沈阳地区一起人副流感病毒3型引起的急性呼吸道感染暴发病原分子流行病学研究

(整期优先)网络出版时间:2022-12-13
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摘要目的明确沈阳地区一起小学急性呼吸道感染疫情暴发的病原及其基因进化特征。方法采集2020年12月末沈阳地区某小学暴发疫情中的患病学生咽拭子标本17份,采用TaqMan低密度阵列分析技术(TaqMan low-density arrays,TLDA)进行常见呼吸道病原检测,并对副流感病毒3型阳性标本采用巢式RT-PCR方法核酸扩增、序列测定和系统进化分析。结果TLDA检测确定10份标本为副流感病毒3型核酸阳性,同时伴有条件致病菌感染,扩增HN基因获得7条完整序列。序列系统进化分析表明本研究7个毒株均处于C3a.1进化分支,其核苷酸同源性为99.9%,与原型株Wash/47885/57核苷酸同源性为94.6%,与进化距离最近的浙江株ZJ/11-s-165/KP690785/CHN/11为99.5%。结论引起沈阳地区该起急性呼吸道感染暴发疫情的病原为副流感病毒3型,为我国东北地区首次报道,其处于C3a.1进化分支。