简介:摘要:目的:运用网络药理学方法探讨枳实芍药散治疗产后腹痛的作用机制。方法:构建“疾病-药物-活性成分-靶点”网络,并进行GO功能和KEGG通路富集分析。结果:筛选出55个靶点为枳实芍药散与产后腹痛症的共同基因靶点。结论:枳实芍药散在治疗产后腹痛中有着多靶点调控、多方面作用的特点。
简介:摘要:目的:运用网络药理学方法探讨芍药甘草汤治疗胃癌的作用机制。方法:构建“疾病-药物-活性成分-靶点”网络,并进行GO功能和KEGG通路富集分析。结果:筛选出121个靶点为芍药甘草汤与胃癌症的共同基因靶点。结论:芍药甘草汤在治疗胃癌中有着多靶点调控、多方面作用的特点。
简介:摘要:目的:运用网络药理学方法探讨玉屏风散治疗慢性肾炎的作用机制。方法:构建“疾病-药物-活性成分-靶点”网络,并进行GO功能和KEGG通路富集分析。结果:筛选出105个靶点为玉屏风散与慢性肾炎症的共同基因靶点。结论:玉屏风散在治疗慢性肾炎中有着多靶点调控、多方面作用的特点。
简介:摘要:目的:运用网络药理学方法探讨玉屏风散治疗非小细胞肺癌的作用机制。方法:构建“疾病-药物-活性成分-靶点”网络,并进行GO功能和KEGG通路富集分析。结果:筛选出153个靶点为玉屏风散与非小细胞肺癌症的共同基因靶点。结论:玉屏风散在治疗非小细胞肺癌中有着多靶点调控、多方面作用的特点。
简介:摘要目的基于网络药理学探讨芍药甘草汤干预紧张性头痛作用机制。方法通过TCMSP筛选得到芍药甘草汤的潜在有效成分与靶点,运用GeneCards、DisGeNET、Drugbank和在线人类孟德尔遗传数据库(OMIM)获取紧张性头痛的作用靶点,得到"芍药甘草汤-紧张性头痛"交集靶点,上传至STRING数据库绘制蛋白相互作用网络(protein-protein interaction, PPI)并进行拓扑分析,借助Cytoscape 3.6.1软件构建"芍药甘草汤-药物成分-靶点-紧张性头痛"可视化网络,并对交集靶点进行GO富集分析及KEGG通路富集分析。结果芍药甘草汤与紧张性头痛的交集靶点有51个,拓扑属性分析提示CASP3、JUN、HSP90AA1、MAPK1、STAT3、CCND1、ESR1、RELA、PTGS2、MAPK14等可能是芍药甘草汤干预紧张性头痛的重要潜在靶点。GO富集分析得到876个细胞生物学过程,62个细胞组分,101个分子功能。KEGG通路富集分析得到TNF信号通路、5-羟色胺能突触通路、核苷酸寡聚化结构域(NOD)样受体信号通路、多巴胺能突触通路和胆碱能突触通路等25条相关信号通路。结论芍药甘草汤对紧张性头痛的干预作用具有多成分、多靶点、多通路的作用机制特点,可为临床用药提供指导。
简介:摘要:目的:运用网络药理学方法探讨小承气汤治疗消化溃疡的作用机制。方法:构建“疾病-药物-活性成分-靶点”网络,并进行GO功能和KEGG通路富集分析。结果:筛选出144个靶点为小承气汤与消化溃疡症的共同基因靶点。结论:小承气汤在治疗消化溃疡中有着多靶点调控、多方面作用的特点。
