简介:细螺旋体病是螺旋体种类引起的传染细菌的疾病。在这研究,我们克隆并且定序从L编码immunodominant蛋白质GroEL的基因。interrogansserovarAutumnalis种类N2,在Chennai在细螺旋体病的爆发期间从一个病人的尿被孤立,印度。这groEL基因另外的leptospiralserovars与相同(99%类似)的高度编码60kDa的蛋白质到那些。RecombinantGroEL是在Escherichiacoli的overexpressed。当没有反应从seronegative控制病人与sera被观察时,Immunoblot分析显示从证实的细螺旋体病病人的sera与recombinantGroEL显示出强壮的反应。另外,GroEL的3D结构作为模板从Thermusthermophilus用chaperonin建筑群cpn60被构造并且验证。结果显示了8.35的Z分数,它在对为蛋白质的期望的价值的好同意。cpn60结构的Ca踪迹和leptospiralGroEL的预言的结构的重叠与1.5的RMSD价值显示第二等的结构元素的好同意?。进一步的学习是必要的作为一个疫苗的部件为细螺旋体病的血清学的诊断并且为它的潜力评估GroEL。
简介:<正>Usingsubtractioncloning,weidentifiedthehumanN-MycDownstream-RegulatedGene-2(hNDRG2),locatedat14q11.2,asacandidatetumorsuppressorgene.Semi-quantitativeRT-PCRshowedthattheexpressionofhNDRG2in15of27(56%)humanGBMtissuesandall6humanglioblastomacelllineswassignificantlylowerthanthatinthenormalbrain.TheexpressionofhNDRG2alsowasevaluatedin60lung-carcinomapatients.17of26casesofsquamouscarcinomaand4of11casesofsmallcelllungcancerdisplayed
简介:流行性感冒A病毒(H1N1),人的地方性的紧张的一个基因分类,鸟并且猪流感,穿过种类障碍到人并且显然获得了人的能力到人的传播。因为NS1蛋白质禁止抗病毒的干扰素/生产,H5N1子类型的一些紧张是高度剧毒的。另一蛋白质NS2调停到通过出口的细胞质的从原子核的病毒的ribonucleoprotein的出口信号。在这份报纸,我们学习了H1N1子类型的这些蛋白质的结构功能关系并且决定了他们的致病力的原因。我们的结果证明非保守的变化稍微稳定了或使动摇NS1或NS1-dsRNA建筑群的结构的域,稍微因此增加了或减少NS1蛋白质并且因而的函数提高了或减少H1N1病毒的致病力。不同紧张的NS2蛋白质在不同领域带了非保守的变化,导致功能的细微损失。这些变化稍微减少了病毒的致病力。因此,结果证实这些病毒的蛋白质的结构功能关系。
简介:N6-(2-羟乙基)腺苷[N6-(2-hydroxyethyl).Adenosine,HEA],又名茧草菌素,是一种钙离子拮抗剂,具有抗紫外辐射、抗血小板凝结和镇痛等效用,是集医药保健、化妆品等多项开发潜力于一身的生物资源,也是衡量虫草制品质量的一个重要生物活性物质指标。该研究采用高效液相色谱法对菌丝体中HEA进行检i贝0,以HEA的产量为指标,考察不同培养方法、培养基及其组分、前体物和氨基酸对粉被虫草(CordycepspruinosaPetch)cp菌株产HEA的影响。结果表明:在沙氏培养基上,静置培养120d,cp菌株HEA的产量明显优于摇床培养20d和发酵罐培养3d的产量,说明随培养时间的延长,cp菌株中HEA的累积会逐步增加。在静置培养条件下,cp菌株在查氏培养基上HEA的产量明显优于沙氏培养基和PD培养基,HEA的产量是沙氏培养基的3.7倍,是PD培养基的4.48倍。以查氏培养基为基础培养基,静置培养120d进行碳、氮源的筛选中,最有利于cp菌株产HEA的是蔗糖和硝酸钠;在无机盐的筛选中,K2nP04是促进cp菌株累积HEA最主要的无机盐,其HEA产量较对照(不添加无机盐的查氏培养基)提高了58.2倍;在查氏培养基上添加不同前体物和氨基酸,发现其结构类似物腺苷、次黄嘌呤和腺嘌呤都有促进cp菌株累积HEA的能力,其中腺苷和次黄嘌呤的效果最好,能提高HEA产量60%以上;添加的14种氨基酸中有组氨酸、L-谷氨酸、甘氨酸、天门冬酰胺、丝氨酸、亮氨酸、L-丙氨酸、赖氨酸和精氨酸等9种氨基酸能促进cp菌株产HEA的能力,其中组氨酸是最有利于cp菌株累积HEA的氨基酸,其HEA产量较ck(查氏培养基)提高251.68%,HEA产量达到(45.56±2.8)mg/L,菌丝体中HEA含量达到(4633.10±65.65)肛∥g。
简介:TheNetAcetmethodhasbeendevelopedtomakepredictionsofN-terminalacetylationsites,butmoreinformationofthedatasetcouldbeutilizedtoimprovetheperformanceofthemodel.Byemployinganewwaytoextractpatternsfromsequencesandusingasamplebalancingmechanism,weobtainedacorrelationcoefficientof0.85,andasensitivityof93%onanindependentmammaliandataset.Awebserverutilizingthismethodhasbeenconstructedandisavailableathttp://166.111.24.5/acetylation.html.
