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267 个结果
  • 简介:大麦糖化力蛋白质含量是影响大麦品质重要指标,对此类性状进行QTL定位具有重要经济意义。本研究分别采用传统单QTL扫描方法3种贝叶斯LASSO方法实现此类性状QTL精细解析。在对大麦蛋白质含量QTL检测上,单QTL扫描方法共检测到了3个QTL,而3种贝叶斯方法检测到了7个QTL,其中2个与单QTL扫描方法检测QTL吻合。在大麦糖化力QTL检测上,传统单QTL扫描方法共检测到了3个QTL,而3种贝叶斯方法除了检测到这3个QTL外,还检测发现了额外2个连锁QTL;表明贝叶斯方法在北美大麦蛋白质含量糖化力QTL检测中可以更加有效地分离处于连锁位置或接近状态QTL进而提高QTL检测效力。

  • 标签: 贝叶斯LASSO QTL 多QTL定位
  • 简介:应用AFLP、SRAP、RAPD、SSR及同工酶等5种标记构建326个标记位点白菜遗传图谱81个DH株系群体,采用MapQTL5软件与MQM作图法对白菜叶片数与单株重进行QTL定位及遗传效应分析。结果表明,通过两个不同年份试验,在10个连锁群上共检测到20个QTL,主要分布在R5、R9连锁群上:控制叶片数有5个,控制单株重有15个;其中,获得两年稳定表达QTL共6个:控制叶片数有1个,控制单株重有5个;另外,估算了单个QTL遗传贡献率和加性效应,发现各QTL加性效应各不相等,各位点遗传贡献率介于9.4%~39.6%之间;控制叶片数控制单株重QTL位点表现为紧密连锁或相似的位置,主要集中在R5连锁群上,这与二者性状表型值相关系数很高相一致。这将为白菜品种改良中产量等性状分子标记辅助选择提供理论依据。

  • 标签: 大白菜 DH群体 白菜叶片数 单株重 QTL
  • 简介:解析穗粒数、小穗数粒重及其QTLs间遗传关联,有利于大麦穗发育遗传标记辅助选择研究。本研究采用SPSS19.0软件分析了25份试验材料小穗数、千粒重穗粒数表型差异,以及不同性状及其QTLs间遗传关联性。结果表明小穗数等3个性状具有显著或极显著差异,育种品种小穗数穗粒数与地方品种没有明显差异,大多数育成品种千粒重显著或极显著高于地方品种,二棱大麦小穗数、穗粒数千粒重没有显著差异,但六棱大麦具有显著或极显著差异;小穗数与穗粒数极显著正相关,偏相关系数为0.835;在试验材料中共检测到4个小穗数QTLs、6个穗粒数QTL6个千粒重遗QTLs,16个QTLs分别位于1H、2H4H等6条染色体上,其中QSn-4HS等8个QTLs具有增效作用、其余QTLs具有减效作用。与标记HVM40-258bp连锁QTL对小穗数穗粒数具有一因多效特性性。小穗数等3个穗部性状分别受遗传效应不同QTLs控制,QTL多效性导致了小穗数与穗粒数关联遗传。

  • 标签: 大麦品种(或品系) 穗部性状差异 SSR标记 关联分析 QTLs检测
  • 简介:植物14-3-3蛋白(GF14蛋白)是一类参与调节植物生命活动过程小分子蛋白。本研究根据高羊茅转录组学测序获得FaGF14-AFaGF14-D基因片段,利用RACE技术得到高羊茅FaGF14-AFaGF14-D基因3’5’cDNA序列,拼接后FaGF14-A基因全长为1153bp,编码260个氨基酸;FaGF14-D基因全长为1291bp,编码266个氨基酸。生物信息学分析结果表明高羊茅FaGF14-AFaGF14-D蛋白都具有典型14-3-3蛋白结构域,包含9个保守琢-螺旋及不保守N-末端C-末端,尤其与禾本科植物GF14蛋白具有较高相似性,位于同一个进化支上,亲缘关系较近。

