简介：摘要目的分析2013—2020年人感染H7N9禽流感密码子使用偏好及其影响因素。方法通过NCBI数据库获得病毒全基因组序列，使用CodonW、EMBOSS、R、Origin 9.0、SPSS 20.0等软件分析病毒的碱基构成、密码子偏好性参数等。结果H7N9病毒全基因组AU含量高于GC，且AU多出现在密码子末位。2013—2020年AU含量逐渐升高，而GC含量逐渐降低。病毒有效密码子数在48.71~56.17之间，提示病毒密码子使用偏性总体较弱。有效密码子数绘图和密码子适应指数分析显示病毒密码子使用偏好受自然选择和突变压力双重影响，自然选择因素更为明显。结论人感染H7N9禽流感病毒密码子使用偏好仍处在不断适应人类宿主的演化过程中，第五波疫情及后续毒株与既往毒株相比存在更加适应宿主的变化。

简介：摘要目的利用全基因组测序数据分析中国耐多药结核分枝杆菌的耐药相关基因突变谱及主要突变类型与菌株基因型的相关性。方法查询并下载NCBI数据库中截至2019年8月公开发表的中国结核分枝杆菌全基因组测序数据，利用全基因组数据预测菌株分子药敏结果，统计不同药物耐药相关基因的突变类型，并分析耐药突变类型与菌株基因型的相关性。结果根据分子药敏结果从2 019株菌株中鉴定出1 024株耐多药菌株，对常用抗结核药物的耐药相关基因主要突变类型分别为katG S315T（73.2%，异烟肼）、rpoB S450L（63.1%，利福平）、rpsL K43R（70.0%，链霉素）、embB M306V（37.4%，乙胺丁醇）、pncA启动子区T（-11）C（7.9%，吡嗪酰胺）、gyrA A90V （32.3%，氟喹诺酮类）、rrs A1401G（67.7%，二线注射类）、fabG1启动子区C（-15）T（87.0%，乙硫异烟胺）、folC I43T（30.4%，对氨基水杨酸）。其中，katG S315T、rpsL K43R、embB M306V、gyrA D94G在L2系菌株中的频率显著高于L4系菌株，folC I43T仅在L2系菌株中发现；katG S315T在古典北京型菌株中比例较高，而rpsL K43R在现代北京基因型菌株中的比例更高，其差异均有统计学意义（均P<0.05）。结论本研究提供了基于全基因组测序的我国耐多药结核分枝杆菌对多种常用抗结核药的耐药相关基因主要突变类型，为研发敏感、特异的快速分子检测方法提供了依据；同时也发现多种耐药相关基因主要突变类型与菌株基因型有关。

简介：摘要目的探索小鼠正常肺组织在重离子射线暴露后不同时期、不同暴露剂量下转录水平表达改变，为寻找重离子放射敏感基因、研究重离子放射效应与损伤机制奠定基础。方法时间梯度实验：采用14.5Gy碳离子射线对小鼠进行全肺野照射，分别于照射后3天和1、3、24周提取肺组织总RNA。剂量梯度实验：采用0、7.5、10.5、12.5、14.5、17.5、20Gy重离子射线照射后1周提取肺组织总RNA。两组实验均行全转录组芯片检测。结果重离子射线14.5Gy照射后急性期(3天)、亚急性期(1周)、炎症期(3周)、纤维化期(24周)小鼠肺部全转录组基因表达主成分分析出现各阶段差异性分离；其中以照射后3天基因表达差异最为显著，照射后1周与其余各时间点均一性最高。细胞凋亡是重离子照射后肺组织主要的细胞死亡类型，以Phlda3为中心的Gdf15、Mgmt、Bax相互关联基因是放射敏感基因(R＝0.76，P<0.001)。结论本研究为重离子照射后正常肺组织生物学效应机制提供了转录水平依据。

简介：摘要患儿 男，5小时龄，因“胎龄35+2周早产、全身水肿5 h”于2021年6月入复旦大学附属儿科医院新生儿重症监护病房。患儿出生后表现为全身水肿、窒息，体重和头围均大于P97，存在低血糖、呼吸衰竭、心功能不全、持续性肺动脉高压和隐睾等。住院期间患儿临床症状呈进行性加重，入院第4天应用极速家系全基因组测序流程，用时23.5 h检测到HRAS基因1个新发杂合致病变异：c.35G>A，p.Gly12Asp，确诊Costello综合征，及时调整了治疗决策。

