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  • 简介:摘要绦虫病是一类严重危害人类健康的人兽共患寄生虫病,其药物治疗和疫苗防治是当今研究的热点,而目前蛋白组学成为了研制疫苗和了解致病机制的重要工具。寄生虫不同发育阶段间蛋白模式的差异可能反映了其在不断变化的环境和生命周期中所使用的特定策略和适应机制,故本文对多种绦虫的蛋白组学研究进展作一综述,旨在为绦虫病的防治提供参考依据。

  • 标签: 绦虫 蛋白质组学 质谱 双向电泳
  • 简介:摘要:在人的生命活动中,蛋白发挥着息息相关的作用,蛋白的主要来源就是食物中,所以做好对食物中蛋白的检测显得十分重要,毕竟食物中的蛋白含量能够直接将食品的营养价值体现出来。多数食品在进行销售之前,都需要对营养物质含量进行分析,明确营养物质的含量标准。但是在现阶段的蛋白测定中,在测定标准方面,还存在较大的误差,所以在进行含量测定的时候,必要加强对检测方法的利用,本文主要对食品检验中蛋白测定方法进行优化。

  • 标签: 食品检验 蛋白质 测定方法 优化
  • 简介:摘要目的通过检测不同时间点肺爆震伤小鼠肺蛋白组学变化,探究肺爆震伤损伤机制。方法60只健康雄性C57BL/6小鼠,随机(随机数字法)分为对照组、爆震后12 h组、24 h组、48 h组、72 h组及1周组(每组10只)。在北部战区总医院动物实验室进行实验,利用自主研发的精准爆震装置建立小鼠肺爆震伤模型;通过大体观察和HE染色评价肺组织损伤情况;基于液相色谱-串联质谱联用(liquid chromatography-tandem mass spectrometry,LC-MS/MS)的蛋白组学技术对小鼠肺组织蛋白进行定量分析,筛选出差异表达蛋白,在此基础上利用生物信息学工具分析蛋白组学变化。结果肺爆震伤后,小鼠肺组织表面可观察到散在出血点,且随时间延长逐渐增多,24 h出血最为严重。HE染色可见爆震后12 h和24 h的肺泡正常组织结构消失,肺泡腔内弥漫性出血,大量炎细胞浸润,肺间质渗出液增多,肺泡壁增厚,肺泡腔萎陷融合。LC-MS/MS共鉴定到6 861个蛋白,定量到608个差异表达蛋白,其中在12、24、48、72 h及1周分别有227个、140个、202个、258个和71个差异蛋白。基因本体论(gene ontology, GO)分析得到包括细胞粘附、细胞外基质组织及胶原原纤维组织等130个生物进程子类,外泌体、细胞外基质及细胞质等66个细胞组分子类,以及细胞外基质结构组成、肌动蛋白结合及抗氧化活性等43个分子功能子类。KEGG分析共得到细胞外基质受体相互作用、黏着斑及PI3K-Akt信号通路等24个子类。结论小鼠肺爆震后早期不同时间点差异表达蛋白组合亦不同,损伤机制复杂,特别是12~24 h肺损伤最为严重,炎症反应显著。

  • 标签: 肺爆震伤 急性肺损伤 质谱 蛋白质组学 炎症反应
  • 简介:摘要目的建立燃煤污染型氟暴露人群血浆中差异表达的5个微小RNA(microRNA,miRNA)靶基因的蛋白-蛋白相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络,筛选具有重要作用的基因及基因模块。方法将本课题组前期筛选的燃煤污染型氟暴露人群血浆中差异表达的5个miRNA(hsa-miRNA-3131、hsa-miRNA-4516、hsa-miRNA-6501-5p、hsa-miRNA-10b-5p、hsa-miRNA-4683)的靶基因定位到STRING在线数据库(https://string-db.org),筛选PPI网络。使用Cytoscape v3.6.0软件对PPI网络可视化,通过NetworkAnalyzer插件得到拓扑属性值度和拓扑属性值介数,筛选PPI网络的中心节点(度和介数均最高的节点)。同时,采用CytoHubba插件中的最大团中心(MCC)分析方法来确定PPI网络中的重要节点。通过MCODE插件进行聚类分析,筛选PPI网络的基因模块。将基因模块所包含的蛋白名称在线提交KOBAS v3.0数据库(http://kobas.cbi.pku.edu.cn/),对MCODE插件筛选出的基因模块进行KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)通路富集分析。结果靶基因的PPI网络由1 035个节点和4 346个边组成。泛素蛋白A-52残基核糖体蛋白融合产物1(UBA52)的度(101)和介数(0.010 723 89)均最高,为PPI网络的中心节点。经MCC分析,UBA52为PPI网络中的重要节点。从PPI网络中选择排名前5的基因模块,5个基因模块的KEGG通路富集分析中高度富集的基因通路分别为泛素介导的蛋白水解、剪接体、内吞作用、神经活性配体-受体相互作用、囊泡转运。结论成功建立了燃煤污染型氟暴露人群血浆中差异表达的5个miRNA靶基因的PPI网络,筛选出UBA52基因和5个基因模块主要通路。