  • 标签: 高羊茅 FaGF14-A FaGF14-D 克隆 分析
  • 简介:查尔酮合成酶(chalconesynthas,CHS)是黄酮类次生代谢物生物合成途径中一个关键酶。为了解CHS与花青素含量相关性,本研究根据转录组数据,利用RT—PCR技术在甘薯中克隆了一个CHS基因(IbCHS1),并对其表达特征进行了分析。结果表明:IbCHS1基因cDNA长1556bp,包含1个1167bp开放阅读框,编码388个氨基酸。IbCHS1蛋白具有典型植物CHS结构特征,其他植物中类似蛋白具有很高同源性。表达分析显示,IbCHS1主要在紫肉甘薯中表达,其表达水平与不同品种甘薯中花青素含量正相关。

  • 标签: 甘薯 查尔酮合成酶 花青素 基因表达
  • 简介:乙烯作为植物激素在生长、发育、抗逆过程中发挥了其独特调节作用。本文在分子生物学水平上概述了植物中乙烯合成途径信号转导途径机制。乙烯合成由甲硫氨酸开始,经过重要中间代谢产物ACC氧化裂解形成乙烯,其中ACC合成酶催化反应为限速反应,为调控乙烯合成重要环节。乙烯信号转导由内质网上乙烯受体识别乙烯开始,在胞质中经一条保守途径,由EIN3将转录信号传递至细胞核中,最后以ERF类转录因子激活或抑制相关基因表达。ERF转录因子参与防卫反应诱导寄主对病原菌不亲和互作建立,受其调控防卫基因被诱导表达后在随后防卫应答过程中发挥了不同作用。

  • 标签: 乙烯合成 信号转导 诱导抗性
  • 简介:利用生物信息学手段,结合公共大豆基因组数据库大豆发育表达芯片数据获得大豆GST家族基因序列、蛋白序列染色体位置等信息并进一步对基因组织表达等进行分析。结果显示大豆中含94个GST家族基因,根据系统发育分析将这些GST基因分成5个亚家族;定位分析表明,94个GST基因分布于大豆16条染色体上。表达分析结果表明,14个不同发育阶段,大多成员至少在一个组织中表达,11差异表达基因中有7在根中表达,另外4在其它部位优势表达,基因表达具有一定特异性。本研究为进一步研究GST家族功能及其抗逆利用提供基础。

  • 标签: GST家族 全基因组筛选 分类分析 差异表达基因
  • 简介:腐霉根腐病严重影响着大豆种子发芽植株生长,谷胱甘肽转移酶是植物与生物胁迫非生物胁迫相互作用主要酶,在失活有毒化合物,保护植物细胞免受氧化损伤等方面扮演着十分重要角色。本研究从腐霉菌侵染抗病大豆灰不支黑豆中分离出GmGST26基因,采用生物信息学方法对大豆GmGST26序列特征、结构、大豆GmGST家族基因进化关系及表达数据进行分析;利用荧光定量PCR技术DGE表达谱数据分别对GmGST26基因在不同抗病品种中表达特点及在抗病大豆互作过程中表达模式进行分析。研究结果表明,腐霉菌侵染大豆后GmGST26基因上调表达,GmGST26编码225个氨基酸,等电点为6.92,具有明显GSTs蛋白典型结构域,属于GSTs家族中Tau亚家族,与GmGST7相似性为98.22%,属旁系同源基因。组织特异性表达分析,主要在根部表达,其次为花,该基因在腐霉菌、疫霉菌与大豆互作过程中表达模式为应激反应上调基因,且防卫反应负调控。

  • 标签: 大豆 谷胱甘肽转移酶 分子特征 表达模式
  • 简介:葡萄浆果颜色是由花色素苷量来决定,UFGT控制花色素苷合成,Myb相关基因通过时空表达调节UFGT,从而使花色素苷在葡萄发育不同阶段不同部位表达。不同葡萄品种调节花色素苷合成强度模式差异造成了有色葡萄品种果皮有多种颜色,白色葡萄品种果皮是由于没有花色素苷合成。Myb相关基因家族主要有八个成员,其中MybA三个种类VlmybA1-1,VlmybA1-2VlmybA2以及MybB两个种类VlmybB1-1VlmybB1-2得到了较深入研究。

