简介:IntheapplicationofRNAitechnology,itisanessentialsteptodesignsiRNAapplicabletotargetgene.Atpresent,therearemanyresearchesandconclusionsonsiRNAdesign.ThispaperaimstotheinfluencesofmRNAsecondarystructureorsiRNAantisense-strandsecondarystructureonsiRNAsilenceefficiency.Thepaperalsodiscussestheproblemsandsetsoutfurtherinsightsintheresearch.
简介:摘要目的前列腺特异膜抗原(PSMA)适配体Apt-A10-3.2可作为前列腺癌早期诊断和靶向治疗的特异性配体。鼠双微体(MDM2)与前列腺癌恶性程度密切相关,且MDM2小干扰RNA(siRNA)可通过RNA干扰机制靶向沉默MDM2目的基因。设计合成PSMA Apt-MDM2 siRNA新型嵌合体,与多西他赛(DTX)联合以探讨PSMA阳性前列腺癌的靶向治疗及99Tcm标记嵌合体显像监测相结合的诊疗新模式。方法PSMA Apt-A10-3.2与MDM2 siRNA通过共价偶联合成嵌合体Apt-siRNA,在PSMA表达阳性的前列腺癌细胞株(22RV1及LNCaP)中,采用Apt-siRNA单独或联合DTX对细胞株进行处理,通过Western blot检测MDM2及凋亡相关蛋白[B淋巴细胞瘤-2基因(Bcl-2)及其相关X蛋白(Bax)、聚ADP核糖聚合酶(PARP)、半胱氨酸蛋白酶3(caspase-3)]表达水平,评价治疗效果。取22RV1荷瘤裸鼠15只,分别予PBS、DTX+Apt(200 pmol)和DTX+Apt(400 pmol)处理,观察肿瘤体积与MDM2水平;行99Tcm-Apt-siRNA SPECT显像,获得肿瘤/肌肉放射性计数(T/M)比值。采用单因素方差分析和Tukey多重检验、线性回归分析等分析数据。结果在22RV1及LNCaP细胞株中,Apt-siRNA明显降低MDM2表达(0.25±0.02,F=183.40,P<0.001;0.56±0.03,F=37.15,P<0.001);Apt-siRNA联合DTX治疗前列腺癌后,Bcl-2表达水平明显降低,Bax、PARP、caspase-3表达水平明显升高。在22RV1荷瘤裸鼠中,Apt-siRNA联合DTX明显抑制肿瘤MDM2蛋白表达(400 pmol:0.59±0.12;F=49.99,P=0.023)及肿瘤体积[400 pmol:(0.22±0.07) cm3;F=71.30,P=0.039];SPECT显像示,治疗后T/M比值明显降低(400 pmol:2.07±0.22;F=34.99,P=0.022),与MDM2表达水平有线性回归关系(R2=0.875,P<0.001)。结论Apt-siRNA联合DTX能有效抑制前列腺癌进展,并通过偶联99Tcm实现PSMA阳性前列腺癌可视化靶向诊疗。
简介:目的筛选出对人CathepsinK(CTSK)基因抑制效率最高的1对siRNA,并通过质粒载体表达该siRNA,为进一步抑制去分化人软骨细胞中CTSK的表达奠定基础。方法针对CathepsinK基因设计4个靶位点,并根据靶位点合成4对siRNA.并转染人软骨细胞。通过Real-timePCR检测4对siRNA中抑制效率最高的1对,与线性化的PGCsilencer-H1/Neo/GFP连接、转化、扩增与纯化质粒。结果4对siRNA转染软骨细胞后72h,通过对照FITC-siRNA的绿色荧光观察.siRNA的转染效率达到70%~80%。Real-timePCR检测每对siRNA的CTSK量与对照组比的百分率得到其抑制效率,分别为:第1对的比值大于对照组(无抑制作用),第2对47.5%,第3对53.1%,第4对67.3%(抑制效率最大)。成功构建出pGCsilencer^TMH1/Neo/GFP/CTSKRNAi载体,经测序证实了克隆的RNAi打靶序列100%正确。结论成功构建了CTSK基因的siRNAs表达质粒,为进一步研究抑制该基因表达对延缓软骨细胞的去分化过程并促进其成软骨能力奠定了基础。
简介:AbstractBackground:Fibroblast-like synoviocytes (FLSs), resident mesenchymal cells of synovial joints, play an important role in the pathogenesis of rheumatoid arthritis (RA). Dickkopf-1 (DKK-1) has been proposed to be a master regulator of bone remodeling in inflammatory arthritis. Here, potential impairation on the activity of FLSs derived from RA to small interfering RNAs (siRNAs) targeting DKK-1 was investigated.Methods:siRNAs targeting DKK-1 were transfected into FLSs of patients with RA. Interleukin (IL)-1β, IL-6, IL-8, matrix metalloproteinase (MMP) 2, MMP3, MMP9, transforming growth factor (TGF)-β1, TGF-β2 and monocyte chemoattractant protein (MCP)-1 levels in the cell culture