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  • 简介:摘要目的探讨筛选出的长链非编码RNA(lncRNA)作为评估神经胶质瘤预后标志物的可能性。方法选择癌症基因组图谱(TCGA)数据库建库至2018年12月的694个胶质瘤样本5个癌旁组织样本,筛选胶质瘤组织癌旁组织间有差异的lncRNA、微RNA(miRNA)mRNA,分析三者神经胶质瘤患者预后的相关性,并构建竞争性内源RNA(ceRNA)网络。基于基因本体(GO)数据库京都基因基因组百科全书(KEGG)数据库对mRNA的生物学功能进行富集分析。采用Kaplan-Meier法对各lncRNA、miRNA或mRNA不同表达水平患者进行生存分析,获得与预后相关的lncRNA、miRNAmRNA。通过单因素多因素Cox比例风险回归模型分析ceRNA网络中有差异的lncRNA,构建预测患者5年总生存率的lncRNA预后模型。根据构建的模型,计算TCGA数据库中694个样本每个样本的危险值,以中危险值为临界值,将患者分为高风险组(≥中危险值)、低风险组(<中危险值),并绘制两组的生存曲线;绘制依据lncRNA预后模型的危险值预测TCGA数据库中神经胶质瘤患者5年总生存率的受试者工作特征(ROC)曲线;采用pheatmap R软件包绘制高、低风险组患者预后模型中各lncRNA基因表达水平的热图。结果从TCGA数据库共得到神经胶质瘤癌旁组织间有差异的44个lncRNA、19个miRNA54个mRNA,并绘制出ceRNA网络图;经Kaplan-Meier法分析,其中22个lncRNA、7个miRNA38个mRNA患者总生存相关。单因素Cox回归分析得到28个预后相关的lncRNA,经多因素Cox回归分析,根据赤池信息准则(AIC)查找最优的涉及16个lncRNA的预后风险模型,即危险值=ARHGAP31-AS1×(-0.357 7)+ LY86-AS1×(0.155 1)+WARS2-IT1×(0.206 4)+PART1×(-0.110 0)+AC110491.1×(-0.142 6)+CACNA1C-IT2×(-0.381 3)+HAS2-AS1×(0.128 8)+AC092171.1×(-0.161 3)+CCDC26×(-0.144 2)+HCG15×(0.384 0)+AL359541.1×(-0.289 2)+GRM5-AS1×(0.120 5)+LINC00237×(-0.085 1)+LINC00310×(-0.213 0)+VCAN-AS1×(-0.090 3)+LINC00303×(0.091 5)。根据构建模型计算的中危险值为0.758,高风险组患者5年总生存率为16.8%(95% CI 11.4%~24.7%),低风险组患者5年总生存率为75.7%(95% CI 68.5%~83.7%)。构建的lncRNA模型预测患者5年总生存率的ROC曲线下面积为0.893。热图显示该模型中各lncRNA基因表达水平在高风险组低风险组患者间有一定差异。结论依据筛选的lncRNA构建的预后风险模型可较好评估神经胶质瘤患者预后,这些lncRNA有望成为神经胶质瘤预后相关的新候选生物标志物。

  • 标签: 神经胶质瘤 长链非编码RNA 竞争性内源RNA 预后 比例危险度模型
  • 简介:摘要小细胞肺癌(SCLC)恶性程度高,侵袭性强,易发生颅脑转移。现有指南均推荐脑预防照射(PCI)作为初始系统性治疗后达到完全缓解的SCLC患者的标准治疗方案。但在MRI广泛应用于颅脑转移诊断的今天,放疗同时免疫治疗及分子靶向治疗的联合治疗方案广泛应用于肺癌,PCI在SCLC治疗中的价值受到质疑并面临挑战。而应用海马保护技术及相关药物减少PCI后神经认知功能损伤成为研究热点。本文将近期文献报道的PCI相关研究结果进行综述,为SCLC患者选择最适合的PCI个体化治疗方案提供参考。

  • 标签: 小细胞肺癌 脑预防照射 颅脑磁共振成像 研究进展