简介:摘要目的研究中国地区发热伴血小板减少综合征病毒(severe fever with thrombocytopenia syndrome virus, SFTSV)分离株已上传至GenBank序列中M片段基本特征及该病毒的遗传和进化规律。方法从GenBank中获取2020年6月25日前分离于中国的SFTSV毒株M片段全序,利用BioEdit软件进行多序列比对,MEGA5.0软件构建系统发生树,比较不同型别及不同来源SFTSV核苷酸和氨基酸的同源性。结果在GenBank数据库收集到203株中国地区发热伴血小板减少综合征病毒分离株的M片段全序,其中分离于人的毒株185株,占总毒株的91.1%,分离于蜱的毒株共11株,占总毒株的5.4%,分离于其他动物如羊、鼠、刺猬的共5株,占总毒株的3.5%。系统发生树分析显示中国地区流行优势株为C2基因亚型,占总毒株的42.4%,核苷酸序列和氨基酸序列同源性分别为96.4%~100.0%和94 .5%~100.0%。人源毒株与动物分离株同源性极高,核苷酸序列和氨基酸序列同源性分别为92.5%~100.0%和92.0%~100.0%。结论对分离自中国的发热伴血小板减少综合征病毒分离株优势株为C2型,且存在着多种型别的共循环。SFTSV可能有从C型向J型进行适应性转换的可能。
简介:摘要目的分析农村井水中耐碳青霉烯类铜绿假单胞菌(PA)及耐药基因的分子流行病学特征。方法依据《饮用天然矿泉水检验方法》(GB 8538-2016)对山东省巨野县农村井水采集112份水样进行检测,并对检出的PA分别进行PFGE分型和药物敏感性试验。PCR鉴定碳青霉烯类耐药基因后,采用S1-PFGE和Southern杂交确定耐药基因的位置,并用结合实验判断基因的可转移性。结果农村井水中PA检出率为54.46%(61/112)。61株菌分为56个PFGE型,100.00%一致带型最多的有2株菌,无明显的优势带型。药敏实验结果显示,多重耐药菌占93.44%(57/61),2株菌携带blaVIM-2耐药基因,均位于质粒上,且均可随质粒发生水平转移。结论农村井水中检出耐碳青霉烯类PA及其耐药基因,此类耐药基因存在水平传播的可能性。
简介:摘要目的研究2018年4月至2019年3月济南市急性呼吸道感染病例中人鼻病毒、呼吸道合胞病毒及人腺病毒的感染情况及流行病学特点,并对分离出的人腺病毒做全基因组序列分析。方法采集2018年4月至2019年3月济南市第四人民医院、山东大学齐鲁儿童医院、章丘区人民医院的急性呼吸道感染住院病例患者的鼻/咽拭子样本共计1 969份,采用实时荧光定量PCR的方法检测样本中呼吸道相关病原体,包括人鼻病毒、呼吸道合胞病毒及人腺病毒的阳性率,并对分离出的7株腺病毒阳性标本进行测序,以确定腺病毒型别,并构建基因进化树进行分析。结果在收集的1 969份标本中,3种呼吸道病毒阳性病例共计242例,阳性检测率为12.30 %(242/1969),鼻病毒阳性率为3.00%(59/1969)、呼吸道合胞病毒阳性率为6.30 %(124/1969)、腺病毒阳性率为3.86%(76/1969)。不同年龄段间鼻病毒检出率差异无统计学意义(Fisher精确检验值8.376,P=0.720),不同年龄段间呼吸道合胞病毒、腺病毒检出率差异均有统计学意义(χ2=19.28、12.16;P=0.001、0.016)。不同性别间腺病毒检出率差异具有统计学意义(χ2=14.33,P<0.001),不同性别间鼻病毒阳性率和呼吸道合胞病毒阳性率均无统计学意义(χ2=0.30、2.90,P=0.862、0.089)。比较不同月份间三种病毒核酸阳性率,发现鼻病毒、呼吸道合胞病毒和腺病毒的检出率分别在10月份、12月份、11月份达到最高(分别为8.61%、26.50%和8.84%)。对测序的7株腺病毒阳性标本构建基因进化树后发现其均为HAdV-2型。结论2018年4月至2019年3月济南市急性呼吸道感染相关的人鼻病毒、呼吸道合胞病毒及人腺病毒在不同组别间有不同的流行病学特点,为急性呼吸道感染的早期预防和临床治疗提供参考依据。
简介:摘要目的分析2021—2022年度山东省流感流行分布特征、流行毒株病原学及其血凝素(HA)基因特性。方法收集2021—2022年度山东省流感样病例(ILI)哨点监测数据,进行描述性分析;采用荧光定量PCR核酸检测、病毒分离方法对采集的ILI标本开展检测,分析不同时间流感病毒的分布,按每市选取3株病毒进行基因测序,进行HA基因进化分析。结果2021—2022年度,山东省54所流感监测哨点医院共报告ILI 528 263例,ILI就诊比例为4.07%,0~4岁ILI最多,为45.86%;呈冬春季流行高峰,最高峰为2021年第52周(6.62%)。共对26 754份标本开展了核酸检测,阳性率27.10%,均为B型Victoria系流感病毒,PCR阳性率高峰为2021年第49周(63.78%);共报告ILI聚集性或暴发疫情295起,经实验室确诊269起为流感病毒阳性,以小学发生的疫情为主,2021年12月份报告疫情数最多。基因进化分析显示:HA基因与2020—2023年度推荐的疫苗株遗传距离均较近,介于98.6%~99.5%,且分成2个分支(V1A.3a.1,V1A.3a.2)。结论2021—2022年度,山东省流感流行高峰在12月,毒株型别单一,流感病毒阳性率和暴发疫情报告数均较高,毒株与WHO疫苗推荐株HA基因同源性较好,但整体上流感病毒群体免疫屏障较弱。
简介:摘要目的了解山东省布鲁氏菌病流行特征及空间聚集性特点,为布鲁氏菌病的科学防控提供参考依据。方法收集2015年1月至2020年12月中国疾病预防控制信息系统传染病报告信息管理系统报告的山东省人间布鲁氏菌病疫情资料,采用描述流行病学方法、空间聚集性分析方法对资料进行分析。结果2015-2020年,山东省共报告人间布鲁氏菌病18 811例,年均发病率为3.16/10万。全年各月份均有人间布鲁氏菌病发生,发病高峰为3-8月份,占66.31%(12 474/18 811)。年均发病率居前5位的县(区)分别为利津县(32.39/10万)、垦利区(11.02/10万)、无棣县(10.35/10万)、沾化区(9.59/10万)和商河县(8.80/10万)。发病人群中,男性13 436例,女性5 375例,男、女性别比为2.50 ∶ 1.00;年龄主要集中在30~69岁,占83.23%(15 656/18 811);职业以农民为主,占85.82%(16 144/18 811)。全局空间自相关分析结果显示,2015-2020年山东省布鲁氏菌病发病率均呈空间聚集性分布;局部空间自相关分析结果显示,山东省人间布鲁氏菌病高发区域主要集中在北部地区。结论山东省布鲁氏菌病发病主要集中在春夏季节,以农民多见,高发区域有空间聚集性。应针对高发季节、高危人群和北部高聚集区域采取重点防控措施,降低布鲁氏菌病发病率。