supernatant were detected by enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA). Invasion assay and 3H incorporation assay were utilized to investigate the effects of siRNAs targeting DKK-1 on FLSs invasion and cell proliferation, respectively. Western blotting was performed to analyze the expression of nuclear factor (NF)-κB, interleukin-1 receptor-associated kinase (IRAK)1, extracellular regulated protein kinases (ERK)1, Jun N-terminal kinase (JNK) and β-catenin in FLSs.Results:DKK-1 targeting siRNAs inhibited the expression of DKK-1 in FLSs (P < 0.01). siRNAs induced a significant reduction of the levels of IL-6, IL-8, MMP2, MMP3 and MMP9 in FLSs compared to the control group (P < 0.05). DKK-1 targeting siRNAs inhibited the proliferation and invasion of FLSs (P < 0.05). Important molecules of pro-inflammatory signaling in FLSs, including IRAK1 and ERK1, were decreased by the inhibition of DKK-1 in FLSs. In contrast, β-catenin, a pivotal downstream molecule of the Wnt signaling pathway was increased.Conclusions:By inhibiting DKK-1, we were able to inhibit the proliferation, invasion and pro-inflammatory cytokine secretion of FLSs derived from RA, which was mediated by the ERK or the IRAK-1 signaling pathway. These data indicate the application of DKK-1 silencing could be a potential therapeutic approach to RA.
简介:目的设计并合成抗人骨肉瘤Periostin基因的siRNA分子,观察基因沉默效应。方法根据GenBank上获取的PeriostinmRNA序列合成4条siRNA分子,用脂质体介导转染体外培养的肉瘤细胞MG-63细胞,培养48h,采用ELISA评估、RT-PCR检测和Westernblot检测分析基因沉默效果。结果不同实验组之间的蛋白表达水平的差异有统计学意义(F=86.52,P〈0.01),与对照组相比,4条PeriostinsiRNA均下调Periostin蛋白表达的水平,其中以PeriostinsiRNA3效果最好,抑制率分别为58.06%、61.78,75.33%和51.67%。结论靶向PeriostinsiRNA均有效抑制Periostin蛋白的表达水平。
简介:客观CXCR4是为癌症基因治疗的一个潜在的目标。在这研究,指向CXCR4基因的RNA干扰制动火箭病毒向量被构造,并且它对由压抑CXCR4基因表示的前列腺癌症房间的侵略的影响被分析。CXCR4特定的siRNA基因被PCR克隆并且插入了进Pgensil-1原生质标志反对染色U6倡导者和EGFP的方法,然后recombinant碎裂是进PLXSN的亚cloned并且由限制酶测试了并且定序。从transfectedPA317房间获得的病毒是进前列腺癌症房间的transfected。CXCR4mRNA的表示被RT-PCR检测。前列腺癌症房间在试管内的侵略的能力被Transwell实验估计。与recombinantPLXSNtransfection,在前列腺癌症房间PC-3m和LNCaP的CXCR4mRNA的表示以率被减少,这被显示出的结果(84.26±10.20)%并且(88.17±11.23)%分别地。Transwell实验的结果也证明房间在下面的数字微膜分别地,在控制组(P<0.05)与46.9±5.3和66.7±6.0相比在PC-3m和LNCaP的对待的组是14.7±3.1和18.9±4.2。结论PLXSN/EGFP-U6-siCXCR4能显著地压抑表示fCXCR4,前列腺癌症房间在试管内的侵略海角被也禁止。这recombinant碎片将在前列腺癌症的治疗是有用的。
简介:目的筛选有效的MRP1siRNA序列,为RNAi的体内外研究提供依据.方法利用Dharmacon公司的RNA在线工具,设计了4对针对MRP1基因不同区域的siRNA序列,分别转染至U251等三种肿瘤细胞,采用荧光转染试剂观察转染效率;采用RT-PCR和Westernblot检测MRP1mRNA和蛋白的表达.结果siRNA1、siRNA2、siRNA3、siRNA4四对序列分别转染上述三种肿瘤细胞后的RT-PCR实验结果说明siRNA2和siRNA4对MRPmRNA有较强的抑制作用.结论siRNA2、siRNA4是可有效抑制MRP基因表达的序列.
