简介:高通量测序技术速度快、成本低、通量高,广泛应用于miRNA领域研究。本研究基于高通量测序技术所产生的海量小RNA数据,结合已有的数据分析软件,开发了一套快速高效一键化的miRNA分析流程。该流程整合多个生物信息学数据分析软件,对多个miRNA高通量测序数据集进行标记、整合和去冗余分析,只需运行一次核心程序就可以实现对多个miRNA高通量测序数据的分析,避免每个样本单独数据分析的技术重复,精简后的数据集能大幅度减少软件计算量,显著提高软件运行效率。本研究利用快速高效miRNA分析流程分析黄颡鱼性腺XX卵巢、XY精巢、YY精巢的miRNA高通量测序数据,获得一批准确的黄颡鱼保守miRNA。在相同参数设置下,miRNA分析流程可以显著节约分析时间。该流程最终输出结果为多样本整合后的miRNA表达数据,便于研究者直接进行样本之间的比较和miRNA的表达差异,减少研究者手动整合分析结果的操作步骤。miRNA分析流程针对多样本miRNA测序数据具有明显的优势,样本越多测序量越大,软件运行效率越高。针对日益积累的海量小RNA测序数据,miRNA分析流程高效快速一键化数据处理优势将会越来越明显。
简介:月季花是园林绿化中非常重要的观赏花卉,品种和类型均十分丰富,然而受地域环境的影响,北京的寒冬限制了很多品种的应用。为了筛选出更多能够适应北京气候特点可在城市园林应用的新型月季品种。在引种观察的基础上,通过电导率的测定和Logistic方程拟合半致死温度对其中5个优良月季品种的耐寒性进行了进一步的测定与评价。结果发现:杂交玫瑰品种‘HuzelLeRougetel’的耐寒能力与对照品种IR,xanthina黄刺玫接近,是被试品种中耐寒能力最好的品种,其次地被类型的‘Grouse’耐寒能力也较强。灌丛型品种‘PalmengarienlFranfurts’再次之,古老品种‘BIoomfield’的耐寒性最差。除古老月季品种外其他的3个月季品种在北京园林中均能够安全越冬,其中应用前景最好的品种为‘HuzelLeRougetet’。