简介：摘要目的对早、中孕期自然流产组织标本进行基于单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism，SNP)探针的染色体微阵列分析(chromosomal microarray analysis, CMA)，在更深层次基因组水平探讨与流产可能相关的遗传学原因。方法回顾性分析本院961例孕20周前孕妇自然流产标本的CMA检测结果。结果(1)流产标本染色体总异常率为54.44%(515/946)，包括单条染色体异常39.53%、两条染色体异常2.22%、多染色体异常0.42%、三倍体及超、亚三倍体4.86%、拷贝数异常(copy number variants, CNV)4.33%、纯合区域(regions of homozygosity, ROH)0.74%、嵌合体2.22%及异源性嵌合(chimera) 0.11%；(2)对41例CNV分析，致病及可能致病性CNV达85.36%，检出临床意义不确定CNV12.20%和可能良性CNV2.44%；(3)7例ROH中2例为全基因组纯合，2例为16号染色体短臂末端大片段纯合，1例为整个21号染色体完全纯合，提示单亲二体可能。结论染色体异常是导致流产的重要因素，应用含SNP探针的CMA技术可以额外增加异常检出率，更好地为自然流产患者在再次妊娠前进行生育风险评估并提供指导。

简介：摘要目的探讨单核苷酸多态性微阵列分析技术(single nucleotide polymorphism array，SNP-array)在孕早期颈项透明层(nuchal translucency，NT)增厚胎儿中的应用。方法采集孕早期产前超声提示胎儿NT增厚的570例孕妇的绒毛膜组织或羊水标本，进行染色体核型分析和SNP-array检测。结果在570例NT增厚的病例中，共检出89例染色体核型异常，比例最高者分别为21、18、13三体和45，X、47，XXY等；SNP-array检出137例结果异常，包括14例已知明确致病的微缺失、微重复遗传性综合征、35例临床意义不明、2例杂合性缺失及1例14号染色体的单亲二倍体等，检出率提高了8.43%。结论对孕早期NT增厚胎儿采用SNP-array技术进行分析，可检出传统核型分析无法识别的染色体微缺失、微重复，为产前诊断及遗传咨询提供更为准确的遗传学信息。

简介：摘要目的探讨染色体核型分析及单核苷酸多态性微阵列(single nucleotide polymorphism array，SNP-array)技术对于高危因素孕妇产前诊断的价值。方法选取2018年1月至2019年12月于本院产前诊断中心就诊的高危孕妇1660例，于孕中期行羊水穿刺，对羊水细胞同时行染色体核型分析及SNP-array检测。比较高危因素(高龄、超声异常、不良孕史、夫妇染色体异常、血清学筛查高风险、无创产前基因检测)两种方法的检出情况。结果所有标本均成功检测。染色体核型分析发现致病性核型135例，检出率为8.13%(135/1660)，SNP-array致病性拷贝数变异(copy number variations，CNVs)检出率为9.04%(150/1660)，两种方法异常染色体检出率差异有统计学意义(χ2＝9.33，P<0.01)。比较合并两项及以上高危因素和单项高危因素的致病性CNVs检出率差异有统计学意义(P<0.05)。当合并两项及以上高危因素时SNP-array致病性CNVs高于传统染色体核型分析的异常核型检出率(χ2＝5.14，P<0.05)。结论SNP-array可增加高危孕妇染色体致病性CNVs检出率，结合染色体核型分析可互补检出平衡易位及低比例嵌合体等，以减少遗传病患儿的漏诊，降低出生缺陷。