简介:摘要目的观察小干扰RNA(small interfering RNA,siRNA)干扰囊泡膜核苷酸转运体(vesicular nucleotide transporter,VNUT)基因对大鼠胰腺β细胞(INS-1)胰岛素分泌的影响。方法2021年1月至6月通过逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)、蛋白印迹和酶联免疫吸附剂测定(ELISA)等方法检测siRNA对VNUT基因表达的作用以及对胰岛素分泌的影响。采用独立样本t检验,P<0.05为差异有统计学意义。结果siRNA转染INS-1细胞24 h后,VNUT基因表达明显下降,对照组和干扰组RNA表达结果分别为(0.452±0.218)和(0.319±0.116),蛋白分别为(0.514±0.297)和(0.369±0.203),差异均有统计学意义(均P<0.05);胰岛素分泌明显抑制,对照组和干扰组结果为(281.45±24.92)ng/L和(176.54±15.70)ng/L,差异有统计学意义(P<0.05)。结论siRNA明显抑制VNUT基因表达与INS-1胰岛素分泌,深入研究VNUT基因对胰岛素分泌的影响可为2型糖尿病发病机制因素提供参考资料。
简介:摘要目的利用腺病毒包装质粒pBHGE3与携带LASP-1 siRNA的穿梭质粒pZD55-LASP-1、pCA13-LASP-1在HEK293细胞内,包装成病毒ZD55-LASP-1和Ad-LASP-1。方法利用Effectene DNA转染试剂将质粒pBHGE3与质粒pZD55-LASP-1、pCA13-LASP-1分别感染HEK293细胞,纯化并扩增病毒。通过PCR鉴定Ad-LASP-1、ZD55-LASP-1是否包含目的基因,E1区是否缺失及有无野生型腺病毒污染。鉴定正确的病毒进行扩增,CsCl梯度离心纯化,TCID50法测病毒滴度。结果PCR鉴定证明ZD55-LASP-1未混杂野生型腺病毒,且包含目的序列LASP-1 siRNA;Ad-LASP-1 E1区缺失,且包含目的序列LASP-1 siRNA。ZD55-LASP-1滴度为4×1010 PFU/ml,Ad-LASP-1滴度为2×1010PFU/ml。Western-blot证实ZD55-LASP-1在肿瘤细胞中表达E1A,Ad-LASP-1不表达E1A。结论靶向表达LASP-1 siRNA序列的病毒ZD55-LASP-1重组成功,为肾癌的下一步基因治疗提供了基础。
简介:目的探讨siRNA对人神经胶质瘤细胞U251的多药耐药的影响,为RNAi的体内研究提供依据。方法利用已初步筛选有效的MRP1siRNA序列,转染U251等三种肿瘤细胞,采用逆转录酶聚合酶链反应(RT-PCR)和Westernblot检测MRP1mRNA和蛋白的表达;采用3-(4,5-二甲基噻唑-2)-2,5-二苯基四氮唑溴盐(3-(4,5-Dimethylthiazol-2-yl)-2,5-diphenyltetrazoliumbromide,MTT)法检测细胞对化疗药物的敏感性改变。结果细胞转染siRNA2和siRNA4,反转录聚合酶链式反应(reversetranscription-PCR,RT-PCR)和Westernblot结果显示转染后多药耐药相关蛋白1(multidrugresistanec-associatedprotein1,MRP1)mRNA和蛋白的表达较未转染组均明显下降;药敏结果显示,转染后肿瘤细胞对表柔比星和长春新碱的敏感性增加,而对紫杉醇的敏感性没有明显改变;RT-PCR、Westernblot和MTT实验证实siRNA2是最有效的siRNA序列。结论siRNA2是体外实验中筛选出的最有效的抑制MRP基因表达的序列,针对MRP1的siRNA通过降低MRP1mRNA和蛋白的表达,可使肿瘤细胞对化疗药物的敏感性增强,逆转肿瘤细胞的多药耐药。
