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7 个结果
  • 简介:Thehomeobox(Hox)genesformanevolutionarilyconservedfamilyencodingtranscriptionfactorsthatplaymajorrolesinsegmentalidentityandorganspecificationacrossspecies.ThecanonicalgroupingofHoxgenespresentintheHOM-CclusterofDrosophilaorrelatedclustersinotherorganismsincludeseight"typical"genes,whicharelocalizedintheorderlabial(lab),proboscipedia(pb),Deformed(Dfd),Sexcombsreduced(Scr),Antennapedia(Antp),Ultrabithorax(Ubx),abdominalA(abdA),andAbdominalB(AbdB).ThemembersofHoxclusterareexpressedinadistinctanteriortoposteriororderintheembryo.AnalysisoftherelatednessofdifferentmembersoftheHoxgeneclustertoeachotherinfourevolutionarilydiverseinsecttaxarevealedthatthelocipb/DfdandAbdB,whicharefarthestapartinlinkage,hadahighdegreeofevolutionaryrelatedness,indicatingthatpb/DfdtypeanteriorgenesandAbdBareclosesttotheancestralanteriorandposteriorHoxgenes,respectively.ThegreaterrelatednessofotherposteriorgenesUbxandabdAtothemoreanteriorgenessuchasAntpandScrsuggestedthattheyarosebygeneduplicationsinthemoreanteriormembersratherthantheposteriorAbdB.

  • 标签: 昆虫 同源基因 基因复制 果蝇 胚胎发育
  • 简介:调查早lycopsids,用吝啬的cladistic分析和贝叶斯的途径的发展史被介绍,与越过25taxa的33个词法人物的一个数据矩阵。产生吝啬和贝叶斯的树在树拓扑学显示出全面类似。在贝叶斯的树上,Protolepidodendrales和heterosporouslycopsids作为二个monophyletic组被认出,并且在后者以内组织Isoetalessensulato形式subclade。这拓扑学暗示一个舌状的人物的获得在lycopsids演变两次在protolepidodendralean雷克勒基亚·班克斯等,并且一次在heterosporouslycopsidclade。以前从华南的中间上面的泥盆纪报导的几lycopsid植物的种系发生的位置,有不明确的顺序的亲密关系,被cladistic分析估计;cf。薛伦戈斯塔奇斯etHao,朱伦戈斯塔奇斯等,王莫尼利斯特罗布斯et果浆,和YuguangiaHao等。在Isoetalesclade以内掉落很好,作为这份订单的最早的成员,当时王米诺斯特罗布斯和Wuxia果浆等。在heterosporouslycopsids的基础部分以内被嵌套。贝叶斯的分析是在系统的研究的一条很有用的途径并且能在分析数据也设置的paleobotanical被使用。

  • 标签: 系统发育分析 贝叶斯方法 泥盆纪 分支系统 拓扑结构 贝叶斯分析
  • 简介:Highlydiversifiedcolorationsamongspringtails(Collembola)havebeenwidelyusedforspeciesdiagnosis,buttheirphylogeneticsignificanceispoorlyknown.WeaddressedthisissueinthelargestEntomobryinaegenusEntomobrya,whichpossessesvariablecolorpatternsamongspecies.Therelationshipswithinthegenusandtoothergenerahavealsorarelybeenstudied.BasedonmaterialmainlyfromChina,wehaveconductedamultilocusphylogenyandtopologytestswithlikelihoodandBayesianalgorithms,andaccordinglydemonstratedthenon-monophylyofChineseEntomobrya.Thedivisionoffiveclades,includingEntomobryaandseveralrelatedgenera,coincidedwellwithfivetypesofcolorations,respectively.FurtheranalysesofdivergencetimeandhistoricalbiogeographyrevealedthatChineseEntomobryaoriginatedmainlyfromPalearctic(northernandwestern)ChinainthePaleoceneandEocene.Thisstudyhighlightsthegreatphylo?geneticvaluesaswellastaxonomicusesofcolorationinChineseEntomobrya.MultiplephylogeneticandbiogeographicoriginsofEntomobryaimplyitscomplicatedrelationshipswithbothscaledandunsealedgeneraofEntomobryinae.

  • 标签: COLORATION Entomobrya Entomobryinae non-monophyly PALEARCTIC origins
  • 简介:大多数phaeophytes(棕色的水藻)和rhodophytes(红水藻)专门在海洋的产地居住并且在海洋的生态学和生物多样性起重要作用。许多这些棕色、红的水藻也是为象由于他们的唯一的新陈代谢和代谢物的食物,药和材料那样的工业的重要资源。然而,因为差的分子的底,包围他们的起源,早多样化,分类,和特殊新陈代谢的许多基本问题在棕色、红的海藻的学习仍然保持未解决。作为1000植物工程的部分,从瓷器海岸的19Phaeophyceae种类和21Rhodophyta种类的海洋的macroalgaltranscriptomes被定序,盖住2数,3个班,11份订单,和19个家庭的一个总数。2Gb的一般水准每样品和一个总数,RNA-seq未加工的数据的87.3Gb被产生。为每件棕色的海藻的样品的约15000~25000unigenes和为每件红海藻的样品的5000~10000unigenes被注解并且分析。注解结果在在红水藻和棕色的水藻之间的基因表示和染色体特征显示出明显的差别;这些差别能甚至在多细胞、单细胞的红水藻之间被看见。结果阐明关于在phaeophytes和rhodophytes以内的种系发生的分类的一些基本问题,并且也揭示许多新奇新陈代谢的小径。这些小径包括海藻的CO2固定和特别糖类在棕色、红的水藻的新陈代谢,和相关基因/基因家庭特征和进化。这些调查结果在已知的海藻的基因信息上造并且显著地改进我们这些海洋的水藻的海藻的生物学,生物多样性,进化,和潜在的利用的理解。

  • 标签: 大型藻类 海洋生态 系统发育 中国沿海 生物学 转录组
  • 简介:用定序技术的16SrDNA基因,entomopatho遗传因子的线虫(杀虫剂的一种)的非共生的细菌的三不同的种(Steinernemasp。并且Heterorhabditissp)从感染的昆虫死尸被孤立并且识别{街郎mellonella幼虫)在48小时的柱子感染以后。顺序类似分析表明紧张SRK3,SRK4和SRK5分别地属于Ochrobactrumcytisi,Schineria幼虫和Ochrobactrumanthropi。isolatesO。anthropi和S。幼虫被发现分别地,而,与Heterorhabditisindica紧张BDU-17和Yer-136被联系O。cytisi与Steinernemasiamkayai紧张BDU-87被联系。Phenotypically,时间的杀虫剂的一种细菌是相当与共生杀虫剂的一种细菌(Photorhabdus和Xenorhabdus类)有关。紧张SRK3和SRK5phylogeographically类似于几非共生者并且污染了在德国(LMG3311T)和中国(X-14)孤立的杀虫剂的一种细菌,当紧张SRK4与S的isolates相同时。从在匈牙利的Wohlfahrtiamagnifica的幼虫(Ll/57,Ll/58,Ll/68和L2/11)。结果被RNA第二等的结构和排列序列的最小的精力计算进一步证实。这研究建议这些线虫的非共生者phylogeographically由于阶段变化在某程度被分叉。因此,这些紧张不是主人依赖者,但是环境特定孤立。

  • 标签: 昆虫病原线虫共生菌 rDNA 16S 感染 系统发育 XENORHABDUS