简介：摘要蛋白质组学研究的对象是生命活动的直接执行者——蛋白质，蛋白质在人体的发育生长和疾病发生发展过程中起着至关重要的作用，是目前临床应用最广泛的标志物类型，也是最直接的药物作用靶标。近年来，以色谱和质谱技术为核心的蛋白组学技术的进步，推动了蛋白质组学研究在深度和广度上的快速发展，其在肝细胞癌临床队列样本研究中的应用，开启了“蛋白质组学驱动的精准医学”新时代。现对近年来蛋白质组学研究凸现的新技术、新方向和在肝癌研究中的新发现做一综述，为临床医生了解蛋白质组学，并利用蛋白质组学助力疾病的诊断和个性化治疗药物研发提供新的思路和参考。

简介：无

简介：摘要目的探究人体中与结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis，Mtb)Rv1705c蛋白相互作用的蛋白质。方法原核表达Rv1705c蛋白基因，收集包涵体，裂解后透析纯化Rv1705c并测定其浓度，ELISA法检测细菌Rv1705c刺激巨噬细胞后细胞因子IFN-γ的分泌量，使用纯化并带有生物素标记的Rv1705c孵育人蛋白质组芯片HuProt™，筛选与Rv1705c相互作用的人类蛋白质，使用GenePix Pro 6.0软件对蛋白质芯片的信号图像进行数据提取，使用GO、KEGG等多个数据库进行生物信息学分析，GST pulldown验证Rv1705c与PSMA3、RSAD2的相互作用。结果纯化结果显示，Rv1705c在包涵体中表达，Rv1705c刺激巨噬细胞后IFN-γ分泌量显著上升。芯片结果显示共筛选出了29个与Rv1705c相互作用的潜在阳性蛋白质，其中PSMA3、NLN、THOP1、UPF3A、RSAD2、OMG、PNKD、STEAP3、MED8共9个蛋白质的信噪比(signal-to-noise ratio，SNR)>1.6。进一步的生物信息学分析发现候选蛋白PSMA3、RSAD2、C1QBP参与固有免疫应答激活信号转导，并且PSMA3、RSAD2与干扰素存在交互作用，GST pulldown验证PSMA3、RSAD2与Rv1705c确有相互作用。结论发现并验证PSMA3、RSAD2与Rv1705c存在相互作用，为Mtb感染机制的研究提供参考。

简介：摘要头颈鳞状细胞癌的全球发病率在最近十年明显上升。头颈肿瘤的病理类型超过90%为鳞状细胞癌，临床上大部分患者确诊时已是晚期，早期识别诊断头颈肿瘤能够极大程度改善患者的预后。随着蛋白质组学技术的不断发展，从传统的蛋白质组学到靶向定量蛋白质组学，再到空间蛋白质组学的出现，特异性的生物标志物有望被发现用于头颈肿瘤的早期诊断、指导治疗以及判断预后。

简介：【摘要】氨基酸序列是蛋白质和多肽重要的结构，其决定蛋白质的高级结构。氨基酸测序在蛋白质研究中越发重要，高分辨率质谱技术的发展大大促进了氨基酸测序的研究。本文综述了氨基酸测序的方法、原理以及其应用的研究进展，随着质谱技术的不断发展，新的测序方法不断建立，氨基酸测序将在蛋白质研究中发挥更大的作用。

简介：摘要糖尿病视网膜病变(DR)是糖尿病患者常见的神经血管性并发症，严重威胁工作年龄人群的视力健康，给我国带来了沉重的社会和经济负担。DR患者就诊时多已发展至增生性糖尿病视网膜病变阶段，需接受玻璃体腔注射药物或手术治疗，但视力恢复不佳，因此以糖尿病患者或早期DR患者为研究对象，探索DR发病新的生物标志物，对早期DR进行及时诊断与治疗具有重要意义。高通量蛋白质组学研究可以检查诸如房水、玻璃体液、泪液和血清等标本量较少的生物流体，找到涉及视网膜炎症过程的差异蛋白，为DR的早期诊断和治疗提供参考。本文就近年来蛋白质组学技术筛选鉴定DR炎性生物标志物的情况及存在的问题进行综述。

简介：

简介：摘要原发性肝癌是我国第4位常见恶性肿瘤及第2位肿瘤致死病因，研发新型生物标志物应用于肝癌患者的早诊早治对于提高生存率十分重要。目前临床上常见的肿瘤标志物大多是糖蛋白质，组学技术对于探索糖蛋白质在肝癌中的临床诊断价值具有重要作用。本文基于肿瘤临床诊断中的糖蛋白质标志物，分析了其诊断方法、问题与挑战；介绍针对糖蛋白质研究的相关技术，包括高通量组学和单一糖蛋白质检测方法，以及基于这些技术发现肝癌潜在的糖蛋白质标志物；并且展望糖蛋白质在肝癌临床诊断中的潜力与应用价值。

