简介:摘要长链非编码RNA(long non-coding RANs,lncRNAs)是指长度超过200个核苷酸且无编码蛋白质功能的一类非编码RNA。近年来研究发现,lncRNAs广泛参与各种生物学过程,如调控细胞的分化、增殖、转移和凋亡等。lncRNAs的异常表达与人类各种疾病尤其与恶性肿瘤密切相关。其中反义lncRNAs是从编码或非编码基因的反义链转录生成的一类lncRNA。在哺乳动物细胞中,反义lncRNAs约占全部lncRNAs的20%,该类lncRNAs能通过调控其附近基因的转录影响细胞的生物学活动,参与包括胃癌在内的肿瘤的发生和发展,相关研究已成为当今肿瘤研究领域的热点。本文拟结合国内外最新研究报道,对近年来在胃癌研究中已经明确有差异变化的反义lncRNAs及其功能加以综述。
简介:摘要在移动通信行业的快速发展下,通信线路工程越来越多,在其设计和施工过程中,由于影响因素多,需要采用科学的项目管理方法提高管理效率。本文主要研究关键链法在通信线路工程中的应用,首先介绍关键链法的理论基础和应用特点,分析其在通信线路工程中的适用性。在此基础上,研究基于关键链法的通信线路工程项目管理策略,包括应用环境分析、工序线路设计、应用优势和注意事项等。
简介:摘要长链非编码RNA(long non coding RNA,lncRNAs)是一类重要的细胞调节因子,参与多种生物过程的调控。这些非编码RNA在表观遗传水平、转录及转录后水平等多个方面发挥着重大调控作用,从而调节机体的多种生理和病理过程。lncRNAs在不同肿瘤中的异常表达与肿瘤本身的特殊生物学病理特征、疾病预后和药物治疗的反应有关,尤其在与人乳头状瘤病毒(human papilloma virus,HPV)感染相关的肿瘤中广泛研究。本文结合国内外最新报道,对在头颈肿瘤研究较多的三类lncRNA-HOTAIR、H19、MALAT-1进行汇总,探究lncRNAs与HPV相关肿瘤的关系,有效的为预防和治疗头颈肿瘤等HPV相关疾病提供新思路。
简介:摘要目的探讨重+轻链淀粉样变性(heavy- and light-amyloidosis,AHL)的临床表现、诊断及预后。方法通过回顾北京大学人民医院收治的2例AHL患者的临床资料及复习文献21例患者资料,明确AHL的临床与预后特点。结果与轻链型淀粉样变性相比,AHL患者多为男性,血、尿免疫固定电泳阳性率高且为完整的免疫球蛋白;肾脏表现为以白蛋白为主的蛋白尿,可出现肾病综合征,镜下血尿常见,肾活检病理可见刚果红染色阳性物质多部位沉积(系膜区、毛细血管壁、小动脉、肾间质),免疫荧光可见单克隆重链合并轻链(类型与血M蛋白一致)团块样沉积、与淀粉样物质沉积部位一致。心脏受累少见,骨髓中浆细胞比例高。结论AHL罕见,在临床表现上不同于轻链型淀粉样变性,预后有待累积病例进一步观察。
简介:摘要目的分析小鼠肾脏衰老过程中长链非编码RNA(lncRNA)的差异表达情况,探索肾脏衰老的机制。方法随机选取3、12和24月龄C57BL/6雄性小鼠各5只(体重均为25 g左右),采用PAS、Masson、半乳糖苷酶(SA-β-gal)染色方法检测小鼠肾脏病理及细胞衰老情况。高通量测序得到3组小鼠组间差异表达的lncRNA及其表达丰度值,绘制热图。采用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)验证差异表达的lncRNA。构建竞争性内源性RNA(competitive endogenous RNA,ceRNA)网络(包含lncRNA、miRNA和mRNA),GO、KEGG富集分析预测差异表达lncRNA靶基因的生物学功能。结果肾脏病理染色结果显示,随着小鼠月龄增加,肾小球系膜基质增多,基底膜增厚,肾小球硬化逐渐加重;肾脏纤维化逐渐加重;SA-β-gal染色阳性区域逐渐增加。测序结果显示,3组小鼠间差异表达的lncRNA共938个已知的lncRNA和542个未知的lncRNA。