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  • 简介:研究距瓣尾囊草种质资源遗传背景和系统进化提供理论依据和技术支持,本研究利用L16(45)正交设计,研究Mg2+等5个因素对PCR扩增结果影响。研究结果表明,在距瓣尾囊草SCoT-PCR最优反应体系(20μL)中,Mg2+、dNTPs、TaqDNA聚合酶、引物以及模板DNA等5个因素最优浓度分别是2.188mmol/L、0.113mmol/L、1.0U、0.625μmol/L和30ng。在此基础之上,从18条引物中初步筛选出12条扩增结果稳定、条带清晰SCoT引物。建立了距瓣尾囊草SCoT-PCR反应体系,经过18条引物和13份种质资源验证,证明体系稳定性好、可靠性高,能满足距瓣尾囊草分子水平上研究。

  • 标签: 距瓣尾囊草 SCoT标记 正交设计 遗传背景
  • 简介:棉酚是种存在于棉酚腺体中倍半萜烯类化合物.由于它抗虫性及毒性,在棉花育种中颇受重视.近年来,对棉酚腺体、棉酚研究较多,已经发现和克隆了棉酚生物合成相关基因,初步阐明了棉酚合成代谢分子调控机制.有关棉酚深入研究将有助于育种家培育种子低酚而植株高酚棉花新品种.

  • 标签: 棉酚腺体 生物合成 低酚棉 分子育种 分子调控机制
  • 简介:为了提高抗病性分子标记检测效率,番茄病害检测及多抗品种选育提供技术依据,本研究通过改良CTAB法、96孔深孔板快速提取番茄微量叶片DNA;利用抗根结线虫病Mi标记,在L16(45)正交设计试验基础上,采用直观量化分析和方差分析两种方法,对番茄实用化PCR分子标记PCR反应5个因素(引物,Mg2+,dNTPs,模板DNA和Taq酶)进行优化;随后分别筛选黄化曲叶病毒病、烟草花叶病毒病、根结线虫病、枯萎病、叶霉病和颈腐根腐病6种病害8个实用化PCR分子标记PCR程序退火温度;并对循环次数进行筛选;最后利用优化后PCR体系程序对供试1442份番茄材料(包括番茄种质资源,群体材料,组合及品种)进行抗病性鉴定。结果表明番茄实用化PCR分子标记PCR最佳反应体系(20μL)引物0.5μmol/L、Mg2+1.5mmol/L、dNTPs0.3mmol/L、DNA480ngDNA、聚合酶1.0UTaq;PCR程序中8个分子标记共同最适退火温度56℃,最佳循环次数33次;筛选出585份多抗(含2种以上抗病基因)番茄材料,可作为中间材料或亲本材料进行多抗品种选育。该实用化PCR分子标记PCR体系建立为番茄利用抗病基因分子标记检测筛选多抗种质资源、品种或群体材料提供了标准化程序。

  • 标签: 番茄 抗病基因 实用化PCR分子标记 正交设计 体系优化
  • 简介:本研究对晋豆23大豆孢囊线虫抗源灰布支黑豆F3代群体共61个单株进行了ISSR分析,共检测出376个基因位点,多态性位点82个,多态性位点比例218%。获得5个共显性位点,5个共显性位点平均基因杂合度0164。ISSR引物(GA)8C检测到3种基因型,ISSR引物VDV(CT)7检测到16种基因型。本研究表明该群体内有较丰富遗传多样性,说明灰布支黑豆是大豆孢囊线虫抗病育种理想抗源。

  • 标签: 大豆 大豆孢囊线虫 ISSR标记 遗传多样性
  • 简介:艾纳香(Blumeabalsamifera)作为贵州道地药材,其次生代谢产物,如类黄酮、艾纳香素等具有重要药理作用。葡萄糖基转移酶(UFGT)是艾纳香类黄酮代谢途径中个关键酶。本研究通过对艾纳香转录组进行测序,借助引物PCR成功克隆得到其葡萄糖基转移酶基因cDNA序列,并对其进行了相应生物信息学分析。分析发现,艾纳香UFGT基因cDNA全长1527bp,共编码508个氨基酸,所编码蛋白分子量56.155kD,等电点5.30,属于疏水性蛋白,可能定位于微体中。此外,艾纳香UFGT蛋白二级结构中0l螺旋占33.07%,延伸链占10.83%,无规则卷曲56.10%,三级结构预测结果致。本研究对于探究黔产艾纳香类黄酮物质生物合成分子机制有指导意义,并为将来类黄酮生物合成提供帮助。

