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  • 简介:橡胶树起源热带雨林,对低温敏感。中国橡胶树(Heveabrasiliensis)种植受到严重低温胁迫影响,而CBF/DREB1(C-repeatbindingfactor/dehydrationresponsiveelementbindingfactor1)是低温信号通路重要转录因子,但目前橡胶树仅克隆到HbCBF1。本研究橡胶树克隆出两个新CBF家族基因HbCBF2和HbCBF3。经测序,HbCBF2和HbCBF3分别编码了234个和242个氨基酸。氨基酸序列分析表明HbCBF2和HbCBF3均含有CBF家族特有两个短肽序列包括个保守DNA结合结构域和NLS簇。通过构建进化树发现HbCBF2、HbCBF3与HbCBF1以及拟南芥CBF序列同源性很高。将HbCBF2和HbCBF3构建到pGEX4T-1原核表达载体上,Transetta(DE3)中进行表达。SDS-PAGE电泳检测它们蛋白质表达51.8kD和53kD,与预期致。对蛋白诱导条件进行优化,构建融合表达质粒pGEX4T-1-CBF2和pGEX4T-1-CBF3,28℃、IPTG浓度0.4mmol/L情况下表达最佳。实验纯化蛋白和研究HbCBF2和HbCBF3橡胶树功能提供理论帮助

  • 标签: 巴西橡胶树 CBF 原核表达
  • 简介:长链酰基辅酶A合成酶(longchainacyl-CoAsynthetase,LACS)是油脂代谢重要催化酶。本研究采用RT-PCR技术,花生(ArachishypogaeaL.)克隆到LACS1(GenBank登录号:KT932703),分析了该基因结构组成,预测编码氨基酸与其他植物同源性,采用实时Real-TimePCR技术对LACS1组织表达进行研究。结果显示,花生LACS1基因全长2219bp,包含1992bpORF,编码663个氨基酸,有22个外显子和21个内含子。氨基酸序列比对显示花生LACS1有真核生物酰基辅酶A合成酶保守结构域,并含有保守激活位点和绑定位点。同源性分析发现花生LACS1与大豆、野生大豆、鹰嘴豆、绿豆、甜橙等15种物种氨基酸序列同源性68%~86%之间,进化树分析显示,花生LACS1与鹰嘴豆等豆科植物亲缘较近。实时荧光PCR分析表明,花生LACS1花生根、茎、叶、针、仁和花等组织均有表达,但差异明显,其中花表达最高,表达量大小顺序花>针>叶>茎>根>仁,地上组织表达高于地下组织。花生LACS1可能参与花生角质层脂质合成。本研究结果揭示植物脂肪酸代谢提供理论依据。

  • 标签: 花生 长链酰基辅酶A合成酶 组织表达 油脂
  • 简介:为了探讨脲类细胞分裂素PBU和嘌呤类细胞分裂素6-BA对尾叶桉愈伤分化、愈伤组织POD基因表达及酶活性影响,将尾叶桉幼苗胚轴切段接种添加PBU+IAA、6-BA+IAA和PBU+6-BA+IAA三种激素组合SPCa培养基,通过统计愈伤组织分化情况、检测POD基因表达差异和酶活性变化来开展研究。6-BA+IAA组合条件,愈伤组织褐化率高达84.71%;PBU+IAA组合,愈伤组织褐化率30.56%;PBU+6-BA+IAA组合时,褐化率最低,24.09%,胚性愈伤组织时比例最高,达47.73%。与6-BA相比,PBU诱导出愈伤POD酶活性显著升高。通过实时定量PCR(real-timequantitativePCR,qPCR)检测6个POD基因表达变化,设6-BA+IAA诱导所得愈伤相对表达1,PBU+IAA诱导所得愈伤BP1,BP4,BP5表达上调,分别为1.88、1.63、2.01;PBU+6-BA+IAA诱导所得愈伤BP3、BP4、BP6表达上调,分别为1.88、1.96、1.93。从实验结果分析,PBU和6-BA有协同效应,通过增强POD酶活性,减轻褐化、促进胚性愈伤分化。PBU和6-BA对不同POD同工酶表达影响不同。本研究可为深入研究PBU和6-BA协同作用分子机理提供参考。