其中,与3月龄小鼠相比,12月龄小鼠有33个lncRNA表达上调,43个lncRNA表达下调;与3月龄小鼠相比,24月龄小鼠有130个lncRNA表达上调,91个lncRNA表达下调;与12月龄小鼠相比,24月龄小鼠有36个lncRNA表达上调,22个lncRNA表达下调。qRT-PCR验证的差异表达倍数较大、表达量较高的10个lncRNA与测序结果一致。GO富集分析结果显示,3组差异表达的lncRNA靶基因多定位于细胞核和细胞质,也可能通过与蛋白结合来发挥作用,还可能参与各种蛋白磷酸化、细胞周期、转录、转录调节等过程。KEGG富集分析结果显示,3组差异表达lncRNA的靶基因富集明显的通路是与肾脏衰老密切相关的Rap1信号通路、FOXO信号通路和MAPK信号通路。结论不同月龄小鼠肾脏lncRNA表达存在显著差异,lncRNA的差异表达可能参与肾脏衰老的发生。
简介:摘要肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)是一种复杂性疾病,大部分确诊时为晚期,因此早期诊断、治疗尤为重要。近年来研究发现,部分长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)在HCC中具有差异性表达,可作为诊断及评估预后的潜在的生物标志物。研究者陆续发现单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)可影响lncRNA的表达,与HCC的发生发展密切相关。lncRNA及其SNPs在HCC诊断、治疗和预后方面发挥的重要作用,可为未来进一步研究及应用提供帮助。
简介:摘要目的探讨坐骨神经损伤后长链非编码RNA(LncRNA)差异表达的基因,以及LncRNA MX1对大鼠雪旺细胞迁移、增殖能力的影响。方法选取10周龄无特定病原体级雄性SD大鼠24只,随机分为0 d(T0)、3 d(T1)、7 d(T2)和14 d(T3)4组,每组6只,建立坐骨神经损伤动物模型。分别于模型建立后第0、3、7、14天取相应组大鼠坐骨神经损伤处的残端组织提取RNA,制备RNA基因芯片进行Heatmap聚类分析,筛选出各个时间点发生差异表达的基因,并选择其中差异表达显著的基因LncRNA MX1。培养iCell-r030大鼠雪旺细胞,分为对照组、Control siRNA组(siRNA组)和LncRNA MX1 siRNA组(siRNA-MX1组),使用相应试剂进行转染。转染后采用实时荧光定量聚合酶链反应(qRT-PCR)检测3组雪旺细胞的LncRNA MX1mRNA表达情况,采用Transwell小室检测雪旺细胞的迁移能力,采用5-乙炔基-2'-脱氧尿苷(EDU)实验检测雪旺细胞的增殖能力。结果各组大鼠均造模成功,实验过程中无大鼠死亡。大鼠损伤坐骨神经组织LncRNA差异基因Heatmap聚类分析的热图显示,与T0组比:T1组共3 066个LncRNA基因发生差异性表达,其中1 634个LncRNA基因表达上调,1 432个LncRNA基因表达下调;T2组共2 498个LncRNA基因发生差异性表达,其中1 634个LncRNA基因表达上调,864个LncRNA基因表达下调;T3组3 567个LncRNA基因发生差异性表达,其中有1 643个LncRNA基因表达上调,1 924个 LncRNA基因表达下调。各组差异表达的LncRNA基因中LncRNA MX1的差异倍数数值较大,差异表达显著。大鼠雪旺细胞qRT-PCR结果显示,转染LncRNA MX1 siRNA后,siRNA-MX1组LncRNA MX1的相对表达量为1.0±0.2,低于对照组的2.3±0.2和siRNA组的2.2±0.2,差异有统计学意义(F=78.47,P<0.001);而对照组和siRNA组组间差异无统计学意义(P>0.05)。迁移、增殖试验结果显示,siRNA-MX1组细胞迁移数量为(24.1±4.2)个、EDU阳性细胞与DAPI阳性细胞的比率为27.5%±2.8%,低于对照组的(50.3±7.8)个、44.1%±7.2%和siRNA组的(49.2±6.2)个、41.8%±7.0%,差异均有统计学意义(F=93.15、121.26,P值均<0.001);而对照组和siRNA组间差异均无统计学意义(P值均>0.05)。结论大鼠坐骨神经损伤后LncRNA MX1差异表达显著,下调LncRNA MX1在大鼠雪旺细胞中的表达可显著降低细胞的迁移、增殖能力。