简介：摘要目的探讨单核苷酸多态性微阵列芯片(SNP-array)技术在胎儿侧脑室增宽产前诊断中的应用。方法选择2016年1月至2018年10月，于广西壮族自治区妇幼保健院进行定期产前检查时，超声筛查提示胎儿侧脑室增宽的433例中、晚孕期孕妇为研究对象。孕妇年龄为19～45岁，孕龄为16＋6～37＋6孕周，其中，中孕期为135例(31.2%)，晚孕期为298例(68.8%)。回顾性分析433例孕妇的胎儿染色体核型分析结果及SNP-array检测结果。本研究经广西壮族自治区妇幼保健院伦理委员会批准[医研伦快审(2019)第(3-21)号]，并与受试者签署临床研究知情同意书。结果①135例行羊膜腔穿刺术产前诊断的中孕期孕妇中，检出胎儿染色体核型异常为22例，异常检出率为16.3%(22/135)。298例行脐静脉穿刺术产前诊断的晚孕期孕妇中，检出胎儿染色体核型异常为17例，异常检出率为5.7%(17/298)。②135例中孕期孕妇羊水样本中，SNP-array检出胎儿染色体异常为28例，异常检出率为20.7%(28/135)。298例晚孕期孕妇脐血样本中，SNP-array检出胎儿染色体异常为37例，异常检出率为12.4%(37/298)。SNP-array检出的65例胎儿染色体异常孕妇中，39例(60.0%)为胎儿染色体核型分析异常者，而26例(40.0%)为胎儿染色体核型分析结果正常者。这26例胎儿染色体核型分析结果正常、SNP-array检测结果异常孕妇中，其胎儿发生致病性拷贝数变异(CNVs)者为11例(7例染色体微缺失、1例染色体微重复、3例染色体微缺失合并微重复)；胎儿发生疑似致病性CNVs者为1例(染色体微缺失)；胎儿发生临床意义不明CNVs者为14例(5例染色体微缺失、4例染色体微重复、5例为1条或多条染色体间杂合性缺失)。结论对产前超声筛查提示胎儿侧脑室增宽的中、晚孕期孕妇，进行SNP-array检测，有助于发现胎儿染色体核型分析无法检出的胎儿染色体亚显微结构异常。

简介：摘要脓毒症是由感染引起的宿主反应失调导致严重器官功能损害的临床综合征，病情严重，病死率高，是感染导致死亡的主要原因。单核苷酸多态性（SNP）是人类可遗传变异中最常见的一种，与脓毒症的遗传易感性、早期诊断、病情发展和预后密切相关。本文就CD14、Toll样受体（TLR）、肿瘤坏死因子（TNF）、白细胞介素（IL-1、IL-6）、血浆纤溶酶原激活物抑制剂1（PAI-1）、血管紧张素转换酶（ACE）等基因多态性与脓毒症遗传易感性的关系进行综述，以期在脓毒症早期预测及诊断、治疗等方面有启示作用。

简介：摘要目的探讨MEIS1、BTBD9、MAP2K5、PTPRD等基因单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms，SNPs)与不宁腿综合征(restless legs syndrome，RLS)的相关性。方法通过检索2021年3月1日以前国内外公开发表的文献，收集与RLS相关的风险基因的病例对照研究，应用Review Manager 5.3及Stata 15.1软件进行统计分析。结果共纳入8篇研究，累计病例数7 824例，对照数14 645例。Meta分析结果显示，与RLS相关的风险基因SNPs位点为：MEIS1 rs2300478(OR＝1.68，95%CI：1.59~1.78)、BTBD9 rs9296249(OR＝1.62，95%CI：1.47~1.77)、BTBD9 rs9357271(OR＝1.49，95%CI：1.44~1.55)、MAP2K5 rs12593813(OR＝1.44，95%CI：1.36~1.53)、MAP2K5 rs11635424(OR＝1.47，95%CI：1.34~1.60)及PTPRD rs1975197(OR＝1.34，95%CI：1.21~1.49)。结论MEIS1 rs2300478、BTBD9 rs9296249、BTBD9 rs9357271、MAP2K5 rs12593813、MAP2K5 rs11635424、PTPRD rs1975197为RLS患病的风险基因位点。

简介：摘要FCN基因是ficolins蛋白的编码基因，3种人类ficolins(ficolin-1、ficolin-2和ficolin-3)蛋白分别由FCN1、FCN2和FCN3基因编码，它们的单核苷酸多态性与多种疾病的遗传易感性有关，可能影响ficolins的血清浓度、结构和功能。本文就近年来FCN基因多态性与疾病易感性关系的最新研究进行综述。

简介：摘要不宁腿综合征（RLS）是一种常见的神经系统疾病，成年人患病率为1%~15%。RLS的病因、发病机制及相关的基因治疗目前尚不完全清楚，研究结果显示RLS可能与某些风险基因的多态性相关。全基因组关联研究迄今为止共揭示了该病的7个风险位点，包括MEIS1、BTBD9、MAP2K5/SKOR1、PTPRD、TOX3、NOS1和2p14的基因间区。文中对近年来RLS风险基因单核苷酸多态性的研究进展作了综述。