  • 标签: 尾叶桉 PBU 6-BA POD 基因表达差异
  • 简介:丙二烯氧化合酶(alleneoxidesynthase,AOS)基因是茉莉酸(JA)合成途径个特异性酶,具有调控植物体内JA合成积累重要作用。本研究通过RACE技术克隆得到了‘西伯利亚’百合Lilium‘Siberia’AOS基因,并将其命名为LsAOS。该基因全长1542bp,编码513个氨基酸,其蛋白序列与小果野芭蕉同源性最高,属于不稳定亲水蛋白。通过对‘西伯利亚’百合4个不同花期,9个不同组织器官进行实时荧光定量PCR(q-PCR)后发现,LsAOS花蕾期中表达最高,随着花朵逐渐开放表达逐渐下降;LsAOS叶片中表达水平最高,其次是内瓣、根、茎等。JA参与植物生长发育过程,与植物抗逆性和次生代谢反应有着密不可分联系。AOS基因是JA途径关键基因之,对JA合成有着重要调控作用

  • 标签: '西伯利亚’百合 LsAOS 基因克隆 表达分析
  • 简介:高干率、高胡萝卜素甘薯新品种福薯604是以广薯87母本计划集团杂交选育而来,2016年通过国家甘薯新品种鉴定委员会鉴定,鉴定编号为国品鉴甘薯2016008。通过对福薯604形态特征、生产力、生长动态、品质特性及抗病性等生理特点进行多年多点研究,结果表明:福薯604鲜薯产量和薯干产量分别比对照广薯87分别增产17.15%和21.69%,薯块干物质含量达到30.43%,食味、外观品质优,同时富含多种营养物质,其中胡萝卜素含量达到7.6mg/100g,抗蔓割病和I型薯瘟病,适于中国南方甘薯种植区域种植。

  • 标签: 甘薯 高淀粉 高胡萝卜素 福薯604
  • 简介:研究距瓣尾囊草种质资源遗传背景和系统进化提供理论依据和技术支持,本研究利用L16(45)正交设计,研究Mg2+等5个因素对PCR扩增结果影响。研究结果表明,距瓣尾囊草SCoT-PCR最优反应体系(20μL),Mg2+、dNTPs、TaqDNA聚合酶、引物以及模板DNA等5个因素最优浓度分别是2.188mmol/L、0.113mmol/L、1.0U、0.625μmol/L和30ng。在此基础之上,18条引物初步筛选出12条扩增结果稳定、条带清晰SCoT引物。建立了距瓣尾囊草SCoT-PCR反应体系,经过18条引物和13份种质资源验证,证明体系稳定性好、可靠性高,能满足距瓣尾囊草分子水平上研究。

  • 标签: 距瓣尾囊草 SCoT标记 正交设计 遗传背景
  • 简介:紫外线B(UV-B)对于植物生长发育具有重要调节作用,其中UVRESISTANCELOCUS8蛋白作为UV-B光受体植物响应UV-B过程起关键作用。草莓是种重要经济果树,目前关于草莓UV-B光受体报道较少。研究草莓UV-B受体蛋白,本研究采用同源克隆方法获得‘丰香’草莓编码UV-B光受体蛋白cDNA序列,进行了生物信息学分析并构建了原核生物表达载体pET32a-UVR8,利用中心点响应面法优化了重组蛋白诱导条件(包括诱导温度,IPTG浓度,菌液浓度和诱导时间)。结果表明:克隆得到了编码草莓UVR8蛋白全长cDNA序列,命名为FaUVR8,生物信息学分析表明该序列长1317bp,编码438个氨基酸,预测分子47.28kD,等电点pI5.85,重建蛋白质三维结构表明该蛋白包含7个β-片状螺旋结构;原核表达得到69.7kD融合蛋白,对四个诱导条件优化表明将工程菌培养至菌液OD600=0.7,加入浓度0.55mmol/LIPTG,27.72℃诱导9h,可获得最大量重组蛋白79μg/mL。研究结果可为后期寻找与FaUVR8蛋白互作下游蛋白,以及进开展其功能研究提供参考。

  • 标签: 草莓 FaUVR8 生物信息学 原核表达
  • 简介:对青薯9号、大西洋、小白花和E1074种基因型马铃薯茎尖进行玻璃化法超低温保存,并运用甲基化敏感扩增多态性(MSAP)技术分析4种材料超低温保存前后DNA甲基化变异情况。结果表明:经玻璃化法超低温保存,四个品种成活率分别为86.93%,/o、78.03%、71.57%和65.82%。成活率和再生率因基因型而异,且不同基因型之间差异显著。用MSAP技术分析超低温保存前后植株甲基化结果显示:用16对引物组合对4个品种进行扩增,平均扩增出493条带;与对照相比,4个品种基因组CCGG序列中有8.4%~14.3%DNA发生甲基化变化。经超低温保存后,去甲基化和甲基化都有发生,并以去甲基化变化为主要趋势。本文运用MSAP技术对马铃薯超低温保存前后植株进行胞嘧啶甲基化分析表明,使用MSAP检测超低温保存后再生植株DNA甲基化遗传变异非常有效

