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  • 简介:目的基于焦磷酸测序技术建立甲型H1N1流感病毒血凝素(HA)基因裂解位点突变的快速检测方法.探讨其临床应用价值。方法采用RT-PCR扩增甲型H1N1病毒血凝素基因中的HA片段.在生物信息学分析的基础上,针对甲型H1N1病毒血凝素基因含有裂解位点序列片段.分别设计一套生物素标记的PCR引物和测序引物.运用焦磷酸测序技术对含甲型H1N1病毒裂解位点基因片段进行序列测定,同时分析青岛地区甲型H1N1流感病毒流行株的裂解位点基因特征。结果建立了基于焦磷酸测序技术检测甲型H1N1流感病毒裂解位点突变方法.实现甲型H1N1流感病毒HA基因裂解位点的高通量检测,青岛地区甲型H1N1流感病毒裂解位点344氨基酸序列没有发生变异。结论本研究所建立的方法具有自动化程度高和结果准确等特点,适用于甲型H1N1流感病毒裂解位点进行快速高通量检测。

  • 标签: 焦磷酸测序技术 甲型H1N1流感病毒 血凝素(HA)基因 突变 裂解位点
  • 简介:摘要 : 目的 :研究进展期胃肠道肿瘤患者 尿苷二磷酸葡糖醛酸转移酶 1A1*28(UGT1A1*28) 基因多态性与伊立替康化疗的毒性反应关系。 方法 :收集我科 45 例进展期胃肠道肿瘤患者化疗前外周血 2ml ,检测 UGT1A1*28 基因多态性。 33 例予以 FOLFIRI 方案, 12 例予以 FOLFOX 方案治疗。观察并记录化疗毒性反应及化疗前胆红素水平。统计分析 UGT1A1*28 基因型与化疗毒性反应及化疗前胆红素水平的关系。 结果 : 45 例患者中 UGTIA1*28 基因启动子区 TA序列 6次重复,为野生 型 (TA)6/ (TA)6 共 34 例 , 化疗前胆红素( 11.6±5.7 ) umol/l ; TA序列 6次和 7次重复, 为 杂合突变型 (TA)6 / (TA)7 共 11 例 , 化疗前胆红素( 12.0±4.0 ) umol/l 。 FOLFIRI 方案组: (TA)6/ (TA)6 共 23 例;未发现 Ⅲ级以上白细胞及粒细胞减少、贫血及血小板减少 , Ⅲ 级以上延迟性腹泻 3 例。 (TA)6 / (TA)7 患者 10 例; 未发现 Ⅲ级以上白细胞、中性粒细胞及血小板减少 ,Ⅲ 级以上血红蛋白减低 1 例,Ⅲ级以上延迟性腹泻 4 例。 FOLFOX 方案组 未发现 Ⅲ级以上血小板减少、贫血、白细胞及中性粒细胞减少;发现Ⅲ级以上腹泻 1 例。 FOLFOX 与 FOLFIRI 组比较,后者严重延迟性腹泻发生率较高,但无统计学意义,( P=0.577 )。 FOLFIRI 组中 UGT1A1*28 (TA)6/ (TA)6 与 (TA)6/ (TA)7 比较,后者严重延迟性腹泻发生率高,但无统计学意义,( P=0.161 )。 结论 : UGT1A1*28 野生基因型 TA6/ 6在中国人中分布频率较高,而突变型发生率较低 。 UGT1A1*28 基因型改变可能提示患者使用伊立替康后发生严重延迟性腹泻。 UGT1A1*28 基因型与化疗前胆红素水平无关。

  • 标签: UGT1A1 基因多态性 伊立替康 延迟性腹泻
  • 简介:药物遗传基因组学是结直肠癌个体化治疗领域的研究热点。伊立替康在体内转化为活性成分SN38后主要经UGT1A1解毒成SN38G排出体外。UGT1A1发生*28或*6突变后功能下降,需减少伊立替康剂量以避免毒副反应。