  • 标签: 艾纳香 UFGT 基因克隆 生物信息学
  • 简介:谷氧还蛋白(glutaredoxin,GRX)是类小分子氧化还原酶,在植物生长发育调控及逆境胁迫中起着重要调节作用。本研究拟对玉米MS22基因生物信息及玉米中GRX基因家族亲缘进化进行分析研究。通过对MS22基因生物信息分析,发现MS22基因全长881bp,编码159个氨基酸,属于CC型谷氧还蛋白。玉米基因组中共鉴定出22个GRX类基因,其中有6个基因为GRX-subⅠ,7个基因属于GRX-subⅡ,9个基因属于GRX-subⅢ。通过聚类分析发现MS22属于GRX-subⅢ类型,该蛋白不同来源CC型谷氧还蛋白氨基酸序列保守性较高,致率介于61%-87%之间。通过该研究对玉米中该类型基因步研究具有较好理论指导意义。

  • 标签: 玉米 MS22 谷氧还蛋白家族 生物信息学
  • 简介:《基因组学应用生物学》(ISSN1674-568X,CN45—1369/Q)是由广西大学主管和主办,公开发行月刊科学期刊,创刊于1982,由北京大学教授朱玉贤院士任主编,广西大学教授陈保善博士和海南省热带农业资源研究所所长方宣钧博士任执行主编。

  • 标签: 《分子植物育种》 编辑部 编辑工作 作者 征稿启事
  • 简介:目前,在铁皮石斛多糖研究主要集中在多糖结构、生物活性等方面,对多糖合成相关基因研究较少,本研究通过对‘红鑫1号’铁皮石斛幼苗期和二生植株以及‘红鑫6号’铁皮石斛二生植株叶、茎、根三部位蔗糖合成酶基因进行RT-PCR扩增测序,发现‘红鑫1号’‘红鑫6号’铁皮石斛蔗糖合成酶前体mRNA存在拼接差异现象,主要形成三种不同mRNA转录本,其翻译得到蔗糖合成酶,结构功能没有改变;分析序列可变剪切差异;同时对铁皮石斛叶、茎、根嬲表达量进行半定量RT-PCR检测,蔗糖合成酶基因在植株中不同部位表达量不同,其表达模式表现为茎〉叶〉根。本研究铁皮石斛蔗糖合成酶基因功能研究提供了科学依据。

  • 标签: 铁皮石斛 多糖合成酶 克隆 表达
  • 简介:多胺是植物体内参与生长发育及各种逆境胁迫响应类重要化合物,其合成过程受多个基因共同调控,S-腺苷甲硫氨酸脱羧酶(S-adenosylmethioninedecarboxylase,SAMDC)基因参与多胺合成过程并发挥关键作用,研究该基因在红麻(HibiscuscannabinusL.)抗旱和耐盐过程中作用,通过红麻转录组数据库筛选到SAMDC基因核心片段,利用染色体步移技术获得了SAMDC基因cDNA全长,命名为HcSAMDC,生物信息学分析表明:HcSAMDC基因编码序列长1137bp,编码378个氨基酸,相对分子量41.8kD,等电点4.86。红麻HcSAMDC与其它植物SAMDC同源性较高,其中可可树氨基酸相似性78%、棉花SAMDC氨基酸相似性82%,该研究对下步分析该基因功能、阐明麻类SAMDC基因逆境调控机制和抗逆基因工程育种具有重要意义。

  • 标签: 红麻 S-腺苷甲硫氨酸脱羧酶 染色体步移 抗旱
  • 简介:本研究以菠萝叶片材料,从中克隆到个可能与菠萝叶刺形成相关基因AcSPL14(Ananascomosussquamosapromoter-binding-likeprotein14)。该基因cDNA全长1330bp,开放阅读框1086bp,编码362个氨基酸。结构域分析结果显示AcSPL14蛋白序列具有SPL蛋白家族共有的功能结构域--SBP(SQUAMOSApromoterbindingprotein-like)结构域,且石刁柏(Asparagusofficinalis)、铁皮石斛(Dendrobiumcatenatum)、月季(Rosachinensis)和麻风树(Jatrophacurcas)SBP序列相似性分别为53%、51%、47%和46%。在此基础上,本研究进步构建了pBI121-AcSPL14过表达载体,获得了工程菌。本研究AcSPL14在菠萝中生物学功能鉴定提供了理论依据,对深入研究菠萝叶刺发生分子机理具有重要意义。

