简介:摘要目的研究A(H1N1)pdm09流感病毒对同型流感病毒感染过的人群是否同样构成威胁,是否与同型季节性流感病毒存在血清交叉反应。方法2008—2009年北方流感冬季流行季之后,建立北京健康人群随访队列,于2009年9月首次调查并采集血清样本。随后,在2010年1月初,A(H1N1)pdm09流感病毒大流行高峰期后,对该队列进行流感样症状(influenza-like illness,ILI)的随访调查。研究季节性流感毒株血凝素抑制抗体、微量中和抗体、IgG1和IgG2抗体反应对ILI发生的影响。结果年龄大于20岁的人ILI的风险显著降低(OR=0.299,95%CI:0.101~0.897,P=0.04)。单因素分析中,2009年流感大流行期间ILI患者血清样本与A(H1N1)亚型流感病毒存在一些交叉反应,但去除2009年A(H1N1)pdm09流感疫苗接种史的混杂因素后,交叉反应无统计学意义(OR=0.324,95%CI:0.124~0.987,P=0.06)。结论从实际的人群中观察到,同型季节性流感毒株可能不会通过体液免疫诱导对A(H1N1)pdm09流感病毒的交叉反应。针对大流行流感病毒的特异性疫苗对疾病保护至关重要。
简介:摘要目的掌握2021年北京市流感流行特征及乙型Victoria系(简称BV)流感病毒血凝素(hemagglutinin,HA)基因、抗原性变异情况,为北京市流感防控提供科学依据。方法对北京市2021年1—11月流感病原学监测结果进行统计分析,并随机抽取15株BV流感病毒,通过HA基因扩增测序,分析其基因变异和进化特征。结果研究期间共收集流感样病例样本16 097份,其中核酸检测阳性208份,经型别鉴定BV流感病毒205份(98.56%)、乙型Yamagata(简称BY)系流感病毒3份(1.44%)。15株BV流感病毒HA基因序列与疫苗株B/Washington/02/2019相比,核苷酸相似度为98.39%~98.75%,氨基酸相似度为97.86%~98.40%。基因进化分析显示15株BV流感病毒均分布于Clade1A.3a2分支,与疫苗株相比存在多位点变异。15株BV流感病毒有11个糖基化位点。1株(6.6%)为疫苗株的低反应株。结论2021年北京市监测到的流感病毒中BV流感病毒占绝对优势,其HA基因位点多处发生变异,提示对该亚型变异的持续监测至关重要,为制定流感防控策略提供科学依据。
简介:摘要目的了解北京市肠道门诊腹泻病例中札如病毒(sapovirus,SaV)的感染特征。方法收集2019年肠道门诊腹泻病例流行病学和临床表现相关资料,应用x2检验或Fisher检验比较不同组间检出率;采集患者粪便标本,应用不同种PCR方法对腹泻病例粪便标本进行札如病毒检测,并进行基因分型。结果1 047例腹泻病例粪便标本中,SaV检出率为2.77%(29/1 047),成功测序16株,GI组11株,GII组4株,GIV组1株。春季检出率5.24%(x2=8.857,P=0.031)高于其他季节;远郊区检出率5.00%(x2=8.906,P=0.012)高于城区及近郊区;不同性别、年龄组检出率差异均无统计学意义。腹泻、恶心、呕吐及腹痛为SaV腹泻病例的主要临床症状。结论SaV是北京市腹泻病例的病原之一,春季和远郊区检出率高,GI组为主要基因型别。
简介:摘要目的分析北京市境外输入性新型冠状病毒(新冠病毒)感染者的流行病学特征及疫苗接种对感染者病毒载量和疾病严重程度的影响。方法数据来源于中国疾病预防控制信息系统传染病报告信息管理系统和现场流行病学调查,应用Excel 2010和SPSS 22.0软件进行数据整理和统计学分析。结果2021年6月1日至9月30日,北京市累计报告171例境外输入性新冠病毒感染者,无症状感染者占66.67%(114/171)。输入国以菲律宾、阿联酋、英国和俄罗斯为主,占67.84%(116/171)。感染者男女性别比为2∶1(114∶57);年龄M(Q1,Q3)为28(23,36)岁;中国籍占80.12%(137/171)。