简介:目前大多数商品化的DNA测序仪的信号检测系统是基于CCD或PMT。基于CCD的系统需要对CCD进行制冷,其造价相对较高且灵敏度相对较低;基于PMT的系统使用机械扫描来实现多通道检测,其工作稳定性相对较低且工作的机械噪音大。本文提出了新型的DNA测序仪,它采用PMT共焦荧光系统,通过f-θ透镜和光学扫描来实现多通道并行检测。在此新系统中采用标准双链DNA样品:pBR322/HaeIII(使用TO染料)进行了毛细管电泳实验,测得系统的检测限可达:1.1841×10-11mol/L。新型DNA测序仪的工作机械噪声相比基于机械扫描的系统要低得多,且工作稳定性和灵敏度也很高。此系统可应用于基于激光诱导荧光的毛细管阵列和多通道微芯片的电泳检测。
简介:导出病毒的nucleic酸的细胞的察觉到为对病毒感染的早防卫是必要的。在最近的年里,包括周期的GMP安培synthase(cGAS)和gamma-interferon-inducible蛋白质(IFI16),察觉到蛋白质的DNA的发现导致了房间怎么对带DNA染色体的到来的病原体唤起强壮的天生的有免疫力的回答的理解。发信号由DNA传感器刺激了取决于适配器蛋白质圈套(干扰素基因的激发器),到启用抗病毒的蛋白质的表示,包括类型我干扰素。便于有效感染,病毒发展了大量避免策略,指向的主人DNA传感器,适配器蛋白质和抄写因素。在这评论,STING小径的导致病毒的激活上的当前的文学被介绍,我们讨论在这条抗病毒的小径指向不同的步的最近识别的病毒的避免机制。
简介:Chaosgamerepresentation(CGR)isaniterativemappingtechniquethatprocessessequencesofunits,suchasnucleotidesinaDNAsequenceoraminoacidsinaprotein,inordertodeterminethecoordinatesoftheirpositionsinacontinuousspace.Thisdistributionofpositionshastwofeatures:oneisunique,andtheotherissourcesequencethatcanberecoveredfromthecoordinatessothatthedistancebetweenpositionsmayserveasameasureofsimilaritybetweenthecorrespondingsequences.ACGR-walkmodelisproposedbasedonCGRcoordinatesfortheDNAsequences.TheCGRcoordinatesareconvertedintoatimeseries,andalong-memoryARFIMA(p,d,q)model,whereARFIMAstandsforautoregressivefractionallyintegratedmovingaverage,isintroducedintotheDNAsequenceanalysis.ThismodelisappliedtosimulatingrealCGR-walksequencedataoftengenomicsequences.Remarkablylong-rangecorrelationsareuncoveredinthedata,andtheresultsfromthesemodelsarereasonablyfittedwiththosefromtheARFIMA(p,d,q)model.
简介:目的:通过对线粒体DNA1555/1494突变耳聋文献病例进行分析,总结患者听力学特点,探讨影响耳聋程度的相关因素。方法以“线粒体DNA1555/1494突变”和“感音神经性聋”为主题词,检索中文CNKI、万方、维普数据库,英文PubMed数据库,进行文献回顾。对线粒体DNA1555/1494突变耳聋患者病例进行基本信息和听力学相关信息统计,按照性别、基因突变信息、是否应用氨基糖甙类抗生素、用药年龄、用药情况、发病间隔、发病年龄、单倍型、突变异质率以及耳聋程度等相关项目编辑excel表格,按需要导入SPSS19.0软件分析。结果共收集到符合要求的文献39篇,资料完整的线粒体DNAA1555G和C1494T突变携带者324例。线粒体DNAA1555G突变共285例,华裔254例,其他亚裔18例,非亚裔13例,线粒体DNAC1494T突变39例均为华裔。明确使用氨基糖甙类抗生素致聋230例,无氨基糖甙类抗生素使用发生耳聋92例。2例应用氨基糖甙类抗生素药物1年听力正常。统计分析发现用药患者的耳聋程度较未用药患者重(X2=25.414,P<0.05)。无论是否用药,发病年龄与耳聋程度有显著的负相关,而用药后发病间隔与耳聋程度无相关(R=0.054,P>0.05)。另外,线粒体DNA1555/1494突变异质率与耳聋程度显著正相关(R=0.823,P<0.05)。结论多种因素影响mtDNAA1555G/C1494T携带者的临床表现。对于线粒体DNAA1555G/C1494T相关耳聋进行早期耳聋基因诊断有重要的临床意义。对突变携带者,严禁使用氨基糖甙类抗生素。