简介：摘要目的本研究以目前国际病毒分类委员会（ICTV）所接受的肠道病毒分界标准为基础，通过客观地比较全基因组/多聚蛋白两两相似值，试图寻找一种简单可靠的方法来对新的肠道病毒进行的分类。方法分析960株肠道病毒在全基因组水平上的两两比对相似值（pairwise identity scores，PIS）的频率分布图，观察在不同肠道病毒型别、不同种及不同属之间是否存在明显的分类界限，结合病毒聚类和系统发育树的结果寻找能够区分肠道病毒不同种/属的标准。结果肠道病毒不同种间及与相近病毒属之间在全基因水平上存在比较好的PIS分类界限。多聚蛋白核苷酸PIS为0.657和0.536时可对肠道病毒进行可靠、稳定的种和属的分类。结论肠道病毒多聚蛋白核苷酸序列间PIS在种和属水平上具备明显的遗传边界，并能够简单、可靠地用于肠道病毒监测实验室新种属的初步鉴定。

简介：摘要目的分析北京市境外输入新型冠状病毒（SARS-CoV-2）基因组特征及变异情况。方法2020年2—3月收集北京市来自5个国家的12例输入性新冠肺炎病例呼吸道标本，采用高通量测序法对病毒基因组测序，对序列进行比对和分析，并采用最大似然法构建系统发育树。结果共获得12条长度为29 826~29 903 bp的SARS-CoV-2基因组序列，与Wuhan-Hu-1参考株的核苷酸和氨基酸序列一致性中位数分别为99.97%（99.94%~99.98%）和99.96%（99.88%~99.98%）。12例基因组共发现22个氨基酸突变位点，其中ORF1ab的P4715L和S蛋白的D614G为最常见突变位点；未发现已报道可明确导致病毒传播力和致病性改变的变异位点，未发现插入和缺失变异。系统发育分析显示，10例欧美国家输入的病毒基因组均位于S-D614G进化支，2例伊朗输入病毒基因组均位于ORF1ab-V378I进化支。结论未发现北京市2020年2—3月份境外输入的12例病毒基因组携带已报道可明确导致病毒传播力和致病性发生变化的变异位点，仍需持续关注病毒变异情况。

简介：摘要目的对2016—2019年北京市GII.2[P16]诺如病毒全长基因组进行系统进化分析。方法收集2016—2019年北京市GII.2[P16]诺如病毒毒株，采用一步法RT-PCR对基因组全长进行分段扩增，应用BioEdit软件分析核苷酸相似性和氨基酸变异情况，采用BEAST软件分别构建衣壳蛋白（major capsid protein，VP1）区和RNA聚合酶（RNA-dependent RNA polymerase，RdRp）区全长序列的贝叶斯进化树，结合流行病学资料对毒株进化特征进行分析。结果测得44个毒株的全基因组序列，其VP1和RdRp基因分型一致。进化分析显示北京市2017年5月以后毒株形成新亚群并分为两个分支，分别以2017—2018年和2018—2019年毒株为主。该亚群毒株在VP1区均存在Val256Ile点突变，但RdRp区没有发现氨基酸变异位点。流行病学数据表明，北京市GII.2[P16]型诺如病毒从2016年10月输入，2017年3月至6月为暴发高峰，2017年7月以后暴发数量明显降低,但2018年底暴发又有所增加。结论北京市GII.2[P16]诺如病毒新变异株2017年5月之后基因特征有所改变，暴发强度降低，但仍具有传播风险。

简介：摘要目的分析北京市不同阶段新型冠状病毒肺炎（新冠肺炎）疫情特征，为今后新冠肺炎及其他新发突发传染病的防控提供参考。方法收集北京市《全民健康信息化疾病预防控制信息系统》和流行病学调查报告中新冠肺炎确诊病例的人口学、来源、发病时间、就诊时间、确诊时间等信息，分析比较不同阶段的特征。结果2020年1月19日至7月10日，北京市共报告新冠肺炎确诊病例935例，疫情可分为三个阶段：武汉输入病例为主的境内输入疫情防控阶段（2020年1月19日至2月28日）；多国境外输入疫情防控阶段（2020年2月29日至6月10日）；新发地市场为主的本地聚集性疫情防控阶段（2020年6月11日至7月10日）。第一阶段病例来源主要为本地病例（51.46%）和境内输入病例（48.54%），第二阶段主要为境外输入及其关联病例（97.80%），第三阶段主要为本地病例（99.12%），三个阶段病例来源构成比差异有统计学意义（x2=1170.680，P<0.01）。所有病例发病至就诊时间M（P25~P75）为2.00（0~5.00）d，就诊至确诊时间M（P25~P75）为1.00（1.00~2.00）d，发病至确诊时间M（P25~P75）为4.00（2.00~7.00）d。三个阶段病例发病至确诊时间、就诊至确诊时间逐渐缩短，差异有统计学意义（H=76.833，P<0.01；H=204.484，P<0.01）。结论北京市三个阶段人口学特征、来源、临床特征均不同，需采取不同的防控措施进行精准防控。

