简介:高通量测序技术速度快、成本低、通量高,广泛应用于miRNA领域研究。本研究基于高通量测序技术所产生的海量小RNA数据,结合已有的数据分析软件,开发了一套快速高效一键化的miRNA分析流程。该流程整合多个生物信息学数据分析软件,对多个miRNA高通量测序数据集进行标记、整合和去冗余分析,只需运行一次核心程序就可以实现对多个miRNA高通量测序数据的分析,避免每个样本单独数据分析的技术重复,精简后的数据集能大幅度减少软件计算量,显著提高软件运行效率。本研究利用快速高效miRNA分析流程分析黄颡鱼性腺XX卵巢、XY精巢、YY精巢的miRNA高通量测序数据,获得一批准确的黄颡鱼保守miRNA。在相同参数设置下,miRNA分析流程可以显著节约分析时间。该流程最终输出结果为多样本整合后的miRNA表达数据,便于研究者直接进行样本之间的比较和miRNA的表达差异,减少研究者手动整合分析结果的操作步骤。miRNA分析流程针对多样本miRNA测序数据具有明显的优势,样本越多测序量越大,软件运行效率越高。针对日益积累的海量小RNA测序数据,miRNA分析流程高效快速一键化数据处理优势将会越来越明显。
简介:太湖新银鱼(Neosalanxtaihuensis)(以下称银鱼)是银鱼科的小型鱼类,原产地在长江中下游及附属湖泊,如太湖、洪泽湖、洞庭湖等,其肉嫩味美,营养丰富,无鳞无刺,整体可食,又具有生长速度快、繁殖力强的特点,是我国优质水产品之一。银鱼便于冷冻、晒干、储藏、运销,国内外市场广阔,价值较高,是优良的绿色食品,多年来一直享誉国内外市场,誉称其为'水中黄金'。由于移植增殖投资少、见效快、管理简单、经济效益高,可充分利用大、中型水库湖泊渔业资源,提高经济效益,因此自20世纪80年代以来,在我国银鱼已被广泛移植增殖,是农民脱贫致富的有效途径。银鱼在国内水库、湖泊已