  • 标签: 马铃薯 玻璃化法 超低温保存 DNA甲基化 甲基化敏感扩增多态性 遗传变异
  • 简介:艾纳香(Blumeabalsamifera)作为贵州道地药材,其次生代谢产物,如类黄酮、艾纳香素等具有重要药理作用。葡萄糖基转移酶(UFGT)是艾纳香类黄酮代谢途径个关键酶。本研究通过对艾纳香转录组进行测序,借助引物PCR成功克隆得到其葡萄糖基转移酶基因cDNA序列,并对其进行了相应生物信息学分析。分析发现,艾纳香UFGT基因cDNA全长1527bp,共编码508个氨基酸,所编码蛋白分子56.155kD,等电点5.30,属于疏水性蛋白,可能定位于微体。此外,艾纳香UFGT蛋白二级结构0l螺旋占33.07%,延伸链占10.83%,无规则卷曲56.10%,与三级结构预测结果致。本研究对于探究黔产艾纳香类黄酮物质生物合成分子机制有指导意义,并为将来类黄酮生物合成提供帮助

  • 标签: 艾纳香 UFGT 基因克隆 生物信息学
  • 简介:为了明确苹果三倍体杂种后代基因组DNA甲基化水平及模式变化特征,本文‘金冠’ב四倍体嘎拉’苹果6l份三倍体后代为试验材料,采用MSAP分子标记技术对其进行了分析。结果表明:(1)61份三倍体杂种后代总甲基化率10.74%~28.86%之间,全甲基化率7.87%~24.22%之间,半甲基化率2.10%~11.84%之间。与母本相比,总甲基化和全甲基化呈上升趋势,半甲基化呈下降趋势;与父本相比,均呈下降趋势。(2)苹果三倍体杂种基因组加倍和重组过程,发生了大量过或超甲基化和去甲基化变异,少量发生了次甲基化现象,极少部分甲基化状态介于双亲之间。(3)共获得4条DNA甲基化差异片段,有3条能够苹果基因组检测到,且同源性较高,分别位于第1条和第12条染色体叠连群上,但是具体功能没有描述。研究结果表明,苹果三倍体杂种后代DNA甲基化水平与倍性相关性不大,在其形成过程发生了大量过或超甲基化变异,苹果三倍体育种中表观遗传变异研究提供了依据。

  • 标签: 苹果 三倍体杂种 DNA甲基化
  • 简介:水稻育性恢复基因Rf-1是目前水稻上克隆恢复基因。通过位于Rf-1位点两个特异性CAPS(cleavableamplifiedpolymorphicsequences)标记对滇I型、野败型、红莲型及BT型恢复系基因型分析,发现这四种不同胞质恢复系Rf-1位点具有相同带型,滇I型两个保持系具有不同带型。结果表明这四种不同胞质系统恢复系均具有Rf-1基因。该结论与恢复系选育系谱分析结果相

  • 标签: 水稻 育性恢复基因 细胞质雄性不育系 Rf-1位点 CAPS标记
  • 简介:糖基转移酶(GTs)是花色苷合成过程最重要修饰酶之,其花色苷合成过程发挥重要作用。本研究日本蛇根草材料,依据其转录组测序结果,设计引物通过RT-PCR方法成功克隆得到OjGT1基因完整cDNA序列,随后对OjGT1功能结构域、生理和化学参数、亲/疏水性、信号肽,二级结构等进行生物信息学分析。分析结果显示,OjGT1基因完整CDS长度1413bp,翻译形成蛋白分子52.087kD,等电点5.12,编码形成亲水性蛋白质,不含信号肽。同时二级结构与三级结构分析显示,OjGT1蛋白结构主要以不规则卷曲为主,其次是α螺旋,延伸链所占比重最小。OjGT1基因成功克隆与生物信息学分析,将为后续研究茜草目其它植物糖基转移酶提供参考,同时日本蛇根草花色苷生物合成研究提供科学依据。