  • 标签: 微小RNA 蛋白质-蛋白质相互作用网络 KEGG
  • 简介:摘要病理性心脏重塑是多种心脏疾病的主要病理改变,表现为心肌肥厚和纤维化,并最终导致心力衰竭。心肌细胞作为一种终末分化细胞,增殖再生能力有限,因此蛋白稳态对于心肌细胞生存和功能极其重要。细胞蛋白稳态是指蛋白的合成与降解过程达到动态平衡,其主要受到包括分子伴侣、泛素蛋白酶体、细胞自噬等3种途径在内的蛋白质量控制系统的调节。近年的研究表明,心肌细胞蛋白稳态在心脏稳态维持中发挥重要作用,蛋白质量控制系统中任一环节出现异常均可能引起蛋白毒性,从而导致病理性心脏重塑。该文综述了蛋白稳态在心脏稳态维持中作用的新进展,并展望了通过调节蛋白稳态治疗心脏疾病的前景。

  • 标签: 心脏重塑 蛋白质稳态
  • 简介::改良双缩脲比色法测定食品中蛋白含量。最大吸收峰为 540nm。线性范围为 0.00-55.13mg/25ml,该方法与凯氏定氮法用 t 检验法检验无显著差异 关键词:蛋白;双缩脲反应;比色测定;凯氏定氮 中图分类号:O629.73 文献标识码:B 文章编号: improved method of biuret spectrometry determines content of protein in food YUE-Qiu-hong, (Xi’an zhongyuan International Certification Techical Services Co.LTD, Xi’an, 710068, China) Abstract:An improved method of biuret spectrometry determines the content of protein in food. The optimum absorbance peak gives 540nm.A positive correlation exists between absorbance and protein content in the rage of 0.00-55.13mg/25ml.This method is not apparently different from Kjeldahl by t-test. Key words:Protein; Biuret; Spectrometry; Kjeldahl 前言部分。 凯氏定氮法测定蛋白含量结果准确,但耗时太长,危险性高,对环境污染大。双缩脲法传 统方法显色时间较长,溶液澄清度不好,重现性差。双缩脲反应受温度,时间影响较大,一般常温下 (20-25℃) 需 1h ,40℃需 15min,60℃需 5-10min。另外加入异丙醇可降低淀粉的溶解性,有利于蛋白的提取和显色。 为了提高蛋白测定的速度及结果的准确性,通过对双缩脲的改良,并与凯氏定氮法比较,以确定改良后的双缩脲法的可行性。 材料与方法 蛋白中含有两个以上的肽键,能与 Cu2+在碱性条件下发生双缩脲反应,生成紫红色络合物,其颜色深浅与蛋白含量成正比,而与蛋白分子量无关。 材料与试剂 0.15mol/L KOH (分析纯 天津金汇太亚化学试剂有限公司) 谷朊粉 (山东成武山河粉业有限公司 ) ,全蛋粉(济南顺发食品有限公司 ) 双缩脲试剂:60ml 4%CuSO4.5H2O(分析纯,天津金汇太亚化学试剂有限公司生产 )200ml 2.5%酒石酸钾钠(分析纯辽宁嘉诚精细化学品有限公司生产 ) , 6 0m l 5 m o l/L KO H ,用蒸馏水定容至 50 0m l。 异丙醇(分析纯 苏州市相城区圣昊精细化工厂 ) 仪器与设备 UV-VIS 分光光度计 (北京美国哈希 HACH 公司) 25ml 具色塞比管 离心机 (80-2 型 常州拓兴实验仪器厂) 超级恒温水浴震荡器 (HZS-H 型 哈尔滨东联电子技术开发有限公司) 注明所用仪器型号(放在仪器名称前)、生产厂商、主要和关键配件、条件。 方法 标准溶液的配置 称取 2.0g 谷朊粉,0.15 mol/L KOH 溶解定容至 100ml,充分摇匀后粗滤, 以此滤液做为标准蛋白 液 。 取 此 滤 液 5 m l 做 凯 氏 定 氮 , 计 算 出 1 m l 中 含 蛋 白 质 的 量 ( mg ) 。 实验条件的确定:

