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  • 简介:Dharmacon公司完成了世界第一个完整基因组siRNA文库,靶向基因包含整个人类基因组。SiARRAY文库是使用公司的SMARTselection和SMARTpool技术开发出来的,对高通量功能基因研究具有明显节约时间和降低成本作用。一个SMARTpoolsiRNA试剂和4个单独的si-RNAs对应人类一个基因。这样每个基因都有5个对应基因沉默反应让研究人员对基因沉默的效果进行独立的验证。

  • 标签: SIRNA 文库 人类基因组 功能基因研究 基因沉默 技术开发
  • 简介:SmallinterferingRNA(siRNA)andmicroRNA(miRNA)aresmallRNAsof18-25nucleotides(nt)inlengththatplayimportantrolesinregulatinggeneexpression.TheyareincorporatedintoanRNA-inducedsilencingcomplex(RISC)andserveasguidesforsilencingtheircorrespondingtargetmRNAsbasedoncomplementarybase-pairing.ThepromiseofgenesilencinghasledmanyresearcherstoconsidersiRNAasananti-viraltool.However,inlong-termsettings,manyvirusesappeartoescapefromthistherapeuticalstrategy.Anexampleofthismaybeseeninthecaseofhumanimmunodeficiencyvirustype-1(HIV-1)whichisabletoevadeRNAsilencingbyeithermutatingthesiRNAtargetedsequenceorbyencodingforapartialsuppressorofRNAi(RNAinterference).Ontheotherhand,becausemiRNAtargetingdoesnotrequireabsolutecomplementarityofbase-pairing,mutationalescapebyvirusesfrommiRNAspecifiedsilencingmaybemoredifficulttoachieve.Inthisreview,wediscussstratagemsusedbyvariousvirusestoavoidthecells'antiviralsi/mi-RNAdefensesandnotionsofhowvirusesmightcontrolandregulatehostcellgenesbyencodingviralmiRNAs(vmiRNAs).

  • 标签: SIRNA MIRNA 爱滋病病毒 病毒感染 疾病预防
  • 简介:IntheapplicationofRNAitechnology,itisanessentialsteptodesignsiRNAapplicabletotargetgene.Atpresent,therearemanyresearchesandconclusionsonsiRNAdesign.ThispaperaimstotheinfluencesofmRNAsecondarystructureorsiRNAantisense-strandsecondarystructureonsiRNAsilenceefficiency.Thepaperalsodiscussestheproblemsandsetsoutfurtherinsightsintheresearch.

  • 标签: MRNA二级结构 SIRNA设计 RNA沉默 RNAI技术 靶基因 反义链
  • 简介:目的构建针对人抑凋亡基因Livin的小干扰RNA(siRNA)重组表达质粒载体。方法通过分子克隆技术,设计并合成具有基因特异性的3组寡核苷酸片段,克隆到pmU6质粒载体,并经菌落PCR鉴定及测序鉴定,Livin的siRNA序列成功克隆到重组表达质粒载体中。结果经菌落PCR鉴定及测序鉴定证实,人Livin的siRNA序列成功克隆到表达载体中,插入序列正确。结论成功构建了LivinsiRNA质粒表达载体,为后续研究降低或沉默Livin基因表达后能否有效抑制膀胱癌细胞增殖和促进细胞凋亡奠定了基础。

  • 标签: LIVIN 表达载体 小干扰RNA
  • 简介:Polyethylenimine-polyL-lysinePEI-PLL共聚物经由PEI开始的L离氨酸N-carboxyanhydrideLysZ-NCA的戒指洞聚合被综合。有siRNA的PEI-PLL的complexation被粒子尺寸和希腊语的第六个字母潜力大小学习。流动cytometric分析和共焦的成像显示出它的优秀细胞内部的trafficking能力。PEI-PLL在vitro比商业PEI-25k显示了更高的基因silencing效率和更低的cytotoxicity。在antitumor学习,PEI-PLL进一步与siVEGF被相结合并且显然为CT26肿瘤模型的处理显示出肿瘤抑制效果。因此,PEI-PLL是在vivo的进一步的antitumor处理的一个有希望的siRNA搬运人候选人。

