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271 个结果
  • 简介:本文介绍了用于PCR植物基因组DNA快速制备方法。该方法只需将少量(4~6mg)植物叶片、适量(200μL)TE缓冲液、和粒钨合金珠放入1个2mL离心管,多功能组织细胞研磨器中振动5min破碎组织后,直接取1μLDNA溶液作为PCR模板。本方法具有简单快速、操作效率高、成本低、扩增效果好等优点,特别适合于大量样品基因型检测。

  • 标签: 水稻 DNA制备 PCR
  • 简介:针对多浆旱生植物霸王富含多酚和多糖类物质特点,常规异硫氰酸胍方法基础上进行改进,摸索出霸王叶和根总RNA提取方法。本方法主要通过提取缓冲液中加入4%β-巯基乙醇以去除多酚物质干扰;用2mol/L醋酸钠(pH4.0)、水饱和酚和氯仿:异戊醇(24:1)抽提以去除多糖和蛋白物质。采用该方法提取霸王总RNA纯度高、完整性好,电泳条带清晰,OD260/OD280值1.8~2.0之间,其质量完全可以满足进步分子生物学研究要求。

  • 标签: 霸王 多酚 多糖 改进的异硫氰酸胍法 RNA提取
  • 简介:SSR和SNP被推荐为玉米品种DNA指纹鉴定优选标记技术。本研究选用大面积推广11套玉米杂交及其亲本作为试验材料,基于SNP芯片分型平台和SSR荧光毛细管电泳平台分析比较两标记在玉米品种真实性鉴定中应用。基于上述两检测平台获得3072个SNP位点和40对SSR引物基因型数据,分析比较各个参数。结果显示:(1)两标记数据获得率均较高,3072个SNP位点平均数据获得率为98.4%,40对SSR引物平均数据获得率为99.47%。(2)两标记均具备较高品种区分能力,3072个SNP位点平均MAF(minorallelefrequency)值为0.357,MAF值大于0.30占71%,平均DP(discriminationpower)值为0.515,DP大于0.5占56%;40对SSR引物平均PIC(polymorphisminformationcontent)值为0.605,PIC大于0.51有32对,平均DP值为0.745,DP值大于0.71有29对。(3)两标记位点鉴定样品杂合率、亲子关系方面结果,样品杂合率均介于0.4~0.6之间,平均杂合率分别为0.525和0.514;SNP数据显示符合亲子关系位点百分比介于95.2%~99.9%之间,SSR数据显示符合亲子关系位点介于36~40个之间。综上所述,SSR和SNP两标记在数据完整性、区分品种能力、位点稳定性等方面差别较小。

  • 标签: 玉米 SSR SNP 真实性鉴定
  • 简介:淀粉含量烤烟烟叶醇化品质高低项重要指标,但目前淀粉含量测定方法较多且缺乏系统比较,造成不同测定方法获得结果横向比较性较差。本研究系统地比较了连续流动法、碘显色法、费林试剂滴定法、离子色谱法以及高效液相色谱法5常见淀粉含量测定方法红花大金元和K326烟叶淀粉含量测定中应用。使用5方法测定了两个醇化初期烟叶样品中淀粉含量,采用标准偏差、回收率以及t检验法,比较了烟草行业标准方法连续流动分析法与其他测定方法结果之间差异性。结果表明,与行业标准连续流动法相比,费林试剂滴定法以及酶水解—离子色谱法,测定结果偏高,且准确度偏低;酸水解-高效液相色谱法测定结果偏低,虽具有很高精密度,但准确性不高;而碘显色法测定结果不但表现出较高准确性和精密度,且与连续流动法测定结果之间不存在显著性差异(t