简介:摘要目的通过网络药理学方法研究二妙散干预特应性皮炎的药理机制,分析其作用的活性成分、分子靶点和信号通路。方法通过TCMSP和Drugbank数据库获得二妙散活性成分和靶点。通过GEO数据库分析差异表达基因,获得特应性皮炎疾病靶点。通过Cytoscape的Bisogenet和CytoNCA插件获得二妙散治疗特应性皮炎的靶基因。通过DAVID数据库进行GO和KEGG富集分析。结果经筛选获得二妙散12种活性成分和107个靶点;鉴定出274个特应性皮炎差异表达基因(矫正P值<0.005和|log2(差异倍数)|>1.5)。得到187个二妙散治疗特应性皮炎的靶基因。靶基因的功能注释与端粒组织、蛋白异四聚体化、基因表达调控等相关。PI3K-Akt、MAPK、HIF-1信号通路等20条通路显著性富集。MAPK1、AKT、RELA、和TP53等多个基因为二妙散基因通路网络中干预特应性皮炎的关键基因。结论二妙散中槲皮素、四氢小檗碱、豆甾醇等核心成分可能通过参与PI3K-Akt、MAPK、HIF-1等信号通路,调控MAPK1、AKT、RELA和TP53等基因靶点,治疗特应性皮炎。
简介:摘要目的运用网络药理学探讨温胆汤治疗高血压的分子机制。方法通过TCMSP和中医药整合药理学研究平台(TCMIP)筛选温胆汤的潜在活性成分和作用靶点,通过药物靶标数据库(TTD)、在线人类孟德尔遗传数据库(OMIM)、GeneCards数据库收集高血压疾病靶点,STRING数据库进行蛋白相互作用分析,采用Cytoscape v3.7.1构建网络,再用ClueGO进行GO功能和KEGG通路富集分析,最后以适合的分子和靶点进行分子对接。结果共筛选出温胆汤141个潜在活性成分和108个潜在治疗靶点;通过cytoHubba中MCC算法筛选出排位前20的核心靶点,GO分析包含164条显著性条目,包括生物过程133条、分子功能24条、细胞定位7条。KEGG通路富集筛选出7条枢纽通路,且活性成分与靶点间对接良好。结论温胆汤可通过多途径、多靶点治疗高血压,可为其临床应用提供数据。
简介:摘要:目的:运用网络药理学方法探讨厚朴三物汤治疗便秘的作用机制。方法:构建“疾病-药物-活性成分-靶点”网络,并进行GO功能和KEGG通路富集分析。结果:筛选出122个靶点为厚朴三物汤与便秘症的共同基因靶点。结论:厚朴三物汤在治疗便秘中有着多靶点调控、多方面作用的特点。
简介:摘要目的应用网络药理学及分子对接探讨四逆散从缓解消化道症状及精神神经症状方面综合干预肠易激综合征的分子作用机制。方法检索TCMSP数据库获取四逆散的主要活性成分及其靶点,GeneCards数据库及疗效药靶数据库(TTD)获取肠易激综合征的靶基因,利用STRING数据库及Cytoscape软件构建蛋白相互作用网络并筛选出核心基因,基于CB-Dock在线对接工具进行核心靶点-药物成分的分子对接验证,运用DAVID和Metascape数据库分别进行GO和KEGG通路分析。结果共获得四逆散活性成分112个及作用靶点204个,肠易激综合征相关靶基因2 805个,中药-疾病交集靶点152个,主要涉及IL-17信号通路、NF-κB信号通路、VEGF信号通路、多巴胺能突触通路、血清素突触通路和钙信号通路。结论四逆散可通过多成分、多靶点、多途径调节神经内分泌通路、调节免疫平衡、改善肠道轻度炎症和修复肠道屏障从而干预肠易激综合征。