  • 标签: 关键词:蛋白质;双缩脲反应;比色测定;凯氏定氮
  • 简介:摘要:近几年,“长寿药”NMN备受市场关注和消费者青睐,NMN是烟酰胺单核苷酸的缩写。NMN制备方法有三种,日本的发酵法、国内的化学合成法和酶法,酶法又分为半酶法和全酶法。半酶法NRCl是化学合成,后面的NMN酶法制备。半酶法合成的NMN因为使用到酶,可能潜在存在蛋白残留,本文重点研究半酶法合成的NMN中的蛋白总含量检测。

  • 标签: 半酶法 NMN 蛋白质总含量检测
  • 简介:摘要目的分析糖尿病性认知功能障碍(DACD)大鼠脑白质差异蛋白组学。方法20只SD大鼠分为对照组(10只)和2型糖尿病(T2DM)组(10只),对照组喂养标准饲料,T2DM组利用高脂高糖饮食联合腹腔注射链脲霉素建立T2DM模型。利用Morris水迷宫检测大鼠认知功能,使用弥散张量成像技术评价大鼠脑白质病变(WML)程度。通过蛋白非标记定量技术(Label-free)进行脑白质差异蛋白组学分析,对筛选出的差异蛋白进行生物信息学分析,最后选取一些差异蛋白进行Western blot验证。组间差异的比较采用独立样本t检验或Wilcoxon检验。结果共筛选到38种差异蛋白:24个蛋白表达上调(差异倍数>2.0且P<0.05),14个蛋白表达下调(差异倍数<-2.0且P<0.05)。差异蛋白主要分布在细胞膜、细胞质、外泌体等,主要参与神经系统发育、负向调控神经细胞的凋亡以及化学突触传递等生物学过程。差异蛋白主要富集在4个信号通路上,且以脑源性神经营养因子、一氧化氮合酶1、神经调节素(GAP43)、囊泡谷氨酸转运蛋白1(SLC17A7)、动力蛋白1、代谢型谷氨酸受体5和氨基酸转运蛋白蛋白为核心骨架,形成蛋白相互作用信息网络。结论差异蛋白同时参与认知功能障碍及WML相关的多条信号通路,GAP43和SLC17A7可能是WML发病机制的关键靶点。