对其中47例进行病毒全基因组测序,76.60%(36/47)属于Delta变异株。疫苗接种率为60.82%(104/171),其中疫苗全程接种率为53.80%(92/171)。13.53%(23/170)的感染者入境当天筛查出核酸阳性,所有感染者均在28 d内检测出核酸阳性。未接种组疾病严重程度高于未全程接种组和全程接种组(P<0.001),出现了1例重型和1例危重型病例。未接种组N基因Ct值M(Q1,Q3)为32.51(23.23,36.06),开放读码框lab(ORFlab)基因Ct值为32.78(24.00,36.38),未全程接种组和全程接种组双基因Ct值中位数较未接种组差异无统计学意义(P>0.05)。结论研究期间,北京市境外输入性新冠病毒感染者以无症状感染者为主。新冠病毒感染者无论是否接种新冠病毒疫苗,其体内均有相似的病毒载量,但疫苗接种可降低疾病严重程度。
简介:摘要目的对发生在中国的首例疑似猕猴α疱疹病毒1型感染者进行实验室确诊。方法采集疑似感染者的脑脊液进行高通量测序,并采集疑似感染者的脑脊液、痘疱液、鼻咽拭子、结痂涂抹、唾液等标本以及密切接触者的痘疱液、口咽拭子、血清等标本后,利用4套实时定量PCR方法检测猕猴α疱疹病毒1型、水痘-带状疱疹病毒、猴痘病毒和正痘病毒。结果疑似感染者的脑脊液高通量测序结果检出285个猕猴α疱疹病毒样序列读数;猕猴α疱疹病毒1型特异性实时定量PCR检测患者脑脊液、结痂涂抹和唾液标本为阳性,疑似感染者的其余样本及密切接触者的样本均为阴性。水痘带状疱疹、猴痘和正痘病毒荧光定量PCR检测所有样本均为阴性。结论患者脑脊液、结痂涂抹和唾液标本猕猴α疱疹病毒1型核酸检测为阳性,结合病人的临床特征、动物接触史及高通量测序结果,确诊该患者为猕猴α疱疹病毒1型感染。
简介:摘要目的对中国首例猕猴α疱疹病毒1型感染病例的感染来源开展调查,探索其感染因素和防控策略。方法运用现场流行病学调查方法收集病例信息,采集职业暴露人群、猕猴和环境样本,并应用实时荧光PCR方法进行猕猴α疱疹病毒1型核酸检测,分析可能的感染源。结果采集共同暴露职业人员样本84件,猕猴生物样品89件,环境样本370件,经检测,其中猕猴猴舍2件环境涂抹样本猕猴α疱疹病毒1型核酸阳性,其它样本均为阴性,病例的感染来源于该研究所日常职业暴露可能性大。通过封闭涉疫研究所、隔离职业暴露人员和排查风险人员等一系列防控措施,在一个最长潜伏期内未发生续发病例。结论该病例属于北京市本地感染偶发病例,感染来源与日常职业暴露有关。猕猴职业暴露人员在日常工作中,应科学的选择和使用防护用品,从而有效降低职业暴露感染风险。
简介:摘要诺如病毒是引起急性胃肠炎的主要病原体之一,极易突变和重组,型别众多。研究早期采用VP1区氨基酸序列对诺如病毒进行分型及鉴定。由于处在或接近聚合酶和衣壳区的重叠区为重组发生的热点区域,因此国际上提出使用聚合酶和衣壳区的双区域分型系统。目前基于2 s标准的双区域分型方法,聚合酶区可分为10个基因组及76种基因型,包括2个暂定基因组及16种暂定基因型,VP1可分为12个基因组及53种基因型,包括2个暂定基因组及5种暂定基因型。暂定基因组和基因型有待进一步型别鉴定和基因组划分。本文对诺如病毒分子特征、不同分型方法的原理、序列扩增方法、在线分型工具及最新的基因分型研究进展进行综述。
简介:摘要目的了解2015—2020年流感流行季北京市流感流行特征。方法使用北京市2015—2020年流感样病例(influenza-like illness,ILI)和流感病原学监测数据,分析流感流行趋势和流感病毒流行特征。结果2015年第27周至2020年第26周共涉及5个流感流行季,流感样病例百分比(percentage of influenza-like illness,ILI%)为1.58%。共检测ILI标本96 892件,流感病毒核酸阳性率为16.32%,其中A(H3N2)亚型6 474件(40.89%)、甲型H1N1 4 410件(27.86%)、乙型Victoria系3 290件(20.78%)、乙型Yamagata系1 597件(10.09%)。