  • 标签: 日本蛇根草 OjGT1 基因克隆 生物信息学分析
  • 简介:启动子是调控外源基因在植物体内表达“开关”。随着植物转基因技术广泛应用,无论是基础研究还是应用研究,人们希望能够充分利用启动子来准确控制外源基因在植物体内表达,使目的基因“开”和“关”、表达“多”和“少”、“何地”和“何时”表达等。能够听从人指挥,实现植物育种分子设计。因此,快速分离和鉴定植物体内各种特异启动子已经成为植物基因工程研究热点和难点。本文互补末端连接反向PCR(CELI—PCR)技术基础上建立起…种快速分离目的基因全长cDNA和启动子序列新方法。该方法利用CELI—PCR进行染色体连续步移,获取足够长目的基因及其上游基因组DNA序列,再根据转录起始位点是目的基因转录本和启动子分界点,其下游转录本外显于可通过RT-PCR扩增,而上游启动子序列则不能被RT-PCR扩增这特点,借助RT-PCR进行cDNA连续步移,直到获得全长cDNA,确定启动子基因5’非翻译区位置,进而精确定位转录起始位点。从而获取目的基因准确启动子序列和全长cDNA序列。因此,建立CELI,PCR基础RITIS技术,可绕过繁琐构建cDNA库和5'-RACE等方法快速分离目的基因全长cDNA和启动子序列。

  • 标签: 启动子 全长CDNA 转录起始位点
  • 简介:细菌脂多糖由O-抗原,核心多糖和脂质A三部分组成,脂质A是细菌内毒素活性根源。植物脂多糖与细菌脂多糖组成基本相似,但不具有微生物脂多糖高毒性。目前,对植物脂多糖合成机制缺乏最基本认识,因此研究植物脂多糖合成具有重要科学价值。作者水稻基因组中发现个含有大肠杆菌EcLpxA功能结构域基因,命名为OsLpxA,该基因催化水稻脂质A合成步反应。本研究用水稻(Oryzasativasubsp.Japonica)苗期叶片材料,提取总RNA并以此为模板,用反转录PCR扩增OsLpxA基因siRNA靶序列,并将其连接到表达载体pTCK303上,构建了RNA干扰载体pTCK303-OsLpxA-RNAi。将该载体通过农杆菌介导法转化水稻,共获得59株具有潮霉素抗性转化苗。然后利用潮霉素特异性引物对全部抗性苗进行PCR检测,其中有38株转化苗呈阳性,表明潮霉素标记基因已整合到了水稻基因组。最后,利用定量PCR检测38株阳性苗OsLpxA基因在转录水平表达变化。结果表明,其中27株阳性苗中导入OsLpxA基因RNA干扰结构成功地降低了目的基因表达。该结果后续对OsLpxA基因功能研究提供参考。

  • 标签: 水稻 UDP-N-乙酰葡萄糖胺酰基转移酶基因 RNA干扰 脂质A
  • 简介:本文应用CTAB法37种竹类植物中提取基因组DNA,根据GenBank中发表5SrDNAITS和matK基因设计引物,通过PCR进行扩增。结果表明:37种竹子5SrDNAITS序列PCR产物大小约为450bp,刚竹属内部无长度上差异,但是舒竹(Phyllostachysshuchengensis)与其他刚竹属植物相比,有个位点差异(由A变为C)。因此,5SrDNAITS属下水平上无法提供较大信息,变异性较低,不适于刚竹属属下水平系统分类研究。同样,选取37种竹子3个竹种matK基因PCR扩增产物直接进行测序,结果显示matK基因在竹亚科属间长度上无差异,产物长度约为1500bp,将测序结果进行同源性比对,变异位点附近寻找多态性酶切位点,碱基序列上有个位点差异(BstNⅠ)。PCR-RFLP结果显示,共有3种竹子在此位点发生变异分别为:浙江淡竹(Phyllostachysmeyeri)、安吉金竹(Phyllostachysparvifolia)和黄古竹(phyllostachysangusta)。刚竹属植物基因序列相当保守,片段刚竹属间绝对核苷酸差异不到1个,所提供信息不够充分。因此,叶绿体5SrDNAITS和matK基因序列不适用于刚竹属植物系统分类研究,但其可能适合在属或属以上分类等级竹类植物系统分类应用。

  • 标签: 竹亚科 刚竹属 5S RDNA ITS基因 MATK基因