  • 标签: L-赖氨酸 SIRNA 聚乙烯亚胺 肿瘤治疗 载体 酸改性
  • 简介:摘要目的构建Survivin靶向siRNA重组表达载体。方法根据GeneBank数据库提供的Survivin基因所有变异体的共同核苷酸序列,选择设计一对带发夹结构的核苷酸序列,克隆到空载体pSIREN-DNR-DsRed-Express中,转化DH5а菌株,提取质粒进行酶切鉴定和测序分析以及菌落PCR。结果经质粒PCR、菌落PC及测序证实Survivin靶向siRNA重组表达载体结果与设计完全一致。结论Survivin靶向siRNA重组表达载体构建成功。

  • 标签: RNA干扰 surviving 基因治疗
  • 简介:摘要目的前列腺特异膜抗原(PSMA)适配体Apt-A10-3.2可作为前列腺癌早期诊断和靶向治疗的特异性配体。鼠双微体(MDM2)与前列腺癌恶性程度密切相关,且MDM2小干扰RNA(siRNA)可通过RNA干扰机制靶向沉默MDM2目的基因。设计合成PSMA Apt-MDM2 siRNA新型嵌合体,与多西他赛(DTX)联合以探讨PSMA阳性前列腺癌的靶向治疗及99Tcm标记嵌合体显像监测相结合的诊疗新模式。方法PSMA Apt-A10-3.2与MDM2 siRNA通过共价偶联合成嵌合体Apt-siRNA,在PSMA表达阳性的前列腺癌细胞株(22RV1及LNCaP)中,采用Apt-siRNA单独或联合DTX对细胞株进行处理,通过Western blot检测MDM2及凋亡相关蛋白[B淋巴细胞瘤-2基因(Bcl-2)及其相关X蛋白(Bax)、聚ADP核糖聚合酶(PARP)、半胱氨酸蛋白酶3(caspase-3)]表达水平,评价治疗效果。取22RV1荷瘤裸鼠15只,分别予PBS、DTX+Apt(200 pmol)和DTX+Apt(400 pmol)处理,观察肿瘤体积与MDM2水平;行99Tcm-Apt-siRNA SPECT显像,获得肿瘤/肌肉放射性计数(T/M)比值。采用单因素方差分析和Tukey多重检验、线性回归分析等分析数据。结果在22RV1及LNCaP细胞株中,Apt-siRNA明显降低MDM2表达(0.25±0.02,F=183.40,P<0.001;0.56±0.03,F=37.15,P<0.001);Apt-siRNA联合DTX治疗前列腺癌后,Bcl-2表达水平明显降低,Bax、PARP、caspase-3表达水平明显升高。在22RV1荷瘤裸鼠中,Apt-siRNA联合DTX明显抑制肿瘤MDM2蛋白表达(400 pmol:0.59±0.12;F=49.99,P=0.023)及肿瘤体积[400 pmol:(0.22±0.07) cm3;F=71.30,P=0.039];SPECT显像示,治疗后T/M比值明显降低(400 pmol:2.07±0.22;F=34.99,P=0.022),与MDM2表达水平有线性回归关系(R2=0.875,P<0.001)。结论Apt-siRNA联合DTX能有效抑制前列腺癌进展,并通过偶联99Tcm实现PSMA阳性前列腺癌可视化靶向诊疗。

  • 标签: 前列腺肿瘤 前列腺特异膜抗原 RNA,小分子干扰 紫杉烷类 放射性核素显像 小鼠,裸
  • 简介:但是pSilencer3.1KDR3能够抑制PC3细胞中KDR基因和蛋白的表达,结果表明针对3号KDR基因位点的pSilencer3.1KDR3载体有效地抑制了PC3细胞中KDR基因和蛋白的表达.,pSilencer3.1KDR3组转染的PC3细胞的生长速度明显变慢