  • 标签: 烟叶 淀粉 连续流动法 碘显色法
  • 简介:为了确保反应体系可行性,以便更好地开展大蒜野生近缘SRAP标记遗传多样性分析,本研究以新疆大蒜野生近缘为材料,采用L16(44)正交法,对其反应体系进行4因素4水平优化试验。结果表明:对大蒜野生近缘PCR扩增影响最大dNTPs浓度,影响最小Taq酶浓度。筛选出15对引物,经过程序和温度筛选,最终确定SRAP反应程序为:94℃条件下预变性1min,其次94℃变性1min、35℃退火1min、72℃延伸1min环境下进行5个循环反应,再与前5个循环相同环境下,提高其退火温度至52℃进行35个循环,最后72℃延伸10min。2μL10×PCRBuffer,dNTPs浓度0.225mmol/L,引物浓度0.250μmol/L,Taq酶用量1.000U,模板DNA用量75.000ng,ddH2O补足20μL,为最佳SRAP-PCR反应体系。研究结果为进步开展大蒜野生近缘遗传多样性分析、亲缘关系鉴定和分子标记辅助育种提供技术支持。

  • 标签: 大蒜野生近缘种 SRAP 正交试验 反应体系
  • 简介:转录组连接基因组遗传信息与蛋白质组,也是基因功能研究基础和出发点。单分子测序技术近年逐渐成熟代测序技术,也称为第三代测序技术,转录组学研究方面较前代测序技术具有独到优势,应用前景广阔。模式植物功能基因组学研究中,全长转录本获得可有力地推进相应基础研究水平,而第三代测序技术为此提供了较好解决方案。本研究就目前技术较为成熟且应用较广泛SMRT等单分子测序技术原理进行了介绍,综述了该技术模式植物转录组学研究中应用现状,对其应用前景进行了展望。

  • 标签: 单分子测序 全长转录组 SMRT 非模式植物
  • 简介:植物叶片中含有的多糖、蛋白质和多酚等物质,很大程度会影响总DNA提取质量。本研究以剑叶虾脊兰(Calanthedavidii)和银带虾脊兰(Calantheargenteo-striata)幼嫩叶片为材料,采用改良CTAB法提取总DNA,设置样品重量(0.05g,0.10g,0.20g)、清洗时间(10min,20min,30min)、水浴温度(25℃,60℃,45℃)、水浴时间(2h,1h,0.5h)4因素3水平正交试验,探究不同因素、不同处理对DNA得率和纯度影响,以获取最佳提取条件。研究发现剑叶虾脊兰和银带虾脊兰DNA最佳提取条件均为:样品重量0.2g、清洗时间30min、水浴温度60℃、水浴时间2h。该处理下剑叶虾脊兰DNA产率最高为490.5ng/μL,A260/A280均值为1.953;该处理下银带虾脊兰DNA产率最高为139.83ng/μL,A260/A280均值为1.967。各因素对剑叶虾脊兰DNA产率影响次序为:样品重量>清洗时间>水浴温度>水浴时间;各因素对银带虾脊兰DNA产率影响为:样品重量>水浴温度>清洗时间>水浴时间。本研究为虾脊兰属分子生物学研究提供科学依据。

  • 标签: 虾脊兰属植物 正交试验 DNA提取方法优化 分子生物学
  • 简介:本研究以广西野生金线莲为材料,对植株形态和授粉特性进行了观测,研究了蒴果成熟度、培养基无机盐浓度、植物生长调节剂及有机添加物对无菌播种萌发影响。结果表明:广西金线莲植株外形优美,人工授粉结实率达到84.8%;蒴果成熟度对灭菌消毒和种子萌发有显著影响,授粉后生长75~90d蒴果为最佳外植体材料;相较于MS和1/4MS,1/2MS培养基上种子萌发最快;培养基中细胞分裂素6-BA、ZT和KT对种子萌发作用不明显,生长素NAA为0.3mg/L时对种子萌发有明显促进作用;添加香蕉汁对种子萌发及之后生长具有显著促进效果。

