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  • 简介:肌肉生长和品质是目前猪肉分子遗传基础研究两个重要内容,通过候选基因法和基因组扫描法已鉴定出多个影响猪肉生长和品质功能基因及若干QTLs,但是这些研究在一定程度上均表现出某些不足。表达谱基因芯片是基因芯片一种,它具有大规模、高通量、缩微和平行处理等优点,为猪肉基因组学研究提供了一项强有力工具。本文将对表达谱基因芯片原理、分类、技术流程、优点和在猪肉基因组研究中应用以及存在问题作一综述并时其应用前景进行展望。

  • 标签: 基因芯片 表达谱 猪肉基因组 应用
  • 简介:在总结中国古典园林意境表达方式基础上,以探寻中国现代园林中中国古典意境表达方式为目的,对国内3个具有代表性现代作品进行分析,从整体布局、空间形式、园林要素、尺度引入、色质抽取5个方面总结中国古典园林意境在现代园林作品中表现手法,给予现代园林在继承和发展中国古典园林意境问题上以一定启示。

  • 标签: 园林意境 表达方式 中国古典园林 中国现代园林
  • 简介:稻瘟病菌基因组测序完成有助于全新效应蛋白挖掘和功能鉴定,而未知功能蛋白生物信息学预测为这些蛋白生物学功能鉴定提供了重要理论参考。本研究利用生物信息学分析对蛋白理化性质分析及其二级结构等进行预测,并构建这四个基因与绿色荧光蛋白(GFP)融合表达载体。从稻瘟病数据库中下载MoS4、MoS74、MoS997、MoS1460基因序列,通过分析得到MoS4、MoS74、MoS997和MoS1460基因ORF分别为281bp、251bp、267bp和240bp;预测MoS997蛋白属于稳定性较好亲水蛋白,MoS4、MoS74属于不稳定疏水蛋白,且MoS74还是一个跨膜蛋白,而MoS1460蛋白则属于不稳定亲水性蛋白,并且获得了四个基因与绿色荧光蛋白(GFP)融合表达载体,并经过测序验证。研究结果为进一步探究稻瘟病菌效应蛋白基因功能及亚细胞定位等提供科学依据。

  • 标签: 稻瘟病 效应蛋白 过表达载体
  • 简介:为探索草莓果实中短链脱氢酶还原酶基因FaSDR在草莓果实发育中作用,以‘北农香’不同发育时期果实为试验材料,从克隆、生物信息学及表达分析草莓果实FaSDR特性。结果表明,FaSDR基因含有804bp开放阅读框,编码267个氨基酸多肽,含有典型脱氢酶保守功能结构域。半定量RT-PCR分析证实,在草莓果实发育过程中,FaSDR基因表达量随着果实着色快速升高,揭示该基因可能参与草莓果实成熟调控。

  • 标签: 草莓果实 短链脱氢酶还原酶SDR 基因克隆 表达分析
  • 简介:SUPL(SUPERMAN-like)是一类单C2H2型锌指蛋白,SUPL基因在植物生长发育过程中起着重要调控作用。利用生物信息学分析方法,我们从水稻中找到了一个SUPL基因ZOS11-11,它位于水稻第11号染色体上,编码245个氨基酸。序列分析结果表明,ZOS11-11具有与其它SUPL蛋白相同功能结构域,包括N端高度保守"QALGGH"序列、核定位信号序列以及C端具有转录调节功能EAR结构域。定量PCR与GUS表达分析表明,ZOS11-11几乎在水稻所有的组织、器官中都有表达,其中在根、茎、叶和雌雄蕊分化阶段幼穗中表达较强,而在其它发育阶段穗中表达相对较弱,表明ZOS11-11可能参与了水稻生长发育调控。但是,增加ZOS11-11表达量并没有明显影响水稻生长发育。这些结果为ZOS11-11基因功能深入研究奠定了基础。

  • 标签: 水稻(Oryza SativaL.) ZOS11-11 锌指基因 表达 功能
  • 简介:利用生物信息学手段,结合公共大豆基因组数据库和大豆发育表达芯片数据获得大豆GST家族基因序列、蛋白序列和染色体位置等信息并进一步对基因组织表达等进行分析。结果显示大豆中含94个GST家族基因,根据系统发育分析将这些GST基因分成5个亚家族;定位分析表明,94个GST基因分布于大豆16条染色体上。表达分析结果表明,14个不同发育阶段,大多成员至少在一个组织中表达,11差异表达基因中有7在根中表达,另外4在其它部位优势表达,基因表达具有一定特异性。本研究为进一步研究GST家族功能及其抗逆利用提供基础。

