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  • 简介:为研究距瓣尾囊草种质资源遗传背景和系统进化提供理论依据和技术支持,本研究利用L16(45)正交设计,研究Mg2+等5个因素对PCR扩增结果影响。研究结果表明,距瓣尾囊草SCoT-PCR最优反应体系(20μL),Mg2+、dNTPs、TaqDNA聚合酶、引物以及模板DNA等5个因素最优浓度分别是2.188mmol/L、0.113mmol/L、1.0U、0.625μmol/L和30ng。在此基础之上,从18条引物初步筛选出12条扩增结果稳定、条带清晰SCoT引物。建立了距瓣尾囊草SCoT-PCR反应体系,经过18条引物和13份种质资源验证,证明体系稳定性好、可靠高,能满足距瓣尾囊草分子水平上研究。

  • 标签: 距瓣尾囊草 SCoT标记 正交设计 遗传背景
  • 简介:紫外线B(UV-B)对于植物生长发育具有重要调节作用,其中UVRESISTANCELOCUS8蛋白作为UV-B光受体植物响应UV-B过程起关键作用。草莓是一种重要经济果树,目前关于草莓UV-B光受体报道较少。为研究草莓UV-B受体蛋白,本研究采用同源克隆方法获得‘丰香’草莓编码UV-B光受体蛋白cDNA序列,进行了生物信息分析并构建了原核生物表达载体pET32a-UVR8,利用中心点响应面法优化了重组蛋白诱导条件(包括诱导温度,IPTG浓度,菌液浓度和诱导时间)。结果表明:克隆得到了编码草莓UVR8蛋白全长cDNA序列,命名为FaUVR8,生物信息学分析表明该序列长1317bp,编码438个氨基酸,预测分子量为47.28kD,等电点pI为5.85,重建蛋白质三维结构表明该蛋白包含7个β-片状螺旋结构;原核表达得到69.7kD融合蛋白,对四个诱导条件优化表明将工程菌培养至菌液OD600=0.7,加入浓度为0.55mmol/LIPTG,27.72℃下诱导9h,可获得最大量重组蛋白79μg/mL。研究结果可为后期寻找与FaUVR8蛋白互作下游蛋白,以及进一步开展其功能研究提供参考。

  • 标签: 草莓 FaUVR8 生物信息学 原核表达
  • 简介:通过增加外源CaCl2和钙离子螯合剂EGTA处理后,研究香蕉幼苗60mmol/LNaCl人工模拟盐胁迫0、4h、8h、12h、24h和48h不同时间下,测定其叶片和根CaM和Ca^2+-ATPase基因相对表达量。结果表明,NaCl胁迫过程,香蕉幼苗正常生长条件下,其根和叶片CaM基因和Ca^2+-ATPase基因均有表达。巴西蕉幼苗根盐胁迫过程CaM基因没有发生显著变化,但是粉蕉根却发生了显著变化,这可能与粉蕉耐盐高于巴西有关。随着盐胁迫时间延长,巴西蕉和粉蕉幼苗根Ca^2+-ATPase基因相对表达量呈现先上升后下降趋势。

  • 标签: 香蕉幼苗 盐胁迫 CaM基因 Ca2+-ATPase基因 荧光定量
  • 简介:对青薯9号、大西洋、小白花和E1074种基因型马铃薯茎尖进行玻璃化法超低温保存,并运用甲基化敏感扩增多态(MSAP)技术分析4种材料超低温保存前后DNA甲基化变异情况。结果表明:经玻璃化法超低温保存,四个品种成活率分别为86.93%,/o、78.03%、71.57%和65.82%。成活率和再生率因基因型而异,且不同基因型之间差异显著。用MSAP技术分析超低温保存前后植株甲基化结果显示:用16对引物组合对4个品种进行扩增,平均扩增出493条带;与对照相比,4个品种基因CCGG序列中有8.4%~14.3%DNA发生甲基化变化。经超低温保存后,去甲基化和甲基化都有发生,并以去甲基化变化为主要趋势。本文运用MSAP技术对马铃薯超低温保存前后植株进行胞嘧啶甲基化分析表明,使用MSAP检测超低温保存后再生植株DNA甲基化遗传变异非常有效。

  • 标签: 马铃薯 玻璃化法 超低温保存 DNA甲基化 甲基化敏感扩增多态性 遗传变异
  • 简介:艾纳香(Blumeabalsamifera)作为贵州道地药材,其次生代谢产物,如类黄酮、艾纳香素等具有重要药理作用。葡萄糖基转移酶(UFGT)是艾纳香类黄酮代谢途径一个关键酶。本研究通过对艾纳香转录进行测序,借助引物PCR成功克隆得到其葡萄糖基转移酶基因cDNA序列,并对其进行了相应生物信息学分析。分析发现,艾纳香UFGT基因cDNA全长1527bp,共编码508个氨基酸,所编码蛋白分子量为56.155kD,等电点为5.30,属于疏水性蛋白,可能定位于微体。此外,艾纳香UFGT蛋白二级结构0l螺旋占33.07%,延伸链占10.83%,无规则卷曲56.10%,与三级结构预测结果一致。本研究对于探究黔产艾纳香类黄酮物质生物合成分子机制有一定指导意义,并为将来类黄酮生物合成提供帮助。

