简介:ThisstudyintendstoinvestigatehowtheelasticityofabacterialphagecanafecttheprocessofDNApackagingandejection.Forthispurpose,weproposeaunifiedcontinuumandstatisticalmechanicsmodelbytakingintoaccounttheefectsofDNAbendingdeformation,electrostaticrepulsionbetweenDNA–DNAstrandsandelasticdeformationofthephagecapsid.Basedonsuchamodel,wederivethequantitativerelationsbetweenpackagingforce,elasticityofcapsid,DNAlengthremaininginthecapsid,osmoticpressureandejectiontime.Thetheoreticallypredictedresultsarefoundtoagreeverywellwithinvitroexperimentalobservationsintheliterature.
简介:摘要面对各种因素导致的DNA损伤,细胞有一套应答修复机制。其中细胞周期阻滞在DNA损伤应答修复中扮演了重要角色,为修复受损DNA创造了条件。关于细胞周期调控的研究集中于细胞周期蛋白依赖性蛋白激酶(CDK)与细胞周期检查点等方面。在DNA损伤修复过程中,损伤位点募集的磷脂酰肌醇-3-激酶样激酶(PIKKs)可引起细胞周期检查点相关蛋白的激活,导致细胞周期阻滞。在碱基切除修复、核苷酸切除修复、错配修复、DNA双链断裂修复等常见的DNA损伤修复途径中,招募的损伤修复相关蛋白在细胞周期调控中也起到一定的作用。因此综述了主要DNA损伤修复形式与细胞周期阻滞之间的关系及研究进展。
简介:在文献中,DNA序列曾被描述为一维游动和三维游动.对前者,一个游动对应于多个DNA序列;对后者,游动和DNA序列一一对应.我们发现在三维游动(xn,yn,zn)中,由xn,yn和zn中任意有序的两个给出的二维游动已经与DNA序列一一对应,且余下的一维游动由该二维游动完全决定.因此,二维游动似乎是描述DNA序列最合适的模型.4个碱基A,C,G和T共有4!=24个排序.每一个排序都给出DNA序列用二维游动的一种描述.两个游动(x'n,y'n)和(x"n,y"n)被看作是等价的,如果(x'n,y'n)=(εx"n,δy"n)或(εy"n,δx"n),这里ε=±1,且δ=±1.于是这24个类型的游动被分成三个等价类;它们的代表分别是(xn,yn),(yn,zn),和(xn,zn),这里(xn,yn,zn)正好是张和张的三维游动.
简介:目前大多数商品化的DNA测序仪的信号检测系统是基于CCD或PMT。基于CCD的系统需要对CCD进行制冷,其造价相对较高且灵敏度相对较低;基于PMT的系统使用机械扫描来实现多通道检测,其工作稳定性相对较低且工作的机械噪音大。本文提出了新型的DNA测序仪,它采用PMT共焦荧光系统,通过f-θ透镜和光学扫描来实现多通道并行检测。在此新系统中采用标准双链DNA样品:pBR322/HaeIII(使用TO染料)进行了毛细管电泳实验,测得系统的检测限可达:1.1841×10-11mol/L。新型DNA测序仪的工作机械噪声相比基于机械扫描的系统要低得多,且工作稳定性和灵敏度也很高。此系统可应用于基于激光诱导荧光的毛细管阵列和多通道微芯片的电泳检测。