目的:估算2005年和2009年全国电子计算机X射线断层扫描技术(CT)、核磁共振成像(MRI)检查总费用及其占卫生总费用的比重,为CT、MRI设备的规划和费用控制提供决策依据。方法:对上海、陕西、湖南和浙江4个省市的二、三级医院进行抽样调查,获得其2005年和2009年CT、MRI服务相关数据,所有数据都由Epidata3.1进行录入,Excel2007进行统计分析。结果:2005和2009全国CT检查总费用分别为:123.43亿元和248.99亿元,占卫生总费用的比例分别为1.43%和1.45%;MRI检查费用分别为45.44亿元和96.14亿元,占卫生总费用的比例分别为,0.52%和0.56%。结论:2005年至2009年全国CT、MRI检查费用增长比较迅速,但是其占卫生总费用的比例变化不大,并不能认为检查费用的增长加重了患者的经济负担。