学科分类
/ 14
279 个结果
  • 简介:TA克隆构建含MOC1基因cDNA片段重组质粒,作为TaqMan定量检测水稻分蘖基因MOC1mRNA标准品,建立了检测方法。采用RT—PCR。方法,从水稻分蘖芽总RNA中逆转录扩增总cDNA,PCR扩增MOC1基因中设计目的片段,将纯化目的片段pMD19-TSimple载体连接,转化宿主菌JM-109,提取重组质粒DNA,PCR鉴定并测序分析。纯化质粒并检测260nm吸光值,确定重组质粒原液拷贝浓度并以此制备荧光定量PCR梯度浓度标准品。对重组质粒进行实时荧光定量PCR实验。建立了MOC1基因mRNA表达实时荧光定量PCR检测方法,特异性好,检测灵敏度达10^2拷贝,线性范围为10^2-10^7拷贝,阈值循环数PCR体系中起始模板量对数值之间有着良好线性关系(r=0.999),扩增效率高(E=92.8%)。成功建立了MOCI基因实时荧光PCR定量标准品,且TaqMan荧光定量RT—PCR方法可对水稻分蘖基因MOC1mRNA表达进行准确定量。

  • 标签: 水稻 分蘖 基因表达 实时定量RT—PCR TAQMAN探针
  • 简介:本研究拟采用香蕉多芽体薄片为转化受体材料,建立起根癌农杆菌介导香蕉遗传转化体系。以巴西蕉组培苗球茎横切薄片为起始材料,诱导获得多芽体,利用多芽体薄片为受体,通过其对潮霉素敏感性和GUS基因瞬时表达率试验,以期找到适合遗传转化条件。结果表明:巴西蕉球茎横切薄片在多芽体诱导培养基(MS+6-BA10mg/L+PP3331mg/L+NAA0.21mg/L)上,经过4至5个月培养,形成了花椰菜结构多芽体。巴西蕉多芽体横切薄片对潮霉素敏感,最佳潮霉素素筛选浓度是25mg/L,转化最佳共培时间为4d。本研究从3次转化中共300个薄片中获得抗性芽18个,经GUS检测和PCR鉴定,获得抗性芽全部为阳性。本研究建立以多芽体薄片为转化受体转化体系,为今后将具有重要经济性状基因导入香蕉提供了技术参考。

  • 标签: 香蕉 遗传转化 多芽体
  • 简介:用高感甘薯茎线虫病甘薯品种徐薯18和高抗茎线虫病徐78-1杂交,得到其F1分离群体。根据连续3年抗病鉴定结果,从中挑选出8个高抗和8个高感茎线虫病株系,构建抗病池和感病池。分别以抗感池基因组DNA为模板,用225对SRAP引物组合进行PCR扩增,其中77对引物组合在抗、感池间表现出多态性。通过一组小群体进一步筛选,有4对引物组合被认为甘薯茎线虫病抗性基因相关。这4对引物组合分别对2个亲本、抗感池和F1分离群体中65个抗病株系和79个感病株系基因组DNA进行SRAP分析,有2对引物组合(a5b12和a9b11)各获得1个甘薯茎线虫病抗性基因紧密连锁分子标记SP1和SP2,它们抗甘薯茎线虫病基因遗传距离分别为4.86cM和4.17cM。获得分子标记对克隆抗病基因和利用分子标记辅助选择提高育种效率具有重要意义。

  • 标签: 甘薯 茎线虫病 SRAP技术 分子标记
  • 简介:根据黄瓜基因组数据库中CsaO20719基因编码区全序列设计引物,通过RT—PCR扩增方法从黄瓜品种津研四号叶片中克隆得到寡肽转运蛋白基因(oligopeptidetransportergene,OPT)。基因编码区全长为2013bp。该基因编码蛋白由20种氨基酸组成,含有670个氨基酸残基,分子量和理论等电点分别为73kD和8.65。预测由该基因转录寡肽转运蛋白为疏水蛋白,有14个连续疏水片断。预测该蛋白不存在信号肽,为非分泌蛋白,存在OPT家族保守结构域,亚细胞定位在细胞膜上,主要功能为参与转运和底物结合。同源性和进化树预测分析显示,OPT蛋白毛果杨和蓖麻寡肽转运蛋白同源性分别达到了81%和79%,所转运底物除有寡肽外,还包含有金属离子-烟草胺螯合物等。qRT—PCR分析同一氮浓度处理OPT基因在不同部位表达结果显示,在无氮及低氮条件下,OPT基因在茎中表达量最高,其次为叶和茎尖。在高氮条件下,OPT主要在茎尖和叶中表达量较高,其次为茎,说明OPT基因在氮胁迫下存在于植物各个部位,并主要集中在生长旺盛部位,为黄瓜生长提供所需能量。不同氮浓度下OPT在茎中表达分析结果显示,OPT基因在无氮及低氮下表达量增加,明显高于正常水平,并且随着氮浓度降低,OPT表达量增加,说明黄瓜OPT基因参与低氮胁迫应答反应,增强黄瓜耐低氮能力。

