比较分析了甲烷八叠球古菌（Methanosarcinamazeistr．Goel）和其他2种系统发育相关的广古细菌（嗜苦古菌（Picrophilustorridusstr．DSM9790）和盐碱古菌（Natronomonaspharaonisstr．DSM2160））的同义密码子使用偏好性．结果表明甲烷八叠球古菌的密码子使用偏好性很小，并且与GC3S值有很高的相关性．这3种广古细菌的密码子使用模式在进化上很保守．通过分层聚类分析，得出较之基因功能对密码子使用的影响，这些广古菌密码子的使用更是由其物种所决定的．考虑到这3个物种生活在pH值差异很大的环境中，推测其生活环境在很大程度上决定了这些微生物密码子的使用方式．
东南大学学报：英文版
2007年2期
