玄奘唯识新译与真谛唯识旧译，两者在前八识学说上没有多大的本质不同，最大的差异在于旧译立第九识，其目的在于混合唯识与如来藏，这与印度唯识本义是不同的。考其原因，实为解决净依问题，一则是因为对唯识在认识与方法论上尚未完备之故。因此与玄奘新译之主要区别反映在心识结构与心性理论、心性解脱理论、种姓、判教思想以及对依他起性质判定等问题上。总之可以认为真谛是用如来藏思想来解释唯识；玄奘新译唯识学是完备的唯识体系，它反映了印度唯识思想体系成熟时的思想意蕴，同时也体现了玄奘于唯识认识与方法论之贡献。所以他们之间的不同是两种思想体系间的差异。以往研究者认为新旧唯识是唯识观上无相与有相之差别的认识，其实是没有发现问题的实质。