  • 标签: GST家族 全基因组筛选 分类分析 差异表达基因
  • 简介:植株高度控制是菊花商品性生产中一个主要考虑因子。我们通过生物技术途径致力于这一问题。菊花"Iridon"植株通过遗传工程异位表达受CaMV35S启动子控制烟草(NicotianatabacumL.)光敏色素B1基因。与野生型(WT)相比,转基因植株较矮,分枝角度较大。由烟草光敏色素B1基因异位表达引起生长下降与采用推荐用量商品化生长调节剂所引起结果相似。在转基因植株叶片上观察到另一个形态效应是与较高叶绿素含量相关联深绿色。在采用一个选择性地减少远红光波长过滤器条件下,转基因植株生长非常类似于野生型植株。并且,当植株用赤霉酸(促进生长)或一种赤霉素合成抑制剂(抑制生长)矮壮素处理后,转基因植株和野生型植株平均节间长度差异在绝对值上来说是相同,这表明了PHY-B1转基因表达引起生长下降不直接与赤霉素生物合成有关。此项技术商品性应用可能提供一种使用化学生长调节剂替代方法,从而降低生产成本。

  • 标签: 光敏色素 转基因植株 异位表达 野生型 赤霉素 叶绿素含量
  • 简介:利用对表达序列标签(expressedsequencetag,EST)数据库进行比对和搜索分析,并通过RT-PCR方法从烟草中克隆到一个包含1218bp开放阅读框新基因NtDSK2。NtDSK2编码了具有典型双特异性激酶特征蛋白。此蛋白与花生STY激酶属于双特异性激酶同一个亚家族。基于EST数字化组织表达特征分析推测NtDSK2在烟草组织中广泛表达。运用半定量RT-PCR方法检测了烟草受烟草花叶病毒(tobaccomosaicvirus,TMV)侵染后表达特征。结果表明NtDSK2表达量在TMV处理后随时间稳步上升,并在48h达到最大。推测NtDSK2是参与烟草抗胁迫调控重要激酶基因。

  • 标签: HZNH 烟草花叶病毒 双特异性激酶
  • 简介:面对全球化带来千城一面的结果,回归体现地域文化景观设计是必然趋势,针对地域文化在景观设计中表达问题,也越来越值得我们去探讨。立足惠州西湖景区,从西湖自然景观文化和人文景观文化两方面,探讨了文化在景区中各种表达方式,以景区建筑、碑记、小品、植物等景观元素为载体,如何表达惠州地域文化特色。

  • 标签: 惠州 地域文化 景观 表达
  • 简介:真核生物起始因子(eIF)种类多且复杂,广泛参与真核生物翻译起始进程,并在植物生长发育调控过程中发挥重要功能。本研究前期通过酵母双杂交从水稻cDNA文库筛选到一个可能调控根系生长发育起始因子,CDS全长为828bp,该基因编码水稻eIF3g亚基,命名为OseIF3g1。利用RT-PCR技术进行克隆,将该基因全长CDS通过BamHⅠ和SmaⅠ酶切位点连接至植物表达载体pBI121,经双酶切验证后确认已成功构建转基因过表达载体,为该基因后续遗传转化及相关功能研究提供基础。

  • 标签: 水稻 eIF3g亚基 基因克隆 载体构建
  • 简介:植物通过光合作用将光能转换为化学能,捕光色素结合(LHC)蛋白与色素形成复合体在捕获、传递和转化光能过程中发挥着重要作用,因此研究毛竹(Phyllostachysedulis)LHC基因结构及表达模式对于揭示其在毛竹光合作用中功能具有重要意义。采用生物信息学方法,对毛竹基因组中LHC基因进行了系统分析。结果表明,在毛竹中共有29个LHC基因同源序列,其包含内含子数量为0~5个。序列分析表明,29个LHC基因编码蛋白分别属于光系统Ⅰ和光系统Ⅱ捕光色素结合蛋白家族LHCⅠ和LHCⅡ。LHCⅠ包含5个亚家族(Lhca1-Lhca5),除了Lhca4含有3个成员外其他亚家族只有1个成员;而LHCⅡ包含6个亚族(Lhcb1-Lhcb6),每个亚家族成员不同,其中Lhcb1成员最多为7个。亲疏水性预测表明,不同亚家族成员存在着一定差异。蛋白结构预测发现,29个蛋白均包含导肽和成熟蛋白,具有跨膜结构域,均包含色素结合位点;其中12个蛋白组成以α-螺旋为主,17个蛋白组成以随机卷曲为主。基因表达谱分析表明,大多数LHC基因主要在叶片和花序中表达,笋中略有表达,而根和鞭中几乎检测不到表达。研究结果为进一步研究毛竹LHC基因功能奠定了基础。

