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40 个结果
  • 简介:Inordertostudythefunctionalstructureofthetranscriptionterminatorsandthemechanismoftermination,asurveyofthechromatinstructure,includingthelocationofDNaseIhypersensitivesitesandthenucleosomearrangement,ofyeastADH1andFLPterminatorswasmade.TheresultsshowthatthereisnorelationshipbetweenthefunctionoftheterminatorsandtheexistenceofDNaseIhypersensitivesites.However,itisfoundthatthereisalwaysanucleosomeattheimmediateupstreamofthetranscrip-tionalterminationsites.Asacontrol,thechromatinstructuresofthepBR322DNAfragmentsontheyeastshuttervectorsarealsoinvestigatedatthesametime.TherandomnucleosomearrangementonthebacterialDNAinyeastagreeswiththepublishedreports.Anewhypothesis,aboutthemechanismoftranscriptionalterminationisputforwardandthereasonofdifferentnucleosomearrangementontheDNAswhichareori-ginallyfromdifferentspeciesinyeastisdiscussed.

  • 标签: Ohromatin terminater nuclecsome pesition yeast.
  • 简介:RNA干涉(RNAinterference,RNAi)现象广泛存在于从真菌到植物、从无脊椎动物到哺乳动物的各种生物中,属于转录后水平的基因沉默(PTGS)。它利用双链RNA(dsRNA)特异性地降解相应序列的mRNA成为siRNA,从而特异性地阻断相应基因的表达,本文重点介绍了RNA干涉的分子机制及技术应用等方面的进展,RNA干涉在后基因组时代的基因功能研究和药物开发中将具有广阔的发展前景。

  • 标签: RNA干涉 基因功能研究 无脊椎动物 基因沉默 后基因组时代 双链RNA
  • 简介:Hybridoma房间在抗体生产率追随者暴露显示增加到张力亢进的条件。然而,内在的机制很好没被理解。在现在的学习,我们假设激活的T房间的原子因素5(NFAT5)/tonicityenhancer绑定蛋白质(TonEBP)工作增加hybridomacells的抗体生产率。NFAT5是osmosensitive哺乳动物的抄写因素。然而,它在没在张力亢进的周围被洗的各种各样的器官的无所不在的表示建议NFAT5可以也在等渗的条件下面调整细胞生长和功能。在这研究,我们由西方的污点分析在hybridoma房间检验了表示ofNFAT5,并且发现它在张力亢进的媒介显著地增加了。为了推进,在hybridoma房间定义NFAT5的功能,RNA干扰技术习惯于down在SGB-8房间(一根hybridoma房间线)调整NFAT5的表示。在等渗的媒介,hybridoma房间的抗体生产率被NFAT5while的down规定减少细胞增殖没被影响。这里介绍的结果表明那NFAT5不仅在hybridoma房间在渗透的压力反应小径起一个重要作用而且为最佳的抗体生产率是必要的。

  • 标签: 杂交瘤细胞 单克隆抗体产率 RNA干扰 NFAT5转录因子 减量调节
  • 简介:RNA(sRNAs)是直接在房间施加他们的功能的非编码的抄本。sRNAs的鉴定由于清楚的顺序和结构的偏爱的缺乏是一项困难的任务。大多数sRNAs在类以内被识别在相关染色体的特定的intergenic区域。然而,几个这些区域仍然保持由于顺序相同或有势力的缺乏未注解统计鉴定工具。一台计算引擎被造了在intergenic区域以内寻找在Enterobacteriaceae染色体识别并且粗略地注解新通常认为的sRNA区域。在相关询问染色体识别类似的sRNA区域作为模板利用试验性地已知的sRNA数据和他们的flankinggenes/KEGGOrthology(击倒)数字。搜索引擎不仅有能力为特定的sRNAs定位通常认为的intergenic区域,而且有力量定位保存,洗牌或删除了在询问染色体的基因簇。因为它使用KO术语定位象sRNAs那样的机能上地重要的区域,更进一步,到另外的基因的击倒数字赋值将增加敏感。PsRNA服务者通过从兴趣的sRNA检索的信息被用于通常认为的sRNA区域的鉴定。计算引擎在http://bioserver1.physics.iisc.ernet.in/psrna/和http://bicmku.in:8081/psrna/在网上是可得到的。