简介：摘要肥胖症在我国的发病率逐年递增，饮食和生活方式干预作为最常用的减重措施，其干预效果受到个体遗传、环境等多方面因素的影响。目前全基因组关联分析已经发现了众多减重相关的单核苷酸多态性位点，并对这些位点与饮食、菌群及其他环境因素间的相互作用进行了探索。本文阐述了与减重饮食干预相关的单核苷酸多态性位点研究及基因-环境相互作用分析，并进一步归纳了遗传风险评分、机器学习建模等多位点分析预测模型在减重领域的应用，以期为精准营养理念在医学减重上的进一步应用和发展提供借鉴。

简介：摘要目的探讨中国人群癌症相关单核苷酸多态性（SNP）的潜在多效性。方法基于美国国立人类基因组研究所及欧洲生物信息学研究所共同构建的全基因组关联研究（GWAS）目录，按照人群来源（中国人群与非中国人群）和疾病性状（癌症与非癌症性状），将2020年8月以前所有GWAS发现SNP分为中国人群癌症、中国人群非癌症、非中国人群癌症和非中国人群非癌症相关4类，描述4类SNP的数量、相互关系和连锁关联情况。结果截至2020年8月，GWAS目录共计纳入4 096篇GWAS的196 813条SNP信息。排除SNP指代不明或发病不相关的信息，最终纳入117 441个独立SNP。按人群来源和疾病性状分组后，中国人群癌症和非癌症疾病（性状）相关SNP分别为619个和9 569个；非中国人群癌症和非癌症疾病（性状）相关SNP分别为4 624个和106 448个。3个SNP与中国和非中国人群2种及以上癌症均相关，分别为rs2736100、rs6983267和rs401681。7个SNP与中国和非中国人群的癌症和非癌症疾病（性状）均相关，分别为rs7705526，rs2736100，rs10993994，rs2735839，rs4430796，rs174537和rs9271588。结论中国人群中存在癌症相关单核苷酸多态性的潜在多效性。

简介：摘要目的对煤工尘肺（CWP）的毛细血管扩张性共济失调症突变基因（ATM）的基因表达量及其功能性单核苷酸多态性（SNP）位点的基因型进行分析，探讨CWP发生发展与ATM的关联。方法于2020年10月，收集贵阳市公共卫生救治中心职业病科2019年1月至2020年9月职业健康体检或就诊的264名研究对象的相关信息。选择无职业危害因素接触史者作为健康对照组，共67人；具有10年以上煤尘接触史且肺部有小阴影但达不到诊断标准的煤矿工人为接尘对照组，共66人；具有同样煤尘接触史且已确诊的壹期CWP患者为煤工尘肺壹期组，共131人。采用逆转录-聚合酶链反应对各组ATM表达量进行检测。通过质谱仪对ATM rs189037、rs1801516进行基因分型。结果各组间ATM表达量差异有统计学意义（P<0.05）；与健康对照组比较，接尘对照组患者的ATM表达明显升高（P<0.05）。随着CWP的发生发展，rs189037野生型GG减少，突变杂合子GA和纯合子AA增加，但差异无统计学意义（P>0.05）；rs1801516野生型GG和突变杂合子GA无明显变化（P>0.05）。rs189037型各组间年龄、中性粒细胞以及嗜碱性粒细胞差异均有统计学意义（均P<0.05），各组间血压、嗜酸性粒细胞、淋巴细胞、单核细胞以及烟酒史差异无统计学意义（均P>0.05）。与野生型GG型比较，突变杂合子和纯合子OR上升，但各组差异均无统计学意义（P>0.05）。结论ATM可能是煤工尘肺发生发展的早期活化基因之一，rs189037可能是影响其基因表达的功能性位点；ATM与炎症反应可能有关，中性粒细胞和嗜碱性粒细胞对CWP的发生发展有影响。

