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甲烷八叠球古菌及其他广古菌同义密码子使用偏好性

简介：比较分析了甲烷八叠球古菌（Methanosarcinamazeistr．Goel）和其他2种系统发育相关的广古细菌（嗜苦古菌（Picrophilustorridusstr．DSM9790）和盐碱古菌（Natronomonaspharaonisstr．DSM2160））的同义密码子使用偏好性．结果表明甲烷八叠球古菌的密码子使用偏好性很小，并且与GC3S值有很高的相关性．这3种广古细菌的密码子使用模式在进化上很保守．通过分层聚类分析，得出较之基因功能对密码子使用的影响，这些广古菌密码子的使用更是由其物种所决定的．考虑到这3个物种生活在pH值差异很大的环境中，推测其生活环境在很大程度上决定了这些微生物密码子的使用方式．
标签：密码子使用偏好性密码子使用相对概率(RSCU) 甲烷八叠球古菌

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