简介：摘要目的基于血凝素-神经氨酸酶蛋白(hemagglutinin-neuraminidase，HN)基因分析我国流行人副流感病毒3型(human parainfluenza virus 3, HPIV3)的基因变异规律和进化特征。方法采用多重荧光PCR方法对2007—2020年5个省市(北京、浙江、安徽、河南、湖南)急性呼吸道感染病例的咽拭子标本进行常见病原体核酸筛查，对HPIV3阳性标本进行HN基因序列测定，与GenBank数据库的国外和我国10个省的HPIV3流行代表株HN基因序列进行比对，应用多种生物信息学方法开展分子进化分析。结果本研究期间从5个省市共获得49株HPIV3的HN基因序列，核苷酸同源性在96.6%~100%之间，其中48株为C3基因亚型，1株为C5基因亚型。系统进化分析显示，我国12个省市在2003—2020年间存在C1、C3和C5基因亚型的毒株共流行，毒株间核苷酸和氨基酸同源性分别为95.4%~99.8%和97.9%~100%，其中C3是我国的优势流行基因亚型，分属于C3a、C3b、C3c、C3e和C3f进化分支，以C3f的传播范围和流行时间最为广泛。对C3基因亚型的进化分析显示，其最近共同祖先形成时间(tMRCA)可追溯到1990年，有效群体规模在2002—2010年间逐渐扩张而后趋于平稳；C3各进化分支HPIV3的HN基因进化速率在3.69×10-4~5.82×10-4替换/位点/年之间；C3基因亚型毒株HN蛋白共享N308、N351、N485和N523潜在N-糖基化位点，选择压力以负向选择为主。结论C3基因亚型是我国的本土优势HPIV3流行型别，形成了广泛传播和持续流行态势，并在流行过程中形成多个进化分支共同循环。

简介：摘要目的了解我国九省份发热呼吸道症候群（FRS）监测病例中常见病毒感染情况。方法研究资料来源于中国疾病预防控制中心“传染病监测技术平台信息管理系统”中九省份（安徽、北京、广东、河北、湖南、吉林、山东、陕西和新疆）2009年1月至2021年6月间的FRS病例监测数据，最终将具有8种病毒［人流感病毒（HIFV）、人呼吸道合胞病毒（HRSV）、人腺病毒（HAdV）、人副流感病毒（HPIV）、人鼻病毒（HRV）、人偏肺病毒（HMPV）、人冠状病毒（HCoV）以及人博卡病毒（HBoV）］核酸检测结果的8 243例FRS监测病例纳入研究。采用χ²检验/Fisher确切概率法分析不同年龄组、不同地区和不同季节病例的病毒检出率差异。结果8 243例FRS病例年龄M（Q1，Q3）为4（1，18）岁，<5岁以下儿童占56.56%（4 662例）；男性占58.1%（4 792例）；病例主要来源于门、急诊病例和住院病例，其中门急诊病例数为2 043例，住院病例数为6 200例。FRS病例的病毒检出率从高到低依次为HRSV、HIFV、HPIV、HRV、HAdV、HMPV、HCoV和HBoV。有524例病例同时检出两种及两种以上病毒，占病毒检测阳性病例数的15.66%。不同年龄组中病毒检出率的差异具有统计学意义（均P<0.05），<5岁以下儿童的病毒检出率较高（49.96%）。南方任一病毒阳性检出率高于北方（P<0.001）。FRS病毒阳性病例全年均有检出，HRSV检出率在秋、冬季较高，HIFV检出率在冬季较高，HMPV检出率在冬、春季较高；而HPIV、HRV、HCoV和HBoV的检出率在夏、秋季节较高，而HAdV在不同季节检出率的差异无统计学意义。与2009—2019年相比，2020—2021年的任一病毒阳性检出率有所下降，由原来的41.37%下降至37.86%；HIFV检出率由原来的10.62%急剧下降至1.37%；HPIV检出率由原来的8.24%下降至5.88%。而HRV和HBoV的检出率则由原来的5.43%和1.79%，分别上升至9.67%和3.19%。结论2009—2021年中国九省份FRS病例以HRSV和HIFV感染较为常见，8种常见呼吸道病毒的流行特征存在年龄、地区和季节差异。