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302 个结果
  • 简介:用高感甘薯茎线虫病甘薯品种徐薯18高抗茎线虫病徐78-1杂交,得到其F1分离群体。根据连续3年抗病鉴定结果,从中挑选出8个高抗8个高感茎线虫病株系,构建抗病池感病池。分别以抗感池基因组DNA模板,用225对SRAP引物组合进行PCR扩增,其中77对引物组合在抗、感池间表现出多态性。通过一组小群体进一步筛选,有4对引物组合认为甘薯茎线虫病抗性基因相关。这4对引物组合分别对2个亲本、抗感池F1分离群体中65个抗病株系79个感病株系基因组DNA进行SRAP分析,有2对引物组合(a5b12a9b11)各获得1甘薯茎线虫病抗性基因紧密连锁分子标记SP1SP2,它们抗甘薯茎线虫病基因遗传距离分别为4.86cM4.17cM。获得分子标记对克隆抗病基因利用分子标记辅助选择提高育种效率具有重要意义。

  • 标签: 甘薯 茎线虫病 SRAP技术 分子标记
  • 简介:利用10对SSR引物对南宁地区5个金花茶种群进行遗传多样性分析,探讨金花茶边缘种群及变种小果金花茶遗传多样性,金花茶合理保护提供科学依据。结果显示:小果金花茶平均等位基因数(A)、有效等位基因数(Ae)、期望杂合度(He)观测杂合度(Ho)分别为4.40、2.433、0.5330.429,表明小果金花茶具有较低水平遗传多样性。STRUCTURE聚类分析显示,5个金花茶种群按照两变种分为2个组。AMOVA结果遗传分化系数(FST)均表明两变种间存在很大遗传分化。位于平果县坡造乡金花茶边缘种群具有最低水平遗传多样性(PPB=50%,A=1.70,Ho=0.100),主分布区种群间存在很大遗传分化。基于以上结果表明,小果金花茶和平果县坡造乡边缘种群应当作为独立保护单元保护起来。

  • 标签: 小果金花茶 金花茶 遗传多样性 遗传分化 边缘种群
  • 简介:简单重复序列(SSR)广泛存在于基因组中,是亲缘关系分析、DNA指纹图谱构建和遗传多样性研究领域中非常重要遗传标记之一。红豆树群体已处于濒危状态,且属无参基因组,其近缘种开发SSR引物亦很少,满足红豆树遗传多样性研究及制定合理保护策略,本研究基于SLAF-seq(specific-locusamplifiedfragmentsequencing)技术对天然群体中典型红豆树进行简化测序,利用MISA软件对测序获得所有SLAF片段进行SSR位点搜索,并对SSR位点特征进行统计分析,最后利用PrimerPremier5.0软件进行引物批量设计。与日本晴水稻测序数据相比,红豆树参考基因组双端比对效率90.14%,酶切效率92.37%,说明SLAF建库正常;测序Q3092.32%,GC含量37.17%,说明达到测序要求。本研究共获得6426462reads592221个SLAF标签,其中16653个多态性SLAF标签,含有17868个SSR位点,平均每6.98kb就分布有1个SSR位点。不同核苷酸重复类型基元类型数量及SSR位点数量间差异较大,除单核苷酸外,二、三核苷酸重复类型数量较多,分别占总SSR位点17.15%15.02%,其中AT/TAGAA/TTC基元重复数量最多,分别为1090个(43.1%)349个(15.2%)。通过批量引物设计共得到2817对引物,以二、三核苷酸类型较多,两者所占比例高达94.8%。结果表明:SLAF-seq技术可以很好应用于红豆树(无参基因组)SSR位点开发,基于简化基因组测序数据发掘SSR位点能够为SSR分子标记开发提供信息,并有助于后续群体遗传多样性交配系统分析等。