  • 标签: 毛竹 LHC基因 结构 表达模式
  • 简介:目前,在铁皮石斛多糖研究主要集中在多糖结构、生物活性等方面,对多糖合成相关基因研究较少,本研究通过对‘红鑫1号’铁皮石斛幼苗期和二年生植株以及‘红鑫6号’铁皮石斛二年生植株叶、茎、根三部位蔗糖合成酶基因进行RT-PCR扩增与测序,发现‘红鑫1号’与‘红鑫6号’铁皮石斛蔗糖合成酶前体mRNA存在拼接差异现象,主要形成三种不同mRNA转录本,其翻译得到蔗糖合成酶,结构功能没有改变;分析序列可变剪切差异;同时对铁皮石斛叶、茎、根嬲表达量进行半定量RT-PCR检测,蔗糖合成酶基因在植株中不同部位表达量不同,其表达模式表现为茎〉叶〉根。本研究为铁皮石斛蔗糖合成酶基因功能研究提供了科学依据。

  • 标签: 铁皮石斛 多糖合成酶 克隆 表达
  • 简介:为了进一步明确苹果茎痘病毒(Applestempittingvirus,ASPV)分子变异及株系分化,制备相应特异性抗血清。本研究以库尔勒地区种植感染ASPV鸭梨(Y)枝条韧皮部为试材,采用RT-PCR技术扩增ASPVCP基因,克隆、测序,获得了鸭梨分离物外壳蛋白(ASVPCP-Y)基因,将该CP基因连接到表达载体PET-28a上,转化到大肠杆菌BL21(DE3),1mmol/LIPTG诱导表达,SDS-PAGE电泳分析。研究结果表明,获得鸭梨ASPVCP基因全长1194bp,推测编码397个氨基酸,与已报道ASPV分离物氨基酸序列同源性为70%左右。进化分析结果显示,ASPVCP基因分离物可聚为三个类群:第一类群寄主为苹果,第二类群寄主为梨(除了NC_003462,苹果),ASPVCP-Y归入第三类群。CP基因在大肠杆菌中诱导表达,其融合蛋白分子量约为42kD。克隆鸭梨ASPVCP基因及构建原核表达载体为制备ASPV重组CP基因多克隆抗体及ASPV分子生物学进一步研究奠定了基础。

  • 标签: 苹果茎痘病毒 外壳蛋白 原核表达
  • 简介:本研究以高抗大白菜芝麻状斑点病品系‘C24’和高感品系‘03B9’为试验材料,利用cDNA-AFLP技术分析其在发病条件(高氮)和不发病或少发病条件(低氮)下基因表达差异,并回收得到与大白菜芝麻状斑点病相关差异表达转录衍生片段(Transcript-derivedfragment,TDF)19条。研究结果表明:12个TDF与NCBI或BrassicaDatabase已有序列同源,功能涉及激素调节、氧化还原酶、细胞结构、蛋白质分解、信号传导等;3个TDF在NCBI或TIGR上有序列同源,但是功能未知;4个TDF未找到同源序列。结合本课题组有关氮素浓度和形态对大白菜芝麻状斑点病影响生理指标的研究结果,可推测大白菜芝麻状斑点病可能是细胞结构受到破坏,细胞膜上细胞信号跨膜转导受阻,ACC、ABA调节,蛋白质降解,PPO引起酚类物质褐变等共同作用所致。

  • 标签: 大白菜 芝麻状斑点病 CDNA-AFLP 基因表达差异
  • 简介:我国畜牧业高效发展一个重要特征是规模化、集约化,随之面临最大问题是应激和疾病,普遍采取对策是添加抗生素或其它药物,因此在饲料中添加抗生素等药物添加剂以达到防病保健和促生长作用已成为动物营养与饲料界普遍举措,但长期、高剂量使用甚至滥用和乱用抗生素和药物将导致动物肠道菌群平衡破坏、动物体内药物残留和耐药性菌株产生,给动物健康带来极其不利影响,更为严重是对消费者健康带来严重威胁。由此引起了人们对食品安全问题极大关注。