简介:TheCoronaviridaefamilyischaracterizedbyanucleocapsidthatiscomposedofthegenomeRNAmoleculeincombinationwiththenucleoprotein(Nprotein)withinavirion.ThemoststrikingphysiochemicalfeatureoftheNproteinofSARS-CoVisthatitisatypicalbasicproteinwithahighpredictedpIandhighhydrophilicity,whichisconsistentwithitsfunctionofbindingtotheribophosphatebackboneoftheRNAmolecule.ThepredictedhighextentofphosphorylationoftheNproteinonmultiplecandidatephosphorylationsitesdemonstratesthatitwouldberelatedtoimportantfunctions,suchasRNA-bindingandlocalizationtothenucleolusofhostcells.SubsequentstudyshowsthatthereisanSR-richregionintheNproteinandthisregionmightbeinvolvedintheprotein-proteininteraction.TheabundantantigenicsitespredictedintheNprotein,aswellasexperimentalevidencewithsynthesizedpolypeptides,indicatethattheNproteinisoneofthemajorantigensoftheSARS-CoV.Comparedwithotherviralstructuralproteins,thelowvariationrateoftheNproteinwithregardstoitssizesuggestsitsimportancetothesurvivalofthevirus.
简介:目的:应用重组杆状病毒表达系统制备由HA、NA、M1和M2蛋白组成的H5N1高致病性禽流感病毒样颗粒,为研究H5N1高致病性禽流感疫苗奠定基础。方法:构建能共表达A/chicken/Jilin/2003(H5N1)禽流感病毒血凝素(HA)和神经氨酸酶(NA)、A/PR/8/34(H1N1)流感病毒基质蛋白(M1)和离子通道蛋白(M2)的2个二元重组杆状病毒,共同感染HighFive细胞,同时表达HA、NA、M1和M2蛋白,使这4种蛋白在感染的细胞内自主组装成病毒样颗粒。经差速离心和蔗糖密度梯度超速离心收获病毒样颗粒,通过Western印迹鉴定病毒样颗粒的组成,透射电镜观察病毒样颗粒形态,血凝试验测定病毒样颗粒的活性。结果:HA、NA、M1、M2蛋白在昆虫细胞中共表达,并组装成病毒样颗粒;电镜观察到病毒样颗粒的形态与流感病毒一致,直径约80nm;血凝试验显示该病毒样颗粒具有凝集鸡红细胞的活性。结论:应用该方法可以制备流感病毒样颗粒,为H5N1流感疫苗研究提供了可行方案。
简介:流行性感冒的所有已知的子类型A病毒在野水鸟被维持,这些病毒的自然水库。流行性感冒A病毒被孤立从许多有改变病态和死亡率的动物种类。更重要地,流行性感冒A病毒与潜在地致命的结果在人引起呼吸疾病。在人的本地或全球的爆发被过量住院和死亡典型地描绘。在1997,H5N1子类型的高度病原的鸟的流行性感冒病毒在传给人的香港出现了,导致由鸟的流行性感冒病毒感染的人的死亡的首先记录的盒子。在越南,印度尼西亚,和泰国在家禽在2003年7月开始的新爆发,和高度病原的鸟的H5N1流行性感冒病毒后来在整个亚洲并且进欧洲和非洲传播了。这些病毒继续与高死亡率感染人并且引起隐约可见的世界范围的担心流行。而且,H5N1病毒爆发在整个亚洲在家禽工业上有破坏效果。因为H5N1病毒爆发看起来从南部的中国发源,我们这里在中国检验H5N1流行性感冒病毒,与他们的生物性质上的一个重音。
简介:Thesurfaceglycoproteinhemagglutinin(HA)helpstheinfluenzaAvirustoevadethehostimmunesystembyantigenicvariationandisamajordrivingforceforviralevolution.Inthisstudy,theselectionpressureonHAofH5N1influenzaAviruswasanalyzedusingbioinformaticsalgorithms.Mostoftheidentifiedpositiveselection(PS)siteswerefoundtobewithinoradjacenttoepitopesites.SomeoftheidentifiedPSsitesareconsistentwithpreviousexperimentalstudies,providingfurthersupporttothebiologicalsignificanceofourfindings.ThehighestfrequencyofPSsiteswasobservedinrecentstrainsisolatedduring2005–2007.PhylogeneticanalysiswasalsoconductedonHAsequencesfromvarioushosts.Viraldriftisalmostsimilarinbothavianandhumanspecieswithaprogressivetrendovertheyears.OurstudyreportsnewmutationsinfunctionalregionsofHAthatmightprovidemarkersforvaccinedesignorcanbeusedtopredictisolatesofpandemicpotential.
