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  • 简介:近日,广域网络应用传输与安全网络网关设备领导厂商BlueCoat系统公司(纳斯达克代码:BCSI)完成了对提供包括应用程序分类和性能管理等尖端WAN流量优化技术的

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  • 简介:Althoughtheproteinsequence-structuregapcontinuestoenlargeduetothedevelopmentofhigh-throughputsequencingtools,theproteinstructureuniversetendstobecompletewithoutproteinswithnovelstructuralfoldsdepositedintheproteindatabank(PDB)recently.Inthiswork,weidentifyaproteinstructuraldictionary(Frag-K)composedofasetofbackbonefragmentsrangingfrom4to20residuesasthestructural"keywords"thatcaneffectivelydistinguishbetweenmajorproteinfolds.Wefirstlyapplyrandomizedspectralclusteringandrandomforestalgorithmstoconstructrepresentativeandsensitiveproteinfragmentlibrariesfromalargescaleofhigh-quality,non-homologousproteinstructuresavailableinPDB.Weanalyzetheimpactsofclusteringcut-offsontheperformanceofthefragmenthbraries.Then,theFrag-KfragmentsareemployedasstructuralfeaturestoclassifyproteinstructuresinmajorproteinfoldsdefinedbySCOP(StructuralClassificationofProteins).OurresultsshowthatastructuraldictionarywithN4004-to20-residueFrag-KfragmentsiscapableofclassifyingmajorSCOPfoldswithhighaccuracy.

  • 标签: PROTEIN FRAGMENT FOLD recognition PROTEIN structure
  • 简介:蛋白质合拢是在生物信息学,许多试探算法为被建议了的一个相关计算问题。这个工作为微分进化(DE)的申请介绍方法论给蛋白质合拢的问题,用双性人维的恐水病极的模型。DE是一个相对最近的进化算法,;在几个工程优化问题成功地被使用了,通常与连续变理。我们介绍在DE印射以便提供一在真实值的向量之间印射的遗传型显型的概念;实际合拢。方法论被详细说明;有基准的几个实验被做。我们把结果与另外的类似的实现作比较。建议DE出现了竞争,统计上一致;很有希望。

  • 标签: 生物信息学 微分进化 格栅模型 计算机
  • 简介:蛋白质合拢问题是生物信息学的最突出的问题之一。在这篇论文,我们与单体的二种学习一个三维的关闭,关,断开,截止格子蛋白质AB模型,恐水病;吸水,;介绍一个启发式的伪物理的算法。由精心地在物理世界上模仿光滑的有弹性的球的运动,算法为给定的单体链发现低精力的配置。一个随后的“关闭,关,断开,截止陷井”策略被建议被触发一为一种粘住的状况的jump以便从本地最小出来。方法在关闭,关,断开,截止格子AB模型被测试了。计算结果显示出有希望的性能。为有13~55单体的所有序列,算法比以前建议的通常认为的接地状态与更低的精力发现状态。而且为有21的序列,34;55单体,新通常认为的接地状态被发现,它与在现在的文学给的那些不同。

  • 标签: 准物理算法 断格模型 跳坑策略 蛋白质
  • 简介:2010年11月16日,应用交付网络技术领导厂商BlueCoat系统公司在北京日前宣布,BlueCoatPacketShaper设备可以对网络应用和内容进行即时反应,这就使得企业能够以最小的IT投入领先于迅猛发展的Web。借助业界首个URL分类功能,PacketShaper设备无需更新或设置新策略,即叮提供能够即时管理最新网络应用和内容的智能控制。

  • 标签: WEB应用 智能控制 分类功能 URL 设备 网络技术