  • 标签: UGT1A1基因多态性 伊立替康 结直肠癌
  • 简介:近年来,恶性肿瘤已成为一种发病率较高的慢性病,尤其是结直肠癌的发病率和死亡率呈逐渐上升趋势。目前伊立替康联合5-氟尿嘧啶与亚叶酸钙方案(FOLFIRI)治疗晚期结直肠癌疗效显著。但由于伊立替康严重的不良反应及明显的个体差异,该方案在临床应用中受到一定限制。伊立替康在体内代谢过程中受多种酶的影响,其中尿苷二磷酸葡糖醛酸转移酶1Al(UGT1A1)在伊立替康体内代谢过程中起到核心作用。但随着深入研究,伊立替康及其代谢物的血药浓度在预测伊立替康相关不良反应甚至个体化给药方面与基因多态性检测同样重要。因此,本文就影响伊立替康个体化治疗的因素作一综述。

  • 标签: 伊立替康 UGT1A1 血药浓度 个体化治疗
  • 简介:摘要目的确定早发性严重视网膜营养不良(EOSRD)一家系的致病基因突变。方法回顾性临床研究。2018年8月于河南省立眼科医院检查确诊的一个汉族EOSRD家系中1例患者及3名家系成员纳入研究。详细采集患者病史后,对受试者行最佳矫正视力(BCVA )、裂隙灯显微镜联合前置镜、眼底彩色照相、频域光相干断层扫描(SD-OCT)及全视野视网膜电图(ff-ERG)检查。采集受试者外周静脉血5 ml,提取全基因组DNA。应用包含441个致病基因的遗传眼病捕获芯片进行靶向捕获富集高通量测序,对明确的致病突变位点进行Sanger测序验证;应用分析软件对突变位点进行生物信息学分析。结果先证者女,6岁,于1岁以后出现双眼夜间视力差。双眼BCVA均为0.1。视盘颜色稍淡;视网膜血管管径稍变细,血管弓外视网膜可见广泛色素改变。SD-OCT检查可见双眼黄斑中心凹处外界膜、椭圆体带及嵌合体带结构欠清、断续;中心凹外可视区神经上皮外丛状层、外核层、外界膜、椭圆体带及嵌合体带逐渐消失,色素上皮层厚度欠均匀。ff-ERG检查,双眼视锥、视杆系统功能严重下降。基因检测结果显示,先证者Tubby样蛋白1 (TULP1基因存在c.921C>A纯合突变,环核苷酸门控通道β1 (CNGB1基因存在c.3121C>T、c.3488G>A复合杂合突变。氨基酸保守性分析结果显示,上述3个突变位点在多个物种中均高度保守。生物信息学分析结果显示,TULP1基因c.921C>A (p.Cys307*)在蛋白质保守区出现翻译终止,CNGB1基因c.3121C>T (p.Arg1041Trp)、c.3488G>A (p.Gly1163Glu)在蛋白质保守区出现氨基酸极性变化,导致蛋白质空间结构产生较大改变。结论TULP1基因c.921C>A纯合突变、CNGB1基因c.3121C>T和c.3488G>A复合杂合突变为该EOSRD家系的突变位点。

  • 标签: 视网膜营养不良 基因 突变 TULP1基因 CNGB1基因
  • 简介:摘要目的分析一例肉碱棕榈酰转移酶1A(carnitine palmitoyl transferase 1A,CPT1A)缺乏症患儿的临床资料、代谢筛查和基因变异特征,探讨该病的诊断要点和分子遗传学发病机制。方法收集2018年5月就诊于湖南省儿童医院神经内科的一例以癫痫起病的CPT1A缺乏症患儿的临床资料及其血液酰基肉碱结果,采集患儿和父母外周血,提取DNA行基因检测。结果血液酰基肉碱谱提示游离肉碱(carnitine 0,C0)升高,C0/(C16+C18)明显升高。基因测序结果显示患儿CPT1A基因c.1846G>A和c.2201T>C复合杂合变异,母亲携带c.1846G>A变异,父亲携带c.2201T>C变异。结论本例CPT1A缺乏症患者以癫痫为第一临床表现发病,国内外暂未见相关报道。血液酰基肉碱分析是筛查和诊断CPT1A缺乏症的必要条件,二代测序有助于该病的确诊。CPT1A基因c.1846G>A和c.2201T>C变异可能为该患儿致病原因,c.1846G>A变异为未报道过的新变异,丰富了CPT1A基因变异谱。