简介：摘要骨髓炎目前仍是困扰骨科医师的一大难题。大量研究表明，遗传因素可能在骨髓炎的发病中起重要作用。单核苷酸多态性(SNPs)作为第3代遗传标记，在骨髓炎遗传易感性方面的研究越来越受关注。对骨髓炎易感性基因的单核苷酸多态性进行深入研究，有助于探索骨髓炎预防、诊断和治疗的新策略。本文就目前基因SNPs与骨髓炎易感性的研究进展作一综述。

简介：摘要目的探讨丝聚蛋白(FLG)基因单核苷酸多态性(SNPs)与儿童支气管哮喘(哮喘)的发生及相关临床指标的关系。方法本研究为病例-对照研究。采用非随机抽样方法，选取2019年3月至2021年3月北部战区总医院诊治的101例哮喘患儿为病例组，同期在北部战区总医院体检正常的健康儿童77名为对照组。应用SNaPshot测序技术检测FLG基因rs11204981、rs1933064和rs146466242位点SNPs并分析单体型，探讨病例组和对照组3个位点SNPs/单体型对儿童哮喘易感性的影响，同时测定嗜酸粒细胞百分比(EOS%)、免疫球蛋白E(IgE)、呼出气一氧化氮(FeNO)和肺功能。结果(1)FLG基因rs11204981、rs1933064和rs146466242位点基因型及等位基因在病例组和对照组间的分布差异均无统计学意义(P值均>0.05)。(2)FLG基因3个位点SNPs与病情严重程度和有无湿疹史病例组间的分布差异均无统计学意义(P值均>0.05)。(3)FLG基因rs11204981位点携带次要等位基因的G/A和G/G基因型EOS%高于A/A基因型，G/A基因型IgE高于A/A基因型，差异均有统计学意义(P值均<0.05)；rs146466242位点T/A基因型EOS%、IgE高于T/T基因型，T/A基因型最高呼气流量占预计值百分比(PEF%pred)低于T/T基因型，差异均有统计学意义(P值均<0.05)；rs1933064位点不同基因型间EOS%、IgE、FeNO及肺功能差异无统计学意义(P>0.05)。(4)FLG基因rs11204981、rs1933064和rs146466242位点共构成3种单体型，单体型与罹患哮喘的风险差异无统计学意义(P>0.05)。结论FLG基因rs11204981、rs1933064和rs146466242位点并非为儿童哮喘及合并湿疹史儿童哮喘的易感位点，其构成的单体型与儿童罹患哮喘无相关性；rs11204981和rs146466242位点携带次要等位基因可能与EOS%和IgE的升高有关。

简介：摘要目的探讨肿瘤坏死因子α(TNF-α)基因G308A单核苷酸多态性与儿童肥胖、代谢紊乱的关系。方法选取2015年1月至2019年12月本院儿科收治的肥胖儿童620例作为研究对象，分为代谢非健康组(n＝267)和代谢健康组(n＝353)，另选本院同期体检健康儿童260名作为对照组。检测TNF-α基因G308A单核苷酸多态性，并比较各组儿童的血清TNF-α水平、肥胖指标和糖脂代谢指标。结果代谢非健康组和代谢健康组的体重指数(BMI)、腰围、臀围和血清TNF-α比较差异无统计学意义(P>0.05)，但均显著高于对照组(P<0.05)。3组的空腹血糖(FPG)、总胆固醇(TC)水平比较差异无统计学意义(P>0.05)。代谢非健康组和代谢健康组儿童的空腹胰岛素(FINS)、空腹胰升糖素(FGC)、HbA1C、三酰甘油(TG)、低密度脂蛋白胆固醇(LDL-C)水平显著高于对照组，且代谢非健康组显著高于代谢健康组(P<0.05)，而高密度脂蛋白胆固醇(HDL-C)显著低于对照组，且代谢非健康组显著低于代谢健康组(P<0.05)。代谢非健康组和代谢健康组中GG基因型频率、等位基因G频率均显著低于对照组，代谢非健康组显著低于代谢健康组，而AA、GA基因型频率、等位基因A频率均显著高于对照组，代谢非健康组显著高于代谢健康组(P<0.05)。AA型、GA型、GG型3组TNF-α、FPG、TC比较，差异无统计学意义(P>0.05)。AA型与GA型BMI、腰围、臀围、FINS、FGC、HbA1C、TG、HDL-C、LDL-C比较，差异无统计学意义(P>0.05)，2组与GG型比较差异有统计学意义(P<0.05)。Pearson相关分析结果表明，TNF-α水平与肥胖指标BMI、腰围、臀围及代谢指标FPG、FINS、FGC、HbA1C、TC、TG、LDL-C呈正相关(P<0.05)；而与HDL-C呈负相关(P<0.05)。结论TNF-α基因G308A单核苷酸多态性与儿童肥胖、代谢紊乱的发生有关。