简介：摘要目的分析北京市2017—2018年流感流行季期间发生流感聚集性疫情的中小学校的流感疫苗接种情接况和保护效果，为流感疫苗接种策略提供进一步的科学依据。方法收集北京市2017年10月—2018年1月期间报告的流感聚集性疫情资料，分析流感聚集性疫情的流行病学特征和流感疫苗接种情况，计算疫苗保护率。结果北京市2017年10月—2018年1月期间共报告流感病毒导致的中小学校聚集性疫情147起，涉及116所中小学，累计发病2 424例，平均罹患率31.7%。乙型Yamagata系流感病毒为引起聚集性疫情的主导株（88起，59.9%）；其中主要发生在小学1~2年级（62起，70.5%）。疫情学校的流感疫苗总体接种率（37.5%）低于全市中小学校总体接种率（46.8%）。接种率≥50%的学校流感聚集性疫情发生率低于接种率<50%的学校。疫情班级中，总体流感疫苗保护率为29.3%，对甲型流感病毒疫情保护率为43.6%，对乙型Yamagata系流感病毒疫情保护率为13.2%；小学3~6年级保护率（49.0%）高于小学1~2年级（0.5%）。结论虽然2017—2018年度流感疫苗不包含乙型Yamagata系流感病毒组分，集体接种流感疫苗依然能减少中小学流感聚集性疫情的发生，提高流感疫苗接种率能更有效的降低学校聚集性疫情的发生。

简介：摘要目的了解北京市8 ~ 10岁儿童甲状腺肿大（简称甲肿）情况，探讨儿童甲肿的影响因素。方法2018年，在北京市16个区，每个区按东、西、南、北、中划分为5个抽样片区，每个片区抽取1个乡镇/街道，每个乡镇/街道抽取1所小学，每所小学抽取8 ~ 10岁非寄宿学生40例。采用B超法测量儿童甲状腺大小，根据《地方性甲状腺肿诊断标准》计算甲状腺容积并判定是否为甲肿。采集儿童随意1次尿样，采用砷铈催化分光光度法检测尿碘；测量儿童身高、体重，计算体质指数（BMI），分析甲状腺容积与身高、体重的相关性。结果共调查儿童3 268例，其中甲肿儿童154例，甲肿率为4.7%，且女生甲肿率[5.7%（93/1 641）]高于男生[3.7%（61/ 1 627），χ2 = 6.694，P < 0.05]。8、9、10岁儿童甲肿率分别为4.3%（15/346）、5.5%（85/1 534）、3.9%（54/1 388），年龄间比较差异无统计学意义（χ2 = 4.544，P > 0.05）。儿童尿碘中位数为175.3 μg/L，为碘适宜水平。8、9、10岁儿童甲状腺容积与身高、体重呈正相关（r = 0.143、0.225，0.323、0.338，0.321、0.346，P均< 0.01）。结论北京市儿童甲肿率较高，甲状腺容积受身高、体重影响较大，建议在研讨儿童甲肿诊断标准时考虑身高、体重的影响。

简介：摘要目的掌握北京市集中发热疫情的流行特征，为流感防控提供科学依据。方法收集北京市2018—2019年流感流行季集中发热疫情资料，对疫情的规模、时间、场所、病原以及防控措施进行描述和分析。结果北京市2018—2019年流感流行季，共报告集中发热疫情742起，85.64%由流感病毒导致。时间上呈现2个高峰。远郊区疫情的规模及罹患率均小于城区（P<0.05），托幼机构疫情的罹患率大于其他场所（P<0.01）。经实验室检测，疫情主要由乙型Victoria系流感病毒（39.09%）、甲型H3N2亚型流感病毒（21.82%）和甲型H1N1流感病毒（20.17%）引起。不同型别流感病毒在不同场所和城郊的分布均不同（P<0.05）。疫情介入时间越早规模越小（r=0.35，P<0.01）。结论北京市集中发热疫情主要分布在小学及托幼机构，疫情的早期发现和处置可以降低疫情的规模。