  • 标签: 肉碱棕榈酰转移酶1A缺乏症 CTP1A基因 变异 癫痫
  • 简介:目的:通过构建DKK1的靶向小干扰RNA(smallinterferingRNA),探讨干扰DKK1基因的表达和对食管癌ECA109及EC1细胞系增殖的影响。方法:转染DKK1siRNA于食管癌细胞系ECA109、EC1,应用蛋白免疫印迹方法检测转染前后细胞中DKK1的蛋白表达变化。食管癌细胞系ECA109及EC1成功干扰DKK1表达后,应用CCK-8法检测癌细胞增殖变化,平板克隆法检测癌细胞的克隆形成能力变化。结果:食管癌细胞系转染DKK1siRNA后,ECA109中DKK1蛋白表达降低48.62%(P〈0.01),EC1中DKK1蛋白表达降低50%(P〈0.01)。在CCK-8法检测癌细胞增殖变化实验中,DKK1siRNA转染后24h、48h及72h,相比阴性对照组,细胞增殖能力显著降低。平板克隆实验中,DKK1siRNA转染后,ECA109细胞克隆均数(77.53±4.948)低于空白对照组(44.2±7.704),克隆率下降42.98%,而EC1细胞克隆均数(71.67±5.239)低于空白对照组(36±2.646),克隆率下降49.76%。结论:干扰DKK1的表达能够抑制食管癌细胞的增殖,DKK1可能成为抑制食管癌增殖的分子靶点。

  • 标签: 食管癌 DKK1 增殖
  • 简介:摘要目的探讨长链非编码RNA(lncRNA)Sox2OT过表达对Aβ1-42诱导PC12细胞损伤及PI3K/Akt通路的影响。方法选取大鼠嗜铬神经瘤细胞株(PC12),利用Aβ1-42对PC12细胞进行处理,建立AD的细胞模型。将Aβ1-42诱导前的PC12细胞设为空白组;将Aβ1-42诱导后的PC12细胞分为control组、Sox2OT过表达(p-Sox2OT)组、p-Sox2OT空载体(p-NC)组、抑制Sox2OT表达(si-Sox2OT)组和si-Sox2OT空载体(si-NC)组。使用噻唑蓝(MTT)方法对细胞的增殖活性进行检测;采用流式细胞术对转染后的细胞周期和凋亡率进行检测;采用Western blot检测PI3K/Akt通路蛋白的表达。结果MTT结果显示,与空白组(99.67±10.50 )相比,control组(29.33±5.51 )的细胞增殖率显著降低(t=10.27,P<0.05)。RT-qPCR结果显示,与control组(0.52±0.06)相比,p-Sox2OT组(2.19±0.16)中的Sox2OT的mRNA表达水平显著升高(t=16.93,P<0.05),si-Sox2OT组(0.22±0.02)中的Sox2OT的mRNA表达水平显著下降(t=15.28,P<0.05);与p-NC组(0.53±0.12)相比,p-Sox2OT组(2.19±0.16)中的Sox2OT的mRNA表达水平显著升高(t=16.25,P<0.05);与si-NC组(0.51±0.09)相比,si-Sox2OT组(0.22±0.02)中的Sox2OT的mRNA表达水平显著下降(t=16.93,P<0.05);control组与p-NC组以及si-NC组间的差异无统计学意义(P>0.05)。此外,p-Sox2OT组细胞的增殖能力(145.00±5.12)显著高于si-Sox2OT组(23.33±4.93)、control组(55.00±5.00)、si-NC组(57.33±8.51)以及p-NC组(56.00±5.57)(t=29.65,21.78,27.55,21.35,均P<0.05)。Control组与p-NC组以及si-NC组间细胞增殖率的差异不具有统计学意义(P>0.05)。细胞周期检测实验显示,p-Sox2OT组G1期的细胞数量显著低于control组和p-NC(t=9.80,8.57;均P<0.05),而p-Sox2OT组G2期的细胞数量与control组和p-NC组相比却显著升高(t=11.02,10.25;均P<0.05);si-Sox2OT组G1期的细胞数量显著高于control组和si-NC组(t=8.22,3.11,均P<0.05),而G2期的细胞数量与control组和si-NC组相比却显著下降(t=6.32,5.33;均P<0.05);control组与p-NC组以及si-NC组间的细胞周期差异无统计学意义(均P>0.05)。在S期中,只有p-Sox2OT组与control组之间的差异有统计学意义(t=1.84,P<0.05)。p-Sox2OT组细胞凋亡率[(3.66±0.26)%]低于si-Sox2OT组[(14.25±0.80)%]、control组[(8.46±0.44)%]、si-NC组[(8.78±0.44)%]以及p-NC组[(8.40±0.21)%](t=21.81,16.27,20.32,21.35,均P<0.05)。Control组与p-NC组以及si-NC组间的细胞凋亡率差异不具有统计学意义(P>0.05)。Western blot结果显示,p-Sox2OT组中p-PI3K和p-Akt蛋白的表达明显高于p-NC(P<0.05);与si-NC组相比,si-Sox2OT组PC12细胞中p-PI3K和p-Akt蛋白的表达显著下降(P<0.05)。结论lncRNA Sox2OT可以通过调控PI3K/Akt通路促进Aβ1-42诱导的PC12细胞的增殖,抑制细胞的凋亡。