简介：摘要动脉性肺动脉高压（pulmonary arterial hypertension，PAH）是一类多种因素共同作用的复杂性疾病，包括特发性PAH、遗传性PAH和疾病相关的PAH等，由于具有高度遗传异质性，其临床特征及预后也具有较大差异。目前，PAH的具体发病机制尚不明确，疾病负担重，诊治方案仍有待探究，因此，研究PAH的遗传易感性对了解疾病的发生发展具有重要意义。随着全基因组关联研究（genome-wide association study，GWAS）的发展，发现了大量与PAH发病机制、临床表型、治疗和预后相关的遗传变异。本综述总结了近年来，国内外使用GWAS开展PAH遗传易感性相关研究的应用进展，为深入探究PAH的发生发展和个体化防治提供新思路。

简介：基于Saint-Venant方程组的守恒形式,重构了各物理变量在单元格边界的黎曼状态值,实现了各变量在计算区域内的二阶精度分布。在此基础上,构造了对流通量项的具有标量耗散特征的有限体积法,并在地表水位相对高程梯度离散式中引入额外空间离散项,该项在有水区域为零,并在无水区域能与地表水位相对高程梯度项相互抵消,从而正确描述地表水位相对高程梯度的真实作用。采用双时间步法对Saint-Venant方程组的空间离散式进行全隐式离散,实现了无条件稳定求解。选取了2个典型算例,采用数量呈倍数递减的3种时间步长进行数值模拟,通过与解析解和实测结果进行对比,验证了数值解法的模拟效果和收敛性。结果表明,建立的数值解法能以优良的拟合度模拟不同断面几何约束下的溃坝过程,模拟结果表现出了良好的收敛性。

简介：据华大基因网站报道，2015年1月26日，来自江西农业大学、华大基因和美国加利福尼亚大学的研究人员共同完成的（俭基因组重测序揭示猪环境适应性的分子机理及可能的属间杂交现勤（Adapta-tionandpossibleancientinterspeciesintrogressioninpigsidentifiedbywhole-genomesequencing）以全文（Article）形式在线发表于国际顶级学术期刊《自然-遗传》（NatureGenetics）。

简介：目的应用白念珠菌全基因组表达谱芯片比较山苍子油处理前后白念珠菌基因的差异性表达，分析山苍子油对白念珠菌整个基因表达谱的影响。方法用山苍子油处理白念珠菌ATCC900028株90min，将处理后的菌株命名为白念珠菌ATCC90028-L，分别抽提细胞总RNA，经杂交、洗涤后，通过扫描分析白念珠菌ATCC90028株和ATCC90028-L株全基因组表达谱的差异。结果基因芯片共筛选出491个差异表达基因，与白念珠菌ATCC90028株比较，在ATCC90028-L株中有216个基因表达上调，有275个基因表达下调，差异表达的基因数量约占总基因数量的11％（491／4634），差异表达基因主要包括白念珠菌麦角固醇生物合成通路中关键靶酶编码基因（ERGs）、应激反应相关基因、DNA复制与损伤修复相关基因、跨膜分子转运相关基因、能量代谢酶类相关基因等。结论山苍子油可使白念珠菌基因组中约11％基因产生差异性表达，影响较为显著，我们推测山苍子油与唑类抗真菌药物的作用机制相似，均通过对白念珠菌麦角固醇生物合成通路中关键靶酶的影响而起作用，基因芯片筛选出的其他差异表达基因也可能与山苍子油的抗真菌作用机制有关，值得进一步研究。

简介：摘要目的优化建立适合本实验室针对人源福尔马林固定石蜡包埋(Formalin-Fixed and Paraffin-Embedded, FFPE)样本的全基因组(Genomic DNA, gDNA)文库构建方案。方法探讨并设计了在FFPE全基因组文库构建各环节优化条件，分析比较FFPE DNA文库片段大小及文库转化率，以选择最优的文库构建流程。结果最终确定DNA起始量50 ng、20 min片段化酶切时间，采用4×稀释的接头进行20 min连接，经过2次特定比例的磁珠筛选方案进行文库构建，实现片段主峰在300 bp~400 bp左右，文库转化率达60%。结论本操作流程针对FFPE样本可以保证高质量的文库构建，同时实现较高文库转化效率。

简介：摘要近几年来子满产妇的发生率呈明显上升趋势,为产科高危因素。对其分娩期特点进行分析,针对性制定防控方案,是降低并发症发生率、提高分娩质量的关键。本次研究选择的对象共20例,均为我院2011年6月～2012年6月收治的子满的患者,回顾20例子满妇女的临床资料,现将相关内容报告如下。