  • 标签: 红豆树 SLAF-seq SSR 分布 位点分析
  • 简介:探究大豆应答非致病菌(Bipolarismaydis)胁迫分子机制,将玉米小斑病菌接种于3周龄大豆苗。取48hpi大豆叶片以TCA/丙酮法提取蛋白质,利用蛋白质双向电泳技术分离蛋白,串联质谱(MS+MS/MS)鉴定蛋白质再结合生物信息学技术进行蛋白质功能分析。结果显示:分离到大豆苗期叶片总蛋白点1300+15个,其中,差异表达(2倍以上,P值〈0.05)蛋白质点18个,除2个蛋白点未成功测序,其余16个差异蛋白点经GO分析可知,差异表达蛋白质功能主要涉及光合作用、胁迫应激非寄主抗性响应,如核酮糖1,5-二磷酸羧化酶、病程相关蛋白PR-10细胞骨架结构相关蛋白profilin-2。同时,由测序结果推测:非致病菌(玉米小斑病菌)胁迫,大豆通过降低光合作用相关蛋白能量代谢相关蛋白表达,来增强防御相关蛋白非寄主抗性相关蛋白表达。

  • 标签: 大豆 应答 玉米小斑病菌 胁迫 双向电泳
  • 简介:用超级杂交稻协优9308母本协青早A保持系协青早B父本恢复系中恢9308杂交,以单粒传方法建立含281个株系重组自交系(RIL)群体。选用695对简单重复序列(SS鼬引物进行亲本多态性筛选,共有186对检测到多态性,频率26.8%。构建成水稻分子遗传图谱共包含163个标记座位,总图距约1578.9cM,覆盖整个基因组87.5%,标记间平均图距9.69cM。群体标记中母本等位基因频率平均为0.52,群体中标记偏分离情况较严重。该图谱构建研究超级杂交稻协优9308各种性状遗传规律及QTL定位打下了基础。

  • 标签: 超级杂交稻 重组自交系 遗传图谱
  • 简介:根据转录组数据库,通过同源克隆获得结缕草ZjSPL4基因,开放阅读框1002bp,编码333个氨基酸,该基因具有SBP基因家族保守域。ZjSPL4编码蛋白分子量36.38163kD,理论等电点(pI)8.79,总平均亲水性-0.707,属于亲水性蛋白。二级结构预测结果显示ZjSPL4蛋白主要由无规则卷曲(Cc)、α螺旋(Hh)构成。ZjSPL4蛋白与其他植物SBP蛋白总体相似度53.71%,通过系统进化树分析发现ZjSPL4谷子二穗短柄草中SPL基因亲缘关系较近。ZjSPL4蛋白亚细胞定位结果显示,其编码蛋白定位于细胞核中。同时日本结缕草ZjSPL4基因受到GA、ABA、蔗糖、低温诱导,说明该基因可能参与结缕草花芽分化以及抗逆反应等过程。因此,克隆分析结缕草ZjSPL4基因可为结缕草花芽分化抗性机制研究以及分子育种提供一定参考。

  • 标签: 日本结缕草 ZjSPL4基因 克隆 亚细胞定位 表达分析
  • 简介:利用SSR分子标记技术对农作物不同品种进行鉴定具有高效、准确、成本低等显著特点。建立软枣猕猴桃资源鉴别方法,本研究选用28对SSR引物对10份软枣猕猴桃资源共16个样品进行鉴别,并结合田间农艺性状调查分析。结果表明,‘长江一号’‘魁绿’无位点差异,其余资源间均存在3个以上位点差异。田间农艺性状调查结果表明,‘长江一号’‘魁绿’差异不显著,其余资源间差异显著。遗传特性及表型上‘长江一号’‘魁绿’相似度极高,而其余8份种质资源间均存在显著差异。本研究结果软枣猕猴桃种质资源鉴别提供可靠技术支持。

  • 标签: 软枣猕猴桃 SSR 鉴别
  • 简介:本试验采用甜叶菊组培苗叶片材料,以RAPD分子标记检验水浴温度时间、取样重量以及优化步骤等三个DNA提取影响因素,进而以SRAPMSAP分子标记技术对RAPD结果进行验证,以提高甜叶菊组培苗DNA提取效率。结果表明,水浴温度、时间70℃30min(A2),取样量0.1g(B2),提取到常规步骤9上清液V(C4)即可满足常规分子标记要求,且提取时间可减少1~1.5h。