  • 标签: 广西金线莲 种源特性 无菌播种 萌发
  • 简介:应用AFLP、SRAP、RAPD、SSR及同工酶等5标记构建326个标记位点白菜遗传图谱和81个DH株系群体,采用MapQTL5软件与MQM作图法对白菜叶片数与单株重进行QTL定位及遗传效应分析。结果表明,通过两个不同年份试验,10个连锁群上共检测到20个QTL,主要分布R5、R9连锁群上:控制叶片数有5个,控制单株重有15个;其中,获得两年稳定表达QTL共6个:控制叶片数有1个,控制单株重有5个;另外,估算了单个QTL遗传贡献率和加性效应,发现各QTL加性效应各不相等,各位点遗传贡献率介于9.4%~39.6%之间;控制叶片数和控制单株重QTL位点表现为紧密连锁或相似的位置,主要集中R5连锁群上,这与二者性状表型值相关系数很高相致。这将为白菜品种改良中产量等性状分子标记辅助选择提供理论依据。

  • 标签: 大白菜 DH群体 白菜叶片数 单株重 QTL
  • 简介:杂种不育性繁殖隔离主要形式,数年来,尽管繁殖隔离广泛生物体体进化生物学中已经成为个关键问题,但仅有几个基因在繁殖隔离中被鉴定。亚洲分为两个亚种,籼稻(indica)和精稻(japonica)。这两个亚种杂交通常为高度不育,水稻胚个特殊种群具有广泛亲和性,与籼稻和精稻进行回交时能产生高度育性杂交本研究中,我们利用图位克隆方法,

  • 标签: 繁殖障碍 杂交种 亲和性 籼稻 调控因子 杂种不育性
  • 简介:本研究以甜瓜杂交新品种‘西州密25号’和‘西州密17号’及其亲本种质为试验材料,利用SSR(simplesequencerepeats)分子标记检测技术,并结合大田传统鉴定方法对其种子纯度及真实进行了分析研究。结果表明,从18对SSR引物中筛选得到多对特异性引物可以鉴定出‘西州密25号’与‘西州密17号’杂交纯度。‘西州密25号’三批种子纯度分别为98.42%、99.41%、99.38%;‘西州密17号’种子纯度为99.22%。SSR分子标记鉴定结果与‘西州密25号’和‘西州密17号’大田植物学形态特征鉴定结果符合率高达99%以上。SSR分子标记方法可以准确鉴定出杂交纯度及真实性,且大大缩短鉴定周期,可为开展‘西州密25号’和‘西州密17号’甜瓜新品种杂交纯度室内鉴定快速检测提供技术支撑。

  • 标签: 甜瓜 西州密17号 西州密25号 SSR 种子纯度
  • 简介:为了筛选陆海杂交后与海岛棉具有相近遗传背景材料,利用海岛棉做轮回亲本,通过回交使杂交后代背景与海岛棉致,将具有供体陆地棉目标性状,分别构建陆地棉和海岛棉指纹图谱,利用指纹图谱进行杂交后代遗传背景选择。选取供体陆地棉与三受体海岛棉作为实验材料,采用分子标记技术,对实验室已有的1300对SSR引物进行筛选,对扩增条带清晰、重复性好且分辨能力强核心引物进行统计分析,确定不同棉花材料指纹图谱。筛选出63对陆地棉和海岛棉之间差异性大、多态性好引物,分别分布于棉花26条染色体,并分别构建了供体陆地棉和三海岛棉指纹图谱。筛选出这63对引物具有良好鉴别和区分能力,适用于作为首选核心引物。本研究为开展海岛棉与陆地棉杂交后利用回交快速获得纯合遗传背景杂交后代提供了研究思路。

