简介：背景与目的：顺铂是神经肿瘤化疗常用药物之一,耐药是疗效不佳原因之一。遗传学改变可以影响肿瘤细胞对化疗的敏感性。本研究旨在利用芯片-基因组杂交技术筛选胶质瘤细胞中与顺铂耐药相关的分子标志物。方法：用芯片-基因组杂交技术对我们先前采用顺铂剂量梯度爬升诱导的对顺铂高度耐药的U251/CP2细胞（IC50为76.5μg/mL）和亲代细胞U251细胞（IC50为1.2μg/ml）筛选与顺铂耐药相关的分子标志物。RT-PCR和实时荧光定量PCR用来对结果进行验证。结果：补体因子H相关蛋白1基因（CFHR1）和补体因子H相关蛋白3基因（CFHR3）在U251细胞中至少各自缺失了一个拷贝,在U251/CP2细胞中完全缺失。IL-7基因在U251/CP2细胞中的拷贝数为U251细胞的2～3倍。结论：CFHR1、CFHR3和IL-7基因可能与胶质瘤对顺铂耐药有关。

简介：目的：筛选卵巢癌实验诊断比较适合的肿瘤标志，进一步探究其临界值。方法将研究对象分为卵巢癌组、卵巢良性肿瘤组和健康体检组，采用电化学发光法检测CA153、CA724、CA125、人附睾蛋白4（humanepididymisprotein4，HE4）等项目的浓度，并以文献报道的方法计算卵巢恶性肿瘤风险模型（riskofovarianmalignancyalgorithm，ROMA）；以SPSS软件分析研究对象肿瘤标志的表达差异，并分析它们的诊断指数（灵敏度＋特异性）；根据受试者工作特征曲线（receiveroperatingcharacteristics，ROC），试确定各肿瘤标志的最佳临界值。结果三组的肿瘤标志表达水平存在显著差异（P＜0．05）；ROMA的诊断能力最佳（诊断指数1．94，灵敏度0．94、特异性1．00），其它依次是HE4（诊断指数1．86，灵敏度0．89、特异性0．97）、CA125（诊断指数1．75，灵敏度0．83、特异性0．91）；依据曲线下面积（areaunderthecurve，AUC），诊断卵巢癌能力大小的肿瘤标志（或项目）分别是：ROMA、HE4、CA125、CA153、CA724。结论诊断卵巢癌应优先考虑CA125、HE4和ROMA等项目，相应临界值可拟定为90．96U/ml、81．38pmol/l和37．22％。

简介：目的筛选并建立与乳腺癌术后复发转移相关的基因表达谱，初步探讨其与疾病发展的关系。方法81例乳腺癌患者入选，其中41例术后5年随访期内出现复发者为研究组，40例未复发仍存活者为对照组。提取所有病例石蜡包埋组织RNA，质量鉴定后，应用实时定量RT—PCR芯片技术平行检测84个已知的与乳腺癌转移特性相关的基因以及5个管家基因和7个质控对照，分析两组问差异表达基因。结果研究组与对照组相比较，12个基因表达有差异，其中9个基因表达上调，3个基因表达下调（P〈0．05）。表达异常的基因与细胞周期调控，细胞内激素信号传导，细胞增殖、分化和凋亡以及细胞迁移和粘附等功能相关。结论RT—PCR芯片技术能快速、准确地提供肿瘤相关特性基因表达谱的信息；乳腺癌术后复发相关基因差异表达分析可为预防和控制该病的复发提供新线索。

简介：目的从转录组水平筛选食管癌淋巴结转移相关基因，为深入研究食管癌淋巴结转移提供线索。方法利用癌症和肿瘤基因图谱（TCGA）数据资源，采用随机森林分类方法从转录水平分析、筛选食管癌淋巴结转移相关基因，并对其进行功能聚类。结果获得了与食管癌淋巴结转移相关基因的相关显著性排序，分析获得的重要相关基因集的功能主要集中在细胞代谢及DNA修复、转录等的调控上，并在其中获得了与食管癌淋巴结转移密切相关的代谢及DNA调控领域中的重要节点基因。结论Heatmap图显示获得一簇明显的淋巴结转移相关基因，聚类分析显示这些基因主要集中在代谢和DNA调控等功能上，网络分析获得了KRAS、PPMB、PPP3CA、ATR、WRN、TOP2B等与食管癌淋巴结转移相关的重要节点基因。