  • 标签: 甜叶菊 DNA提取 分子标记
  • 简介:Na^+/H^+逆向运输蛋白植物耐盐性方面起着极为重要作用。根据不同植物中功能相同同源基因保守序列设计引物,通过RT-PCR方法从真盐生植物北美海蓬子(SalicorniaBigeloviiTorr.)中克隆出包括有1683bp完整编码区在内2591bp(GenBank登陆号DQ157454)Na^+/H^+逆向运输蛋白基因(SbNHX1)cDNA序列。将该基因编码区序列构建到植物表达载体pVKH-35S-pA上,并通过农杆菌介导转化到模式植物拟南芥(Arabidopsisthaliana)中,得到T3代转入单基因种子。200mmol/LNaCl胁迫培养结果显示,转基因拟南芥200mmol/LNaCl胁迫条件生长状况好于野生型植株,植物表现有一定耐盐性。

  • 标签: 北美海蓬子 Na^+/H^+逆向运输蛋白 转基因拟南芥 耐盐性
  • 简介:鉴定合成通过高通量随机组合方法获得潜在功能片段生物学功能需要一套高效便捷酵母表达专用载体。酵母表达载体pYES2多克隆位点不含起始密码子,通过设计含有ATGEcoRⅠ酶切位点特异性引物扩增一段Intron,利用In-Fusion重组技术(Clontech)将该片段构建至酵母表达载体pYES2,得到一个含有ATG重组酵母表达载体pYES2-ATG。为了检测该载体功能,扩增不含起始密码子DNA序列nlea,该序列由本实验设计合成,具有潜在耐盐功能。构建重组表达载体pYES2-ATG-nlea酵母中进行功能鉴定。研究结果表明,半乳糖诱导后,含pYES2-ATG-nlea重组酵母菌株耐盐能力明显高于含pYES2-ATG空质粒菌株,表明该载体系统上添加了起始密码子nlea成功表达,具有一定耐盐性,同时也证明改造载体系统可用于没有起始密码子编码区序列功能筛选鉴定。pYES2-ATG酵母载体系统不影响原始载体基本功能元件表达,同时能使不含起始密码子编码区序列酵母中正常表达,大规模进行多个基因功能鉴定中具有重要应用价值。

  • 标签: 起始密码子 酿酒酵母 pYES2 In-Fusion重组技术
  • 简介:β-1,4-葡聚糖内切酶(endo-β-1,4-glucanase,EGase)植物组织生长、开花、果实成熟、器官脱落等方面都具有非常重要作用。本研究克隆了一个新水稻β-1,4-葡聚糖内切酶家族基因OsGLU16。序列分析表明该基因位于水稻第8号染色体,cDNA全长1827bp,包含一个1572bp开放阅读框,编码523个氨基酸残基。蛋白质同源性分析表明,OsGLU16基因编码蛋白第54~第516个氨基酸残基区域具有高度保守GH9催化结构域。本研究成功构建了OsGLU16基因过表达载体pCaMV35S—OsGLU16-EGFP,并获得了转基因水稻植株。植株表型分析表明,野生型相比,过表达株系表现为株高穗长显著下降。本研究初步探明了OsGLU16基因过表达转基因水稻植株表型特征,这进一步丰富β-1,4-葡聚糖内切酶基因家族水稻生长发育过程中作用提供理论基础。

  • 标签: β-1 4-葡聚糖内切酶 水稻 OsGLU16 克隆 过表达
  • 简介:本研究以云南小油菜材料,克隆出乙酰辅酶A羧化酶BCCP亚基基因,并对克隆基因进行生物信息学分析,结果表明云南小油菜BCCP基因含有6个外显子,编码258个氨基酸,有四个功能保守区,第四功能保守区是生物素化功能域,并且RT—PCR结果表明该基因是表达、有功能。云南小油菜BCCP亚基甘蓝型油菜Bp4氨基酸序列相比较,有30个氨基酸发生变化;云南小油菜BCCP基因ORF甘蓝型油菜Bp4mRNA同源性高达96%。