简介:摘要外泌体(exosome)是包裹着核酸、蛋白质、脂类、氨基酸和代谢物的直径大约100 nm的膜性囊泡,大部分细胞都可分泌。长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)是长度大于200个核苷酸的非编码RNA,没有蛋白质的表达,但能在转录、转录后及表观遗传水平上调控基因的表达。外泌体lncRNA(exosomal lncRNA)是指由外泌体携带、运输和分泌的lncRNA,可以通过参与细胞间信号传导,引起细胞内基因表达改变,对肿瘤等疾病的发生发展产生重要影响。外泌体lncRNA有望成为一种新型的肿瘤生物标记物,可通过液体活检应用到肿瘤的诊断、治疗及预后判断中。本文就外泌体lncRNA在肿瘤中的作用以及在肿瘤诊断、治疗和预后判断方面的应用潜力进行综述。
简介:摘要目的探索长链非编码RNA(lncRNA)068对黑素瘤细胞系A375迁移的影响及潜在机制。方法2015年12月至2020年11月在南通大学附属医院皮肤科门诊收集经病理确诊的皮肤黑素瘤患者21例,采用定量PCR(qPCR)检测其黑素瘤组织与相邻癌旁组织中lncRNA 068的表达。通过慢病毒转染在A375细胞中过表达或敲降lncRNA 068,过表达实验分为LV-GFP组和LV-lncRNA 068组,低表达实验分为LV-LacZ shRNA组和LV-lncRNA 068 shRNA组,其中LV-GFP组和LV-LacZ shRNA组均作为对照;Transwell实验及划痕实验检测过表达或敲降lncRNA 068对A375细胞迁移的影响,EdU细胞增殖实验和CCK8法分别检测各组增殖细胞比例及细胞活力,细胞免疫荧光染色检测过表达或敲降lncRNA 068对上皮-间质转化的影响。将各组慢病毒转染的A375细胞接种于BALB/c裸鼠腋窝,每3天测量并计算肿瘤体积,30 d后处死所有裸鼠,切除肿瘤组织并测量肿瘤体积和质量。将培养的B16F10细胞接种于BALB/c裸鼠背部和足部皮下构建B16F10移植瘤模型,2周后处死裸鼠,qPCR和Western印迹法分别检测B16F10移植瘤及癌旁组织中炎症因子mRNA的表达及IKK/P65信号通路相关蛋白的表达。两组间比较采用t检验,各组间不同时间点肿瘤体积及质量的比较采用重复测量方差分析。结果qPCR显示,人黑素瘤组织及裸鼠B16F10移植瘤组织中lncRNA 068相对表达量(0.414 ± 0.109、0.717 ± 0.041)均明显低于相应的癌旁组织(1.050 ± 0.103、1.011 ± 0.023,t = 19.48、10.83,均P < 0.001)。Transwell实验及划痕实验均显示,LV-lncRNA 068组细胞迁移能力显著低于LV-GFP组(均P < 0.01),而LV-lncRNA 068 shRNA组明显强于LV-LacZ shRNA组(均P < 0.05)。细胞免疫荧光实验显示,与LV-GFP组相比,LV-lncRNA 068组E钙黏蛋白荧光强度增强,而N钙黏蛋白荧光强度减弱(均P < 0.001);与LV-LacZ shRNA组相比,LV-lncRNA 068 shRNA组E钙黏蛋白荧光强度减弱,而N钙黏蛋白荧光强度增强(均P < 0.05)。体内裸鼠成瘤实验显示,过表达组与敲降组黑素瘤的体积、质量差异均无统计学意义(P > 0.05)。