简介：摘要分析辽宁省丹东市一起新型冠状病毒肺炎（新冠肺炎）家庭聚集性疫情，追踪疫情的传染源。应用现场流行病学方法调查辽宁省丹东市一起新冠肺炎家庭聚集性疫情中的病例及密切接触者，对调查资料及数据进行描述性分析，对病例及密切接触者的样本采用实时荧光定量RT-PCR法进行新型冠状病毒核酸检测，同时结合血清特异性抗体检测。报告疫情中涉及确诊病例3例，无症状感染者2例，家庭内密切接触者累计34人，其中8人为外省探亲人员，1人与确诊病例同航班，抗体IgG为阳性。本次家庭聚集性疫情是由外省途经武汉来到本地探访亲友的既往感染者引起的家庭聚集疫情。

简介：摘要目的分析辽宁省2018—2019年甲型流感毒血凝素(hemagglutinin，HA)基因，计算并评估流行株与疫苗株的匹配度。方法选取2018—2019年49株甲型流感毒株进行测序，对HA基因进行进化分析；研究抗原表位、糖基化位点及受体结合位点变异情况；采用Pepitope模型对流行株与疫苗匹配度进行分析。结果2018—2019年流感流行季为11月份至次年3月份，主要流行型别为新甲型H1N1亚型。经进化分析，新甲型H1N1流行株属于6B.1分支，与当年疫苗株属于同一分支；季节性H3N2毒株分布在3C.2a分支上，与2018—2019年疫苗株处于同一分支，但2019—2020年疫苗株位于3C.3a分支。部分毒株在抗原表位及受体结合位点上发生了突变。若干毒株与疫苗株相比，糖基化位点发生了增加或缺失，并未出现新的糖基化位点。使用Pepitope模型对疫苗效力从分子水平进行评估，本年度新甲型H1N1流感疫苗效力及2019—2020年疫苗株预测效力均能达到较为理想的效果。但是季节性H3N2疫苗株与本年度流行株匹配度低，计算出的疫苗效力半数以上为负值。2019—2020年H3N2亚型疫苗株效力有待进一步观察。结论2018—2019年辽宁省甲型H1N1流行株发生了一定程度的变异，H3N2亚型流行株与2018—2019年疫苗株匹配度低。应密切关注流行株的基因变异情况并及时更新疫苗株。

简介：摘要目的了解辽宁省手足口病(hand, foot and mouth disease, HFMD)患者中分离到的柯萨奇病毒A组6型(coxsackievirus A group 6 type, CV-A6)VP1区基因特征。方法收集2014—2018年辽宁省14个市送检的HFMD患者非肠道病毒A组71型(enterovirus A group 71 type, EV-A71)和非柯萨奇病毒A组16型(coxsackievirusA16, CV-A16)肠道病毒(enterovirus, EV)的阳性标本，通过细胞培养法分离EV，提取病毒RNA，用RT-PCR法对EV VP1区基因扩增和序列测定。利用Blast对测序结果比对后确定病毒基因型别。对鉴定为CV-A6的分离株利用软件DNAStar和MEGA5.0进行VP1区同源性分析，并构建系统进化树。结果2014—2018年辽宁省共收到非EV-A71和非CV-A16其他EV的阳性标本7 379份，用人横纹肌瘤细胞(rhabdomyosarcoma cells, RD)分离出111株CV-A6。通过遗传进化分析显示，CV-A6流行株形成A、B、C、D分支，D分支分为D1～D3亚分支，2014—2018年43株辽宁省CV-A6分离株处在D2和D3亚分支，D2亚分支11株，D3亚分支32株。辽宁CV-A6分离株间的VP1区基因核苷酸同源性和氨基酸同源性分别为91%～100%和95.5%～100%；与处在A分支的原型株Gdula的核苷酸同源性为79%～82%，氨基酸同源性为90.9%～92.4%，亲缘关系较远；与2008年芬兰变异株KM114057共同处在D分支，亲缘关系近，核苷酸同源性为93%～96%，氨基酸同源性为93.9%～98%。结论辽宁省CV-A6分离株有D2和D3分支共同流行传播，其中D3分支是优势流行株。