基因芯片技术对结核分枝杆菌非痰标本检出和耐药性检测的临床应用

(整期优先)网络出版时间:2019-08-18
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基因芯片技术对结核分枝杆菌非痰标本检出和耐药性检测的临床应用

周小宇陈新平刘九红黄文怡

江西省都昌县第二人民医院检验科江西省九江市332600

摘要目的:探讨分析基因芯片技术对结核分枝杆菌非痰标本检出和耐药性检测中的临床应用。方法:选择我院结核科288例涂片阳性患者作为研究对象,对采集样本分别进行基因芯片检测和罗氏培养,分别标本检出情况和耐药情况。结果:共计检出分枝杆菌240株,检出率为83.33%,其中,MTB复合群176株,NTM64株,NTM中鸟分枝杆菌居多,占73.4%(47/64)。初治涂片阳性155例,复治涂片阳性85例。对初治涂片阳性标本进行耐药性检测,异烟肼耐药24例,与金标准相比,其差异不具有统计学意义(P>0.05);基因芯片技术的灵敏度为86.67%,特异度为92.14%;kappa值为0.81,为高度一致性。利福平耐药32例,与金标准相比,其差异不具有统计学意义(P>0.05);基因芯片技术的灵敏度为90.48%,特异度为91.44%;kappa值为0.85,为高度一致性。结论:基因芯片技术能够迅速、准确的判断结核分枝杆菌对异烟肼、利福平的耐药情况,指导临床用药,值得进一步推广和应用。

关键词基因芯片技术;结核分枝杆菌;非痰标本;耐药性

结核病作为一种慢性传染病,在世界范围内严重威胁着公共健康,至今该病都是全球十大死因之一。在中国,每年约有13万人死于结核病[1]。由于治疗的不规范性,耐药的结核分枝杆菌不断增加,有可能会成为将来结核病的主导态势,给治疗增加难度。目前,临床上用于检测结核分枝杆菌的方式有多种,但大部分所需要的检测时间较长,不利于早期诊断[2]。随着分子生物技术的发展,基因芯片技术开始应用于结核分枝杆菌的检测。本文将对基因芯片技术在结核分枝杆菌非痰标本检出和耐药性检测中的临床应用进行探讨分析,旨在为临床应用提供参考。

1资料与方法

1.1研究资料

选择我院结核科2018年5月-2019年4月期间收治的108例涂片阳性患者作为研究对象,其中,男性68例,女性40例,年龄23-81岁,平均年龄(48.32±6.7)岁。

1.2研究方法

取患者体表、胸骨前可疑包块穿刺液并将其分成3份,通过检测选取患者涂片阳性培养标本,2份进行基因芯片检测,剩余1份标本做罗氏培养。

药敏试验则是在观察结核杆菌的菌落组成后取菌落接种,配制菌悬液(1mg/ml),稀释浓度为10-2mg/ml和10-4mg/ml,再分别接种到异烟肼(0.2μg/ml)和利福平(40μg/ml)的药敏培养基上,37℃培养6周,观察培养结果。

1.3统计学分析

所有数据均采用SPSS20.0软件进行统计分析,其中,计数资料采用卡方检验,用P<0.05表示结果具有统计学意义;真实性采用灵敏度和特异度进行评估,可靠性用Kappa值评估,其中,0.8-1.0为最强一致性,0.61-0.8为高度一致性,0.41-0.6为中度。

2结果

2.1分枝杆菌菌种鉴定结果

288例患者标本中共计检出分枝杆菌240株,检出率为83.33%(240/288),其中,MTB复合群176株,NTM64株,NTM中鸟分枝杆菌居多,占73.4%(47/64)。初治涂片阳性155例,复治涂片阳性85例。

2.2初治涂片阳性患者结核分枝杆菌基因芯片检测对异烟肼耐药性结果

检测结果见表1。由表1可知,异烟肼耐药24例,与金标准相比,其差异不具有统计学意义(P>0.05);基因芯片技术的灵敏度为86.67%(13/(13+2)),特异度为92.14%(129/(129+11));kappa值为0.81,为高度一致性。

2.3初治涂片阳性患者结核分枝杆菌基因芯片检测对利福平耐药性结果

检测结果见表2。由表2可知,利福平耐药32例,与金标准相比,其差异不具有统计学意义(P>0.05);基因芯片技术的灵敏度为90.48%(19/(19+2)),特异度为91.44%(123/(123+13));kappa值为0.85,为高度一致性。

3讨论

基因芯片技术是近年来发展较为迅速的一项现代分子生物技术,其原理是对待测的DNA用另一个已知核酸序列的DNA按碱基互补配对的原则进行杂交,通过计算机的处理可得到待测的DNA序列。该技术的主要特点在于具有较高的灵敏性和特异性,能够合理、及时、准确的指导临床用药[3-4]。

在本次研究中,通过选择我院结核科288例涂片阳性患者作为研究对象,对采集样本分别进行基因芯片检测和罗氏培养,分别标本检出情况和耐药情况。结果显示共计检出分枝杆菌240株,检出率为83.33%,MTB复合群176株,NTM64株,NTM中鸟分枝杆菌居多,占73.4%(47/64)。初治涂片阳性155例,复治涂片阳性85例。对初治涂片阳性标本进行耐药性检测,异烟肼耐药24例,与金标准相比,其差异不具有统计学意义(P>0.05);基因芯片技术的灵敏度为86.67%,特异度为92.14%;kappa值为0.81,为高度一致性。利福平耐药32例,与金标准相比,其差异不具有统计学意义(P>0.05);基因芯片技术的灵敏度为90.48%,特异度为91.44%;kappa值为0.85,为高度一致性。这也与文献报道结果相一致[5]。

综上所述,将基因芯片技术应用于结核分枝杆菌的检测,能够迅速、准确的判断结核分枝杆菌对异烟肼、利福平的耐药情况,非痰标本包块穿刺液胸腹水涂片阴性鉴别诊断,指导临床用药,是一种新近的实验室操作技术,值得进一步推广和应用。

参考文献:

[1]陈瑶,吴英松.基因芯片技术对结核分枝杆菌耐药性检测的临床应用[J].分子诊断与治疗杂志,2017,9(2):108-111

[2]许榕青,李丹,林银霞,等.基因芯片技术检测结核分枝杆菌利福平和异烟肼耐药性临床应用评价[J].中国人兽共患病学报,2017,33(1):43-48

[3]李晓非,梁桂亮,普冬,等.基因芯片技术在分枝杆菌菌种鉴定和结核耐药性检测中的应用及评价[J].中国实验诊断学,2015,19(2):204-207

[4]钟业腾,吕志辉,林明冠,等.基因芯片法与线性探针法对痰标本中结核分枝杆菌检测的应用价值[J].中国感染控制杂志,2019,18(4):283-288

[5]陈林,沈静,朱大冕,等.基因芯片技术在检测痰涂阳肺结核患者结核分枝杆菌耐药性的应用效果[J].检验医学与临床,2017,14(9):1220-1223