简介：摘要年龄相关性黄斑变性( age-related macular degeneration，AMD)是一种遗传异质性疾病，可导致老年人进行性和不可逆转的视力丧失。研究发现遗传因素是致病的主要原因之一，因此，单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms，SNPs)与AMD的关系成为广大研究学者们的研究热点。为了更好地了解AMD的发生机制，文章介绍了Toll样受体4(Toll-like receptors, TLR4)、转铁蛋白(Transferrin，TF)及转铁蛋白受体(Transferrin receptor，TFR)、载脂蛋白E(apolipoprotein E，APOE)及补体因子I(Complement factor I，CFI)的SNP位点与AMD的关系，为AMD的预防及控制提供新思路。

简介：摘要目的探讨解整合素-金属蛋白酶33(ADAM33)基因单核苷酸多态性与河南汉族瘢痕疙瘩患者的相关性，从基因水平对瘢痕疙瘩的预防及治疗提供理论依据。方法2018年3月至2019年3月，郑州大学第一附属医院整形外科收治瘢痕疙瘩患者84例，男39例，女45例，年龄4～75(30.42＋19.46)岁；增生性瘢痕患者78例作为对照组，男43例，女35例，年龄3～81(27.74＋18.43)岁。选取ADAM33基因上3个单核苷酸多态性位点，用Sequenom MassARRAY系统进行基因分型检测，比较各位点基因型和等位基因频率差异性。结果瘢痕疙瘩组与增生性瘢痕组ADAM33基因rs3918394(L1)、rs574174(ST＋7)位点基因型分布符合Hardy-Weinberg遗传平衡定律(P>0.05)；rs597980(ST＋5)位点基因型分布不符合Hardy-Weinberg遗传平衡定律(χ2＝6.499，P<0.05)；L1位点基因型频率、等位基因频率组间差异有统计学意义(P<0.05)，ST＋7位点基因型频率、等位基因频率组间差异无统计学意义(P>0.05)；L1位点GG基因型及G等位基因组间差异有统计学意义(χ2＝6.387、6.117，均P<0.05)；ST＋7位点各基因型及各等位基因组间差异无统计学意义(P>0.05)；ST＋7与L1位点间存在着弱连锁不平衡；瘢痕疙瘩组Hap2(CA)显著低于增生性瘢痕组(χ2＝6.752，P<0.05)。结论ADAM33基因L1位点可能与河南汉族瘢痕疙瘩患者易感性相关，L1位点GG基因型及G等位基因是瘢痕疙瘩发生的危险因素。ADAM33基因可能存在特异性瘢痕疙瘩易感性单体型或保护性单体型。

简介：摘要目的探讨微RNA（miRNA）单核苷酸多态性与慢性自发性荨麻疹（CSU）的风险关联。方法采用病例对照研究，收集2019年1-6月在济宁医学院附属医院皮肤科诊治的98例CSU患者及同期148例健康对照，均为山东籍汉族，采集静脉血后提取基因组DNA，针对miRNA多态性位点rs2431697（miR-146a）、rs57095329（miRNA-146a）、rs3746444（miRNA-499）、rs11614913（miRNA-196a2）和rs895819（miRNA-27a）行多重PCR扩增反应和单碱基延伸反应，进行单核苷酸多态性（SNP）位点分型。采用χ2检验分析组间等位基因、基因型及遗传模型分布差异，非条件Logistic回归分析基因SNP与疾病发生风险的关系。结果所有样本SNP均成功分型。miRNA-196a2 SNP位点rs11614913等位基因为T/C，病例组等位基因T频数110（56.1%），对照组131（44.3%），两组T/C频率分布差异有统计学意义（χ2 = 6.64，P = 0.010），该位点等位基因T可能是CSU发生的危险因素（OR = 1.61，95% CI：1.12 ~ 2.32）。病例组rs11614913基因型CC、CT、TT频数分别为16（16.3%）、54（55.1%）、28（28.6%），对照组为48（32.4%）、69（46.6%）、31（20.9%），两组基因型分布差异有统计学意义（χ2 = 8.16，P = 0.017）；两组显性遗传模型（TT+CT与CC）分布差异亦有统计学意义（χ2=7.95，P = 0.005），显性遗传模型可能增加了CSU发病风险（OR=2.46，95% CI：1.30 ~ 4.65）。结论我国山东汉族人群miRNA-196a2 SNP与CSU风险可能存在关联，rs11614913可能会增加CSU发病风险。