简介:目的探讨采用RNA干扰抑制原代成骨细胞中LIMK2的表达及其抑制效率,为进一步研究LIMK2基因的作用奠定基础。方法针对小鼠LIMK2基因,化学合成3条siRNA,分别编号为R1、R2、R3,用脂质体分别介导转染到小鼠原代成骨细胞中,转染后24、48h提取细胞的总RNA和总蛋白.分别进行RT—PCR和Westernblot检测.研究3条siRNA在不同时间点对LIMK2基因的抑制效率。结果RT—PCR结果显示编号为R3的siRNA对LIMK2mRNA表达的抑制效率最高.两组应用R3siRNA后的LIMK2mRNA表达量分别为对照组的19.30%(转染后24h)、18.63%(转染后48h):Westernblot检测显示编码为R3的siRNA对LIMK2蛋白表达的抑制效果最明显,两组应用R3siRNA的LIMK2蛋白表达量分别仅为空白对照组的1.32%(转染后24h)、1.19%(转染后48h)。结论编号为R3的siRNA可以很好地抑制小鼠原代成骨细胞的LIMK2表达。
简介:目的构建表达针对HBsAg小发卡RNA(shRNA)的重组腺相关病毒载体,以观察该病毒在体外对HBsAg和HBeAg的抑制作用。方法将表达针对HBsAg的shRNA定向克隆到pAAV/U6-hrGFP质粒中,获得重组表达质粒(pAAV-shHBs-hrGFP);采用磷酸钙转染法将该质粒与包装质粒pAAV-RC和辅助质粒pHelper共同转染AAV293细胞,进行rAAV-shHBs-hrGFP重组病毒包装。收获病毒感染HepG2.215细胞;采用ELISA法检测HBsAg和HBeAg水平。结果酶切鉴定、测序结果表明,pAAV-shHBs-hrGFP载体成功构建。包装收获的rAAV-shHBs-hrGFP病毒液可以感染HepG2.215细胞,并且可以抑制HBsAg和HBeAg的表达。结论制备的rAAV-shHBs-hrGFP病毒载体能够抑制HBV在体外的抗原表达。
简介:目的探究siRNA作用于不同类型子宫内膜癌细胞雌激素受体相关受体α(estrogenreceptor-relatedreceptorα,ERRα)的表达及细胞的凋亡情况。方法siRNA处理RL952、AN3-CA、HEC-1A和HEC-1B细胞,以RL952、AN3-CA为Ⅰ型子宫内膜癌体外模型,HEC-1A、HEC-1B为Ⅱ型子宫内膜癌体外模型;采用荧光定量PCR法检测ERRαmRNA的表达,Westernblot法检测ERRα蛋白的表达,流式细胞仪分别检测siRNA干扰后4株子宫内膜癌细胞的凋亡情况。结果siRNA组较对照组ERRαmRNA表达水平显著下降(RL952:0.701±0.017vs.1.165±0.019;AN3-CA:0.899±0.019vs.1.362±0.007;HEC-1A:0.093±0.004vs.0.541±0.038;HEC-1B:0.158±0.004vs.0.356±0.001;P均〈0.05)。各株细胞siRNA组与对照组ERRαmRNA的表达比较,差异有统计学意义(P〈0.05),ERRαmRNA表达分别减少了39.77%、34.01%、82.82%和55.78%。Westernblot结果显示,4株细胞RNA干扰后ERRα蛋白表达与mRNA表达趋势一致。4株细胞凋亡率:RL952为(30.000±1.056)%vs.(10.572±1.027)%;AN3-CA为(32.931±1.613)%vs.(10.274±0.882)%;HEC-1A为(17.272±0.950)%vs.(8.704±0.608)%;HEC-1B为(18.703±1.877)%vs.(3.801±0.265)%,siRNA干扰4株细胞后凋亡率与各自对照组比较,差异均有统计学意义(P〈0.05)。结论siRNA能够有效抑制子宫内膜癌中ERRα的表达,ERRα低表达可能与子宫内膜癌细胞的凋亡增加密切相关。