孙义林1韩振武2徐永成3
(1辽宁省大连市金州区传染病医院116100)
(2辽宁省大连市中医医院116013;3辽宁省大连市第三人民医院116037)
【中图分类号】R73【文献标识码】A【文章编号】1672-5085(2011)16-0100-02
【摘要】目的讨论早发肿瘤与15个STR位点的关联。方法早发肿瘤组为早发肝癌、胃癌和肺癌住院患者,共29例,男15例,女14例。其中,肝癌组9例,男5例,女4例;胃癌组10例,男女各5例;肺癌组10例,男女各5例。STR对照组是100位无关健康个体,男女各50例。STR采用PCR和五色荧光自动检测技术进行检测。结果STR中D6S1043-17位点的频数为0.103,对照组频数为0.030,该项存在显著性差异(P<0.05);其他位点没有显著性差异(P>0.05)。结论STR中D6S1043-17位点的频率高于对照组,其附近可能有早发肿瘤的共同易感基因。
【关键词】肝癌胃癌肺癌STR
【Abstract】ObjectiveDiscussinearlyattackpatientwithcanceritsassociationwith15STRLoci.MethodsTheearlylivercancer,gastriccancer,lungcancergroupconsistedof29hospitalizedcoronarycancerpatientsincluding15malesand14females,ofwhomearlylivercancergroupincluded5malesand4females;earlygastriccancergroup5malesand5femalesandearlylungcancergroup5malesand5females.TheSTRcontrolgroupconsistedof100non-relatedandhealthyinpidualsincluding50malesand50females.PCRSTRbyautomaticdetectionandfive-colorfluorescencedetectiontechnology.ResultsThelocifrequencyofSTRsD6S1043-17was0.103andthatinthecontrolgroupwas0.030.Therewassignificantdifference(P<0.05)inthisitemandnosignificantdifferenceinotheritems(P>0.05).ConclusionThelocifrequencyofSTRsD6S1043-17ishigherthanthatinthecontrolgroup,sotheremightbecommonsensitivegenesnearbytoearlytumor.
【Keywords】LivercancerGastriccancerLungcancerSTR
本实验针对早发肿瘤15个STR(包括D8S1179、D21S11、D7S820、CSF1PO、D3S1358、THO1、D13S317、D16S539、D2S1338、D19S433、VWA、TPOX、D18S51、D5S818、FGA)进行综合分析,进一步阐述其发病机制,为早发肿瘤的预防、诊断和治疗积累一定的数据。
1材料与方法
1.1标本来源
1.1.1肿瘤组均为原发性肿瘤,标本来自2009年9月28日到2009年12月12日在大连第三人民医院住院患者。全部病例已经手术和病理确诊。肝癌组病程均在半年以内,而胃癌组和肺癌组病程在一年之内。
1.1.1.1肝癌组,9例,其中男5例,35岁~54岁,BMI=22.63±1.74;女4例,43岁~54岁,BMI=25.39±2.01。
1.1.1.2胃癌组,10例,其中男5例,44岁~52岁,BMI=23.82±3.73;女5例,32岁~45岁,BMI=24.22±4.50。
1.1.1.3肺癌组,10例,其中男5例,20岁~54岁,BMI=22.52±4.50;女5例,32岁~49岁,BMI=23.68±3.43。
1.1.2STR对照组100名无关健康个体,男女各50例。
以上各组均排除糖尿病、肝病、肾病、传染病、血液病等疾病。
1.1.3标本采集分别将对照组与肿瘤组患者(肿瘤标本来源于手术前、未进行放疗或化疗清晨空腹血)的静脉血采于EDTA-K2抗凝剂的抗凝管中,检测STR。
1.2STR(短串联重复序列)的检测按试剂盒说明书进行,质控在控。
1.3统计学处理采用统计学软件SPSS11.5进行数据处理,对于最小频数小于5.0时使用确切概率法。
2结果
检测结果见表1。
表1肿瘤组特定STR座位各重复序列的频率分布(阳性值)
※与对照组比较具有统计学意义(P<0.05)。
3讨论
随着人类对于肿瘤认识的不断深入,不同时期人们对肿瘤赋予不同的定义。由于人类迄今尚不能充分阐明肿瘤的起源及其本质,所以很难给肿瘤一个精准的概念。一般认为,肿瘤是机体在各种环境和遗传因素联合作用下引起细胞异常变化,并且逃避了免疫系统的监视形成新生物,通常表现为肿块。肿瘤是一种与其他疾病有着根本不同的病种,因为大多生物体的疾病都具有个别性,唯独肿瘤是一种有着共性的疾病。所谓肿瘤的共性,主要表现在所有组成肿瘤的细胞,在增殖上有自主性和分化异常。肿瘤的发生,从根本上说,已经涉及到细胞生命的起源、发生和发展问题。
人类基因组是一个十分稳定的体系,不同群体及个体都有相同数目的染色体和基因,也有基本相同的核苷酸序列,由于基因组结构的这种稳定性决定了人类这一物种的稳定性;人类基因组又是一个变异的体系,长期进化中,基因组的DNA序列在不断发生变异,其中的一些变异被保存下来,导致不同种族、群体、个体间基因组的差异性及多态性。因此,除单卵双生没有两个完全相同的基因组[1]。基因多态性是指DNA序列所构成的常见变异在某群体中的出现频率不小于1%。人类基因组DNA多态性分为序列多态性和序列长度多态性,前者指两条同源染色体的DNA序列长度相等,但是存在某些核苷酸对差异,如限制性片段长度多态性和单核苷酸多态性等;后者则表现为重复序列及其拷贝数的差异,称为短串联重复序列多态性(STRPs),包括小卫星多态性,又称为数量可变的串联重复序列(VNTR),和微卫星多态性,又称为简单重复序列多态性(SSLPs)。串联重复序列(STR),即微卫星DNA序列多态性是一类广泛存在于原核生物、真核生物基因组的DNA串联重复序列,由2~6个碱基组成重复序列,多数由两个碱基组成,其简单重复序列在同一位点重复次数可有较大差异,因此,STR在群体中可有多达几十种等位片段(多态性),因而其信息量较大[2],对肿瘤分子诊断具有一定的价值。
近年来,随着STR检测技术的发展,其应用领域也随之日益广泛。本试验就采用了STR对肿瘤进行检测。一般来讲,目的基因与STR位点有连锁关系,则其位置可能与STR位点邻近,故而,对其附近区域进行克隆测序,就可能发现目的基因[3,4]。本次特定STR的检测结果中:肿瘤组D6S1043-17位点的频率高于对照组(P<0.05),其附近可能有早发肿瘤的共同易感基因。这表明肝癌、胃癌、肺癌可能是遗传性肿瘤或者是遗传易感性肿瘤。我们将进一步进行详细研究其发生、发展机制,并且寻找出STR位点邻近真正的基因。
参考文献
[1]LewinB.Genes,7thed,NewYork:OxfordUniversityPress,2000.
[2]吕建新,尹一兵.分子诊断学.中国医药科技出版社,279-280.
[3]滕少康,劳明.STR应用的研究进展.中华临床医药,2004,5(15):1562-9023.
[4]卢太僧,邱倍芳.薛京伦医学分子遗传学.复旦大学出版社,1998,5:505-50.