  • 标签: 糖尿病,2型 认知功能障碍 脑白质 蛋白质组学 非标记定量
  • 作者: 薛敏 任新军 柯屹峰 刘巨平 范小娥 李筱荣
  • 学科: 医药卫生 >
  • 创建时间:2021-06-25
  • 出处:《中华实验眼科杂志》 2021年第06期
  • 机构:天津医科大学眼科医院 天津医科大学眼视光学院 天津医科大学眼科研究所 天津市视网膜功能与疾病重点实验室 天津市眼科学与视觉科学国际联合研究中心 300384 薛敏现在安徽省第二人民医院眼科,合肥 230041,天津医科大学眼科医院 天津医科大学眼视光学院 天津医科大学眼科研究所 天津市视网膜功能与疾病重点实验室 天津市眼科学与视觉科学国际联合研究中心 300384
  • 简介:摘要目的采用定量蛋白组学技术分析高度近视患者房水中的蛋白组谱。方法纳入2019年1—8月在天津医科大学眼科医院于白内障手术中用1 ml注射器采集伴或不伴高度近视的年龄相关性白内障患者房水标本各34例34眼(每例100 μl),分别作为高度近视白内障组和单纯白内障组。各组分别选取16例16眼房水标本,采用BCA法进行蛋白定量并比较,采用非标记液相色谱串联质谱分析得到2个组的差异表达蛋白。进一步将生物大数据用基因本体功能富集和京都基因与基因组百科全书通路富集分析差异表达蛋白的功能和信号转导通路。各组分别选取18例18眼房水标本采用酶联免疫吸附实验(ELISA)进行质谱检测结果的扩大样本量验证。结果高度近视白内障组房水标本平均蛋白量浓度为(1 134.91±104.78)ng/L,明显高于单纯白内障组的(706.71±85.43)ng/L,差异有统计学意义(t=11.977,P<0.01)。2个组患者房水标本中共鉴定出463个可定量蛋白,其中86个差异表达蛋白,包括49个表达上调蛋白和37个表达下调蛋白。这些差异表达蛋白的分类主要包括蛋白结合活性调节因子、细胞外基质蛋白、载体蛋白、细胞间信号分子、蛋白修饰酶等,分别占32.70%、14.50%、9.10%、9.10%和7.30%。生物信息学分析表明,86个差异表达蛋白主要富集在补体激活及其调节、急性炎症反应、细胞外基质组织重塑等生物学过程。其中21个差异表达蛋白富集于补体和凝血级联通路,15个差异表达蛋白富集于细胞外基质-受体相互作用通路,8个差异表达蛋白富集于PI3K-Akt信号通路。ELISA结果表明,随机选取的3个差异表达蛋白在2个组之间表达变化趋势均与非标记定量蛋白组学分析结果一致。结论高度近视白内障与单纯白内障之间房水蛋白表达谱有显著变化,高度近视与炎症和免疫相互作用以及细胞外基质的重塑密切相关。

  • 标签: 高度近视 非标记 蛋白质组学 房水 病理机制
  • 简介:摘要目的探讨蛋白摄入量对头颈肿瘤患者根治性放化疗期间黏膜损伤和营养状况的影响。方法选取2018年7月至2019年12月南京大学医学院附属鼓楼医院收治的72例头颈肿瘤患者的临床资料进行前瞻性研究。采用数字随机表法将患者分为2组,根据剔除标准,最终干预组纳入患者32例[男性27例、女性5例,年龄(51.67±12.92)岁]、对照组29例[男性23例、女性6例,年龄(56.03±8.26)岁]。干预组在常规膳食基础上接受在院蛋白补充方案[补充乳清蛋白粉50 g/d,使总蛋白摄入量达1.5~2.0 g/(kg·d)];对照组采用在院常规膳食方案[蛋白摄入量为1.0~1.2 g/(kg·d)]。所有患者均采用根治性同步放化疗方案。比较治疗前后2组患者的黏膜损伤程度、营养指标变化、治疗疗效和相关并发症。计数资料的比较采用四格表χ2检验;两样本均数的比较采用成组t检验。结果2组患者在年龄、身高、血压、心率(t=-1.59~1.26)、性别、学历和病种(鼻咽癌与其他疾病)(χ2=0.01~0.45)方面的差异均无统计学意义(均P>0.05)。在口腔黏膜损伤方面,干预组患者的损伤程度低于对照组[16%(5/32)对38%(11/29)],且差异有统计学意义(χ2=3.913,P=0.04);在营养指标方面,干预组与对照组比较,除了骨骼肌、体脂肪和血红蛋白外,干预组在体重[(-2.80±2.66) kg对(-4.85±2.35) kg,t=3.18,P<0.01]、体重指数[(-1.00±0.95) kg/m2对(-1.81±0.89) kg/m2,t=3.38,P<0.01]、握力[(5.59±4.20) kg对(2.59±5.32) kg,t=2.46,P=0.02]和血清白蛋白[(-1.40±3.37)g/L对(-3.07± 2.92) g/L,t=2.06,P=0.04]指标的维持上均优于对照组。2组在疗效评价、腹泻、便秘和发热指标上的差异均无统计学意义(χ2=0.24~1.30,均P>0.05)。结论在头颈肿瘤根治性放化疗中,补充蛋白有缓解患者放射性黏膜损伤程度的作用,在保持患者营养指标上也具有优势。