  • 标签: 黄瓜 寡肽转运蛋白基因(OPT) 克隆 低氮 生物信息学分析
  • 简介:利用10对SSR引物对南宁地区5个金花茶种群进行遗传多样性分析,探讨金花茶边缘种群及变种小果金花茶遗传多样性,为金花茶合理保护提供科学依据。结果显示:小果金花茶平均等位基因数(A)、有效等位基因数(Ae)、期望杂合度(He)和观测杂合度(Ho)分别为4.40、2.433、0.533和0.429,表明小果金花茶具有较低水平遗传多样性。STRUCTURE聚类分析显示,5个金花茶种群按照两变种分为2个组。AMOVA结果和遗传分化系数(FST)均表明两变种间存在很大遗传分化。位于平果县坡造乡金花茶边缘种群具有最低水平遗传多样性(PPB=50%,A=1.70,Ho=0.100),主分布区种群间存在很大遗传分化。基于以上结果表明,小果金花茶和平果县坡造乡边缘种群应当作为独立保护单元保护起来。

  • 标签: 小果金花茶 金花茶 遗传多样性 遗传分化 边缘种群
  • 简介:简单重复序列(SSR)广泛存在于基因组中,是亲缘关系分析、DNA指纹图谱构建和遗传多样性研究领域中非常重要遗传标记之一。红豆树群体已处于濒危状态,且属无参基因组,其近缘种开发SSR引物亦很少,为满足红豆树遗传多样性研究及制定合理保护策略,本研究基于SLAF-seq(specific-locusamplifiedfragmentsequencing)技术对天然群体中典型红豆树进行简化测序,利用MISA软件对测序获得所有SLAF片段进行SSR位点搜索,并对SSR位点特征进行统计分析,最后利用PrimerPremier5.0软件进行引物批量设计。与日本晴水稻测序数据相比,红豆树参考基因组双端比对效率为90.14%,酶切效率为92.37%,说明SLAF建库正常;测序Q30为92.32%,GC含量为37.17%,说明达到测序要求。本研究共获得6426462reads和592221个SLAF标签,其中16653个多态性SLAF标签,含有17868个SSR位点,平均每6.98kb就分布有1个SSR位点。不同核苷酸重复类型基元类型数量及SSR位点数量间差异较大,除单核苷酸外,二、三核苷酸重复类型数量较多,分别占总SSR位点17.15%和15.02%,其中AT/TA和GAA/TTC基元重复数量最多,分别为1090个(43.1%)和349个(15.2%)。通过批量引物设计共得到2817对引物,以二、三核苷酸类型较多,两者所占比例高达94.8%。结果表明:SLAF-seq技术可以很好应用于红豆树(无参基因组)SSR位点开发,基于简化基因组测序数据发掘SSR位点能够为SSR分子标记开发提供信息,并有助于后续群体遗传多样性和交配系统分析等。

  • 标签: 红豆树 SLAF-seq SSR 分布 位点分析
  • 简介:为探究大豆应答非致病菌(Bipolarismaydis)胁迫分子机制,将玉米小斑病菌接种于3周龄大豆苗。取48hpi大豆叶片以TCA/丙酮法提取蛋白质,利用蛋白质双向电泳技术分离蛋白,串联质谱(MS+MS/MS)鉴定蛋白质再结合生物信息学技术进行蛋白质功能分析。结果显示:分离到大豆苗期叶片总蛋白点1300+15个,其中,差异表达(2倍以上,P值〈0.05)蛋白质点18个,除2个蛋白点未成功测序,其余16个差异蛋白点经GO分析可知,差异表达蛋白质功能主要涉及光合作用、胁迫应激和非寄主抗性响应,如核酮糖1,5-二磷酸羧化酶、病程相关蛋白PR-10和细胞骨架结构相关蛋白profilin-2。同时,由测序结果推测:在非致病菌(玉米小斑病菌)胁迫下,大豆通过降低光合作用相关蛋白和能量代谢相关蛋白表达,来增强防御相关蛋白和非寄主抗性相关蛋白表达。