简介:预言潜水艇的能力从它的顺序的蛋白质的细胞的本地化是很重要的,它关于蛋白质的功能提供信息。我们在场一个计算工具,PredSL,它利用神经网络,Markov链,隐藏的Markov建模的侧面,和得分为潜水艇的预言的矩阵在从N终端氨基酸顺序的真核细胞的房间的蛋白质的细胞的本地化。它试图分类蛋白质进五个组:叶绿体,thylakoid,线粒体,能分泌的小径,和“其它”。当在一个五倍的交叉验证过程测试了时,PredSL分别地为植物和非植物数据集表明86.7%和87.1%全面精确性。与TargetP,迄今为止是最广泛地使用的方法,和LumenP相比,PredSL的结果在大多数情况中是可比较的。当在Saccharomycescerevisiae染色体的试验性地验证的蛋白质上测试了时,PredSL可比较地表现如果比为一样的任务的任何可得到的算法不好。而且,PredSL是为这些的预言有能力的唯一的方法代替作为通过URL:http://bioinformatics.biol.uoa.gr/PredSL/的独立应用可得到的细胞的本地化。
简介:抗性种质N9659含有野生二粒小麦(资源编号:AS846)的抗白粉病基因,并对陕西关中地区白粉病优势小种表现为高抗。为了研究其抗白粉病基因的遗传规律,用高感品种辉县红、阿勃、陕160和阿勃21个缺(单)体系分别与N9659进行杂交,F1和F2苗期接种关中地区白粉病流行小种。结果显示,组合辉县红×N9659、阿勃×N9659、陕160×N9659及阿勃21个缺(单)体系和N9659杂交组合的所有F1均表现为高抗白粉病,F2的白粉病抗感比例除组合阿勃5BM×N9659偏离3∶1外,其他组合均符合3∶1,表明N9659苗期白粉病抗性由1对位于染色体5B上的完全显性基因控制。
简介:2009年3月在美国和墨西哥流感样患者的呼吸道标本中鉴定出新的猪源性甲型H1N1流感病毒。该病毒可人-人传播,已蔓延到112个国家和地区。为了遏制不断重组或重配的流感病毒,各国学者对甲型H1N1流感病毒的分子生物学特征、复制周期及实验室诊断做了细致的研究,以研发相应的药物或疫苗,这些成就为世界各国防控今年新鉴定的猪源性甲型H1N1流感病毒感染发挥了重要作用。现就猪源性甲型H1N1流感病毒的鉴定、基因组结构特征做一综述。
简介:目的:观察外源给予H2O2对C2C12细胞中UII/UT系统表达的影响。方法:培养小鼠肌原细胞系C2C12细胞株,应用胎盘蓝染色和测定细胞培养液中LDH的含量检测H2O2对细胞损伤的影响,应用放射免疫的方法检测细胞培养液和裂解液中UII的含量,应用RT-PCR法测定C2C12中UTmRNA的表达,应用WesternBlot检测不同浓度H2O2对肌原细胞系C2C12中UT蛋白表达的影响。结果:外源给予不同浓度的H2O2,C2C12细胞裂解液中UII的含量各组间无明显差异,但增加了细胞孵育液中UII的含量,10-4M和10-3M时分别增加了83.1%(p〈0.01)和94.5%(P〈0.01)。低浓度H2O2(0.5×10-6M,10-6M,10-5M,10-4M)刺激明显增加了UTmRNA的表达,而高浓度的H2O2(10-3M)刺激反而使UTmRNA的表达降低。高浓度的H2O2(10-6M,10-5M,10-4M,10-3M)刺激使UT蛋白表达分别增加了200.1%、255.6%、111.1%和100.1%(均p〈0.05)。结论:H2O2作为T2DM发病因素之一的活性氧族,可能是T2DM时骨骼肌组织中UII/UT系统表达增加的一个因素。
简介:TRAF2isacriticaladaptormoleculeforTNFreceptorsininflammatoryandimmunesignaling.Uponreceptorengagement,TRAF2isrecruitedtoCD40andtranslocatestolipidraftsinaRINGfinger-dependentprocess,whichenablestheactivationofdownstreamkinases.TRAF1candisplaceTRAF2andCD40fromraftfractions,anditpromotestheabilityofTRAF2tosustainsignalactivation.ReplacementoftheRINGfingerofTRAF2witharaft-targetingsignalrestoresJNKactivationandassociationwiththecytoskeletalproteinFilamin,butnotNF-KBactivation.TRAF1-/-dendriticcellsshowattenuatedresponses