简介：包天仁教授的英语“四位一体”教学法实验已经在我市进行了十余年，实验由试点实验阶段、少数学校参与实验部分区域实验，发展为全市参与的大规模、重点实验阶段。随着英语“四位一体”教学法的不断发展和成熟，我市英语“四位一体”教学法实验已走过了英语“四位一体”复习教学方法的移植实验，

简介：原发性高血压是一种由多种机制共同作用的多基因疾病。由肥胖导致的病理改变是与其相关的一个信号通路。我们主要研究高血压的一个亚型——肥胖相关的高血压，以寻找其致病基因。我们入选了55个有两个患病同胞或者更多患者的家系，他们均来自于地理位置偏远的加拿大法裔人群，其中15个家系的肥胖发病率较高（≥70％）。我们在所有的高血压家系和有高肥胖发病率的高血压家系中利用多位点连锁分析方法进行全基因组扫描（GeneHunter2．1；位点密度：10cm）。在所有55个家庭的扫描中，我们在1号染色体和11号染色体上分别发现了两个连锁值显著（LODscore=2．5）的位点D1S1597和D11S1999。我们对仅患有肥胖高血压的家系进行扫描，在1号染色体的同一区域内发现连锁值最显著（LODscore=3．1）的一个位点是D1S1597。然后我们又D1S1597周围的其他遗传标记进行基因分型，得到了一个连锁更加显著的位点D1S2672（LODscore=3．5）。与肥胖高血压相关的许多候选基因都位于这个区域，其中包括肿瘤坏死因子受体2（tumornecrosisfactorreceptor2）和心房利钠肽基因（atrialnatriureticpeptidegenes）。这些结果表明，研究临床定义明确的高血压亚型可能有助于寻找、鉴定复杂性疾病的致病基因，例如本研究中利用肥胖相关的高血压亚型。

简介：摘要目的应用高通量测序和生物信息学分析技术，从一起经货轮输入的新冠肺炎(COVID-19)聚集性病例标本中直接测定新型冠状病毒(2019 novel coronavirus，2019-nCoV)全基因组序列，并从全基因组水平分析2019-nCoV的基因组变异特征，追溯病毒的潜在来源。方法采用2019-nCoV全基因组靶向扩增结合Ion S5二代测序的技术，对来源于同一艘货轮的8例COVID-19确诊病例咽拭子标本进行病毒全基因组测序。应用在线分析平台，判断病毒型别，分析病毒突变位点。利用进化分析软件，构建系统发育树，结合病例流行病学资料，推测病毒的来源。结果成功测序获得8条长度为29 822~29 865 bp的2019-nCoV全基因组序列，平均测序深度为11 928×~33 588×，基因组覆盖度为99.73%~99.87%；Pangolin分型结果显示8个2019-nCoV基因组均属于VOC/Delta(B.1.617.2)进化分支；全基因组突变分析显示，与武汉参考株(NC_045512.2)相比，8个2019-nCoV基因组序列核苷酸突变的中位数为35个(31个~38个)，氨基酸突变的中位数为26个(24个~28个)，突变位点分布于8个编码区(ORF1a、ORF1b、S、ORF3a、M、ORF7a、ORF8、N)；进一步分析发现8个2019-nCoV基因组中含有23个属于2019-nCoV Delta(B.1.617.2·AY.2)变异株的特征性突变位点；但因8个2019-nCoV基因组间的突变位点并非完全重合，且流调报告显示货轮中途经停多个口岸且有人员更替，故推测该起聚集性COVID-19疫情可能有不同传播来源；进化分析显示，8个2019-nCoV序列共同处于B.1.617.2进化分支的AY.2子分支上，同Pangolin分型及突变分析结果一致。结论本研究从一起经货轮输入的COVID-19聚集性疫情病例标本中测序获得8个Delta变异株全基因组序列，本研究所构建的测序方法和分析结果可在COVID-19防控中为2019-nCoV的变异分析和病例溯源提供参考。