  • 标签: 中基因 基因表达 沉默细胞
  • 简介:目的筛选出对人CathepsinK(CTSK)基因抑制效率最高的1对siRNA,并通过质粒载体表达该siRNA,为进一步抑制去分化人软骨细胞中CTSK的表达奠定基础。方法针对CathepsinK基因设计4个靶位点,并根据靶位点合成4对siRNA.并转染人软骨细胞。通过Real-timePCR检测4对siRNA中抑制效率最高的1对,与线性化的PGCsilencer-H1/Neo/GFP连接、转化、扩增与纯化质粒。结果4对siRNA转染软骨细胞后72h,通过对照FITC-siRNA的绿色荧光观察.siRNA的转染效率达到70%~80%。Real-timePCR检测每对siRNA的CTSK量与对照组比的百分率得到其抑制效率,分别为:第1对的比值大于对照组(无抑制作用),第2对47.5%,第3对53.1%,第4对67.3%(抑制效率最大)。成功构建出pGCsilencer^TMH1/Neo/GFP/CTSKRNAi载体,经测序证实了克隆的RNAi打靶序列100%正确。结论成功构建了CTSK基因的siRNAs表达质粒,为进一步研究抑制该基因表达对延缓软骨细胞的去分化过程并促进其成软骨能力奠定了基础。

  • 标签: 基因 双链RNA 质粒体
  • 简介:AbstractBackground:Fibroblast-like synoviocytes (FLSs), resident mesenchymal cells of synovial joints, play an important role in the pathogenesis of rheumatoid arthritis (RA). Dickkopf-1 (DKK-1) has been proposed to be a master regulator of bone remodeling in inflammatory arthritis. Here, potential impairation on the activity of FLSs derived from RA to small interfering RNAs (siRNAs) targeting DKK-1 was investigated.Methods:siRNAs targeting DKK-1 were transfected into FLSs of patients with RA. Interleukin (IL)-1β, IL-6, IL-8, matrix metalloproteinase (MMP) 2, MMP3, MMP9, transforming growth factor (TGF)-β1, TGF-β2 and monocyte chemoattractant protein (MCP)-1 levels in the cell culture supernatant were detected by enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA). Invasion assay and 3H incorporation assay were utilized to investigate the effects of siRNAs targeting DKK-1 on FLSs invasion and cell proliferation, respectively. Western blotting was performed to analyze the expression of nuclear factor (NF)-κB, interleukin-1 receptor-associated kinase (IRAK)1, extracellular regulated protein kinases (ERK)1, Jun N-terminal kinase (JNK) and β-catenin in FLSs.Results:DKK-1 targeting siRNAs inhibited the expression of DKK-1 in FLSs (P < 0.01). siRNAs induced a significant reduction of the levels of IL-6, IL-8, MMP2, MMP3 and MMP9 in FLSs compared to the control group (P < 0.05). DKK-1 targeting siRNAs inhibited the proliferation and invasion of FLSs (P < 0.05). Important molecules of pro-inflammatory signaling in FLSs, including IRAK1 and ERK1, were decreased by the inhibition of DKK-1 in FLSs. In contrast, β-catenin, a pivotal downstream molecule of the Wnt signaling pathway was increased.Conclusions:By inhibiting DKK-1, we were able to inhibit the proliferation, invasion and pro-inflammatory cytokine secretion of FLSs derived from RA, which was mediated by the ERK or the IRAK-1 signaling pathway. These data indicate the application of DKK-1 silencing could be a potential therapeutic approach to RA.

  • 标签: Dickkopf-1 Fibroblast-like synoviocytes Rheumatoid arthritis small interfering RNAs
  • 简介:目的设计并合成抗人骨肉瘤Periostin基因的siRNA分子,观察基因沉默效应。方法根据GenBank上获取的PeriostinmRNA序列合成4条siRNA分子,用脂质体介导转染体外培养的肉瘤细胞MG-63细胞,培养48h,采用ELISA评估、RT-PCR检测和Westernblot检测分析基因沉默效果。结果不同实验组之间的蛋白表达水平的差异有统计学意义(F=86.52,P〈0.01),与对照组相比,4条PeriostinsiRNA均下调Periostin蛋白表达的水平,其中以PeriostinsiRNA3效果最好,抑制率分别为58.06%、61.78,75.33%和51.67%。结论靶向PeriostinsiRNA均有效抑制Periostin蛋白的表达水平。