  • 标签: 菠萝 叶刺 AcSPL14 基因克隆
  • 简介:本研究以甜瓜杂交新品种‘西州密25号’和‘西州密17号’及其亲本种质试验材料,利用SSR(simplesequencerepeats)分子标记检测技术,并结合大田传统鉴定方法对其种子纯度及真实性进行了分析研究。结果表明,从18对SSR引物中筛选得到多对特异性引物可以鉴定出‘西州密25号’‘西州密17号’杂交种纯度。‘西州密25号’三批种子纯度分别为98.42%、99.41%、99.38%;‘西州密17号’种子纯度99.22%。SSR分子标记鉴定结果与‘西州密25号’和‘西州密17号’大田植物学形态特征鉴定结果符合率高达99%以上。SSR分子标记方法可以准确鉴定出杂交种纯度及真实性,且大大缩短鉴定周期,可为开展‘西州密25号’和‘西州密17号’甜瓜新品种杂交种纯度室内鉴定快速检测提供技术支撑。

  • 标签: 甜瓜 西州密17号 西州密25号 SSR 种子纯度
  • 简介:细胞质雄性不育(cytoplasmicmalesterility,CMS)是植物杂种优势利用基础,大量研究表明CMS是线粒体基因细胞核基因互作结果。蛋白质是基因表达产物,也是基因功能执行者,研究线粒体蛋白质有利于探索CMS产生机理。本文综述了CMS相关线粒体蛋白质研究进展,并探讨了PPR(penta-tricopeptiderepeats)基因结构特征、生物学功能及对CMS相关基因表达调控。

  • 标签: 细胞质雄性不育性 线粒体蛋白质组 PPR
  • 简介:本研究以双单倍体马铃薯DM突变体材料,利用PCR-walking方法扩增其突变体侧翼序列。在试验中,以60个鉴定过阳性突变体样品材料扩增后,有28个样品扩增出有效条带。PCR胶回收后测序,有2个样品测序无信号,其他26个样品,将测序载体序列和马铃薯基因组序列用BLASTN比对,发现有6个样品分别插入到了马铃薯1、3或7号染色体上。通过进步比对,发现编号为TDM90突变体中,载体插入了PREDICTED:Solanumtuberosumtrans-resveratroldi-O-methyltransferase-like(LOC102590422),mRNA马铃薯反式白藜芦醇基因中。试验说明了PCR-walking法扩增马铃薯侧翼序列是可行。且载体插入马铃薯反式白藜芦醇基因中对马铃薯白藜芦醇基因表达有何影响,有进步研究下去重要意义。

  • 标签: 马铃薯DM突变体 PCR-walking 侧翼序列扩增 白藜芦醇
  • 简介:研究甘蓝型油菜种质遗传多样性,以提高甘蓝型油菜种质利用效率。本研究从140对甘蓝型油菜SSR引物中,筛选出40对多态性好SSR标记,并结合植株田间农艺性状特征鉴定,对63份来自四川甘蓝型油菜种质资源进行遗传多样性、群体结构和性状关联分析。研究结果表明:40对多态性好引物共检测到152个等位变异,引物平均多态性位点3.8,平均多态信息量(PIC)0.8497;在带型分析基础上,根据相似系数将参试材料聚5大类群,多数参试材料属于第2、3大类群;在SSR多态信息基础上,对参试材料进行群体结构分析,将参试材料分为4个群体,86%参试材料Q值大于0.70。对40个SSR位点8个主要农艺性状用TASSEL软件GLM(generallinearmodel)模型进行关联分析,共检测到15个位点农艺性状显著相关,其中6个位点极显著相关。这6个SSR位点分别为:yw222和ywy05标记全株角果数极显著相关,yw140和yw134标记主序角果数极显著相关,ywy19和yw138标记次分支数极显著相关;其中ywy19同时每角粒数、主序角果数、主序有效长显著相关。研究结果表明,本研究参试材料具有较好代表性,遗传多样性较丰富;研究分析所得与农艺性状极显著关联SSR标记位点在提高甘蓝型油菜种质利用效率方面具有重要实践意义。

  • 标签: 甘蓝型油菜 SSR 遗传多样性 关联分析
  • 简介:转录因子可以调节众多下游基因表达,在植物抗逆境中起重要调节作用。以南方型紫花苜蓿Medicagosativa‘Millennium’耐盐突变体材料,以正常培养(MT_CK2)和盐胁迫(MT_N2)条件下2个样品叶片进行转录组测序分析,并进行qRT-PCR验证RNA-Seq结果可靠性,研究耐盐突变体叶片盐胁迫应答相关转录因子基因。结果表明:经过250mmol/LNaCl胁迫72h,共检测到30900个基因表达量发生了变化,7694个基因差异表达,共有隶属于50个转录家族422个转录因子发生了差异表达,上调表达268个,下调表达154个。盐胁迫应答基因数量最多是MYB基因家族,其次是WRKY、NAC、bHLH和AP2-EREBP转录家族。此外,候选出MsANT、MsbHLH36、MsNAI1、MsbZIP、MsbZIP73A、MsC3H、MsMYB85、MsNAD、MsMYB、MsNAC、MsTrihelix和MsWRKY等盐胁迫应答相关重要转录因子。本研究揭示紫花苜蓿盐胁迫分子机制奠定基础。