  • 标签: 葡萄 花色素苷 MYB UFGT 色素形成
  • 简介:针对多浆旱生植物霸王富含多酚多糖类物质特点,在常规异硫氰酸胍方法基础上进行改进,摸索出一种霸王叶根总RNA提取方法。本方法主要通过在提取缓冲液中加入4%β-巯基乙醇以去除多酚物质干扰;用2mol/L醋酸钠(pH4.0)、水饱和酚氯仿:异戊醇(24:1)抽提以去除多糖蛋白物质。采用该方法提取霸王总RNA纯度高、完整性好,电泳条带清晰,OD260/OD280值在1.8~2.0之间,其质量完全可以满足进一步分子生物学研究要求。

  • 标签: 霸王 多酚 多糖 改进的异硫氰酸胍法 RNA提取
  • 简介:微卫星标记(SSR)是分子育种中常用遗传标记,葫芦科中仅有黄瓜、甜瓜、西瓜进行了大规模SSR标记开发,其他作物均不同程度地面临SSR标记缺乏情况。利用近源物种间分子标记具有一定通用性,本研究合成源于黄瓜、甜瓜西瓜60对SSR标记,从中筛选出42对可用标记,对甜瓜、西瓜、黄瓜、南瓜、苦瓜、冬瓜、节瓜丝瓜8种葫芦科作物进行验证,分析这三种瓜类SSR标记在葫芦科中穿梭性。结果表明,42对标记中有29对(69%)能在8种常见葫芦科作物中都得到有效扩增,在5种及5种以上物种中有扩增引物达到38对,占90.5%,表明这三种瓜类SSR标记在葫芦科作物中有良好穿梭性,这为葫芦科中数目庞大未测序作物提供一种切实可行、高效低成本分子标记开发方法。

  • 标签: SSR 葫芦科 穿梭标记 黄瓜 甜瓜 西瓜
  • 简介:随着我国园林绿化市场持续升温,园林植物育种领域研究不断得到重视,在传统育种技术基础上,以现代生物技术、航天和离子注入诱变育种为核心高新技术育种得到较大程度发展.本文阐述了基因工程细胞工程技术在园林植物株型花型、花色香味、生长发育、延缓衰老、抗病虫、抗逆境等方面的研究现状;综述了航天育种离子注入育种等高新技术研究基础,及其在园林植物种质创新领域研究进展;并介绍了国内有关研究单位一些相关研究情况.分析了园林植物育种技术发展趋势,并重点对园林植物现代生物技术、航天和离子注入育种作了展望.

  • 标签: 园林植物 高新技术育种 生物技术育种 航天诱变育种 离子注入诱变育种
  • 简介:为了解烟草杂交组合Florda301×GDH94杂种优势表现及其形成原因,我们分析了该组合6个农艺性状杂种优势表现,并利用主成分分析法对各农艺性状贡献进行了分析;利用6对SRAP引物,对Florda301×GDH94及其亲本进行cDNA-SRAP差异表达分析,并对差异表达片段进行克隆测序分析。结果表明:超高亲优势表现为株高〉叶数〉叶厚〉叶长〉叶宽〉叶面积;中亲优势表现为株高〉叶数〉叶面积〉叶长〉叶宽〉叶厚。叶面积叶长、叶宽,叶长与叶宽呈极显著相关。主成分分析将6个农艺性状简化为3个主成分,即叶产量因子、长势因子、叶数因子,提供信息占全部信息量95.99%。6对SRAP引物在Florda301×GDH94及其亲本中共扩增出66条带,其中差异条带32条,占48.48%;差异表达类型分为UNF1、ABF1、UNP1、UNP2、DMP、DMP2六种,分别占:19.20%、8.04%、4.60%、5.75%、2.30%、6.90%。从杂种特异表达片段中分离两条片段分别与GDP-甘露糖4,6-脱水酶蔗糖6-果糖基转移酶同源。本研究结果为烟草农艺性状杂种优势研究提供基础理论参考。