  • 标签: 动物健康 非特异性免疫因子 表达调控 抗菌肽 药物添加剂 食品安全问题
  • 简介:根据黄瓜基因组数据库中CsaO20719基因编码区全序列设计引物,通过RT—PCR扩增方法从黄瓜品种津研四号叶片中克隆得到寡肽转运蛋白基因(oligopeptidetransportergene,OPT)。基因编码区全长为2013bp。该基因编码蛋白由20种氨基酸组成,含有670个氨基酸残基,分子量和理论等电点分别为73kD和8.65。预测由该基因转录寡肽转运蛋白为疏水蛋白,有14个连续疏水片断。预测该蛋白不存在信号肽,为非分泌蛋白,存在OPT家族保守结构域,亚细胞定位在细胞膜上,主要功能为参与转运和底物结合。同源性和进化树预测分析显示,OPT蛋白与毛果杨和蓖麻寡肽转运蛋白同源性分别达到了81%和79%,所转运底物除有寡肽外,还包含有金属离子-烟草胺螯合物等。qRT—PCR分析同一氮浓度处理OPT基因在不同部位表达结果显示,在无氮及低氮条件下,OPT基因在茎中表达量最高,其次为叶和茎尖。在高氮条件下,OPT主要在茎尖和叶中表达量较高,其次为茎,说明OPT基因在氮胁迫下存在于植物各个部位,并主要集中在生长旺盛部位,为黄瓜生长提供所需能量。不同氮浓度下OPT在茎中表达分析结果显示,OPT基因在无氮及低氮下表达量增加,明显高于正常水平,并且随着氮浓度降低,OPT表达量增加,说明黄瓜OPT基因参与低氮胁迫应答反应,增强黄瓜耐低氮能力。

  • 标签: 黄瓜 寡肽转运蛋白基因(OPT) 克隆 低氮 生物信息学分析
  • 简介:查尔酮合成酶(chalconesynthas,CHS)是黄酮类次生代谢物生物合成途径中一个关键酶。为了解CHS与花青素含量相关性,本研究根据转录组数据,利用RT—PCR技术在甘薯中克隆了一个CHS基因(IbCHS1),并对其表达特征进行了分析。结果表明:IbCHS1基因cDNA长1556bp,包含1个1167bp开放阅读框,编码388个氨基酸。IbCHS1蛋白具有典型植物CHS结构特征,和其他植物中类似蛋白具有很高同源性。表达分析显示,IbCHS1主要在紫肉甘薯中表达,其表达水平与不同品种甘薯中花青素含量正相关。

  • 标签: 甘薯 查尔酮合成酶 花青素 基因表达
  • 简介:根据转录组数据库,通过同源克隆获得结缕草ZjSPL4基因,开放阅读框为1002bp,编码333个氨基酸,该基因具有SBP基因家族保守域。ZjSPL4编码蛋白分子量为36.38163kD,理论等电点(pI)为8.79,总平均亲水性为-0.707,属于亲水性蛋白。二级结构预测结果显示ZjSPL4蛋白主要由无规则卷曲(Cc)、α螺旋(Hh)构成。ZjSPL4蛋白与其他植物SBP蛋白总体相似度为53.71%,通过系统进化树分析发现ZjSPL4与谷子和二穗短柄草中SPL基因亲缘关系较近。ZjSPL4蛋白亚细胞定位结果显示,其编码蛋白定位于细胞核中。同时日本结缕草ZjSPL4基因受到GA、ABA、蔗糖、低温诱导,说明该基因可能参与结缕草花芽分化以及抗逆反应等过程。因此,克隆分析结缕草ZjSPL4基因可为结缕草花芽分化与抗性机制研究以及分子育种提供一定参考。

  • 标签: 日本结缕草 ZjSPL4基因 克隆 亚细胞定位 表达分析
  • 简介:用限制性内切酶XbaⅠ和SacⅠ从克隆载体pUCm-ACO上切下约1.2kb香蕉ACO基因,将其定向连接在经相同酶切质粒载体pBI-121上,构建成植物表达载体pBI-aACO。在此基础上用EcoRⅠ和HindⅢ从在pBI-aACO上切下大小约2.3kb目的基因35Sp-aACO-NOSt,将其连接在质粒载体pCAMBI-A2301载体上,构建成香蕉ACO反义基因植物表达载体pCB-aACO。采用直接转化法将pCB-aACO导入根癌农杆菌菌株EHA105,采用该菌株转化普通烟草。在Kanamycin选择压力下获得烟草转化不定芽和完整植株,经过GUS组织化学法检测、以及PCR和RT-PCR方法鉴定,验证了该植物表达载体报告基因,选择基因和目的基因都得到了表达,证明该植物表达载体构建成功。此项研究为下一阶段用该反义基因转化香蕉品种以改良香蕉果实耐贮运性打下基础。

  • 标签: 香蕉 ACO 植物表达载体 遗传转化
  • 简介:【目的】克隆黄牛、牦牛和犏牛Sycp2基因序列,了解牛Sycp2基因序列特征和组织表达特征,分析睾丸组织中Sycp2基因表达水平。【方法】采用电子克隆和克隆测序技术获得黄牛、牦牛和犏牛Sycp2基因序列,利用生物信息学方法分析其序列特征;采用RT—PCR分析牛Sycp2基因组织表达特征:

  • 标签: 基因序列 电子克隆 睾丸组织 黄牛 mRNA 犏牛