qPCR和Western印迹实验显示,LV-lncRNA 068组A375细胞中白细胞介素(IL)-10、紧密连接蛋白1 mRNA及蛋白的表达均显著高于LV-GFP组(均P < 0.05),而LV-lncRNA 068 shRNA组IL-10、紧密连接蛋白1 mRNA及蛋白表达均显著低于LV-LacZ shRNA组(均P < 0.05)。B16F10黑素瘤组织中IL-10 mRNA的表达量显著低于癌旁组织(P < 0.01),而IL-6、TNF- α mRNA表达及p-P65蛋白表达均显著高于癌旁组织(均P < 0.001),p-IKK蛋白表达量显著高于癌旁组织(P < 0.01)。结论LncRNA 068过表达可抑制黑素瘤细胞A375的迁移,并可能通过抑制IKK/P65信号通路影响炎症的发生,抑制上皮-间质转化过程。
简介:摘要目的研究增殖期与消退期婴儿血管瘤(IH)长链非编码RNA(lncRNA)与mRNA的差异表达情况。方法2019年1-3月在四川大学华西医院小儿外科收集行手术切除治疗的8例IH组织(增殖期与消退期各4例),运用基因芯片技术筛选差异表达(P < 0.05,差异倍数≥ 1.5)lncRNA和mRNA,并用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)技术对芯片结果进行验证。同时,应用生物信息学方法,对差异基因进行GO功能和KEGG通路分析,并构建lncRNA-mRNA共表达网络,预测差异lncRNA的顺式作用靶基因。结果通过基因芯片技术共筛选出405条差异lncRNA(108条下调,297条上调)与772条差异mRNA(107条下调,665条上调)。qRT-PCR验证4条lncRNA(n335248、ENST00000450864、n333319和n335185)与4条mRNA(EDNRA、IFI6、HK2与ITGA1)的表达,结果与基因芯片检测结果一致。GO与KEGG富集分析发现,差异mRNA主要参与血管凝固、轴突导向、血管生成和细胞黏附等生物过程,差异mRNA主要富集在代谢通路、细胞局部黏附、肌动蛋白细胞骨架调控、白细胞跨内皮迁移、磷脂酰肌醇-3-激酶/丝苏氨酸蛋白激酶等信号通路。lncRNA-mRNA共表达网络由度值≥ 15的23条mRNA和58条lncRNA共同构建组成。结论增殖期与消退期IH组织中存在大量差异表达的lncRNA和mRNA,这些lncRNA可能通过调控相应的靶mRNA参与IH发生发展。
简介:摘要目的观察肺腺癌合并肺栓塞患者中差异表达的长链非编码RNA(lncRNA),探讨肺腺癌合并肺栓塞发生的潜在分子机制。方法收集新疆医科大学附属肿瘤医院2019年1月至2019年12月肺腺癌合并肺栓塞、单纯肺腺癌、单纯肺栓塞和正常对照组人群外周血各4例,TRIzol® Reagent提取总RNA,利用Illumina高通量测序技术同时对肺腺癌合并肺栓塞、肺腺癌、肺栓塞以及正常人群(各4例)lncRNA表达谱测定,分别比较各组差异表达的lncRNA。lncRNA样本相关性采用StringTie软件和PrepDE.py进行相关性分析。结果13 897个已知lncRNA,经CPC、CNCI和HMMER软件进行编码能力预测发现12 900个新型lncRNA。肺腺癌合并肺栓塞与单纯肺腺癌组比较,检测到725个差异表达的lncRNA(其中326个上调,399个下调,P<0.05)。肺腺癌合并肺栓塞与单纯肺栓塞组比较,发现932个差异表达的lncRNA(其中452个上调,480个下调,P<0.05)。肺腺癌合并肺栓塞与正常对照组比较,1 190个差异表达的lncRNA(其中453个上调,737个下调,P<0.05),差异倍数最大的上调lncRNA为MERGE.31027.6,差异倍数最大的下调lncRNA为MERGE.30976.2。结论lncRNA-MERGE.31027.6、lncRNA-MERGE.30976.2可能参与肺腺癌合并肺栓塞的发生。