简介：摘要目的通过网络药理学和蛋白质组学方法探讨加减血癥汤治疗浸润型胃癌的潜在作用机制。方法利用TCMSP检索加减血癥汤有效成分及其作用靶点，采用高效液相色谱法串联质谱联用（HPLC-MS/MS）法测定浸润型胃癌的靶点，加减血癥汤预测的靶基因与浸润型胃癌的靶点蛋白质数据进行维恩分析，获取作用靶基因，通过STRING获得蛋白质-蛋白质相互作用网络（PPI），采用Cytoscape软件构建方剂-药物-化合物-基因网络，通过DAVID数据库对靶点进行GO富集分析和KEGG通路富集分析。结果筛选出加减血癥汤中69个有效成分，215个药物靶点；660个在浸润型胃癌过表达蛋白质，10个药物靶点和基因靶点的共有靶点。PPI网络包括10个蛋白节点，其中3个核心节点为CASP3、BCL2L1和STAT1。KEGG富集到11条通路，包含PI3K-Akt信号通路、p53信号通路、癌症中蛋白聚糖、细胞凋亡、Jak-STAT信号通路等。结论加减血癥汤可能通过PI3K-Akt信号通路、p53信号通路和Jak-STAT信号通路介导凋亡发挥抑制作用。本研究为加减血癥汤治疗浸润型胃癌作用机制的进一步研究提供理论依据。

简介：摘要急性呼吸窘迫综合征（acute respiratory distress syndrome, ARDS）的临床病死率高，早期预警并积极干预对于改善ARDS预后非常重要。文章就近年来ARDS相关预警生物标志物及蛋白质组学研究现状进行综述，分析与ARDS发生、发展和预后相关的各种预警生物标志物，讨论蛋白质组学在ARDS预警生物标志物中的应用，为后续开展标志物高通量的筛选、验证提供参考。

简介：摘要: 目的 研究大豆分离蛋白及混合蛋白质粉对正常小鼠免疫功能的调节作用。方法 昆明种小鼠240只，随机分为4组，每组60只，即空白对照组、大豆分离蛋白低、高剂量组(0.24、0.48g/kg)、混合蛋白质粉低、高剂量组(0.05、0.15g/kg)连续灌胃30d，测定小鼠脾淋巴细胞增殖反应能力和自然杀伤(NK)细胞活性；观察二硝基氟苯(DNFB)诱导迟发型变态反应(DTH)；通过血清溶血素和抗体生成细胞(PFC)检测体液免疫功能；利用单核巨噬细胞的吞噬功能检测小鼠非特异性免疫功能。结论 大豆分离蛋白及混合蛋白质粉对正常小鼠免疫功能均有一定调节作用，可增强小鼠免疫能力。

简介：[摘要]目的 探讨某品牌蛋白质粉对小鼠的免疫调节作用。方法 依据《保健食品检验与评价技术规范》（2003版）增强免疫力功能检验方法，将某品牌蛋白质粉按0.25、0.5、1.5g/（kg·BW）3个剂量灌胃给予实验小鼠，同时设阴性对照组，每天灌胃1次，连续灌胃30d后，进行各项免疫指标的测定。结果 小鼠足跖肿胀度增加明显，在中、高剂量组与阴性对照组比较差异均有统计学意义（P＜0.05）。血清溶血素水平检测中，受试物中、高剂量组的溶血素水平高于阴性对照组，差异有统计学意义（P＜0.05，P＜0.01）。小鼠的单核-巨噬细胞碳廓清指数，受试物各剂量组与阴性对照组比较差异有统计学意义（P＜0.05）。ConA诱导的淋巴细胞转化能力、抗体生成细胞数、腹腔巨噬细胞吞噬鸡红细胞百分率及吞噬指数、NK细胞活性试验中，各剂量组与阴性对照组比较差异无统计学意义(均P＞0.05)。结论 某品牌蛋白质粉具有增强免疫力的功能。