  • 标签: 大豆 应答 玉米小斑病菌 胁迫 双向电泳
  • 简介:解析穗粒数、小穗数和粒重及其QTLs间遗传关联,有利于大麦穗发育遗传和标记辅助选择研究。本研究采用SPSS19.0软件分析了25份试验材料小穗数、千粒重和穗粒数表型差异,以及不同性状及其QTLs间遗传关联性。结果表明小穗数等3个性状具有显著或极显著差异,育种品种小穗数和穗粒数地方品种没有明显差异,大多数育成品种千粒重显著或极显著高于地方品种,二棱大麦小穗数、穗粒数和千粒重没有显著差异,但六棱大麦具有显著或极显著差异;小穗数穗粒数极显著正相关,偏相关系数为0.835;在试验材料中共检测到4个小穗数QTLs、6个穗粒数QTL和6个千粒重遗QTLs,16个QTLs分别位于1H、2H和4H等6条染色体上,其中QSn-4HS等8个QTLs具有增效作用、其余QTLs具有减效作用。标记HVM40-258bp连锁QTL对小穗数和穗粒数具有一因多效特性性。小穗数等3个穗部性状分别受遗传效应不同QTLs控制,QTL多效性导致了小穗数穗粒数关联遗传。

  • 标签: 大麦品种(或品系) 穗部性状差异 SSR标记 关联分析 QTLs检测
  • 简介:用超级杂交稻协优9308母本协青早A保持系协青早B和父本恢复系中恢9308杂交,以单粒传方法建立含281个株系重组自交系(RIL)群体。选用695对简单重复序列(SS鼬引物进行亲本多态性筛选,共有186对检测到多态性,频率为26.8%。构建成水稻分子遗传图谱共包含163个标记座位,总图距约1578.9cM,覆盖整个基因组87.5%,标记间平均图距为9.69cM。群体和标记中母本等位基因频率平均为0.52,群体中标记偏分离情况较严重。该图谱构建为研究超级杂交稻协优9308各种性状遗传规律及QTL定位打下了基础。

  • 标签: 超级杂交稻 重组自交系 遗传图谱
  • 简介:查尔酮合成酶(chalconesynthas,CHS)是黄酮类次生代谢物生物合成途径中一个关键酶。为了解CHS花青素含量相关性,本研究根据转录组数据,利用RT—PCR技术在甘薯中克隆了一个CHS基因(IbCHS1),并对其表达特征进行了分析。结果表明:IbCHS1基因cDNA长1556bp,包含1个1167bp开放阅读框,编码388个氨基酸。IbCHS1蛋白具有典型植物CHS结构特征,和其他植物中类似蛋白具有很高同源性。表达分析显示,IbCHS1主要在紫肉甘薯中表达,其表达水平不同品种甘薯中花青素含量正相关。

  • 标签: 甘薯 查尔酮合成酶 花青素 基因表达
  • 简介:转录组连接基因组遗传信息蛋白质组,也是基因功能研究基础和出发点。单分子测序技术是近年逐渐成熟新一代测序技术,也称为第三代测序技术,在转录组学研究方面较前代测序技术具有独到优势,应用前景广阔。在非模式植物功能基因组学研究中,全长转录本获得可有力地推进相应基础研究水平,而第三代测序技术为此提供了较好解决方案。本研究就目前技术较为成熟且应用较广泛SMRT等单分子测序技术原理进行了介绍,综述了该技术在非模式植物转录组学研究中应用现状,对其应用前景进行了展望。

