2016—2017年北京市呼吸道感染病例人冠状病毒流行特征

(整期优先)网络出版时间:2020-09-10
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摘要目的研究阐明北京地区人冠状病毒(human coronavirus,HCoV)的流行特征和基因变异规律,为HCoV的感染防控提供分子流行病学依据。方法本研究收集了2016—2017年北京市呼吸道多病原监测采集的HCoV阳性病例样本287份和流行病学数据,分析HCoV检出率、人群、季节特征,采用RT-PCR方法扩增HCoV pol基因部分片段用于HCoV分型和进化分析研究。结果本研究HCoV检出率为1.89%,HCoV阳性样本的呼吸道病毒共感染率为20.56%(59/287)。鉴定出OC43型69株,核苷酸同源性为97.2%~100%,氨基酸同源性为92.2%~100%;229E型39株,核苷酸同源性为99.2%~100%,氨基酸同源性为99.2%~100%;HKU1型10株,NL63型2株。结论OC43型和229E型为2016—2017年北京市HCoV主要型别,呈现出一定的季节差异,同一型别流行株具有很高的核苷酸和氨基酸同源性。