  • 标签: 计算引擎 比较鉴别 小RNA 基因组注释 编码基因 小分子RNA
  • 简介:从动物组织中提取总RNA是现代分子生物学研究中经常使用的重要实验技术,按常规方法获得的总RNA产品中常伴有大分子量染色体DNA污染.为此,我们摸索出了保证RNA制品纯度、质量和产量的DNA酶消化最佳反应条件.利用改良后的方法提取了小鼠脏器组织总RNA,进行了新基因mPC-1在小鼠脏器中表达的组织分布研究.

  • 标签: 动物组织 提取 高纯度总RNA 改进 应用
  • 简介:在一项新的研究中。来自英国利兹大学的研究人员发现一种方法阻止疱疹病毒劫持宿主细胞中该病毒进行复制和导致疾病所需的重要通路。相关研究结果在线发表在NatureMicrobiology期刊上。论文共同通信作者为来自利兹大学阿斯特伯里结构分子生物学中心的AdrianWhitehouse教授和RichardFoster博士。Whitehouse教授说,“我们已花了数年时间证实在所有疱疹病毒中发现的一种蛋白招募宿主细胞中的一种被称作人TREX的蛋白复合体来协助稳定化和运输细胞核外的疱疹病毒RNA,这样它们能够表达为病毒蛋白。”“如今我们鉴定出一种能够破坏这种至关重要的病毒一宿主细胞相互作用的化合物,从而阻止疱疹病毒复制和产生传染性的病毒颗粒。”

  • 标签: 蛋白复合体 疱疹病毒 RNA 运输 NAT 靶标
  • 简介:基因枪和农杆菌介导的遗传转化是目前常用的两种单子叶植物遗传转化方法。载体的发展和改良是提高植物遗传转化效率的重要基础,RNA干扰载体和过表达载体是目前通过遗传转化研究植物基因功能的主要工具。Gateway克隆技术是一种基于lambda噬菌体特异位点重组特性的通用克隆技术,该技术可以将大批目的基因方便、快捷地连接到受体载体上。本文利用Gateway技术结合传统酶切、连接方法,构建了适用于单子叶植物基因枪和农杆菌转化的RNA干扰Gateway载体pAHC.PSK—RNAi、pClean—G185.RNAi和过表达Gateway载体pAHC.PSK—OE和pClean—G185一OE,为利用基因枪和农杆菌介导的遗传转化,在小麦和水稻等单子叶植物中进行规模化基因功能研究奠定了基础。

  • 标签: 单子叶植物 遗传转化 RNA干扰 过表达 GATEWAY
  • 简介:念珠菌是最主要的致病性真菌之一。随着医学分子生物学的发展,有关对念珠菌的致病基因及其表达的研究越来越广泛,进行这些研究的一个关键步骤就是RNA的提取。主要由几丁质组成的真菌的细胞壁厚且坚韧,因此破壁是提取念珠菌RNA的关键。

  • 标签: 白念珠菌 RNA提取 破壁
  • 简介:[目的]蜡蚧轮枝菌是一种防治植物病原物和害虫的生防菌,弄清其致病的分子基础具有重要的意义。[方法]利用IlluminaHiSeq技术测序蜡蚧轮枝菌的cDNA文库,并进行RNA-Seq序列拼接和功能注释。[结果]共获得1634670条高品质reads,碱基GC含量48.50%。14856条Unigene经组装拼接后,在Nr、Swiss-Prot、COG和KEGG数据库中分别比对得到1467、9379、6518和4188条Unigenes。采用GO分类工具将21403条Unigenes分成24个功能组,主要包含在细胞组成(1369)、分子功能(1679)和生物学过程(1928)3个大类里,在COG数据库注释的基础上,把6518条Unigenes分成38个功能组,通过GO和COG丰度识别分类,聚类的主要是一般功能预测、次生代谢产物的合成、运输和分解代谢以及信号转导机制起作用的独立基因。能与KEGG路径匹配的108条Unigenes中大部分和新陈代谢途径及次生代谢产物的合成有关。[结论]这些结果将有助于找寻蜡蚧轮枝菌的致病因子,从而丰富其致病机理。

