果表明:此芯片可以从患者骨髓样本RNA中准确检测到阳性参照序列以及与融合基因相对应的特异基因片段。84例白血病患者骨髓标本中,31例(36.90%)具有8种染色体结构畸变产生的融合基因。包括te1/am11、e2a/pbx1、bcr/ablp190、bcr/ablp210、m11/af4、am11/eto、pm1/rarα、cbfβ/myh11。芯片检测的敏感性及特异性和RT—PCR方法相当。结论:采用多重巢式RT—PCR结合寡聚核苷芯片方法,可快速并同时筛选出8种染色体结构畸变产生的融合基因,为儿童白血病危险分层、治疗选择、预后判断提供重要依据。此种方法应用于筛查初治白血病儿童融合基因表达时优缺点并存,具有一定临床实用价值。

  • 标签: 融合基因 寡核苷酸芯片 RT—PCR 白血病
  • 简介:目的研究血管内皮生长因子(VEGF)反义寡核苷(ASODN)转染对神经母细胞瘤LA-N-5细胞VEGFmRNA表达的影响以及对肿瘤细胞增殖、分化的影响。方法用LipofectamineTM2000介导的VEGFASODN和错义寡核苷(MSODN)转染LA-N-5细胞,半定量RT-PCR检测各组细胞VEGF165和VEGF121mRNA转染前后不同时间表达的变化;MTT法测定转染后各组细胞的生长曲线及抑制率。结果半定量RT-PCR检测结果显示,在转染后72hVEGF165和VEGF121mRNA的表达:ASODN组为0.346±0.029和0.227±0.036,ASODN+LipofectamineTM2000组为0.275±0.035和0.165±0.017。ASODN组和ASODN+LipofectamineTM2000组均显著抑制VEGFmRNA的表达,ASODN+LipofectamineTM2000组抑制作用较ASODN组更强(P<0.05);转染后ASODN组和ASODN+LipofectamineTM2000组细胞增殖显著受抑,在48h时抑制率最高,分别为(39.92±2.7...

  • 标签: 神经母细胞瘤 血管内皮生长因子 反义寡核苷酸 基因治疗
  • 简介:恶性肿瘤细胞对化疗药物产生耐药性,可能主要有两种途径:一种是细胞自身的遗传特性发生改变,通过抑制凋亡和减少DNA损伤使肿瘤细胞存活;另一种是细胞传递药物的功能(包括增加药物外排、降低药物摄取、解毒作用等)受损。这两种途径均可以造成药物的吸收减少及药物代谢及排泄速度加快[1]。当肿瘤细胞对某种药物产生耐药性时,也会对一系列作用机制相似的药物产生耐药性,继而对其他结构、细胞靶点和机制迥然不同的化疗药物产生交叉耐药性,即多药耐药性(multipledrugresistance,MDR)[2]。

  • 标签: 单核苷酸多态性 卵巢上皮癌 化疗耐药 恶性肿瘤细胞 交叉耐药性 化疗药物
  • 简介:摘要白塞综合征(BS)是一种病因不明的全身系统性血管炎,特定的环境刺激作用于基因易感的个体是其最可能的发病机制。人类白细胞抗原B51虽然是目前公认的BS易感基因,但其所致的发病风险却不足20%,因而提示人体尚存在其他与BS相关的基因位点。细胞因子是免疫系统的信号传递分子,参与了人体所有免疫应答。近年来许多研究报道了细胞因子基因单核苷多态性(SNP)与BS的相关性,其中涉及辅助性T细胞1相关细胞因子、白细胞介素1、白细胞介素17以及趋化性细胞因子等多种炎性反应因子和多个炎性反应通路。这些SNP可影响BS的发病风险,也可影响BS患病个体的表型,上述SNP效力的叠加可能是BS发病的遗传机制。(中华眼科杂志,2020,56:876-880)

  • 标签: 贝赫切特综合征 细胞因子类 多态性,单核苷酸