  • 标签: 艾纳香 UFGT 基因克隆 生物信息学
  • 简介:以小白菜为试验材料,水培条件下,研究叶面喷施不同浓度黄腐酸(0.08%,0.15%,0.25%)对硝酸盐胁迫下(120mmol/L)小白菜活性氧代谢及相关基因表达影响。结果表明,硝酸盐胁迫可引起小白菜叶片中MDA、O2^-和H2O2含量增加,生长受到抑制;硝酸盐胁迫下施用黄腐酸(fulvicacid,FA)能显著促进小白菜生长发育,提高膜稳定指数和抗氧化酶活性,增加脯氨酸和可溶性糖等渗透调节物质含量,减少O2^-和H2O2积累,其中以处理Ⅳ(0.15%FA)处理效果最好;随黄腐酸浓度增加,活性氧代谢相关基因Cu/Zn-SOD和POD表达水平呈先升后降趋势,CAT基因表达水平持续增加,APX基因表达水平则表现为先降后升随后下降趋势,其中Cu/Zn-SOD、POD和APX基因表达水平均在处理Ⅳ(0.15%FA)时达到顶峰,CAT基因表达水平处理Ⅴ(0.25%FA)时最高。适宜浓度黄腐酸可有效缓解硝酸盐胁迫对小白菜所造成伤害,增强其抗盐。本研究通过喷施外源黄腐酸,研究其对硝酸盐胁迫下小白菜生长、活性氧、渗透调节物、抗氧化酶活性及相关基因表达影响,为探讨黄腐酸调控蔬菜盐害提供理论依据。

  • 标签: 黄腐酸 硝酸盐胁迫 小白菜 活性氧 基因表达
  • 简介:糖基转移酶(GTs)是花色苷合成过程中最重要修饰酶之一,其花色苷合成过程中发挥重要作用。本研究以日本蛇根草为材料,依据其转录测序结果,设计引物通过RT-PCR方法成功克隆得到OjGT1基因完整cDNA序列,随后对OjGT1功能结构域、生理和化学参数、亲/疏水性、信号肽,二级结构等进行生物信息学分析。分析结果显示,OjGT1基因完整CDS长度为1413bp,翻译形成蛋白分子量为52.087kD,等电点为5.12,编码形成亲水性蛋白质,不含信号肽。同时二级结构与三级结构分析显示,OjGT1蛋白结构主要以不规则卷曲为主,其次是α螺旋,延伸链所占比重最小。OjGT1基因成功克隆与生物信息学分析,将为后续研究茜草目其它植物糖基转移酶提供参考,同时也为日本蛇根草花色苷生物合成研究提供科学依据。

  • 标签: 日本蛇根草 OjGT1 基因克隆 生物信息学分析
  • 简介:启动子是调控外源基因在植物体内表达“开关”。随着植物转基因技术广泛应用,无论是基础研究还是应用研究,人们希望能够充分利用启动子来准确控制外源基因在植物体内表达,使目的基因“开”和“关”、表达“多”和“少”、“何地”和“何时”表达等。能够听从人指挥,以实现植物育种分子设计。因此,快速分离和鉴定植物体内各种特异启动子已经成为植物基因工程研究热点和难点。本文互补末端连接反向PCR(CELI—PCR)技术基础上建立起…种快速分离目的基因全长cDNA和启动子序列新方法。该方法利用CELI—PCR进行染色体连续步移,获取足够长目的基因及其上游基因DNA序列,再根据转录起始位点是目的基因转录本和启动子分界点,其下游转录本外显于可通过RT-PCR扩增,而上游启动子序列则不能被RT-PCR扩增这一特点,借助RT-PCR进行cDNA连续步移,直到获得全长cDNA,确定启动子基因5’非翻译区位置,进而精确定位转录起始位点。从而获取目的基因准确启动子序列和全长cDNA序列。因此,建立CELI,PCR基础上RITIS技术,可绕过繁琐构建cDNA库和5'-RACE等方法快速分离目的基因全长cDNA和启动子序列。

  • 标签: 启动子 全长CDNA 转录起始位点
  • 简介:不饱和脂肪酸衍生物植物胁迫应答中发挥着重要生理功能,其介导途径中转录因子结合相应顺式作用元件,特异性调控防御相关基因表达,增强植物对环境胁迫抗性。本综述概述了逆境胁迫下植物不饱和脂肪酸衍生物合成代谢途径和介导防卫信号途径,总结了信号转导相关转录因子分类、结构及功能研究进展,旨在为植物不饱和脂肪酸衍生物介导途径调控网络分子育种方面的利用提供参考,以期通过转录因子遗传修饰改良植物抗逆性。

  • 标签: 植物 不饱和脂肪酸衍生物 抗逆 信号通路 转录因子
  • 简介:细菌脂多糖由O-抗原,核心多糖和脂质A三部分组成,脂质A是细菌内毒素活性根源。植物脂多糖与细菌脂多糖组成基本相似,但不具有微生物脂多糖高毒性。目前,对植物脂多糖合成机制缺乏最基本认识,因此研究植物脂多糖合成具有重要科学价值。作者水稻基因中发现一个含有大肠杆菌EcLpxA功能结构域基因,命名为OsLpxA,该基因催化水稻脂质A合成第一步反应。本研究用水稻(Oryzasativasubsp.Japonica)苗期叶片为材料,提取总RNA并以此为模板,用反转录PCR扩增OsLpxA基因siRNA靶序列,并将其连接到表达载体pTCK303上,构建了RNA干扰载体pTCK303-OsLpxA-RNAi。将该载体通过农杆菌介导法转化水稻,共获得59株具有潮霉素抗性转化苗。然后利用潮霉素特异性引物对全部抗性苗进行PCR检测,其中有38株转化苗呈阳性,表明潮霉素标记基因已整合到了水稻基因。最后,利用定量PCR检测38株阳性苗OsLpxA基因在转录水平表达变化。结果表明,其中27株阳性苗中导入OsLpxA基因RNA干扰结构成功地降低了目的基因表达。该结果为后续对OsLpxA基因功能研究提供参考。

  • 标签: 水稻 UDP-N-乙酰葡萄糖胺酰基转移酶基因 RNA干扰 脂质A