  • 标签: cDNA-SRAP 农艺性状 杂种优势
  • 简介:根据刺五加鲨烯合酶基因2(squalenesynthase,SS2)鲨烯环氧酶基因1(squaleneepoxidase,SE1)DNA序列,通过Southern杂交qRT-PCR法确定SS2SE1拷贝数。以actin为内参照基因,利用qRT-PCR法分光光度法确定不同SS2SE1拷贝数下基因表达量皂苷含量。结果表明,刺五加SS2存在12拷贝,SE1存在1、23拷贝类型及其相互组合6种拷贝数组合基因型。刺五加SS2SE1表达量与皂苷含量均随拷贝数增加而显著提高(p〈0.05),两者间存在极显著正相关关系(P〈0.01)。SS2SE1每增加1个拷贝可使皂苷含量分别提高0.570.42倍。研究结果为进一步揭示刺五加皂苷含量差异形成分子机理奠定了基础。

  • 标签: 刺五加 鲨烯合酶 鲨烯环氧酶 拷贝数 皂苷
  • 简介:SSRSNP被推荐为玉米品种DNA指纹鉴定优选标记技术。本研究选用大面积推广11套玉米杂交种及其亲本作为试验材料,基于SNP芯片分型平台SSR荧光毛细管电泳平台分析比较两种标记在玉米品种真实性鉴定中应用。基于上述两种检测平台获得3072个SNP位点40对SSR引物基因型数据,分析比较各个参数。结果显示:(1)两种标记数据获得率均较高,3072个SNP位点平均数据获得率为98.4%,40对SSR引物平均数据获得率为99.47%。(2)两种标记均具备较高品种区分能力,3072个SNP位点平均MAF(minorallelefrequency)值为0.357,MAF值大于0.30占71%,平均DP(discriminationpower)值为0.515,DP大于0.5占56%;40对SSR引物平均PIC(polymorphisminformationcontent)值为0.605,PIC大于0.51有32对,平均DP值为0.745,DP值大于0.71有29对。(3)两种标记位点鉴定样品杂合率、亲子关系方面结果是一致,样品杂合率均介于0.4~0.6之间,平均杂合率分别为0.5250.514;SNP数据显示符合亲子关系位点百分比介于95.2%~99.9%之间,SSR数据显示符合亲子关系位点介于36~40个之间。综上所述,SSRSNP两种标记在数据完整性、区分品种能力、位点稳定性等方面差别较小。

  • 标签: 玉米 SSR SNP 真实性鉴定
  • 简介:为了探讨脲类细胞分裂素PBU嘌呤类细胞分裂素6-BA对尾叶桉愈伤分化、愈伤组织POD基因表达及酶活性影响,将尾叶桉幼苗下胚轴切段接种在添加PBU+IAA、6-BA+IAAPBU+6-BA+IAA三种激素组合SPCa培养基中,通过统计愈伤组织分化情况、检测POD基因表达差异酶活性变化来开展研究。6-BA+IAA组合条件下,愈伤组织褐化率高达84.71%;PBU+IAA组合下,愈伤组织褐化率为30.56%;PBU+6-BA+IAA组合时,褐化率最低,为24.09%,胚性愈伤组织时比例最高,达47.73%。与6-BA相比,PBU诱导出愈伤POD酶活性显著升高。通过实时定量PCR(real-timequantitativePCR,qPCR)检测6个POD基因表达变化,设6-BA+IAA诱导所得愈伤相对表达量为1,PBU+IAA诱导所得愈伤中BP1,BP4,BP5表达上调,分别为1.88、1.63、2.01;PBU+6-BA+IAA诱导所得愈伤中BP3、BP4、BP6表达上调,分别为1.88、1.96、1.93。从实验结果分析,PBU6-BA有协同效应,通过增强POD酶活性,减轻褐化、促进胚性愈伤分化。PBU6-BA对不同POD同工酶表达影响不同。本研究可为深入研究PBU6-BA协同作用分子机理提供参考。