  • 标签: 蜡蚧轮枝菌 RNA-SEQ 转录组
  • 简介:大麻THCA合成酶基因CsTHCA在调控大麻THC含量方面起着重要的作用。通过RT-PCR方法从大麻中克隆了CsTHCA,该基因开放阅读框全长1638bp,共编码545个氨基酸。通过pSKint中间载体,构建CsTHCARNA干扰植物转化载体并转化大麻茎尖,获得转基因植株,通过分析大麻中THCA合成酶基因的表达并结合薄层色谱法和SPE-HPLC法发现,转基因植株中基因表达量降低且THC含量降低,这表明CsTHCA通过某种机理正调控THC的含量。

  • 标签: 大麻 CsTHCA RNA干扰 遗传转化
  • 简介:目的:检测前列腺癌及癌旁正常前列腺组织中RNA结合蛋白QKI-5的表达情况并分析其临床意义。方法:收集前列腺癌及与之匹配的癌旁组织124例,通过免疫组化染色、Westernblot、实时PCR方法检测其QKI-5的表达水平,并分析QKI-5的表达与前列腺癌临床病理特征的关系。结果:前列腺癌组织中QKI-5蛋白及mRNA表达水平均明显低于癌旁正常前列腺组织,并且随着Gleason评分的增高而降低(P〈0.05)。前列腺癌组织中QKI-5的表达与其Gleason评分(r=-0.939,P〈0.05)、TNM分期(r=-0.913,P〈0.05)、血清PSA值(r=-0.743,P〈0.05)均密切相关。结论:QKI-5在前列腺癌的发生发展过程中可能起抑癌基因的作用,并可能作为前列腺癌的诊断、病情分析和预后评估的参考指标。

  • 标签: RNA结合蛋白QKI-5 前列腺癌 表达 WESTERN BLOT
  • 简介:目的:从航天诱变向日葵种子中提取高质量的总RNA。方法:采用改进的SDS法,提取缓冲液与氯仿同时作用液氮研磨材料后,用酸酚-氯仿抽提一次,经LiCl过夜沉淀、DNaseⅠ处理、1/2体积的无水乙醇沉淀多糖,最后加入1/10体积的醋酸钠和2倍体积的无水乙醇沉淀总RNA,用琼脂糖凝胶电泳与紫外分光光度法测定产量与纯度,用PT-PCR鉴定RNA的质量。结果:提取的RNA电泳条带清晰,D260nm/D230nm、D260nm/D280nm值分别为2.09、2.00,其产量为35.30μg/100mg,用PT-PCR能扩增出肌动蛋白基因片段。结论:采用该方法提取的总RNA纯度高、完整性好,适于进一步的分子生物学研究

  • 标签: RNA提取 向日葵 航天诱变 多酚 多糖
  • 简介:昆虫的embryonic以后开发高度依赖于ecdysteroid荷尔蒙20-hydroxyecdysone。万圣节前夕基因更鬼(spok,cyp307a2)被记录了在果蝇melanogaster和Bombyxmori涉及ecdysteroidogenesis。我们这里描述克隆和万圣节前夕基因的描述更鬼(Lsspok,Lscyp307a2)在小棕色的planthopperLaodelphaxstriatellus,hemipteran昆虫种。LsSPOK有三个保存昆虫的P450主题,也就是说Helix-K,PERF主题和heme有约束力的领域。Lsspok的时间、空间的表示模式被量的聚合酶链反应评估。通过fouth中间形态和早第五中间形态的阶段,Lsspok显示出二表情在秒天和第五天的第四中间形态的美女的山峰,和二马槽在第一天第四和第五中间形态。在白天5第四中间形态的美女上,Lsspok清楚地在prothoracic腺被定位的胸有高抄本水平。在美女阶段的Lsspok的双strandedRNA的饮食的介绍成功地将目标基因击倒,蜕皮激素的减少的表达式水平受体(LsEcR)基因,引起的nymph的致命性和推迟的开发。在Lsspok-dsRNA-exposed美女的20-hydroxyecdysone的摄取没增加Lsspok表示水平,但是几乎完全救LsEcRmRNA水平并且在幸存和发展上减轻否定效果。因此,我们的数据建议ecdysteroidogenic小径在昆虫被保存,LsSPOK为在在L的ecdysteroidogenesis的特定的步负责。striatellus。