  • 标签: 小干扰RNA 骨膜蛋白 骨肉瘤 构建
  • 简介:客观CXCR4是为癌症基因治疗的一个潜在的目标。在这研究,指向CXCR4基因的RNA干扰制动火箭病毒向量被构造,并且它对由压抑CXCR4基因表示的前列腺癌症房间的侵略的影响被分析。CXCR4特定的siRNA基因被PCR克隆并且插入了进Pgensil-1原生质标志反对染色U6倡导者和EGFP的方法,然后recombinant碎裂是进PLXSN的亚cloned并且由限制酶测试了并且定序。从transfectedPA317房间获得的病毒是进前列腺癌症房间的transfected。CXCR4mRNA的表示被RT-PCR检测。前列腺癌症房间在试管内的侵略的能力被Transwell实验估计。与recombinantPLXSNtransfection,在前列腺癌症房间PC-3m和LNCaP的CXCR4mRNA的表示以率被减少,这被显示出的结果(84.26±10.20)%并且(88.17±11.23)%分别地。Transwell实验的结果也证明房间在下面的数字微膜分别地,在控制组(P<0.05)与46.9±5.3和66.7±6.0相比在PC-3m和LNCaP的对待的组是14.7±3.1和18.9±4.2。结论PLXSN/EGFP-U6-siCXCR4能显著地压抑表示fCXCR4,前列腺癌症房间在试管内的侵略海角被也禁止。这recombinant碎片将在前列腺癌症的治疗是有用的。

  • 标签: 逆转录酶病毒 介导 CXCR4-siRNA 前列腺癌 体外侵袭力 抑制
  • 简介:目的筛选有效的MRP1siRNA序列,为RNAi的体内外研究提供依据.方法利用Dharmacon公司的RNA在线工具,设计了4对针对MRP1基因不同区域的siRNA序列,分别转染至U251等三种肿瘤细胞,采用荧光转染试剂观察转染效率;采用RT-PCR和Westernblot检测MRP1mRNA和蛋白的表达.结果siRNA1、siRNA2、siRNA3、siRNA4四对序列分别转染上述三种肿瘤细胞后的RT-PCR实验结果说明siRNA2和siRNA4对MRPmRNA有较强的抑制作用.结论siRNA2、siRNA4是可有效抑制MRP基因表达的序列.

  • 标签: SIRNA MRP1 多药耐药 肿瘤细胞
  • 简介:摘要小干扰RNA(siRNA)具有沉默互补的目标信使RNA(mRNA)从而抑制疾病相关基因表达的作用。因其高效性及特异性,siRNA具有作为基因药物的巨大潜力,但其在体内易受到血管屏障、内涵体及RNA酶等因素的影响,从而难以发挥药效。因此,设计高效的能够负载siRNA的纳米载体以使其富集至靶标是目前siRNA药物研发的重要任务,高分子聚合物纳米载体是目前研究热点之一。本文就高分子聚合物纳米载体实现siRNA药物递送的研究进展进行综述。

  • 标签: 小干扰RNA 高分子聚合物 纳米载体 药物递送
  • 简介:摘要目的观察小干扰RNA(small interfering RNA,siRNA)干扰囊泡膜核苷酸转运体(vesicular nucleotide transporter,VNUT)基因对大鼠胰腺β细胞(INS-1)胰岛素分泌的影响。方法2021年1月至6月通过逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)、蛋白印迹和酶联免疫吸附剂测定(ELISA)等方法检测siRNA对VNUT基因表达的作用以及对胰岛素分泌的影响。采用独立样本t检验,P<0.05为差异有统计学意义。结果siRNA转染INS-1细胞24 h后,VNUT基因表达明显下降,对照组和干扰组RNA表达结果分别为(0.452±0.218)和(0.319±0.116),蛋白分别为(0.514±0.297)和(0.369±0.203),差异均有统计学意义(均P<0.05);胰岛素分泌明显抑制,对照组和干扰组结果为(281.45±24.92)ng/L和(176.54±15.70)ng/L,差异有统计学意义(P<0.05)。结论siRNA明显抑制VNUT基因表达与INS-1胰岛素分泌,深入研究VNUT基因对胰岛素分泌的影响可为2型糖尿病发病机制因素提供参考资料。