  • 标签: 尾叶桉 PBU 6-BA POD 基因表达差异
  • 简介:双精氨酸蛋白转运系统(twin-argininetranslocationsystem,Tat)在伴侣蛋白校正监控下将已正确折叠蛋白通过细菌细胞质膜植物叶绿体类囊体膜。Tat分泌产物信号序列具典型双精氨酸基序,包含多拷贝膜蛋白TatA、TatBTatC。其中TarATatB基因在细菌中已进行了大量研究,但是植物中作用机理尚不清楚。本实验以茄科植物马铃薯为研究对象,克隆基因并采用生物信息学手段进行序列比对,通过烟草脆裂病毒介导基因沉默技术,结合半定量RT—PCR来解析StTatAStTatB功能。结果表明:马铃薯StTatAStTatB与大肠杆菌、衣藻、番茄具有高度同源性,且在叶绿体发育过程中起重要作用。

  • 标签: 基因StTatA和StTatB 全长克隆 VIGS 半定量RT—PCR 功能分析
  • 简介:通过增加外源CaCl2钙离子螯合剂EGTA处理后,研究香蕉幼苗在60mmol/LNaCl人工模拟盐胁迫0、4h、8h、12h、24h48h不同时间下,测定其叶片CaMCa^2+-ATPase基因相对表达量。结果表明,在NaCl胁迫过程中,香蕉幼苗在正常生长条件下,其根叶片CaM基因Ca^2+-ATPase基因均有表达。巴西蕉幼苗根在盐胁迫过程中CaM基因没有发生显著变化,但是粉蕉根却发生了显著变化,这可能与粉蕉耐盐性高于巴西有关。随着盐胁迫时间延长,巴西蕉粉蕉幼苗根Ca^2+-ATPase基因相对表达量均呈现先上升后下降趋势。

  • 标签: 香蕉幼苗 盐胁迫 CaM基因 Ca2+-ATPase基因 荧光定量
  • 简介:启动子是调控外源基因在植物体内表达“开关”。随着植物转基因技术广泛应用,无论是基础研究还是应用研究,人们希望能够充分利用启动子来准确控制外源基因在植物体内表达,使目的基因“开”“关”、表达“多”“少”、在“何地”“何时”表达等。能够听从人指挥,以实现植物育种分子设计。因此,快速分离鉴定植物体内各种特异启动子已经成为植物基因工程研究热点难点。本文在互补末端连接反向PCR(CELI—PCR)技术基础上建立起…种快速分离目的基因全长cDNA启动子序列新方法。该方法利用CELI—PCR进行染色体连续步移,获取足够长目的基因及其上游基因组DNA序列,再根据转录起始位点是目的基因转录本启动子分界点,其下游转录本中外显于可通过RT-PCR扩增,而上游启动子序列则不能被RT-PCR扩增这一特点,借助RT-PCR进行cDNA连续步移,直到获得全长cDNA,确定启动子基因5’非翻译区位置,进而精确定位转录起始位点。从而获取目的基因准确启动子序列全长cDNA序列。因此,建立在CELI,PCR基础上RITIS技术,可绕过繁琐构建cDNA库5'-RACE等方法快速分离目的基因全长cDNA启动子序列。

  • 标签: 启动子 全长CDNA 转录起始位点
  • 简介:本研究利用常规回交育种结合分子标记辅助选择技术,将来自C750抗白叶枯病基因Xa23抗稻瘟病基因pi9聚合到感病杂交稻恢复系闽恢3139中。最后在回交后代中获得了4个双抗稻瘟病白叶枯病改良系ZR21-sk1、ZR21-sk2,ZR21—sk3ZR21-sk4,且其遗传背景恢复率达96%以上。用来自福建省具有代表性24个稻瘟病菌株白叶枯病广致病型菌系P6对改良株系进行人工接菌鉴定,结果表明,聚合了Xa23pi9基因改良系同时抗稻瘟病白叶枯病,且抗性与抗谱与供体亲本C750相似。农艺性状分析显示,改良株系所配组合基本保持闽恢3139农艺性状配合力,可直接应用于生产或作抗性育种亲本。

  • 标签: 分子标记辅助选择 稻瘟病 白叶枯病 杂交稻恢复系 pi9/Xa23基因