  • 标签: 长链非编码RNA Sox2OT 阿尔茨海默病 PI3K/Akt Aβ1-42
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  • 简介:摘要本文报道1个连续3次妊娠早孕期超声均提示胎儿四肢短小家系的遗传学分析。取第2次妊娠引产胎儿组织行染色体核型分析及全外显子组测序,结果提示DYNC2H1基因存在EX64-EX83 Del及c.8190G>T杂合变异。实时荧光定量聚合酶链反应及Sanger测序验证2个变异分别遗传自表型正常的父亲和母亲,前者为疑似致病性变异,后者为临床意义未明变异。综合病史及变异基因特点,高度怀疑胎儿为常染色体隐性遗传的复合杂合变异导致的短肋多指综合征Ⅲ型。第3次妊娠胎儿引产后采用实时荧光定量聚合酶链反应和Sanger测序进行验证,结果与第2次妊娠胎儿一致。由于第2、3次妊娠胎儿表型相似,提示DYNC2H1基因EX64-EX83 Del及c.8190G>T杂合变异可能是该家系短肋多指综合征Ⅲ型的致病变异。

  • 标签: 短肋多指(趾)畸形综合征 胞浆动力蛋白类 骨软骨发育不良 肋骨 杂合子 遗传变异 全外显子组测序
  • 简介:摘要1岁9月龄男性患儿存在胎儿期宫内发育迟缓、小头畸形、小脑发育不良和体格发育迟缓,同时表现为早发的联合免疫缺陷、小肠结肠炎及骨髓衰竭,进而合并严重感染,出现巨细胞病毒感染所致坏死性视网膜综合征及大肠埃希菌败血症。经基因检测分析发现DKC1基因半合子错义变异c.146C>T(p.Thr49Met),该变异遗传自母亲,且该变异为Hoyeraal-Hreidarsson综合征已知的致病性变异。

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  • 简介:1例55岁女性患者因高脂血症规律服用阿托伐他汀钙片20mg,1次/d。2年后双小腿出现瘀斑伴胀痛、麻木,实验室检查示血清肌红蛋白682μg/L、肌酸激酶1007U/L。同期患者未服用其他药物。考虑为阿托伐他汀钙片相关横纹肌溶解,停用该药,给予对症支持治疗。20d后患者症状消失,血清肌红蛋白和肌酸激酶水平恢复正常。发生横纹肌溶解后行他汀类药物肌损伤相关有机阴离子转运多肽OATP的编码基因SLCO1B1C521T检测,结果为TT型(非突变基因型),提示OATP-SLCO1B1C521T基因型不能完全预测他汀类药物的肌毒性。