简介：摘要目的探讨AKT1基因单核苷酸多态性对海南黎族高血压性脑出血分子预警的价值。方法选择2019年1月至2020年10月在海南省某医院收治的海南黎族高血压性脑出血(hypertensive intracerebral hemorrhage，HICH)患者56例、黎族健康对照人群100人、健康汉族对照203人作为研究对象，提取基因组DNA后进行AKT1基因rs2494739、rs2494744、rs2498794位点分型。利用SPSS 25.0分析上述位点在汉族黎族之间、黎族健康人群与脑出血人群之间的差异性。结果AKT1基因rs2498794位点、rs2494739位点、rs2494744位点多态性在汉族与黎族健康人群中的分布频率差异无统计学意义(P>0.05)。rs2498794位点三种基因型AA 、AG、GG在黎族HICH患者中的检出率(14.28%、39.29%、46.43%)与黎族健康对照组(44.00%、47.00%、9.00%)，差异有统计学意义(P<0.05)。rs2494744三种基因型AA、AG、GG在黎族HICH患者中的检出率分别为57.14%、37.50%、5.36%，与黎族健康对照组(20.00%、44.00%、36.00%)相比较差异有统计学意义(P<0.05)。rs2494739位点三种基因型CC、CT、TT在海南黎族HICH患者中检出率分别为14.28%、46.43%、39.29%，与黎族健康对照(34.00%、41.00%、25.00%)相比较，差异有统计学意义(P<0.05)。rs2494744-A在病例组的检出率(75.89%)远高于黎族健康对照组(42.00%)，等位基因A的风险比值比为4.35，rs2498794-G在病例组和黎族健康对照组的检出率分别为66.07%和32.50%，风险比值比为4.04，等位基因rs2494744-A和rs2498794-G与脑出血的发生均具有密切关联(P<0.05)。结论AKT1基因rs2494744-AA、rs2498794-GG以及等位基因rs2494744-A、rs2498794-G是黎族HICH的危险因素，对HICH分子预警体系的构建具有重要价值。

简介：摘要白塞综合征（BS）是一种病因不明的全身系统性血管炎，特定的环境刺激作用于基因易感的个体是其最可能的发病机制。人类白细胞抗原B51虽然是目前公认的BS易感基因，但其所致的发病风险却不足20%，因而提示人体尚存在其他与BS相关的基因位点。细胞因子是免疫系统的信号传递分子，参与了人体所有免疫应答。近年来许多研究报道了细胞因子基因单核苷酸多态性（SNP）与BS的相关性，其中涉及辅助性T细胞1相关细胞因子、白细胞介素1、白细胞介素17以及趋化性细胞因子等多种炎性反应因子和多个炎性反应通路。这些SNP可影响BS的发病风险，也可影响BS患病个体的表型，上述SNP效力的叠加可能是BS发病的遗传机制。（中华眼科杂志，2020，56：876-880）

简介：摘要阿尔茨海默病（AD）是一种渐进性神经退行性疾病，需服用药物改善患者症状，但疗效存在个体差异。以“阿尔茨海默病”“药物疗效”“单核苷酸多态性”以及“Alzheimer′s disease”“Drug efficacy”“Single nucleotide polymorphism”作为关键词，在中国知网、维普数据库、万方数据库、Pubmed、Springer Link和Cochrane Library 数据库检索2000年1月至2020年7月发表的相关文献，对AD药物疗效差异与基因单核苷酸多态性相关性进行综述，包括ABCA1、ApoE、ChAT、CHRNA7、IL-6、A2M、CYP2D6、BChE、5HT2a、PON-1和ESR1基因，为临床医生治疗AD时选择药物提供参考依据。