简介：单个核苷酸多型性(SNP)是决定任何二个无关的个人之间的差别的基因变化。各种各样的人口组能用SNP与对方被区分开来。例如，HapMap数据集与大约1000万SNP有四个人口组。为人的进化，种族变化，和人口赋值上的更多的卓见，我们建议发现哪个SNP在决定人口组是重要的然后作为输入特征用这些相关SNP分类不同人口。在这研究，我们开发了评价措施的修改t测试并且把它用于HapMap遗传型数据。第一，我们为赋值包括F统计和增进知识的海角与另外的特征重要性措施比较评价所有SNP。第二，我们作为输入选择最高度评价的SNP的不同数字到一个分类器，例如支持向量机器，以便发现最好的特征相应于最好的分类精确性的子集。试验性的结果证明建议方法在发现在决定人口组是重要的SNP是很有效的，与减少的计算负担和更好的分类精确性。

简介：InordertodevelopclinicaldiagnostictoolsforrapiddetectionofSARS-CoV(severeacuterespiratorysyndrome-associatedcoronavirus)andtoidentifycandidateproteinsforvaccinedevelopment,theC-terminalportionofthenucleocapsid(NC)genewasamplifiedusingRT-PCRfromtheSARS-CoVgenome,clonedintoayeastexpressionvector(pEGH),andexpressedasaglutathioneS-transferase(GST)andHisx6double-taggedfusionproteinunderthecontrolofaninduciblepromoter.WesternanalysisonthepurifiedproteinconfirmedtheexpressionandpurificationoftheNCfusionproteinsfromyeast.Todetermineitsantigenicity,thefusionproteinwaschallengedwithserumsamplesfromSARSpatientsandnormalcontrols.TheNCfusionproteindemonstratedhighantigenicitywithhighspecificity,andtherefore,itshouldhavegreatpotentialindesigningclinicaldiagnostictoolsandprovideusefulinformationforvaccinedevelopment.

简介：我们分析了表示的基因(transcriptomes)和翻译的蛋白质(专业版--teomes)在肌肉纸巾和激活的CD4+和五种类型的CD8+T淋巴细胞(T房间)，2糖尿病(T2DM)用Affymetrix微数组和集体spectrometry使遭到，并且把他们与匹配的非糖尿病的控制作比较。胰岛素受体(INSR)的基因表达，维生素D受体，胰岛素降级酶，Akt，胰岛素受体substrate-1(IRS-1)，IRS-2，葡萄糖transporter4(GLUT4)，并且glycolytic小径的酶被减少至少50%在T2DM比在控制。然而，有比在血浆房间glycoprotein-1的规定上面的双重的基因大，肿瘤坏死因素(在T2DM的TNF，和gluconeogenic酶比在控制。为INSR或TNF的基因silencing分别地导致了GLUT4的抑制或刺激。相应于上述翻译transcriptomes的分子的重量的Proteome侧面显示出在T2DM和控制之间的变化的不同模式。同时，在在肌肉和T2DM的激活的T房间之间的transcriptomes和proteomes的变化是可比较的。激活的T房间，类似于肌肉房间，表示胰岛素发信号和葡萄糖新陈代谢基因和基因产品。在结论，在T2DM的T房间和肌肉相对非糖尿病的控制在某些基因和基因产品的表示展出了差别。在transcriptomes的这些改变和在T2DM的proteomes可以涉及胰岛素抵抗。

简介：Leishmaniaisassociatedwithabroadspectrumofdiseases,rangingfromsimplecutaneoustoinvasivevisceralleishmaniasis.Here,thesequencesoftencysteineproteasesoftypesA,BandCofLeishmaniamajorwereobtainedfromGeneDBdatabase.PredictionofMHCclassIepitopesofthesecysteineproteaseswasperformedbyNetCTLprogramversion1.2.Inaddition,byusingBcePredserver,differentstructuralpropertiesoftheproteinswerepredictedtofindouttheirpotentialBcellepitopes.Accordingtothiscomputationalanalysis,nineregionswerepredictedasBcellepitopes.Theresultsprovideusefulinformationfordesigningpeptide-basedvaccines.

简介：在染色体为特定的DNA目标设计锌手指蛋白质主题在染色体工程的领域里是批评的。我们为为绑在特定的目标DNA地点的C2H2锌手指预言识别helices开发了一个计算方法。这预言用锌手指蛋白质和他们的目标DNA三位字节的彻底的数据集基于人工的神经网络。用户们能为也要预言在的二或三根锌手指选择选择一模块化或为输入DNA顺序的synergistic时尚。这个方法将为对为几个生物、生物医学的应用程序设计特定的锌手指抄写因素和锌手指核酸酶感兴趣的研究人员是珍贵的。网工具ZiF预言在http://web.iitd.ac.in/sundar/zifpredict/在网上是可得到的。