  • 标签: 头颈肿瘤 放射疗法 黏膜损伤 蛋白质 营养不良
  • 简介:摘要目的寻找颈椎后纵韧带骨化(OPLL)患者骨化后纵韧带组织与邻近未骨化的后纵韧带组织的差异表达蛋白,探讨OPLL发生的病理生理学机制。方法选取5例2018年1至3月在北京大学第三医院骨科接受颈椎前路减压手术的颈椎OPLL患者,手术中切除的骨化的后纵韧带组织作为OPLL组,手术中切除的临近未骨化的后纵韧带组织作为对照组,采用基于数据非依赖采集的蛋白组学技术筛选差异表达的蛋白,通过文献查询明确差异表达蛋白功能,找到在OPLL发生发展中起作用的蛋白。结果OPLL组与对照组相比,共有9个蛋白有差异表达(差异倍数≥2和P<0.05),在骨化后纵韧带组织中的表达均上调,主要与核苷酸转运与代谢、细胞外结构、翻译、核糖体结构与生物发生、一般功能预测、信号转导机制等相关。文献查询后发现其中5个蛋白的功能可能与OPLL的发生发展相关,包括胶原α-1(Ⅱ)链(COL2A1)、基质Gla蛋白(MGP)及信号肽、CUB和EGF-样结构域包含蛋白1(SCUBE1)、骨调节蛋白(OMD)、成纤维细胞生长因子结合蛋白2(FGFBP2)。结论本研究筛选到的与OPLL相关的差异表达蛋白,对OPLL病理生理学研究及其生物标志物的发现提供了基础。

  • 标签: 骨化,后纵韧带 蛋白质组学 数据非依赖采集 差异表达蛋白
  • 简介:摘要目的研究大鼠孕期慢性应激致子代学习记忆能力损伤相关的差异蛋白及信号通路,探讨可能的作用机制。方法于2019年7至10月,选择80~90日龄SPF级未曾受孕的雌性SD大鼠16只,体重(200±20)g;90~100日龄SPF级雄性SD大鼠12只,体重(220±20)g。适应性饲养1周后随机分组,雌鼠分为对照组和模型组(各8只);雄鼠分为对照交配组(8只)和模型交配组(4只),正常饲养。建立慢性不可预知温和应激(CUMS)模型,连续刺激21 d。应激前1天,第1、7、14、21天对雌鼠进行内眦静脉取血,测定皮质酮含量。利用Morris水迷宫实验检测子鼠的空间学习记忆能力,通过苏木素-伊红和尼氏染色观察子鼠海马组织形态学变化,采用同位素标记相对和绝对定量(iTRAQ)技术对子鼠海马组织进行蛋白组学相关分析。结果与对照组比较,模型组雌鼠血浆皮质酮含量明显增高(F=7.717,P<0.05),模型建立成功。与对照子鼠组比较,模型子鼠组逃避潜伏期延长、游泳平均速度降低、跨越平台次数减少、目标象限游程缩短(P<0.05)。模型子鼠组海马组织结构中细胞形态不规则,神经元数量少,尼氏体分布不均匀、体积小、数量少。子鼠组共筛选出5 065个蛋白,差异蛋白共26个(P<0.05),其中上调和下调分别为19、7个。差异蛋白主要参与23种生物学过程、14种细胞组分和9种分子功能。京都基因和基因组百科全书(KEGG)富集分析显示,共富集到57条通路,其中8条信号通路明显富集(P<0.05),可能参与子代学习记忆能力损伤的信号通路有5条,包括神经活性配体-受体相互作用、cGMP-PKG信号通路、黏附连接、FoxO信号通路和Notch信号通路,主要有酪氨酸蛋白激酶受体、α2A肾上腺素能受体、cGMP依赖性蛋白激酶等差异蛋白可能参与损伤过程。结论孕期慢性应激可能导致子代学习记忆能力损伤,蛋白组学方法所富集的信号通路和筛选的关键差异蛋白可能在损伤过程中起重要作用。