  • 标签: 陆地棉 海岛棉 SSR 指纹图谱 快速回交
  • 简介:为研究株诺丽内生真菌M50抗菌和抗肿瘤生物活性并鉴定此菌株,本研究对实验室保藏诺丽内生真菌M50,采用ITSrDNA测序鉴定内生真菌M50;以金黄色葡萄球菌、大肠杆菌、沙门氏菌和枯草芽孢杆菌为指示细菌,采用滤纸片扩散法对其次生代谢产物抗菌性进行测试;以新暗色柱节孢菌、辣椒疫霉、西瓜枯萎病菌和拟盘多毛孢为指示真菌,采用平板对峙法对其抑菌性进行测试;以肝癌细胞株SMMC-7721、Lewis肺癌、前列腺癌细胞株PC-3为指示癌细胞,采用MTT法对其次生代谢产物抗肿瘤活性进行测试。内生真菌M50鉴定为Leptoxyphiumfumago;金黄色葡萄球菌、大肠杆菌、沙门氏菌和枯草芽孢杆菌抑菌圈大小分别为(13.16±0.22)mm、(12.06±0.31)mm、(7.89±0.17)mm和(11.05±0.22)mm;新暗色柱节孢菌、辣椒疫霉、西瓜枯萎病菌和拟盘多毛孢抑制率分别为50.00%、18.36%、12.35%和46.91%;肝癌细胞株SMMC-7721、Lewis肺癌、前列腺癌细胞株PC-3半抑制浓度分别为45.46μg/mL、53.33μg/mL、80.48μg/mL。说明内生真菌M50具有广谱抗菌和抗肿瘤生物活性。本研究为解决药源问题带来新希望和契机,为开发诺丽新产品提供理论依据和技术支撑。

  • 标签: 诺丽 内生真菌 次生代谢产物 抑菌 抗肿瘤
  • 简介:为培育食味品质优良、综合丰产性好粳稻新品种,本研究以高产粳稻品种武香粳14作母本,以食味品质优良粳稻品种关东194(含有控制低直链淀粉含量和暗胚乳突变基因Wx-mq)作父本配制杂交组合。通过比较Wx-mq与其位于第6染色体上等位基因Wx-b,Wx-a,wxDNA序列,发现Wx-mq基因外显子4和外显子5上存在两个碱基突变,外显子4上G-A突变产生了NIaⅢ酶切位点,并设计合成了能区分含或不含Wx-mq纯合基因型和杂合基因型CAPS标记。利用该标记对武香粳14/关东194衍生F5、F6株系进行辅助选择,筛选含Wx-mq纯合基因型单株。成熟后对胚乳淀粉性质调查结果与分子检测结果完全致,分子标记辅助选择效果达100%。这样我们就成功培育了食味品质优良、综合丰产性好粳稻新品种南粳46。

  • 标签: 分子标记辅助选择 优良食味 水稻 酶切扩增多态性序列
  • 简介:简要介绍了5传统、最常用DNA分子标记(RFLP、RAPD、AFLP、SSR和SNP)技术原理及它们优缺点,也总结了TRAP这种新产生分子标记技术原理、优点及应用前景。综述了这几类分子标记在花生种质进化、遗传多样性分析、分子图谱构建及抗虫、抗病等方面的研究。利用SSR和RAPD标记能够发现野生和栽培多态性进而实现分子标记对花生遗传多样性分析,可以将许多花生品种分为不同品种群,能够对花生进行种质进化研究。RFLP和AFLP技术利于花生图谱构建,利用DNA中特定限制性酶切位点上碱基对改变及酶切位点之间分予重排,可以发现花生品种间DNA许多多态性位点,进而绘制分子标记图谱。AFLP技术花生青枯菌和花生抗黄曲霉研究方面有很大进展。RAPD技术花生根瘤菌、花生线虫病等方面已有显著进展。最后对分子标记在花生育种中应用前景进行了简单展望。