  • 标签: 云南小油菜 乙酰辅酶A羧化酶 BCCP亚基
  • 简介:EST-SSR标记是基于表达序列标签(expressedsequencetags,EST)数据信息,并结合SSR标记特点开发出一种新型分子标记。本文利用12对EST-SSR标记对湖北省内目前主要栽培8个黑杨品种进行分子鉴定,同时对不同EST-SSR位点进行相关遗传参数分析。品种鉴定结果表明,仅需4对EST-SSR引物即可将8个亲缘关系较近黑杨品种完全区别开来。遗传多样性分析显示,多态位点百分比为58.3%,平均有效等位基因数2.09个,平均Shannon信息指数0.61,平均杂合度0.35。这些结果表明,杨树EST-SSR标记完全可以应用于品种鉴定及群体遗传多样性分析。

  • 标签: 杨树 EST-SSR标记 品种鉴定
  • 简介:作物种子蛋白是人类牲畜日常蛋白质主要来源;肉类相比,植物蛋白质营养品质往往不够完全,主要表现在禾谷类作物种子蛋白质中赖氨酸色氨酸含量,豆类蔬菜类蛋白质缺乏蛋氨酸半胱氨基酸等含硫氨基酸。采用传统育种技术提高作物蛋白质营养品质方面的成效不大,现代分子生物技术进展改良植物种子蛋白质营养品质提供了有效技术路线,目前已发展了几种分子水平上改良作物蛋白质营养价值方法,包括内源蛋白质序列修饰、同源优质蛋白基因过量表达、异源优质蛋白基因转移表达、人工合成新蛋白基因、以及增加游离必需氨基酸含量等。本文重点从上述5个方面综述近年来采用基因工程技术提高作物蛋白质营养品质进展,并就其中可能存在问题作了讨论。

  • 标签: 作物种子蛋白 营养品质 必需氨基酸 基因工程
  • 简介:类黄酮(Flavonoids)是植物体内一类重要次生代谢产物,它以结合态(黄酮苷)自由态(黄酮苷元)形式存在于水果、蔬菜、豆类茶叶等许多植物中,对植物生长发育有着重要调节作用。查尔酮合成酶(Chalconesynthase,CHS,EC2.3.1.74)是植物类黄酮合成途径第一个关键酶,调控类黄酮生物合成以及类黄酮成分起着决定作用。本研究基于番茄全基因组测序数据,利用生物信息学方法,鉴定了查尔酮合成酶基因家族成员,分析其内含子一外显子结构特征、系统发育关系,序列结构保守性以及染色体上分布。研究表明:查尔酮合成酶(S1CHS)是含有8个成员多家族基因,蛋白质序列编码位于160(S1CHS05)~438(S1CHS08)个氨基酸之间;相似性33.7%(S1CHS02S1CHS06)~92.0%(S1CHS04S1CHS07)之间,表明这些序列之间具有较高遗传多样性;此外,结构分析发现这些基因均含有较少内含子(0~2个);序列比对表明这些基因具有较高保守性;它们不均匀分布番茄1、5、6、912号染色体上。该研究不仅有助于未来了解该基因家族进化起源提供参考,而且可为我们进一步分析该基因家族成员功能奠定基础。

  • 标签: 番茄 查尔酮合成酶 生物信息学 表达分析
  • 简介:木质素(Lignin)是植物苯丙烷代谢途径中重要产物之一,它为植物细胞壁提供了必要强度、疏水性以及对外界恶劣环境抗性。其中肉桂醇脱氢酶(CAD)是木质素合成途径中一种关键酶,参与S-木质素、G-木质素H-木质素合成。本文主要对CAD基因特征、CAD木质素生物合成中作用及酶学分析、CAD基因在木质素合成调控中研究状况进行了综述,并且对CAD基因研究方法和在实际生产中应用作出了展望。