简介:摘要目的利用网络药理学技术研究经典药对当归-白芍治疗心血管疾病的作用及机制。方法检索TCMSP和相关文献筛选得到当归-白芍药对中潜在活性化合物,并结合SWISS、STITCH数据库挖掘化合物对应的靶点;通过治疗靶标数据库(TTD)、在线人类孟德尔遗传数据库(OMIM)和DrugBank数据库挖掘心血管疾病靶点;构建蛋白互作网络,分析主要靶点;利用生物学信息注释数据库(DAVID 6.8)进行KEGG信号通路注释分析,并应用Cytoscape构建成分-主要靶点-关键通路网络。结果构建的成分-靶点-通路网络中包括17个药对成分,54个主要靶点及10条关键通路。涉及的通路包括炎症相关通路(TNF信号通路)、心血管系统相关通路(PI3K-AKT信号通路、FoxO信号通路、VEGF信号通路、Rap1信号通路等)、催乳素信号通路和雌激素信号通路。结论应用网络药理学验证了当归-白芍药对多成分、多靶点、整体调节的作用特点,推测其主要通过调节血管生成、炎症反应和细胞凋亡等途径发挥治疗心血管疾病的作用。
简介:摘要:目的:运用网络药理学及分子对接技术探讨银翘散治疗儿童肺炎支原体肺炎的作用靶点及潜在机制。方法:运用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)及中药分子机制分析综合数据库筛选银翘散化合物相关靶点。运用人类基因数据库GeneCards筛选儿童MPP相关靶点。交集靶点被用于构建化合物靶点蛋白质-蛋白质相互作用网络并进行基因本体论和京都基因与基因组百科全书代谢通路富集分析。运用Cytoscape软件进行可视化,依据各节点度值确定关键化合物、最大团中心性(MCC)值确定核心靶点。利用Autodock软件对关键化合物及核心靶点进行分子对接。结果:筛选出156种活性成分及56个交集靶点。GO和KEGG富集结果表明银翘散可能通过调控机体免疫功能、细胞因子及炎症反应、抗氧化损伤,影响白介素-17、肿瘤坏死因子、Toll样受体以及JAK酪氨酸蛋白激酶-信号传导和转录激活因子等信号通路的活性,达到治疗儿童MPP作用。分子对接结果表明银翘散关键化合物与核心靶点均可稳定结合。结论:银翘散对儿童MPP的治疗的药理作用是多组分、多靶点、多通道的联合作用。
简介:摘要目的运用网络药理学和分子对接技术分析七方胃痛颗粒干预胃癌的潜在作用机制。方法运用TCMSP、TCMID和Swiss Target Prediction数据库筛选七方胃痛颗粒的药物化学成分及相关靶点,采用GeneCards、OMIM数据库筛选胃癌作用靶点,并获得药物-疾病共同靶点,上传至STRING数据库,构建蛋白相互作用关系(PPI)网络,得到关键靶点,在Oncomine肿瘤数据库中分析关键靶点与胃癌的相关性。通过Cytoscape软件构建药物-疾病调控网络,采用Cytoscape软件的CluoGO插件和R语言对关键靶点进行GO和KEGG富集分析。通过分子对接验证药物分子和靶分子结合的可能性。结果获得七方胃痛颗粒的药物化学成分168个,胃癌作用靶点2 803个,药物-疾病共同靶点49个。药物-疾病调控网络中度值较高的化学成分为β-谷甾醇、芒柄花素、豆甾醇等。PPI网络中关键靶点为MAPK8、FOS、AR等,GO富集分析集中于凋亡信号通路中线粒体外膜通透性的正调控等,KEGG富集分析显著富集在细胞凋亡通路等。分子对接结果显示药物分子与靶分子结合性好、构象稳定。结论七方胃痛颗粒可诱导与胃癌相关的基因、蛋白表达,影响激素水平、细胞凋亡等生物学过程,激活凋亡信号通路来发挥主效应。
简介:摘要:目的:运用网络药理学方法探讨小承气汤治疗慢性肾脏病的作用机制。方法:构建“疾病-药物-活性成分-靶点”网络,并进行GO功能和KEGG通路富集分析。结果:筛选出117个靶点为小承气汤与慢性肾脏病症的共同基因靶点。结论:小承气汤在治疗慢性肾脏病中有着多靶点调控、多方面作用的特点。