  • 标签: 灰飞虱 靶基因 RNA干扰 若虫 半翅目昆虫 细胞色素P450
  • 简介:目的:获得抑制效果好的泛素C端水解酶LI(UCH—L1)基因小干扰RNA(siRNA)干扰载体。方法:根据Gen—Bank中大鼠UCH—L1基因序列设计并合成4对siRNA寡核苷酸序列,将4对寡榱苷酸序列退、k成双链后分别插入siRNA表达载体pcDNA6.2-GW/EmGFP—miR中构建4个siRNA表达质粒,测序鉴定后将4个siRNA表达磺牝分别转染HEK293细胞,利用Western印迹和qPCR方法检测干扰效果;将干扰效果最好的质粒包装成腺病毒,感染大汛血管平滑肌细胞(VSMC),并采用TNF-a干预诱导UCH—Ll表达升高,Western印迹验证干扰效果。结果:测序分析证实4对siRNA寡核苷酸序列分别插入siRNA表达载体pcDNA6.2-GW/EmGFP—miR;qPCR检测与Western印迹均表明第3号siRNA表达载沐对UCH—Ll表达的抑制程度最高,将其包装成腺病毒并转染VSMC能显著抑制TNFd湾导的U(:H—I。l表达升高。结论:构建并筛选出干扰效果好的UCH—LlsiRNA干扰载体。

  • 标签: 泛素C端水解酶L1 RNA干扰 HEK293细胞 血管平滑肌细胞
  • 简介:我们以前报导了人的ACAT1基因通过从染色体抄录的二不连续的RNA处理的interchromosomal生产妄想的mRNA1和7。妄想的mRNA把AUG1397-1399和GGC1274-1276用作翻译开始codons分别地,与在人的房间是确实地在场的后者生产正常50-kDaACAT1和新奇酶地活跃的56-kDaisoform,包括人的导出单核白血球的巨噬细胞。在这个工作,我们报导位于GGC1274-1276codon的附近的RNA第二等的结构为56-kDaisoform的生产被要求。三预言的茎环(nt1255-1268,1286-1342和1355-1384)的效果被transfecting表示plasmids个别地测试进包含的房间野类型,删除或变异的茎环序列连接了到一个部分ACAT18月开的读物框架(ORF)或到另外的基因的ORF。表示模式被西方的污点分析监视。我们发现从染色体7的在上游的stem-loop1255-1268和从染色体1的下游的stem-loop1286-1342为56-kDaisoform的生产被需要,而从染色体1的最后stem-loop1355-1384是非必需的。用有一个稳定的发卡的monocistronic和bicistronic向量的实验的结果证明从GGC1274-1276codon的那翻译开始被一个内部核糖体入口地点(怒火)调停。进一步的实验表明从GGC1274-1276codon的那翻译开始要求在上游的组成AU的RNA第二等的结构和下游地GC富有的结构。这个机械学的工作为人的ACAT1抄本的妄想的性质的生物意义提供进一步的支持。

  • 标签: 核糖核酸 染色体区域 核糖核酸二级结构 内部核糖体进入点
  • 简介:为了研究通过功能筛选得到的一个新的红细胞分化相关的全长cDNA(命名为EDRFI)的功能,选择K562细胞作为模型细胞来观察反义EDRFI表达对细胞功能的影响.通过快速构建,同时得到了正向和反向插入片段的真核表达载体pcDNA3-EDRFI-S(sense)及peDNA3-AS(antisense),并通过改进的LipofectAMINE细胞转染和G418筛选,得到了稳定表达的细胞株,进行基因组PCR鉴定,证明了转染的高效性.NorrhemB10t试验的结果表明,反义载体转染的K562细胞中,EDRF1在mRNA表达水平上受到下调,提示EDRF1反义DNA的表达可能抑制了EDRF1mRNA的正常转录.进一步,γ-珠蛋白和PKC-α的表达在反义构建质粒转染K562细胞中的表达均受到下调,这可能传递了红细胞分化的负反馈信号,从而抑制了珠蛋白的合成.