简介：摘要目的估计北京市流感流行阈值和分级强度阈值，对2018－2019年流行季流感流行水平进行分级预警，并对估计阈值的方法进行评价。方法应用北京市近5个流感流行季的流感样病例数和流感样病例百分比（ILI%）监测数据，采用移动流行区间法（MEM）估计流感流行阈值和分级强度阈值。应用交叉验证方法评价MEM与2种监测数据类型估计流行阈值的预警效果，评价指标为马修相关系数、约登指数、灵敏度和特异度。结果估计预警2018－2019年流行季的流感样病例数的流行阈值为12 984例、中位强度阈值为22 503例、高强度阈值为37 589例、超高强度阈值为47 157例，评价流行阈值的指标马修相关系数为62%、约登指数为60%、灵敏度为69%、特异度为91%。应用ILI%监测数据，估计预警2018－2019年流行季流感流行阈值、中位强度阈值、高强度阈值及超高强度阈值分别为1.66%、2.46%、3.84%和4.66%，评价流行阈值的指标马修相关系数为59%、约登指数为54%、灵敏度为60%、特异度为94%。结论MEM对预警流感流行有较好特异性，准确性在可接受范围内，该方法可在北京市流感分级预警中进行实际应用。应用流感样病例数监测资料预警效果略优于ILI%。

简介：摘要目的评估"健康教育+信息提示"对提高幼儿园儿童流感疫苗接种率的效果。方法2015—2016流感流行季在北京市东城区和西城区分别随机4所幼儿园，将全部2 443名儿童的家长作为调查对象。将8所幼儿园随机分为干预组和对照组，只给予干预组"健康教育+信息提示"的干预措施。主要结局为干预前后儿童接种流感疫苗行为的变化。应用logistic回归模型分析儿童接种流感疫苗行为变化的影响因素。结果两次均应答者2 041人，有效应答率为83.5%。在干预前后，干预组接种率分别为0.4%（4/1 067）和2.9%（31/1 067），对照组分别为0.8%（8/974）和0.9%（9/974）。干预组接种行为变好、不变和变差者分别占2.8%（30/1 067）、96.9%（1 034/1 067）和0.3%（3/1 067），对照组分别占0.7%（7/974）、98.7%（961/974）和0.6%（6/974）。logistic回归模型结果显示，干预组（OR=3.804，P=0.007）、家长知道接种时间地点（OR=2.864，P<0.01）的儿童流感疫苗接种行为变好的可能性更高。结论"健康教育+信息提示"的干预措施能够提高幼儿园儿童流感疫苗接种率，但效果欠佳。

简介：摘要目的了解北京地区5岁以下儿童轮状病毒、诺如病毒、腺病毒及星状病毒相关急性胃肠炎的流行特点和临床特征。方法在北京地区6个区县6家医院肠道门诊每月收集前30名年龄在5岁以下首次就诊的急性胃肠炎患者的信息资料和粪便样本，并对轮状病毒、诺如病毒、腺病毒及星状病毒四种病原进行PCR检测，采用描述性流行病学方法对四种病毒相关的急性胃肠炎流行特征进行描述，单因素方差分析各病毒引起的急性胃肠炎的Vesikari临床严重程度评分，采用非条件logistic回归分析急性胃肠炎的临床特征相关危险因素。结果2 052份样本中，非混合感染709例（34.6%）：其中轮状病毒411例（20.0%），诺如病毒153例（7.5%），腺病毒86例（4.2%），星状病毒59例（2.9%）；混合感染135例（6.6%）。轮状病毒性急性胃肠炎的Vesikari评分（8.0±3.1）高于诺如病毒（6.4±2.4，P<0.001）、腺病毒（6.2±2.1，P<0.001）及星状病毒（6.1±2.0，P<0.001）。临床特征比较结果显示：以星状病毒为参照，5岁以下儿童感染轮状病毒急性胃肠炎后更易出现：≥5 d的腹泻（OR=3.33）、1 d内≥3次的呕吐（OR=8.79）、≥1 d的呕吐（OR=3.96）、Vesikari评分≥11的重症病例（OR=13.19）；感染诺如病毒易出现1 d内≥3次的呕吐（OR=5.71）；感染腺病毒易出现≥5 d的腹泻（OR=2.62）；以轮状病毒为参照，5岁以下儿童感染诺如病毒（OR=0.40）或腺病毒（OR=0.28）后较少出现≥38.4 ℃的发热症状。结论本研究结果显示各病毒导致的急性胃肠炎特点不同，轮状病毒引起的急性胃肠炎临床症状较重，24月龄以下婴幼儿是轮状病毒感染的高危人群，应尽早采取有效预防措施如接种疫苗来保护易感人群。