  • 标签: 单分子测序 全长转录组 SMRT 非模式植物
  • 简介:根据转录组数据库,通过同源克隆获得结缕草ZjSPL4基因,开放阅读框为1002bp,编码333个氨基酸,该基因具有SBP基因家族保守域。ZjSPL4编码蛋白分子量为36.38163kD,理论等电点(pI)为8.79,总平均亲水性为-0.707,属于亲水性蛋白。二级结构预测结果显示ZjSPL4蛋白主要由无规则卷曲(Cc)、α螺旋(Hh)构成。ZjSPL4蛋白与其他植物SBP蛋白总体相似度为53.71%,通过系统进化树分析发现ZjSPL4谷子和二穗短柄草中SPL基因亲缘关系较近。ZjSPL4蛋白亚细胞定位结果显示,其编码蛋白定位于细胞核中。同时日本结缕草ZjSPL4基因受到GA、ABA、蔗糖、低温诱导,说明该基因可能参与结缕草花芽分化以及抗逆反应等过程。因此,克隆分析结缕草ZjSPL4基因可为结缕草花芽分化抗性机制研究以及分子育种提供一定参考。

  • 标签: 日本结缕草 ZjSPL4基因 克隆 亚细胞定位 表达分析
  • 简介:利用SSR分子标记技术对农作物不同品种进行鉴定具有高效、准确、成本低等显著特点。为建立软枣猕猴桃资源鉴别方法,本研究选用28对SSR引物对10份软枣猕猴桃资源共16个样品进行鉴别,并结合田间农艺性状调查分析。结果表明,‘长江一号’‘魁绿’无位点差异,其余资源间均存在3个以上位点差异。田间农艺性状调查结果表明,‘长江一号’‘魁绿’差异不显著,其余资源间差异显著。在遗传特性及表型上‘长江一号’‘魁绿’相似度极高,而其余8份种质资源间均存在显著差异。本研究结果为软枣猕猴桃种质资源鉴别提供可靠技术支持。

  • 标签: 软枣猕猴桃 SSR 鉴别
  • 简介:乙烯作为植物激素在生长、发育、抗逆过程中发挥了其独特调节作用。本文在分子生物学水平上概述了植物中乙烯合成途径和信号转导途径机制。乙烯合成由甲硫氨酸开始,经过重要中间代谢产物ACC氧化裂解形成乙烯,其中ACC合成酶催化反应为限速反应,为调控乙烯合成重要环节。乙烯信号转导由内质网上乙烯受体识别乙烯开始,在胞质中经一条保守途径,由EIN3将转录信号传递至细胞核中,最后以ERF类转录因子激活或抑制相关基因表达。ERF转录因子参与防卫反应诱导和寄主对病原菌不亲和互作建立,受其调控防卫基因被诱导表达后在随后防卫应答过程中发挥了不同作用。

  • 标签: 乙烯合成 信号转导 诱导抗性
  • 简介:葡萄浆果颜色是由花色素苷量来决定,UFGT控制花色素苷合成,Myb相关基因通过时空表达调节UFGT,从而使花色素苷在葡萄发育不同阶段和不同部位表达。不同葡萄品种调节花色素苷合成强度和模式差异造成了有色葡萄品种果皮有多种颜色,白色葡萄品种果皮是由于没有花色素苷合成。Myb相关基因家族主要有八个成员,其中MybA三个种类VlmybA1-1,VlmybA1-2和VlmybA2以及MybB两个种类VlmybB1-1和VlmybB1-2得到了较深入研究。

  • 标签: 葡萄 花色素苷 MYB UFGT 色素形成
  • 简介:本试验采用甜叶菊组培苗叶片为材料,以RAPD分子标记检验水浴温度时间、取样重量以及优化步骤等三个DNA提取影响因素,进而以SRAP和MSAP分子标记技术对RAPD结果进行验证,以提高甜叶菊组培苗DNA提取效率。结果表明,水浴温度、时间为70℃30min(A2),取样量为0.1g(B2)时,提取到常规步骤9上清液V(C4)即可满足常规分子标记要求,且提取时间可减少1~1.5h。

  • 标签: 甜叶菊 DNA提取 分子标记
  • 简介:Na^+/H^+逆向运输蛋白在植物耐盐性方面起着极为重要作用。根据在不同植物中功能相同同源基因保守序列设计引物,通过RT-PCR方法从真盐生植物北美海蓬子(SalicorniaBigeloviiTorr.)中克隆出包括有1683bp完整编码区在内2591bp(GenBank登陆号为DQ157454)Na^+/H^+逆向运输蛋白基因(SbNHX1)cDNA序列。将该基因编码区序列构建到植物表达载体pVKH-35S-pA上,并通过农杆菌介导转化到模式植物拟南芥(Arabidopsisthaliana)中,得到T3代转入单基因种子。200mmol/LNaCl胁迫培养结果显示,转基因拟南芥在200mmol/LNaCl胁迫条件下生长状况好于野生型植株,植物表现有一定耐盐性。