  • 标签: 反义RNA 红细胞分化 蛋白激酶C-Α 信号转导 γ- 珠蛋白
  • 简介:目的:构建能介导结缔组织生长因子(CTGF)基因RNA干扰的复制缺陷型腺病毒表达载体。方法:以大鼠CTGF基因为靶序列,设计并合成含编码短发夹RNA序列的寡核苷酸,构建腺病毒穿梭质粒P-shuttle-CTGF,酶切及测序分析正确后,与腺病毒骨架质粒pAdEasy-1共转染AD-293细胞,进行病毒包装,得到腺病毒载体Ad.H1-CTGF,用该载体感染HSC-T6细胞,观察其对CTGF基因表达抑制的效果。结果:构建的腺病毒穿梭质粒p-shuttle-CTGF经酶切、测序分析证实正确;包装的病毒载体滴度为4×1010PFU/mL,感染HSC-T6细胞后,Western印迹证实CTGF表达显著减少。结论:构建的腺病毒载体Ad.H1-CTGF可有效抑制HSC-T6中CTGF的表达,为抗纤维化研究提供了有力的工具。

  • 标签: 结缔组织生长因子 RNA干扰 腺病毒载体
  • 简介:目的:观察DcR3基因小干扰RNA(siRNA)对人结肠癌SW480细胞裸鼠皮下移植瘤DcR3基因表达的影响。方法:建立结肠癌SW480细胞裸鼠皮下移植瘤模型,瘤体注射脂质体与DcR3siRNA混合物,转染DcR3siRNA,免疫组织化学及RT-PCR检测观察DcR3基因的表达。结果:建立了结肠癌SW480细胞裸鼠皮下移植瘤模型;治疗后,治疗组移植瘤明显减小,空白对照组、阴性对照组肿瘤体积显著大于治疗组(P〈0.01);各组肿瘤组织中DcR3基因均有不同程度的表达,治疗组表达程度明显低于阴性对照组及空白对照组(RT-PCRP〈0.05,免疫组化P〈0.01)。结论:人结肠癌SW480细胞在裸鼠皮下有良好的成瘤性;脂质体与DcR3siRNA混合物可特异性抑制结肠癌裸鼠皮下移植瘤内DcR3基因的表达。

  • 标签: 结肠癌 SW480细胞 DcR3基因 小干扰RNA 裸鼠 脂质体
  • 简介:目的:探讨长链非编码RNA(longnoncodingRNA,lncRNA)在氧化型低密度脂蛋白(oxidizedlow-densitylipoprotein,ox-LDL)诱导的损伤人脐静脉内皮细胞(humanumbilicalveinendothelialcells,HUVEC)与正常HUVEC中表达谱的差异。方法:采用lncRNA芯片检测ox-LDL诱导的损伤HUVEC与正常HUVEC中lncRNA及mRNA的表达差异,筛选出HUVEC损伤相关的lncRNA。结果:相对于正常HUVEC,在ox-LDL诱导的损伤HUVEC中表达上调和下调超过2倍的lncRNAs和mRNAs分别有139种和113种,上调和下调超过4倍的lncRNAs和mRNAs分别有35种和28种。结论:与正常HUVEC比较,ox-LDL诱导的损伤HUVEC中lncRNA的表达谱显著变化,lncRNA可能在血管内皮细胞损伤过程中发挥一定作用。

  • 标签: 长链非编码RNA 人脐静脉内皮细胞 氧化型低密度脂蛋白 芯片