简介：摘要目的对2017年北京市一起疑似输入性基孔肯雅热病例进行处置及分析。方法对疑似病例进行流行病学调查,采集疑似病例唾液和尿液标本，采用荧光定量PCR方法检测基孔肯雅病毒的核酸。结果核酸检测结果显示基孔肯雅病毒核酸阳性，证实为输入性病例。指导酒店进行消毒，宣教防控知识。结论北京有潜在风险，应加强监测。

简介：摘要目的估算北京市2018－2019流行季流感的发病率和住院率。方法基于北京市昌平区和怀柔区的流感样病例（influenza like illness, ILI）监测、流感病原学监测、住院严重急性呼吸道感染（severe acute respiratory infection, SARI）病例监测和医疗卫生服务利用调查的数据，采用乘法模型估算流感的发病率和流感相关的SARI住院率。结果北京市昌平区和怀柔区2018－2019流行季流感的发病率为5.4%（95%CI：4.5%~7.4%），流感相关的SARI住院率为31/10万（95% CI：22/10万~44/10万），住院发病比约为1 : 174。发病率最高的为5~14岁组儿童，住院率、住院发病比最高的均为< 5岁儿童。北京市2018－2019流行季甲型H1N1流感导致的发病率（2.3%，95%CI：1.9%~3.2%）、住院率（17/10万，95% CI：11/10万~28/10万）、住院发病比（1 : 137）高于其他亚型。结论流感导致的疾病负担在儿童中尤为严重，建议制订针对儿童的免疫策略，预防流感传播。

简介：摘要目的了解北京市境外输入性新型冠状病毒肺炎病例在京密切接触者的流行病学特征，为评估和优化境外输入性新型冠状病毒肺炎疫情防控措施提供科学依据。方法使用密切接触者调查表，调查北京市2020年2月至4月期间报告的境外输入性病例在京密切接触者基本信息、暴露相关信息等。在密切接触者纳入隔离医学观察后，追踪每日健康监测状况，描述其流行病学特征、转归情况，计算不同类型、不同暴露条件和不同隔离医学观察方式下，密切接触者转为确诊病例的感染率。结果北京市境外输入性新型冠状病毒肺炎病例及密切接触者的变化趋势均大致呈钟型曲线。截至2020年4月30日，累计对1 271例境外输入性新型冠状病毒肺炎病例在京密切接触者完成了隔离医学观察，转归情况分别为期满解除1 245例、确诊26例、无症状感染0例，总感染率为2.05%；其中航班密接感染率0.69%（7/1 011），非航班密接感染率7.31%（19/260）。暴露类型为同餐（37.50%）、同住（30.23%），曾经出现症状（34.62%），非航班密切接触者（7.31%），隔离观察方式为住院（68.97%），与确诊病例同排（2.07%）及机组人员（16.67%）的密切接触者感染率较高。结论北京市境外输入性新型冠状病毒肺炎病例在京密切接触者以航班密切接触为主，航班密切接触者转为确诊病例的感染率低，应继续坚持并优化各项科学措施，严格防控境外输入疫情。暴露类型、与病例座位相距排数等因素可能是密切接触者转归的影响因素。

简介：摘要目的调查北京市2020年1—4月期间报告的新型冠状病毒肺炎病例医务人员密切接触者的情况，为指导新冠肺炎疫情防控提供科学依据。方法使用统一的密切接触者调查表，当医务人员被判定为病例密切接触者后24 h内进行调查，收集基本信息、暴露信息等，医学隔离期间监测每日健康状况，统计分析其流行病学特征及转为确诊病例的感染率情况。结果医务人员密切接触者共405例，其中男92人（22.72%），女313人（77.28%），平均年龄38.47岁。经过医学隔离观察后共有390例期满解除，14例转归为新冠肺炎确诊病例，1例转归为无症状感染者，总感染率为3.70%（15/405）。医务人员密切接触者不同科室（x2=36.321，P<0.05）、与病例关系（x2=24.891，P<0.05）、暴露类型（x2=29.246，P<0.05）、隔离方式（x2=10.122，P<0.05）是医务人员密切接触者感染的影响因素。结论医务人员作为新型冠状病毒肺炎患者的直接接触者，需要在日常生活和工作中加强分区管理，避免与病例共同暴露在其生活和工作环境中，加强安全防护。