  • 标签: 肉桂醇脱氢酶 木质素 生物合成
  • 简介:采用YC4YC9组合群体,该组合在F4代通过分子测定基因型分别为Aabb、aaBbAaBb杂合型。通过近红外检测技术检测,YC4组合中高油酸类型表型频率NIR值低于80%占19.77%,高于80%占80.23%。YC9组合中高油酸类型表型频率NIR值低于80%占28.35%,高于80%占71.65%。考种结果表明,筛选紫色种皮高油酸花生且产量高于‘冀花5号’花生品种50%以上材料,YC4组合群体共筛选到材料69株,中果类型50株,大果类型19株。中果类型中荚果形状多为普通型,果嘴形状多为中等明显;大果类型中荚果形状也多为普通型,果嘴形状多为中等明显;YC9组合群体共筛选到19株材料,中果类型13株,大果类型6株。中果类型中荚果形状多为普通型,果嘴形状多为中等明显;大果类型中荚果形状多为普通型茧型,果嘴形状多为中等非常明显。通过继代选择,获得3个紫色种皮高油酸新品系ZG-4-19-5-3、ZG-4-20-18-1ZG-9-15-9-5,油酸NIR值分别为86.92%、85.77%88.14%,分子鉴定结果与其表型一致。该批新种质材料创制不仅提高了高油酸花生医疗保健价值,同时对中国高油酸花生种质资源丰富及品质育种具有重要意义。

  • 标签: 花生 紫色种皮 高油酸 荚果性状
  • 简介:本实验以野生甜椒(CA157)、栽培甜椒(CA52)二者渐渗系(CL122)群体材料,进行了耐低温IL系筛选低温胁迫对甜椒幼苗生理生化指标的测定。结果表明,渐渗系CL122整个低温处理及恢复过程中CA157表型相近,耐寒性显著高于CA52。低温胁迫,对三种材料幼苗相对电导率、丙二醛(MDA)含量、可溶性糖含量、脯氨酸含量、PSⅡ光化学效率、抗氧化酶活性等指标的分析发现有些指标抗性密切相关。说明野生甜椒染色体上可能含有控制其耐寒性关键QTL,幼苗低温应答指标可以鉴定植株抗性,但应选择差异化较明显时期。

  • 标签: 甜椒 渐渗系 低温胁迫 生理指标
  • 简介:本研究利用常规回交育种结合分子标记辅助选择技术,将来自C750抗白叶枯病基因Xa23抗稻瘟病基因pi9聚合到感病杂交稻恢复系闽恢3139中。最后回交后代中获得了4个双抗稻瘟病白叶枯病改良系ZR21-sk1、ZR21-sk2,ZR21—sk3ZR21-sk4,且其遗传背景恢复率达96%以上。用来自福建省具有代表性24个稻瘟病菌株白叶枯病广致病型菌系P6对改良株系进行人工接菌鉴定,结果表明,聚合了Xa23pi9基因改良系同时抗稻瘟病白叶枯病,且抗性抗谱供体亲本C750相似。农艺性状分析显示,改良株系所配组合基本保持闽恢3139农艺性状配合力,可直接应用于生产作抗性育种亲本。

  • 标签: 分子标记辅助选择 稻瘟病 白叶枯病 杂交稻恢复系 pi9/Xa23基因
  • 简介:本研究以国家马尾松种质资源库(浙江省淳安县姥山林场)马尾松二代核心育种群体内36个亲本无性系为材料,研究其主要生长性状及ISSR遗传变异。马尾松二代育种亲本生长性状总体上优良,但生长性状亲本无性系之间存在显著差异,表明二代育种群体具有丰富表型性状变异。利用15个ISSR标记对36个二代亲本无性系进行分析,多态位点百分率(PPL)83.33%。Nei's基因多样性(HE)0.328,Shannon信息多样性指数(I)0.476,亲本间分子遗传距离范围是0.24~0.82,平均为0.414,分子水平上证明马尾松二代育种群体遗传多样性较高,具有较好高世代遗传改良潜力。基于Nei's无偏遗传距离进行UPGMA聚类,36个无性系中35个聚在5个类群内,聚类结果与马尾松二代亲本遗传背景、系谱关系及产地纬度部分吻合,证实了应用ISSR标记开展马尾松分子辅助育种可行性。本研究合理选配二代亲本、开展杂交育种提供一定借鉴。

  • 标签: 马尾松 ISSR 生长性状 开花结实