简介：摘要目的探讨非组配型股骨柄用于全髋翻修的长期疗效，分析髋关节翻修术后残留的不等长的影响因素。方法分析随访武汉市第四医院2009年1月至2014年12月进行髋关节翻修，同一术者使用带棘非组配型股骨假体的病例。共62例，男16例，女46例。复查双侧髋关节正侧位片，并进行Harris评分。评估术前和术后双侧肢体长度差异(LLD)的情况。我们将全髋关节置换术后LLD分为髋臼侧，股骨侧，关节间隙3个部分，并分别记录。两组间比较采用两独立样本t检验，术前术后数值的比较使用配对样本t检验。3组之间数值的比较使用方差分析。结果患者年龄(68.5±8.76)岁，随访(117.1±21.1)个月。术前Harris评分40.7±38.6，术后Harris评分平均为(84.2±27.6)分。术前患肢短缩(1.89±0.94) cm，术后患肢短缩(0.56±0.46) cm，LLD术后明显缩小(P<0.01)。根据术前患者肢体长度差异来源，将患者分为髋臼侧组(A组，10例，16.1%)，股骨侧组(F组，38例，61.3%)和混合组(C组，14例，22.6%)。3组之间术前肢体长度差异无统计学意义，F组(0.45±0.42) cm术后肢体长度差异明显低于A组(0.67±0.43) cm和C组(0.79±0.50) cm(P<0.05)。结论髋关节翻修术前患者存在的LLD可以分为髋臼侧组，股骨侧组和混合组3种不同类型，髋臼假体重建位置对翻修术后LLD影响更大。

简介：摘要目的分析北京市一株人呼吸道合胞病毒(human respiratory syncytial virus, HRSV)A亚型全基因组序列的变异和遗传特征。方法对北京友谊医院住院儿童鼻咽抽吸物样本核酸进行二代测序，获得了一株HRSV A亚型全基因组序列，与其他相关参考株构建系统发生树，并对主要蛋白编码区进行同源性分析、单核苷酸多态性分析以及N-糖基化位点预测。结果系统发生树和同源性分析结果提示，本研究获得的HRSV病毒株(RSVA/Beijing-China/2017)属于A亚型ON1基因型。核苷酸和氨基酸变异分析表明G蛋白、F蛋白和L蛋白变异性较大。氨基酸变异位点分析显示G蛋白第142位发生了氨基酸替换(L142S)。F蛋白P27肽中(110-136aa)有一处氨基酸替换(S105N)，在抗原位点Ø(62-69aa和196-210aa)中也发生了氨基酸替换(C69Y)。N-糖基化位点预测发现该毒株的F蛋白N-糖基化位点有5个，G蛋白N-糖基化位点有4个。结论本研究所得的HRSV毒株属于A亚型ON1基因型，G蛋白、F蛋白和L蛋白变异较大，G和F蛋白共发生22处氨基酸替换。

简介：“子见南子”是孔子去鲁适卫会晤卫灵公夫人南子的纯粹文化事件，却被后世儒生称为“最不可解者”，也是当世诸杰和历代儒者倍感迷惑和试图破解的症结。名声欠佳的“寡小君”南子欲见孔子，囿于南子掌卫之势下的外围压迫、屈身“行道”的内在机理以及化解君臣嫌隙，延续儒家“道统”思想的考量，“子见南子”俨然成为事实，这既是对自身的一场博弈也是给予世俗的本来回应和诠释，应该从理性层面规避过尤阐释，揭示其内在发生的必然性和逻辑。

简介：摘要：本文提出了一种基于时间序列分析组合模型的变形监测与预报方法，该方法将ARIMA模型和指数平滑模型相结合，并利用Kalman滤波算法对模型进行优化。采用该方法对某隧道进行了变形监测与预报研究，并与传统的单一模型进行了对比分析。研究结果表明，基于时间序列分析组合模型的变形监测与预报方法具有更高的预测精度和更好的实时性。

简介：利用共有峰率和变异峰率双指标，以番薯属六种样品的红外光谱为依据，计算出所测样品的共有峰率和变异峰率，建立番薯属六种样品的共有峰率和变异峰率双指标序列，揭示了番薯属六种样品之间的关系．结果表明紫薯果皮与紫薯果肉，白薯果皮与白薯果肉，红薯果皮与红薯果肉共有峰率分别为66．7％、37．5％、44．4％；三种番薯的果肉与果皮差距较大．通过比较三种果肉与三种果皮，可以发现它们的共有峰率在50％左右，这说明同属三种番薯的组成成分较为相近．该方法能从整体水平分析出番薯属的成分，具有速度快、重现性好、操作简单、破坏性小、样品量少等优点，从而为解决番薯属内在差异和植物同属鉴别提供了一种新的方法．

简介：统计分析了西昆仑及交汇区1970--2010年148个Ms≥4．5级地震序列，统计结果表明，这一区域的地震类型具有一定的地域性、复杂性以及与地震的强度有一定的关系。

简介：记叙文作为全部文体的写作基础,在初中作文教学中占据着十分重要的位置。另外,在各种文体的写作教学过程中,教师也比较重视记叙文写作教学,而且学生也将自己的时间均用在了记叙文写作的训练方面。然而就当前而言,记叙文写作教学中却未制定出完善的计划,随意性较大。