  • 标签: 花生 分子标记 辅助育种
  • 简介:本研究利用以0—153为父本和SGK9708为母本构建196个陆地棉重组自交系(F6:8)为材料对棉籽油分含量和蛋白质含量进行了遗传分析和QTL定位。通过四个环境下群体材料棉籽油分含量和蛋白质含量分析表明棉籽油分含量和蛋白质含量均为典型数量性状,其中棉籽油分含量存在超低亲本超亲分离,而其蛋白质含量呈现超高亲本超亲分离。相关性分析显示棉籽油分含量和蛋白质含量呈极显著负相关,同步提高两者棉籽含量较为困难。基于包含186个标记,总长827.84cM,标记间平均距离4.45cM,覆盖棉花基因组18.6%遗传连锁图谱,应用WinQTLcart2.5软件对四个环境下棉籽油分含量和蛋白质含量进行了QTL定位,共检测到8个油分含量QTLs,解释表型变异5.42%~13.15%,其中稳定QTL1个。4个蛋白质含量QTLs,解释表型变异4.35%~14.93%。本研究结果可为进行陆地棉种子营养品质性状分子遗传改良奠定基础。

  • 标签: 陆地棉 重组自交系 棉籽油分 蛋白质 QTL
  • 简介:大豆主要油料作物,起源于中国,我国种质资源十分丰富。大豆孢囊线虫(SCN)(HeteroderoglycinesIchinohe)土传定居性内寄生线虫,不易防治,常引起大豆黄萎病等病害,大豆生产上危害最大病害之。大豆孢囊线虫病生理小种多达十几种,我国,大豆孢囊线虫病病原主要为3、4号生理小种。大豆抗孢囊线虫研究世界上大豆抗病育种研究热点之本课题前期研究中,根据已克隆植物抗孢囊线虫病基因保守序列设计引物,对经常规鉴定为抗(感)孢囊线虫3号生理小种15个大豆品种基因组DNA进行PCR扩增,大豆抗病品种中获得条大豆抗孢囊线虫特异条带。本研究在此基础上利用该对引物,对高抗孢囊线虫3号小种北京小黑豆基因组DNA进行扩增,并克隆了特异扩增片段,命名为RSCN3,经测序及BLAST分析,发现其DNA序列与GenBank、EMBL、DDBJ、PDB中大豆似受体激酶RHG4、水稻TMK(leucinerichprotein,receptor-likekinase)基因等均有80%以上同源性。根据该DNA序列推测其氨基酸序列,在其序列中共找到21个亮氨酸,将该序列与蛋白质序列同源性进行比较,结果发现与植物中受体激酶、富含亮氨酸重复蛋白激酶有较高同源性。因此推测RSCN3克隆片断为个与受体激酶有类似作用抗病相关基因RGA,并将该序列登录到GenBank中,登录号为:AY580161。

  • 标签: 大豆 孢囊线虫 抗病基因同源序列 基因克隆
  • 简介:DNA条形码技术基于物种种内特异性和间多样性利用个或几个标准DNA片段(DNAbarcode)构建生物鉴别数据库。本研究根据GenBank中豆科牧草matK和rbcL基因核苷酸序列,设计4对通用引物对豆科五个主要牧草属(苜蓿属Medicago,车轴草属Trifolium,红豆属Onobrychis,小冠花属Coronilla,野豌豆属Vicia)牧草进行扩增。扩增产物进行测序和分析,筛选出六牧草四个标记位点5’端和3’端保守序列,并对各标记位点保守区内核苷酸进行单核苷酸多态性(SNPs)单倍型分析,数据表明:matK1、matK2、matK3均有5个单倍型,五个牧草属有其特有单倍型;rbcL基因有6个单倍型,车轴草属白三叶和红三叶有其特有单倍型。根据matK(matK1,matK2,matK3)和rbcL基因筛选四个标记位点为六牧草建立了相对应特异DNA识别码。说明matK和rbcL组合后可作为豆科六牧草潜在条形码。

  • 标签: 单倍型组合 MATK基因 RBCL基因 DNA条形码