  • 标签: siRNA 2型糖尿病 胰岛素分泌 囊泡膜核苷酸转运体
  • 简介:摘要目的利用腺病毒包装质粒pBHGE3与携带LASP-1 siRNA的穿梭质粒pZD55-LASP-1、pCA13-LASP-1在HEK293细胞内,包装成病毒ZD55-LASP-1和Ad-LASP-1。方法利用Effectene DNA转染试剂将质粒pBHGE3与质粒pZD55-LASP-1、pCA13-LASP-1分别感染HEK293细胞,纯化并扩增病毒。通过PCR鉴定Ad-LASP-1、ZD55-LASP-1是否包含目的基因,E1区是否缺失及有无野生型腺病毒污染。鉴定正确的病毒进行扩增,CsCl梯度离心纯化,TCID50法测病毒滴度。结果PCR鉴定证明ZD55-LASP-1未混杂野生型腺病毒,且包含目的序列LASP-1 siRNA;Ad-LASP-1 E1区缺失,且包含目的序列LASP-1 siRNA。ZD55-LASP-1滴度为4×1010 PFU/ml,Ad-LASP-1滴度为2×1010PFU/ml。Western-blot证实ZD55-LASP-1在肿瘤细胞中表达E1A,Ad-LASP-1不表达E1A。结论靶向表达LASP-1 siRNA序列的病毒ZD55-LASP-1重组成功,为肾癌的下一步基因治疗提供了基础。

  • 标签: LASP-1 肾细胞癌 条件增殖型腺病毒
  • 简介:目的探讨siRNA对人神经胶质瘤细胞U251的多药耐药的影响,为RNAi的体内研究提供依据。方法利用已初步筛选有效的MRP1siRNA序列,转染U251等三种肿瘤细胞,采用逆转录酶聚合酶链反应(RT-PCR)和Westernblot检测MRP1mRNA和蛋白的表达;采用3-(4,5-二甲基噻唑-2)-2,5-二苯基四氮唑溴盐(3-(4,5-Dimethylthiazol-2-yl)-2,5-diphenyltetrazoliumbromide,MTT)法检测细胞对化疗药物的敏感性改变。结果细胞转染siRNA2和siRNA4,反转录聚合酶链式反应(reversetranscription-PCR,RT-PCR)和Westernblot结果显示转染后多药耐药相关蛋白1(multidrugresistanec-associatedprotein1,MRP1)mRNA和蛋白的表达较未转染组均明显下降;药敏结果显示,转染后肿瘤细胞对表柔比星和长春新碱的敏感性增加,而对紫杉醇的敏感性没有明显改变;RT-PCR、Westernblot和MTT实验证实siRNA2是最有效的siRNA序列。结论siRNA2是体外实验中筛选出的最有效的抑制MRP基因表达的序列,针对MRP1的siRNA通过降低MRP1mRNA和蛋白的表达,可使肿瘤细胞对化疗药物的敏感性增强,逆转肿瘤细胞的多药耐药。

  • 标签: SIRNA MRP1 多药耐药 U251细胞
  • 简介:目的探讨采用RNA干扰抑制原代成骨细胞中LIMK2的表达及其抑制效率,为进一步研究LIMK2基因的作用奠定基础。方法针对小鼠LIMK2基因,化学合成3条siRNA,分别编号为R1、R2、R3,用脂质体分别介导转染到小鼠原代成骨细胞中,转染后24、48h提取细胞的总RNA和总蛋白.分别进行RT—PCR和Westernblot检测.研究3条siRNA在不同时间点对LIMK2基因的抑制效率。结果RT—PCR结果显示编号为R3的siRNA对LIMK2mRNA表达的抑制效率最高.两组应用R3siRNA后的LIMK2mRNA表达量分别为对照组的19.30%(转染后24h)、18.63%(转染后48h):Westernblot检测显示编码为R3的siRNA对LIMK2蛋白表达的抑制效果最明显,两组应用R3siRNA的LIMK2蛋白表达量分别仅为空白对照组的1.32%(转染后24h)、1.19%(转染后48h)。结论编号为R3的siRNA可以很好地抑制小鼠原代成骨细胞的LIMK2表达。

  • 标签: LIMK2基因 RNA干扰 成骨细胞
  • 简介:摘要目的研究沉默Wnt-1基因表达,对A2细胞脑转移能力的影响。方法siRNA转染A2细胞;将人血管内皮细胞贴附于Transwell膜上建立血脑屏障模型;检测沉默Wnt-1基因对A2细胞脑转移能力的影响。结果转染siRNA后,A2细胞迁徙能力显著抑制。结论抑制Wnt-1基因表达能够降低肺腺癌脑转移能力。

  • 标签: 人肺腺癌细胞株A2 Wnt-1 siRNA 脑转移