简介：摘要目的研究二甲双胍干预对噪声性听力损失（NIHL）的保护作用及其差异蛋白质组学表达谱。方法于2021年1月，将39只Wistar雄性大鼠随机分为对照组、噪声暴露组、二甲双胍+噪声暴露组，每组13只。噪声暴露组和二甲双胍+噪声暴露组大鼠连续暴露在声压级120 dB（A）、中心频率8 kHz的倍频程噪声下4 h；二甲双胍+噪声暴露组大鼠从噪声暴露前3 d开始给予200 mg/kg/d二甲双胍干预，共7 d。采用听性脑干反应（ABR）测试各组大鼠右耳噪声暴露前、噪声暴露后1、4、7 d的听力阈值变化情况，采用串联质谱标签（TMT）定量蛋白组学鉴定并分析各组大鼠内耳差异表达蛋白质，并用冰冻切片进行免疫荧光染色验证。结果在噪声暴露后1、4、7 d，噪声暴露组和二甲双胍+噪声暴露组大鼠右耳短声ABR阈值明显高于对照组，二甲双胍+噪声暴露组大鼠右耳短声ABR阈值明显低于噪声暴露组（P<0.05）。与噪声暴露组比较，二甲双胍+噪声暴露组大鼠差异表达上调蛋白1 035个，差异表达下调蛋白1 145个；GO富集分析显示，显著差异表达蛋白主要涉及结合、分子功能调节、信号转导等功能；KEGG通路富集分析发现，差异表达蛋白显著富集的通路包括磷脂酰肌醇3激酶-蛋白激酶B（PI3K-Akt）信号通路、焦点黏附、糖尿病性心肌病、分裂体、丝裂原活化蛋白激酶（MAPK）信号通路等。免疫荧光实验显示，与噪声暴露组比较，二甲双胍+噪声暴露组胰岛素样生长因子1受体（IGF1R）荧光强度增加，真核细胞翻译起始因子4E结合蛋白1（eIF4EBP1）荧光强度减弱。结论噪声暴露可导致大鼠听力阈值升高，二甲双胍可通过多条通路和生物学过程改善噪声引起的听力阈值异常。

简介：【摘要】目的：探讨定喘汤加减对急性发作期哮喘患者血清蛋白质组及免疫功能的影响。方法：选取2017年1月至2020年6月收治我院的急性发作期哮喘患者100例为研究对象，对照组给予常规治疗，研究组给予定喘汤加减治疗，最后对两组患者血清蛋白质组、免疫功能。结果：治疗后，两组患者的CD4+、CD8+水平均降低，且研究组显著低于对照组( P＜0. 05)。治疗后，两组患者的HSP70降低 ( P＜0. 05)。结论：定喘汤加减对急性发作期哮喘患者的疗效良好，其能够调控血清HSP70水平，促进CD4+、CD8+细胞凋亡，缓解患者的临床症状，值得临床推广应用。

简介：摘要：随着现代医学的发展，对于药物外源性疾病越来越重视，而蛋白质作为一类重要的物质载体成了生物医理研究中必不可少而且不可或缺。在临床上细胞内蛋白是一种非常重要但又十分广泛使用且具有很高应用价值和安全性等优点。近年来，随着基因工程、分子生物技术和分子生物学学科的发展，人们对蛋白质药物研究逐渐深入。本文基于蛋白质药物对其在细胞内的递送策略总结，并分析其潜在的应用方式，了解蛋白质药物递送技术的实际进展。

简介：摘要目的定量分析SD大鼠非动脉炎性前部缺血性视神经病变(NAION)模型中视神经组织蛋白表达变化，并对差异蛋白进行生物信息学分析。方法选取10只8周龄体质量200~250 g的SPF级雄性SD大鼠，采用孟加拉玫瑰红联合激光光动力方法建立NAION模型，最终选取4只造模成功的大鼠作为NAION模型组，同时取4只体质量和周龄相匹配的健康、无眼疾SD大鼠作为正常对照组。于造模后7 d，分离各组大鼠球后视神经，采用酶切法进行样本制备，采用同位素标记相对和绝对定量标记结合液相色谱-串联质谱技术对组织蛋白进行质谱鉴定和定量检测，选取组间表达倍数大于1.5倍且差异有统计学意义(P<0.05)的蛋白为差异蛋白，并对差异蛋白进行生物信息学分析。结果造模后3 d，NAION模型组大鼠视盘隆起，荧光素眼底血管造影图像显示视盘区有荧光素钠渗漏，模型建立成功。共鉴定出1 291个可定量蛋白，其中差异蛋白80个。与正常对照组比较，NAION模型组中表达上调的蛋白5个，表达下调的蛋白75个。V型胶原α1链(Col5A1)和cAMP依赖性蛋白激酶催化亚基β(Prkacb)、G蛋白相关支架蛋白(Dlg1)等蛋白表达升高；神经微丝蛋白(Nefm)、微管相关蛋白1b(Map1b)、Ras相关蛋白(Rala)、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶N2(Pkn2)、血小板活化因子乙酰水解酶IB亚基(Pafah1b1)等蛋白表达降低。差异蛋白主要参与细胞骨架的调节、细胞对缺氧的反应、轴突生成及延伸、突触调节、神经元凋亡调控、轴浆运输等生物学进程。京都基因与基因组通路富集分析结果显示，差异蛋白主要参与代谢通路、突触囊泡循环、血小板活化等信号通路。结论神经生长、能量代谢、轴浆运输及凋亡等信号通路相关蛋白的表达共同参与NAION中神经细胞的凋亡。

