简介:近日,广域网络应用传输与安全网络网关设备领导厂商BlueCoat系统公司(纳斯达克代码:BCSI)完成了对提供包括应用程序分类和性能管理等尖端WAN流量优化技术的
简介:Althoughtheproteinsequence-structuregapcontinuestoenlargeduetothedevelopmentofhigh-throughputsequencingtools,theproteinstructureuniversetendstobecompletewithoutproteinswithnovelstructuralfoldsdepositedintheproteindatabank(PDB)recently.Inthiswork,weidentifyaproteinstructuraldictionary(Frag-K)composedofasetofbackbonefragmentsrangingfrom4to20residuesasthestructural"keywords"thatcaneffectivelydistinguishbetweenmajorproteinfolds.Wefirstlyapplyrandomizedspectralclusteringandrandomforestalgorithmstoconstructrepresentativeandsensitiveproteinfragmentlibrariesfromalargescaleofhigh-quality,non-homologousproteinstructuresavailableinPDB.Weanalyzetheimpactsofclusteringcut-offsontheperformanceofthefragmenthbraries.Then,theFrag-KfragmentsareemployedasstructuralfeaturestoclassifyproteinstructuresinmajorproteinfoldsdefinedbySCOP(StructuralClassificationofProteins).OurresultsshowthatastructuraldictionarywithN4004-to20-residueFrag-KfragmentsiscapableofclassifyingmajorSCOPfoldswithhighaccuracy.
简介:蛋白质合拢问题是生物信息学的最突出的问题之一。在这篇论文,我们与单体的二种学习一个三维的关闭,关,断开,截止格子蛋白质AB模型,恐水病;吸水,;介绍一个启发式的伪物理的算法。由精心地在物理世界上模仿光滑的有弹性的球的运动,算法为给定的单体链发现低精力的配置。一个随后的“关闭,关,断开,截止陷井”策略被建议被触发一为一种粘住的状况的jump以便从本地最小出来。方法在关闭,关,断开,截止格子AB模型被测试了。计算结果显示出有希望的性能。为有13~55单体的所有序列,算法比以前建议的通常认为的接地状态与更低的精力发现状态。而且为有21的序列,34;55单体,新通常认为的接地状态被发现,它与在现在的文学给的那些不同。