ILI周报告数、ILI%与流感病毒阳性率变化趋势基本一致(r=0.796,P<0.001;r=0.808,P<0.001)。2017—2018年和2018—2019年流行季活跃期较长。2017—2018、2018—2019年流行季ILI周报告数较高(49 628人次和71 555人次),核酸阳性率峰值较高(58.51%和57.08%)。结论2015—2020年北京市流感流行符合北半球流行特征,其中2017—2018和2018—2019流行季活跃期较长、流行水平较高,且各流行季优势毒株不同。
简介:摘要目的了解北京市新型冠状病毒肺炎无症状感染者的流行病学特征。方法描述分析2020年2月1日至11月30日北京市新冠肺炎无症状感染者流行病学特征。结果北京市54例新冠肺炎无症状感染者平均年龄(37.19±15.99)岁,男女比例为1.45 : 1;以接触确诊病例(45.28%)或其污染的环境(43.40%)而感染为主;42.59%(23例)通过密切接触者筛查发现;从末次暴露到首次核酸检出阳性时间间隔中位数为11 d;仅2例无症状感染者的2名密切接触者(2/1 139,0.18%)不排除为续发病例。结论新冠肺炎无症状感染者以中青年为主,主要通过接触确诊病例或其污染的环境感染,密切接触者筛查是发现无症状感染者的主要途径,不排除无症状感染者造成传播的可能,应加强对无症状感染者的发现力度,继续严格管理。
简介:摘要目的分析北京市2017—2018年流感流行季期间发生流感聚集性疫情的中小学校的流感疫苗接种情接况和保护效果,为流感疫苗接种策略提供进一步的科学依据。方法收集北京市2017年10月—2018年1月期间报告的流感聚集性疫情资料,分析流感聚集性疫情的流行病学特征和流感疫苗接种情况,计算疫苗保护率。结果北京市2017年10月—2018年1月期间共报告流感病毒导致的中小学校聚集性疫情147起,涉及116所中小学,累计发病2 424例,平均罹患率31.7%。乙型Yamagata系流感病毒为引起聚集性疫情的主导株(88起,59.9%);其中主要发生在小学1~2年级(62起,70.5%)。疫情学校的流感疫苗总体接种率(37.5%)低于全市中小学校总体接种率(46.8%)。接种率≥50%的学校流感聚集性疫情发生率低于接种率<50%的学校。疫情班级中,总体流感疫苗保护率为29.3%,对甲型流感病毒疫情保护率为43.6%,对乙型Yamagata系流感病毒疫情保护率为13.2%;小学3~6年级保护率(49.0%)高于小学1~2年级(0.5%)。结论虽然2017—2018年度流感疫苗不包含乙型Yamagata系流感病毒组分,集体接种流感疫苗依然能减少中小学流感聚集性疫情的发生,提高流感疫苗接种率能更有效的降低学校聚集性疫情的发生。
简介:摘要目的分析北京市新型冠状病毒肺炎(COVID-19)病例密切接触者流行病学特征及感染危险因素,为COVID-19防控策略的制定和控制措施的效果评价提供科学依据。方法收集2020年1月6日至2021年2月15日北京市报告的20 681例密切接触者基本信息、暴露信息及转归信息,分析密切接触者的流行病学特征,采用多因素 logistic 回归模型分析其新型冠状病毒(新冠病毒)感染的危险因素。结果北京市COVID-19病例密切接触者感染率为2.16%(447/20 681);年龄M(P25,P75)为35(27,49)岁;以20~59岁人群为主(81.77%,16 912/20 681);隔离观察方式主要为集中隔离(82.15%,16 989/20 681);主要暴露类型占43.96%(9 093/20 681),分别为同室工作/学习(16.06%,3 322/20 681)、同乘交通工具(12.88%,2 664/20 681)、诊疗/护理(7.80%,1 612/20 681)和同住(7.23%,1 495/20 681)。