  • 标签: 大鼠 孕期 慢性应激 学习记忆能力 子代 同位素标记相对和绝对定量技术
  • 简介:摘要目的探讨维持性血液透析(MHD)患者发生蛋白能量消耗(PEW)的主要危险因素。方法将166例MHD患者按诊断标准分为PEW组及对照组。采集所有患者的一般临床资料、身体物理指标及理化分析结果,比较两组患者间各指标的差异。采用Logistic分析寻找MHD合并PEW的危险因素。结果PEW组和对照组的血压、蛋白摄入量、是否服用维生素,以及尿酸、肌酐、血钙水平方面的差异有统计学意义(均P<0.05)。多因素Logistic回归分析结果显示,血压、每日睡眠时间、是否服用维生素、BMI,以及肌酐、甲状旁腺素(PTH)是MHD合并PEW的危险因素。结论在临床中,应该更多地注重控制MHD患者的血压、改善其睡眠、补充维生素等。

  • 标签: 血液透析 蛋白质能量消耗 危险因素
  • 简介:摘要目的分析老年血液透析和腹膜透析患者的蛋白能量消耗(PEW)的危险因素,为预防该类患者PEW以及预后改善提供依据。方法根据国际肾脏营养与代谢学会关于PEW诊断标准共纳入上海市第八人民医院肾内科、复旦大学附属中山医院老年科、上海交通大学附属第六人民医院肾内科2016年5月至2020年6月行腹膜透析(PD)和血液透析(HD)治疗未发生PEW的老年患者112例为非PEW组,同期纳入114例发生PEW的患者归为PEW组;比较两组患者一般资料、生化指标、人体学测量、生物电阻抗等指标的差异,采用二分类Logistic回归分析老年HD和PD患者发生PEW的独立危险因素。结果PEW组与非PEW组比较,PEW组平均年龄更高(t=0.951、P<0.001),≥65岁者占比更高(χ2=17.161、P<0.001),体质指数更低(t=6.740、P<0.001),糖尿病肾病发生率更高(χ2=14.176、P<0.001),血液透析率更高(χ2=4.543、P=0.033),透析月龄更长(t=2.306、P=0.023),转铁蛋白、血清前白蛋白、血清总蛋白、血红蛋白水平、总胆固醇、体细胞质量指数更低(t=6.262、13.405、9.507、8.341、4.610、5.599、2.499,均P<0.05),高敏C反应蛋白水平、水分比更高(t=6.380、4.519,均P<0.001),上臂肌围更小(t=5.418、P=0.000)。二分类Logistic回归分析结果显示,≥65岁、透析龄、血清白蛋白、高敏C反应蛋白水平是HD治疗的老年患者PEW发生的独立影响因素(OR=2.762、0.182、2.694、2.980,P=0.023、0.007、0.009、0.027);≥65岁、体质指数、血红蛋白水平是PD治疗的老年患者发生PEW的独立影响因素(OR=2.452、0.671、0.962,P=0.013、0.000、0.000)。结论HD老年患者的PEW发生率较PD者低,临床应根据影响因素进行干预,预防PEW的发生。

  • 标签: 腹膜透析 血液透析 蛋白质能量消耗
  • 简介:摘要2020年1月30日,世界卫生组织宣布由新型冠状病毒(SARS-CoV-2)导致的新型冠状病毒肺炎疫情成为国际关注的突发公共卫生事件。自2002年严重急性呼吸综合征冠状病毒和2012年中东呼吸综合征冠状病毒引起的肺炎大流行以来,SARS-CoV-2的出现并导致新型冠状病毒肺炎的暴发,标志着冠状病毒再次跨越物种屏障并导致在人类中大规模流行。目前对于SARS-CoV-2的防治主要借鉴于对冠状病毒的治疗经验,仅局限在对症支持治疗,并无针对性的有效治疗措施。本文从基因组、蛋白及疫苗方面综述了SARS-CoV-2的研究进展,为防治SARS-CoV-2提供新思路。

  • 标签: 基因组 疫苗 新型冠状病毒 蛋白质
  • 简介:摘要年龄相关性黄斑变性是老年人群中主要的不可逆致盲眼病,其主要致病因素包括年龄增长、遗传变异和生活方式等,但具体致病机制尚未完全阐明。蛋白组学技术作为近年来新兴的研究手段已经逐步应用于眼科领域。目前已经有大量研究对该疾病患者的血液、泪液、房水、玻璃体液、视网膜和脉络膜、玻璃疣以及视网膜色素上皮细胞标本进行了蛋白组学分析来筛选疾病的生物标志物并探究疾病相关机制。这些研究结果不仅能够帮助我们对疾病作出更加准确的诊断,还能在治疗靶点的选择以及预后判断中起到指导作用。