简介：摘要目的对脓毒症患者进行蛋白质质谱分析，寻找脓毒症诊治的潜在新靶点。方法采用横断面观察研究方法，纳入2019年1月至12月在西南医科大学附属医院急诊科急诊重症监护病房（EICU）就诊的12例脓毒症患者及同期9例健康体检者。采集两组受试者外周血进行蛋白质质谱分析，并采用非依赖性采集技术得到各蛋白表达数据。将所得数据导入整合差异表达和通路分析在线网络工具IDEP2，对数据进行ID转换，并进行均一化处理，验证其可比性，再用主成分分析剔除离群数据。以P<0.05、log2差异倍数（FC）>1或log2FC<-1为差异有统计学意义，筛选出差异蛋白。用DAVID在线网站将筛选出的差异蛋白进行基因本体（GO）分析，从蛋白质的生物过程、细胞组分、分子功能3个方面对蛋白进行富集分析，同时进行京都基因与基因组百科全书数据库（KEGG）通路分析。通过基因与蛋白质相互作用检索数据库（STRING）在线网站进行蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）分析，找到紧密联系的相关蛋白。结果两组数据经均一化处理后提示具有可比性。最终共筛选出125个差异蛋白，其中99个上调，26个下调。GO富集分析显示，筛选出的差异蛋白主要分布在细胞外，具有细胞调节功能及催化活性，参与生物调节、代谢过程及免疫过程；KEGG通路分析提示这些蛋白参与了氨基酸、糖类代谢及免疫相关通路。PPI分析显示，关键蛋白主要为基质金属蛋白酶14（MMP14）、纤维蛋白1（FBLN1）和血浆激肽释放酶1（KLKB1）等，最终筛选出与炎症、免疫等紧密相关的MMP14及KLKB1，二者可能是早期诊治脓毒症的潜在新靶点。结论MMP14和KLKB1可能为脓毒症诊治及预后判断的潜在生物标志物。

简介：【摘要】目的：比较硒粉-硫酸钾、硫酸铜-硫酸钾混合催化剂在血液制品蛋白质含量测定中的消化时间及测定结果差异情况。方法：采用凯氏定氮法对人血白蛋白、静注人免疫球蛋白（pH4）、人免疫球蛋白测定蛋白质含量，各品种分别使用硒粉-硫酸钾、硫酸铜-硫酸钾两种混合催化剂进行消化。结果：硒粉-硫酸钾催化剂消化时间约50分钟；硫酸铜-硫酸钾催化剂消化时间约90分钟；两种催化剂测定血液制品的蛋白质含量结果无显著性差异。结论：凯氏定氮法测定血液制品蛋白质含量时，硒粉-硫酸钾催化剂的消化时间相对于硫酸铜-硫酸钾催化剂大大缩短，且对测定结果无显著性影响。

简介：摘要目的通过蛋白重组技术低成本、快速制备高浓度人视黄醇结合蛋白4（hRBP4）参考物质，解决临床hRBP4高值参考物质难以获取的需求。方法在美国国立生物技术信息中心NCB查找hRBP4的互补DNA序列，经大肠埃希菌密码子优化后人工合成，然后将DNA片段克隆至原核表达质粒pET-28a（+）中，以构建重组hRBP4表达载体。将重组质粒转化至E. coli BL21感受肽中，优化诱导表达条件（如温度、转速和异丙基硫代半乳糖苷IPTG浓度等）、诱导质粒表达并对重组蛋白进行His融合标签纯化，获取纯化后的hRBP4重组蛋白。结果DNAMAN软件对比显示编码hRBP4蛋白的碱基序列完全正确，成功构建重组hRBP4原核表达质粒；SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳结果显示亲和纯化产物中可清晰可见约相对分子质量26 000电泳条带；临床尿液和血清hRBP4常规检测系统均可检测到纯化的hRBP4蛋白，且稀释倍数与检测浓度间呈现良好线性关系。结论成功构建重组hRBP4高水平表达系统，重组hRBP4蛋白纯度大、浓度高、生产周期短，有望在室间质量评价质控品和有证参考物质研制中发挥重要作用。

简介：摘要环状RNA由于5'帽状结构的缺失一直被认为是非编码RNA，不具有编码蛋白或多肽的功能。随着高通量转录组测序、核糖体测序等技术的进展，研究发现环状RNA的序列中存在短开放阅读框和内部核糖体进入位点，具有编码多肽或蛋白质的能力，并在胶质瘤、肝细胞癌、胃癌、乳腺癌、结肠癌等恶性肿瘤增殖中发挥重要作用。现通过综述环状RNA编码功能，分析其编码产物-多肽或蛋白质在人类恶性肿瘤增殖机制中的作用。