指示病例的职业分别有干部职员(19.34%,3 999/20 681)、家务待业(17.34%,3 586/20 681)、商业服务(13.85%,2 864/20 681)、餐饮食品业(10.77%,2 228/20 681),对应的密切接触者占61.30%(12 677/20 681)。多因素logistic回归分析结果显示,相比于其他暴露类型,同餐(OR=3.96,95%CI:2.30~6.83)、同住(OR=6.41,95%CI:4.48~9.17)为新冠病毒感染的危险因素;相比于其他职业,指示病例的职业为餐饮食品业(OR=3.06,95%CI:1.29~7.25)和教师(OR=4.94,95%CI:1.43~17.08)为新冠病毒感染的危险因素。结论同餐和同住是密切接触者感染新冠病毒的主要暴露类型;指示病例为餐饮食品业或教师职业者,其密切接触者感染新冠病毒的风险增加。应继续采取集中隔离、疫苗接种等COVID-19综合性防控措施。
简介:摘要目的对2016—2019年北京市GII.2[P16]诺如病毒全长基因组进行系统进化分析。方法收集2016—2019年北京市GII.2[P16]诺如病毒毒株,采用一步法RT-PCR对基因组全长进行分段扩增,应用BioEdit软件分析核苷酸相似性和氨基酸变异情况,采用BEAST软件分别构建衣壳蛋白(major capsid protein,VP1)区和RNA聚合酶(RNA-dependent RNA polymerase,RdRp)区全长序列的贝叶斯进化树,结合流行病学资料对毒株进化特征进行分析。结果测得44个毒株的全基因组序列,其VP1和RdRp基因分型一致。进化分析显示北京市2017年5月以后毒株形成新亚群并分为两个分支,分别以2017—2018年和2018—2019年毒株为主。该亚群毒株在VP1区均存在Val256Ile点突变,但RdRp区没有发现氨基酸变异位点。流行病学数据表明,北京市GII.2[P16]型诺如病毒从2016年10月输入,2017年3月至6月为暴发高峰,2017年7月以后暴发数量明显降低,但2018年底暴发又有所增加。结论北京市GII.2[P16]诺如病毒新变异株2017年5月之后基因特征有所改变,暴发强度降低,但仍具有传播风险。
简介:摘要目的高血压是流感住院患者最常见的基础病,本研究旨在探索高血压与流感患者住院结局的关联性。方法选取2016年10月1日至2019年4月30日确诊流感的严重急性呼吸道感染(Severe acute respiratory infection,SARI)住院患者为研究对象,以单纯患有高血压者作为高血压组,无任何基础病者作为对照组,随访两组的治疗过程,比较治疗结局,并采用多因素COX比例风险模型探索高血压对流感病例住院天数的影响。结果共纳入流感住院病例120例,其中高血压组53例,对照组67例。高血压组与对照组的年龄中位数分别为72岁(IQR:66-79)和63岁(IQR:58-78),差异有统计学意义(P=0.008)。高血压组与对照组患者的治愈出院率分别为98.11%和100%,差异无统计学意义(P=0.442);两组患者的住院天数分别为9天(IQR:8-14)和10天(IQR:7-12天),差异无统计学(P=0.269)。多因素回归分析显示,高血压组相对于对照组流感病例住院时间的差异无统计学意义(HR=0.82,95%CI:0.56-1.19);随着年龄增大出院的风险比下降(HR=0.98,95%CI:0.97-1.00),即年龄大者住院时间长。结论高血压不是导致流感患者住院时间延长或出现死亡结局的独立危险因素,年龄增长是导致住院时间延长的风险因素。