  • 标签: 蛋白质组学 年龄相关性黄斑变性 生物标志物
  • 简介:摘要:随着环保要求的提升,生物催化代替化学催化法生产原料药的应用越来越广,生物催化法涉及的最大问题是总蛋白含量残留的检测。通过配制一定浓度范围内的BSA(牛血清白蛋白)标准溶液,测试其吸光度,绘制以浓度-吸光度标准曲线。将待测样品经预处理后,稀释成一定浓度的溶液,也进行吸光度的测试,换算出以BSA标准牛血清蛋白计算的待测样品中的蛋白总含量。磷酸西格列汀蛋白总含量残留检测方法的定量限、线性、回收率良好。

  • 标签: 磷酸西格列汀 水合物 蛋白质含量 检测分析
  • 简介:摘要目的探讨基于串联质谱标签(Tandem Mass Tags,TMT)的蛋白组学技术鉴定和分析先天性胫骨假关节(congenital pseudarthrosis of the tibia,CPT)病变骨膜组织中的差异表达蛋白。方法取CPT伴神经纤维瘤病1型(neurofibromatosis type 1,NF1)患者(NF1-CPT组)、CPT不伴NF1患者(非NF1-CPT组)和开放性胫骨骨折患者(对照组)的胫骨骨膜标本。采用基于TMT的蛋白组学技术,对各组胫骨病变骨膜组织中差异表达的蛋白进行鉴定和分析。设定倍数变化≥1.5或≤0.66且P值<0.05作为筛选差异表达蛋白的阈值。以在线工具DAVID和STRING生物信息学资源用于生成差异蛋白的GO注释、KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路富集和蛋白-蛋白相互作用(protein-protein interaction,PPI)。结果NF1-CPT组中有347种差异表达的蛋白,其中212种上调、135种下调;非NF1-CPT组中有467种差异蛋白,其中281种上调、186种下调。NF1-CPT组与非NF1-CPT组共有差异蛋白231种,除HLA-DRB1(在NF1-CPT组中上调而在非NF1-CPT组中下调)外,其余230种差异蛋白在两组中表达趋势相同(上调117种、下调113种)。有116种蛋白仅在NF1-CPT组中发生改变(上调94种、下调22种),236种蛋白仅在非NF1-CPT组中改变(上调164种、下调72种)。与非NF1-CPT相比,NF1-CPT组的47种蛋白变化1.5倍(P<0.05)。结论CPT病变骨膜组织与正常胫骨骨膜组织蛋白表达存在差异,NF1-CPT与非NF1-CPT的病变骨膜蛋白表达也存在差异,有助于对CPT发病机制的理解。

  • 标签: 胫骨 假关节 骨膜 质谱分析法
  • 简介:摘要目的应用血浆蛋白组学方法建立诊断模型,探索诊断和识别肾移植临床几乎耐受的新方法。方法收集2011年11月至2012年11月来自华中科技大学同济医学院附属同济医院等多家医疗机构的43例受试者血浆样本。分为临床几乎耐受组(18例)、排斥反应组(12例)以及健康对照组(13例)。应用表面增强激光解吸离子化飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术对血浆样本进行蛋白组学分析。使用Biomarker Wizard及Biomarker Patterns软件筛选差异质谱峰,建立诊断模型。通过检索SWISS-PROT及TrEMBL数据库,对模型节点质谱峰进行鉴定。结果获得差异蛋白谱峰21个(P<0.05)。建立由M2 565.15、M1 966.28、M6 674.78、M1 103.27,M1 716.69、M1 966.28五个质谱峰构成的诊断模型。模型诊断临床几乎耐受的敏感性为83.3%、特异性为92.0%、ROC曲线下面积为0.951。模型节点质谱峰的生物信息学鉴定结果为:B型利钠肽(ANFB)、黑色素浓集激素(MCH)、三叶因子1(TFF1)、强啡肽原(PDYN)、蛋白酶体激活亚3(PSME3)。结论通过血浆蛋白组学方法建立诊断模型能够有效识别肾移植临床几乎耐受者。

  • 标签: 肾移植 免疫耐受 蛋白质组学