简介：摘要目的研究2018年4月至2019年3月济南市急性呼吸道感染病例中人鼻病毒、呼吸道合胞病毒及人腺病毒的感染情况及流行病学特点，并对分离出的人腺病毒做全基因组序列分析。方法采集2018年4月至2019年3月济南市第四人民医院、山东大学齐鲁儿童医院、章丘区人民医院的急性呼吸道感染住院病例患者的鼻/咽拭子样本共计1 969份，采用实时荧光定量PCR的方法检测样本中呼吸道相关病原体，包括人鼻病毒、呼吸道合胞病毒及人腺病毒的阳性率，并对分离出的7株腺病毒阳性标本进行测序，以确定腺病毒型别，并构建基因进化树进行分析。结果在收集的1 969份标本中，3种呼吸道病毒阳性病例共计242例，阳性检测率为12.30 %(242/1969)，鼻病毒阳性率为3.00%(59/1969)、呼吸道合胞病毒阳性率为6.30 %(124/1969)、腺病毒阳性率为3.86%(76/1969)。不同年龄段间鼻病毒检出率差异无统计学意义(Fisher精确检验值8.376，P＝0.720)，不同年龄段间呼吸道合胞病毒、腺病毒检出率差异均有统计学意义(χ2＝19.28、12.16；P＝0.001、0.016)。不同性别间腺病毒检出率差异具有统计学意义(χ2＝14.33，P<0.001)，不同性别间鼻病毒阳性率和呼吸道合胞病毒阳性率均无统计学意义(χ2＝0.30、2.90，P＝0.862、0.089)。比较不同月份间三种病毒核酸阳性率，发现鼻病毒、呼吸道合胞病毒和腺病毒的检出率分别在10月份、12月份、11月份达到最高(分别为8.61%、26.50%和8.84%)。对测序的7株腺病毒阳性标本构建基因进化树后发现其均为HAdV-2型。结论2018年4月至2019年3月济南市急性呼吸道感染相关的人鼻病毒、呼吸道合胞病毒及人腺病毒在不同组别间有不同的流行病学特点，为急性呼吸道感染的早期预防和临床治疗提供参考依据。

简介：摘要对山东省人感染猪链球菌菌株开展基因组流行病学及病原学分析，为制定合理、精准的猪链球菌预防、控制措施提供依据。本研究对分离的猪链球菌菌株开展分子分型、基因组系统进化树、毒力基因型别、耐药谱、耐药基因及其传播元件等方面的分析，并通过比较菌株刺激宿主细胞产生细胞因子的能力评价不同菌株的致病力。结果显示，血清2型、ST1型是山东患者来源猪链球菌的优势型别，其主要临床表现为脑膜炎。系统进化树分析表明山东菌株主要由5个分枝组成。山东菌株均属高致病型菌株，但细胞因子试验表明分枝2的菌株致病力显著强于其他山东菌株。除分枝3的SD2与SD4菌株外，其余山东菌株均携带不同种类的耐药基因及其传播元件。综上，山东猪链球菌的来源及进化途径存在多样性的特征，且致病能力有显著差异，需要在基因组水平开展菌株监测的工作。

简介：摘要在新型冠状病毒肺炎（新冠肺炎）全球大流行的环境下，流感的流行强度、流行特征和人群的感染风险均呈现出新的特点，且全球多地区已出现新冠肺炎和流感共同流行的情况。新冠肺炎和流感的传播方式、临床症状等方面相似，流感病毒与新型冠状病毒对细胞的作用机制上也存在相似之处，同时做好新冠肺炎和流感的防控工作具有较强可行性和重大现实意义。本文从流感疫苗接种预防共同感染、流感疫苗和新冠病毒疫苗同时接种等方面，探讨了流感和新冠共同防控的相关策略和措施，提出了相应的思考和建议，以期为季节性流感疫苗和新型冠状病毒疫苗接种策略的制订提供科学支撑。

简介：摘要目的研究中国地区发热伴血小板减少综合征病毒(severe fever with thrombocytopenia syndrome virus, SFTSV)分离株已上传至GenBank序列中M片段基本特征及该病毒的遗传和进化规律。方法从GenBank中获取2020年6月25日前分离于中国的SFTSV毒株M片段全序，利用BioEdit软件进行多序列比对，MEGA5.0软件构建系统发生树，比较不同型别及不同来源SFTSV核苷酸和氨基酸的同源性。结果在GenBank数据库收集到203株中国地区发热伴血小板减少综合征病毒分离株的M片段全序，其中分离于人的毒株185株，占总毒株的91.1%，分离于蜱的毒株共11株，占总毒株的5.4%，分离于其他动物如羊、鼠、刺猬的共5株，占总毒株的3.5%。系统发生树分析显示中国地区流行优势株为C2基因亚型，占总毒株的42.4%，核苷酸序列和氨基酸序列同源性分别为96.4%～100.0%和94 .5%～100.0%。人源毒株与动物分离株同源性极高，核苷酸序列和氨基酸序列同源性分别为92.5%～100.0%和92.0%～100.0%。结论对分离自中国的发热伴血小板减少综合征病毒分离株优势株为C2型，且存在着多种型别的共循环。SFTSV可能有从C型向J型进行适应性转换的可能。