  • 标签: 南方型紫花苜蓿 转录因子 叶片 盐胁迫
  • 简介:根据201547日,中国科学院文献情报中心公布2015-2016度中国科学引文数据库(ChineseScienceCitationDatabase,CSCD)收录来源期刊目录(网址http://sciencechina.cn/cscd_source.jsp),《基因组学应用生物学》榜上有名,入选中国科学引文数据库来源期刊核心库。中国科学引文数据库(CSCD)被誉为"中国SCI",是中国最具权威收录数据库之,被CSCD收录标志着入选期刊在该领域领先水平。

  • 标签: 应用生物学 核心库 基因组学 HTTP
  • 简介:在海南省科学技术协会直接领导下,在海南省热带农业资源研究所大力支持下,年轻海南省生物工程协会以创新导航发展,全面树立经营协会、服务会员、贡献社会理念,通过建立生物工程领域科学研究技术创新服务平台,培育了系列具有特色品牌服务产品,取得了明显成效。

  • 标签: 海南省生物工程协会 现代生物技术 会员 第二届 海南省科学技术协会 产业
  • 简介:简要介绍了5种传统、最常用DNA分子标记(RFLP、RAPD、AFLP、SSR和SNP)技术原理及它们优缺点,也总结了TRAP这种新产生分子标记技术原理、优点及应用前景。综述了这几类分子标记在花生种质进化、遗传多样性分析、分子图谱构建及抗虫、抗病等方面的研究。利用SSR和RAPD标记能够发现野生种和栽培种多态性进而实现分子标记对花生遗传多样性分析,可以将许多花生品种分为不同品种群,能够对花生进行种质进化研究。RFLP和AFLP技术利于花生图谱构建,利用DNA中特定限制性酶切位点上碱基对改变及酶切位点之间分予重排,可以发现花生品种间DNA许多多态性位点,进而绘制分子标记图谱。AFLP技术在花生青枯菌和花生抗黄曲霉研究方面有很大进展。RAPD技术在花生根瘤菌、花生线虫病等方面已有显著进展。最后对分子标记在花生育种中应用前景进行了简单展望。

  • 标签: 花生 分子标记 辅助育种
  • 简介:本研究以油茶品种‘长林4号’无性系扦插苗材料,采用RT-PCR技术分离出个油茶铝激活苹果酸转运体基因。该基因cDNA全长1761bp,编码586个氨基酸,分子量65.59kD,理论等电点(PI)6.27。与其他植物ALMT蛋白高度同源,将该基因命名为CoALMT(GenBank登录号:KT932706)。CoALMT蛋白含有6个跨膜区,可能定位在细胞质膜上。CoALMT蛋白二级结构中α-螺旋(Alphahelix)、β折叠(Extendedstrand)、β转角(Betaturn)、无规则卷曲(Randomcoil)分别占52.05%、16.89%、8.70%、22.35%。以‘长林4号’和‘长林166号’无性系扦插苗材料,利用qRT-PCR技术分析了沙培条件下两个不同无性系在不同磷水平下不同器官组织中CoALMT基因表达。结果表明,低磷处理下,两个无性系油茶根系CoALMT表达量均上升,说明油茶根系中CoALMT基因表达受到低磷诱导。茎和叶中表达模式根中存在差异。低磷处理下不同组织中,‘长林166号’中CoALMT基因表达量均比‘长林4号’高。综上结果可知CoALMT基因参与油茶对低磷响应,其可能会影响油茶磷吸收利用效率。

  • 标签: 油茶 苹果酸转运体 低磷胁迫下 基因克隆 表达分析
  • 简介:不论是野生还是离体条件下,珠芽均是植物进行繁殖再生重要器官,已从多方面进行了研究,但缺乏全面系统介绍。本综述从植物珠芽定义、起源发生部位、发育过程、显微结构、生理生态及实际生产中作用等方面介绍了珠芽研究进展,认为植物珠芽可着生于叶腋、花序或叶片表面,是由薄壁细胞分裂分化而来;珠芽发育经历了启动、膨大和成熟三个阶段,内源激素含量和变化有关;珠芽在数量、萌发率和生活力等方面有明显优势,是良种繁育和种群繁衍高效方式;并探讨了珠芽形成分子机制,对未来珠芽研发进行了展望。

  • 标签: 珠芽 发育过程 形成机制 研究应用