简介：摘要目的分析赣州市流行的麻疹病毒的基因特征。方法采集麻疹疑似病例咽拭子标本，应用荧光RT-PCR方法检测麻疹病毒核酸；用Vero/SLAM细胞对麻疹病毒核酸检测阳性标本进行病毒分离培养，并将麻疹病毒分离株进行核蛋白N基因和血凝素蛋白H基因扩增、测序；运用DNAStar、Bioedit和MEGA 5.0等分子生物学软件对N基因和H基因进行序列特征分析。结果978份疑似麻疹病例咽拭子标本中，检出47份麻疹病毒核酸阳性，阳性率为4.81%，分离到25株毒株；扩增的13株毒株均为H1基因型的H1a亚型，与H1a基因型代表株（CHN/93/2）N基因核苷酸、氨基酸的同源性分别98.0%~98.5%、97.9%~99.6%，与H基因核苷酸、氨基酸的同源性分别为98.2%~98.9%、97.4%~98.5%。各分离株N基因与中国疫苗株Shanghai-191之间核苷酸、氨基酸的同源性分别为93.7%~95.2%、95.2%~96.8%；H基因与Shanghai-191之间核苷酸、氨基酸的同源性为94.2%~96.5%、94.2%~96.6%。结论2013—2016年赣州市麻疹病毒流行株为H1a亚型，疫苗株对现流行株有保护性，但仍需持续监测麻疹病毒基因的变异情况。
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