埃博拉病毒进化有基因“引擎”

(整期优先)网络出版时间:2015-12-22
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埃博拉病毒进化有基因“引擎”

中国科学院武汉病毒研究所研究员张波课题组,对1976年到2014年全球暴发的7次埃博拉疫情中的埃博拉病毒(ZEBOV)进行生物信息学分析,结果显示,ZEBOV的GP基因受到自然选择作用,而且在2014年暴发的毒株中具有显著加快的进化速率,推测该基因的变化与此次大范围人与人之间快速传播相关。相关论文已在最新一期国际传染性疾病研究期刊《传染、遗传和进化》上在线发表。这一发现对流行病学调查和疫苗设计有重要意义。

科研人员对历年来所有ZEBOV进行了全基因组正选择检测,结果发现,与病原性和免疫逃避相关的GP基因,以及与病毒复制、翻译有关的L基因均呈现出明显的正向选择压力。其中,GP基因的正向选择位点主要位于该蛋白晶体结构的粘蛋白样结构域上,其中2个为此次暴发毒株的特征性氨基酸位点。L基因的正向选择位点则主要位于可变区,这些高度变异的序列可能在L蛋白的功能和空间结构上发挥着重要作用。此外,2014年西非的流行株与早期暴发的毒株相比,其GP基因具有显著加快的进化速率。

文章第一作者、中国科学院武汉病毒研究所刘思情博士解释称,不论是受到正向选择作用,还是进化速率加快,都意味着埃博拉病毒在不断变化的过程中能够更好地适应新环境。