简介：探寻特异性强和灵敏度高的肝癌早期黏诊断标志物，进一步提高肝癌早期诊断水平，是目前肝癌综合防治研究的重点之一。随着人类基因组计划的初步完成以及蛋白质组学技术的成熟发展，肿瘤标志物研究领域的重心从结构基因组学向功能蛋白质组学转移。差异（比较）蛋白质组学研究在疾病的早期诊断、病程及疗效监测、环境因素影响分析等方面有广泛的研究应用价值。本文就其应用于寻找肝癌血清标志物的研究进展做一综述。

简介：目的：筛选胃癌血管特异性短肽GEBP11（CTKNSYLMC）的结合受体.方法：采用Western-blot、免疫细胞化学染色法对共培养人脐静脉内皮细胞（co-HUVECs）CD31和KDR的表达进行检测;化学合成生物素标记的GEBP11,应用免疫沉淀、免疫磁珠法分离富集与GEBP11结合的蛋白质;采用Western-blot检测,确定并获取特异性蛋白条带;利用液相色谱一二级质谱（LC-MS/MS）及生物信息学分析,对条带蛋白进行测序和分析.结果：co-HUVECs表达CD31,KDR表达增加.通过免疫沉淀和Western-blot分析,发现一条与GEBP11特异结合的条带,其分子量约为12KD.经LC-MS/MS和生物信息学分析,获得候选蛋白ATP7B.结论：经鉴定co-HUVECs表达内皮细胞标志性分子且KDR表达上调;利用免疫沉淀-质谱法筛选获得了GEBP11受体的候选蛋白,为研究GEBP11的作用机制奠定了基础.

简介：目的研究抗癌药吉西他滨（Gemcitabine）诱导胰腺癌Panc-1细胞凋亡的相关基因。方法应用基因芯片技术检测50．33μg／LGemcitabine作用于胰腺癌PANC-1细胞48h后凋亡基因表达的变化。结果Gemcitabine抑制细胞表达14种凋亡相关基因，包括IRF-4、Scotin、14—3—3gamma、PDE4、GRPS、TID1、AFP、STAT5、Sox-4、c-Rel、MYCN、Htt、CatD、Gd。相反，gemcitabine促进了3种凋亡相关基因的表达，包括CyclinB1、ASK1、AKT2。结论Gemcitabine诱导胰腺癌Panc—1细胞凋亡通过非依赖caspaseASK1途径。

简介：目的探讨筛选鼻咽低分化鳞癌血清肿瘤标志物的临床应用价值。方法应用表面增强激光解吸离子化飞行时间质谱（sulaceenhancedlaserdesorption/ionizationtime—obflightmassspeetrometry，SELDI—TOF—MS）及CMl0型弱阳离子交换芯片对61例初治的鼻咽低分化鳞癌患者和72名健康人血清标本进行蛋白质指纹图谱测定，其中80例用于建模（40例鼻咽癌，40名健康人），53例用于肓法检测（21例鼻咽癌，32名健康人），用BiomarkerWizard3．01及BiomarkerPattern5．01分析软件对测得的数据进行处理及建立诊断模型。结果用建立的区分鼻咽低分化鳞癌与健康人的血清蛋白指纹图诊断模型进行肓法检测的准确性、敏感性和特异性分别为86．8％、81．0％和90．6％。其中Ⅰ、Ⅱ期鼻咽低分化鳞癌检出的准确性为73．7％，Ⅲ、Ⅳ期鼻咽低分化鳞癌检出的准确性为81．0％。结论用SELDI—TOF—MS技术与生物信息分析法筛选的血清肿瘤标志物对鼻咽低分化鳞癌的定性诊断提供了一条新途径。