  • 标签: 北美海蓬子 Na^+/H^+逆向运输蛋白 转基因拟南芥 耐盐性
  • 简介:鉴定合成或通过高通量随机组合方法获得潜在功能片段生物学功能需要一套高效便捷酵母表达专用载体。酵母表达载体pYES2多克隆位点处不含起始密码子,通过设计含有ATG和EcoRⅠ酶切位点特异性引物扩增一段Intron,利用In-Fusion重组技术(Clontech)将该片段构建至酵母表达载体pYES2,得到一个含有ATG重组酵母表达载体pYES2-ATG。为了检测该载体功能,扩增不含起始密码子DNA序列nlea,该序列由本实验室设计合成,具有潜在耐盐功能。构建重组表达载体pYES2-ATG-nlea在酵母中进行功能鉴定。研究结果表明,半乳糖诱导后,含pYES2-ATG-nlea重组酵母菌株耐盐能力明显高于含pYES2-ATG空质粒菌株,表明在该载体系统上添加了起始密码子nlea成功表达,具有一定耐盐性,同时也证明改造载体系统可用于没有起始密码子编码区序列功能筛选和鉴定。pYES2-ATG酵母载体系统不影响原始载体基本功能元件表达,同时能使不含起始密码子编码区序列在酵母中正常表达,在大规模进行多个基因功能鉴定中具有重要应用价值。

  • 标签: 起始密码子 酿酒酵母 pYES2 In-Fusion重组技术
  • 简介:β-1,4-葡聚糖内切酶(endo-β-1,4-glucanase,EGase)在植物组织生长、开花、果实成熟、器官脱落等方面都具有非常重要作用。本研究克隆了一个新水稻β-1,4-葡聚糖内切酶家族基因OsGLU16。序列分析表明该基因位于水稻第8号染色体,cDNA全长1827bp,包含一个1572bp开放阅读框,编码523个氨基酸残基。蛋白质同源性分析表明,OsGLU16基因编码蛋白在第54~第516个氨基酸残基区域具有高度保守GH9催化结构域。本研究成功构建了OsGLU16基因过表达载体pCaMV35S—OsGLU16-EGFP,并获得了转基因水稻植株。植株表型分析表明,野生型相比,过表达株系表现为株高和穗长显著下降。本研究初步探明了OsGLU16基因过表达转基因水稻植株表型特征,这为进一步丰富β-1,4-葡聚糖内切酶基因家族在水稻生长发育过程中作用提供理论基础。

  • 标签: β-1 4-葡聚糖内切酶 水稻 OsGLU16 克隆 过表达
  • 简介:本研究以野生型三生烟(Nicotianatabacumcv.Xanthinc.)及T_2、T_3代转hpaXm(即hpa1Xm)基因烟草和转hpaXmN-端缺失突变体(标记为hpaXm△LP)烟草为试材,对目标基因整合表达、叶绿素含量及防御酶活性进行检测。结果表明,卡那霉素抗性筛选、PCR及RT-PCR检测证明,外源目的基因hpaXm和hpaXm△LP整合到烟草基因组中,在转录水平上正常表达,且两个世代中稳定遗传。叶绿素含量测定中,转基因烟草含量显著高于野生型植株,同种转基因植株T_2代含量显著高于T_3代,而转hpaXm基因烟草总叶绿素含量比转hpaXm△LP基因烟草高,无显著性差异。防御酶活性测定,表明转基因烟草PAL、POD和PPO活性皆显著高于野生型植株;而转hpaXm基因烟草PAL和POD活性显著高于转hpaXm△LP基因烟草;同品种转基因烟草中,T_2代PAL活性显著高于T_3代。说明hpa1Xm基因在烟草中表达能显著提高其叶绿素含量及抗病防御酶活性水平,且不同世代转基因烟草之间表现有所差异。初步探索了hpaXm功能、遗传稳定性及信号肽类似序列对hpaXm表达及功能影响。

  • 标签: 转hpaXm基因烟草 转hpaXm△LP基因烟草 叶绿素含量 防御酶活性