简介:摘要目的调查北京市市售结球生菜诺如病毒(norovirus,NoV)和轮状病毒(rotavirus,RV)污染情况。方法2015年11月至2016年10月,在北京市某菜市场摊位采集结球生菜54件。用离心法和直接法,分别对应3种洗脱液洗脱菜叶中病毒并浓缩,用荧光PCR法检测NoV和RV核酸。用半巢式RT-PCR方法扩增NoV阳性样本的衣壳蛋白区基因,PCR产物直接测序,用BioEdit7.0. 9.0软件进行序列比对,用MEGA6.06软件构建进化树。结果54件结球生菜,未检出RV。NoV总检出率为11.1%(6/54),其中GI组1件、GⅡ组3件、GI/GⅡ组混合2件。春夏秋冬季检出率依次为8.3%(1/12)、0.0%(0/8)、28.6%(4/14)和5.0%(1/20)。1件GⅡ阳性样本测序成功,为GⅡ.3基因型,该毒株与2014年广东省人源毒株KY348698相似性最高100.0%。结论北京市市售部分结球生菜存在人源NoV污染,生食未洗净结球生菜有引起病毒性急性胃肠炎的风险。
简介:摘要目的掌握北京市集中发热疫情的流行特征,为流感防控提供科学依据。方法收集北京市2018—2019年流感流行季集中发热疫情资料,对疫情的规模、时间、场所、病原以及防控措施进行描述和分析。结果北京市2018—2019年流感流行季,共报告集中发热疫情742起,85.64%由流感病毒导致。时间上呈现2个高峰。远郊区疫情的规模及罹患率均小于城区(P<0.05),托幼机构疫情的罹患率大于其他场所(P<0.01)。经实验室检测,疫情主要由乙型Victoria系流感病毒(39.09%)、甲型H3N2亚型流感病毒(21.82%)和甲型H1N1流感病毒(20.17%)引起。不同型别流感病毒在不同场所和城郊的分布均不同(P<0.05)。疫情介入时间越早规模越小(r=0.35,P<0.01)。结论北京市集中发热疫情主要分布在小学及托幼机构,疫情的早期发现和处置可以降低疫情的规模。
简介:摘要目的分析新型冠状病毒肺炎(COVID-19)病例N基因Ct值与其密切接触者续发风险的关系,进而探索呼吸道病毒载量与其传染力的关系。方法选择北京市发病0~7 d内有N基因Ct值记录的COVID-19确诊病例,将其密切接触者作为研究对象。收集密切接触者相关信息,主要包括性别、年龄、隔离方式、暴露方式、转归情况(发病与否)等变量。应用非条件多因素logistic回归模型分析COVID-19病例发病0~7 d内N基因Ct值与其密切接触者转归之间关联。结果在1 618名密切接触者中,77人转归为COVID-19确诊病例或无症状感染者,续发率为4.8%。多因素分析显示,通过同餐(OR=2.741,P=0.054)、同住(OR=9.721,P<0.001)方式暴露、非集中隔离(OR=18.437,P<0.001)、对应病例发病0~7 d内N基因Ct值<20(OR=8.998,P=0.004)或Ct值在20~25之间(OR=3.547,P=0.032)是密切接触者续发风险增加的危险因素。结论COVID-19病例呼吸道病毒载量与其传染力之间存在明确的正相关,提示COVID-19病例N基因Ct值可以作为其密切接触者管理的参考指标之一。
简介:摘要目的估算北京市2018-2019流行季流感的发病率和住院率。方法基于北京市昌平区和怀柔区的流感样病例(influenza like illness, ILI)监测、流感病原学监测、住院严重急性呼吸道感染(severe acute respiratory infection, SARI)病例监测和医疗卫生服务利用调查的数据,采用乘法模型估算流感的发病率和流感相关的SARI住院率。结果北京市昌平区和怀柔区2018-2019流行季流感的发病率为5.4%(95%CI:4.5%~7.4%),流感相关的SARI住院率为31/10万(95% CI:22/10万~44/10万),住院发病比约为1 : 174。发病率最高的为5~14岁组儿童,住院率、住院发病比最高的均为< 5岁儿童。北京市2018-2019流行季甲型H1N1流感导致的发病率(2.3%,95%CI:1.9%~3.2%)、住院率(17/10万,95% CI:11/10万~28/10万)、住院发病比(1 : 137)高于其他亚型。结论流感导致的疾病负担在儿童中尤为严重,建议制订针对儿童的免疫策略,预防流感传播。