  • 标签: 羟甲基戊二酰辅酶A还原酶抑制剂 横纹肌溶解 基因学
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  • 简介:摘要PHC的形成是多基因、多步骤,并在遗传和环境因素等作用影响的结果。PHC的发生与其易感相关基因的SNP密切相关,主要集中在DNA损伤修复基因、药物代谢酶基因等方面。其中,XPD是核苷酸切除修复家族中重要成员,为多功能基因;而CYP2E1、GSTM1是致癌物代谢的一相酶和二项酶,参与多种致癌物的代谢活化过程。XPD、CYP2E1及GSTM1基因的表达受多种因素影响,存在多种多态性,与肝癌易感性间存在密切关系。

  • 标签: 肝细胞性肝癌 XPD CYP2E1及GSTM1基因 遗传易感性
  • 简介:摘要目的实时荧光定量PCR检测多发性骨髓瘤患者WT1和MDR1基因的表达水平,并探讨其临床意义。方法构建实时荧光定量PCR检测WT1和MDR1基因表达水平技术,检测30例不同分期多发性骨髓瘤患者血清WT1和MDR1表达水平,并对其表达量进行统计学分析。结果多发性骨髓瘤患者WT1和MDR1表达显著高于对照组(P<0.05),且两者与患者分期显著相关,其中,WT1基因在Ⅲ期与Ⅰ期、Ⅱ期比较中具有显著性差异(P<0.05),MDR1基因在Ⅰ期、Ⅱ期、Ⅲ期两两比较中均具有显著性差异(P<0.05)。另外,WT1和MDR1基因表达水平呈现相关性(P=0.008),且两者均与β2-微球蛋白水平呈正相关,P值分别为0.006和0.034。结论WT1和MDR1基因表达水平可以作为多发性骨髓瘤患者疾病进程的检测指标。

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  • 简介:目的探讨广西扶绥县肝癌高发区壮族人群谷胱甘肽转硫酶GSTM1和GSTT1基因多态性在肝癌家族聚集性中的作用,以及一级亲属与先证者之间HCC易感性的关系。方法采用病例一对照研究方法,收集21个广西扶绥县壮族肝癌家系76例,以及该地区21个对照家系68例,采用多重PCR技术和凝胶成像分析方法,对入选者GSTM1和GSTT1基因型进行检测,用ELISA法检测HBsAg,并将实验结果与临床资料相结合,进行统计学分析。结果(1)GSTM1基因空白型在肝癌家系组、对照家系组之间的频率分别为67.1%和36.8%(P=0.000);GSTT1基因空白型在肝癌家系组、对照家系组之间的频率分别为40.8%和19.1%(P=-0.005);GSTM1和GSTT1基因同时缺失在肝癌家系组、对照家系组的频率分别为31.6%和2.9%(P=0.000)。②将GSTM1及GSTT1基因同时表达型为基准计算两基因联合作用的危险度,GSTM1基因缺失GSTT1基因表达型、GSTM1基因表达GSTT1基因缺失型、GSTM1基因及GSTT1基因联合缺失型的OR值分别为0.102、0.210和3.092。(3)GSTM1基因空白型在先证者与其直系亲属之间的频率分别为71.4%和65.5%(P=0.620),GSTT1基因空白型在先证者与其直系亲属之间的频率分别为47.6%和38.2%(P=0.454)。GSTM1和GSTT1基因同时缺失在先证者与其直系亲属之间的频率分别为33.3%和30.9%(P=-0.839),差异均无统计学意义(P〉0.05)。结论(1)GSTM1和GSTT1基因的多态性与肝癌家族聚集性相关;(2)GSTM1和GSTT1基因联合缺失与HCC的发生呈显著正相关,且两基因可能具有协同作用;③直系亲属与先证者HCC发生率无差别。

  • 标签: 肝肿瘤 谷胱甘肽转硫酶M1 谷胱甘肽转硫酶T1 家系 基因多态性