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  • 作者: 王成玲 王嘉正 刘志国 徐帅 朱雄 李欢 王晓霞 邱小彤 魏孔娇 范仕弘 韩李超 李振军
  • 学科: 医药卫生 >
  • 创建时间:2021-10-10
  • 出处:《中华流行病学杂志》 2021年第09期
  • 机构:西藏大学医学院,拉萨 850000,山东第一医科大学第一附属医院(山东省千佛山医院)检验医学科,山东省医药卫生临床检验诊断学重点实验室,济南 250000,中国疾病预防控制中心传染病预防控制所,传染病预防控制国家重点实验室,北京 102206,海南省三亚市人民医院检验科,中心实验室 572000,西藏大学医学院,拉萨 850000 中国疾病预防控制中心传染病预防控制所,传染病预防控制国家重点实验室,北京 102206
  • 简介:摘要目的建立纹带棒状杆菌的多位序列(MLST)方法,探讨临床分离纹带棒状杆菌的种群结构和遗传进化关系。方法筛选出7个管家基因(gyrA、gyrB、hsp65、sodA、secA1、rpoB、16S rRNA),设计引物并进行PCR扩增和测序测序所得序列通过SeqMan 软件进行拼接。采用DnaSP 5.10.01软件、Splits tree 4.14.2软件对管家基因的多样性及基因重组特征进行评价;采用MEGA 7.0.14软件基于序列型别(ST)采用M-L法构建系统发育树,采用BioNumerics软件基于ST特征值构建最小生成树,并用eBURST软件分析ST间遗传进化关系。结果所选的7个位点在所有试验菌株中均获得了预期的扩增产物;Splits tree表明所有纹带棒状杆菌的聚类一致,提示基因重组是推动纹带棒状杆菌进化的潜在动力;MLST将344株纹带棒状杆菌分成72个STs,85.7%的菌株形成克隆复合体(CC)结构,CC19形成了优势克隆复合体,但包含菌株数最多的ST为该克隆复合体中的ST16。ST具有一定的地域聚集性且与分离年份具有一定的相关性。结论我国纹带棒状杆菌呈现高度的遗传多样性,CC19为优势克隆复合体。本研究建立的MLST方案可用于纹带棒状杆菌的,但尚需优化改进。

  • 标签: 纹带棒状杆菌 多位点序列分型 管家基因 序列型
  • 简介:目的分析白假丝酵母菌多位序列(MLST)与标本来源、药物敏感性之间的关系,探讨菌株间的亲缘关系及其分子流行病学特征。方法收集2015年4—5月某院新生儿科病房分离的白假丝酵母菌,采用试剂盒对菌株进行体外药物敏感性测试,并采用MLST方法对菌株进行,分析菌株间的同源性及分子流行病学特征。结果共分离15株白假丝酵母菌,来自4例患儿和1名医务人员,15株白假丝酵母菌经MLST获得3个序列(ST),其中13株为ST1997,另外2株分别为ST1359和ST1933。经eBURST软件对ST进行聚类分析,ST1997菌株属于Group13,ST1359菌株属于Group1,ST1933菌株属于Group20。同一患者外周血和外周静脉导管分离的白假丝酵母菌属于同一克隆株。结论新生儿科病房存在白假丝酵母菌血流感染的暴发,应积极制定相应的预防控制措施,加强对新生儿科病房的医院感染管理。

  • 标签: 白假丝酵母菌 血流感染 多位点序列分型 新生儿科 暴发
  • 简介:摘要目的了解四川省人间布鲁氏菌病(简称布病)分离菌株的情况。方法66株菌株分离自2014 - 2020年四川省人间布病确诊病例,分别应用BCSP31-PCR、AMOS-PCR方法对分离菌株进行属、生物鉴定;选用多位序列(MLST)-9方法对分离菌株进行实验,通过在线全球MLST数据库对比序列(ST);并通过BioNumerics 7.6软件,使用最小生成树(MST)对新发现和已知ST序列进行聚类分析。结果2014 - 2020年四川省自人间布病确诊病例分离的66株菌株均为布鲁氏菌属,其中羊种布鲁氏菌65株,牛种布鲁氏菌1株。存在3个已知ST(ST-8、ST-39、ST-2)和1个新发现型别(ST-101)。其中,ST-8为四川省主要ST(90.91%,60/66),另有4株羊种布鲁氏菌为ST-39,1株牛种布鲁氏菌为ST-2。新发现型别ST-101于2019年离自乐山市,属羊种布鲁氏菌克隆群,与ST-8进化关系紧密。结论四川省布鲁氏菌主要流行株为羊种布鲁氏菌,主要基因为ST-8,同时存在少量ST-39、ST-101、ST-2。

  • 标签: 布鲁氏菌 多位点序列分型 分子分型
  • 简介:摘要目的分析并焦磷酸测序法与Sanger测序法检测在丙型肝炎病毒基因中的应用情况。方法选取2018年3月——2018年11月期间100例丙型肝炎患者,收集其血浆标本,分成相等的2份,其中1份采用焦磷酸测序法进行检测,另外1份采用Sanger测序法检测,对2种检测方法在丙型肝炎病毒基因结果进行对比。结果通过焦磷酸测序法和Sanger测序法对HCV-RNA进行基因,100例标本共有93例结果一致,其余7例结果不一致,一致率达到93.0%;焦磷酸测序法和Sanger测序法在高病毒载量检出率对比上无明显差异(P>0.05);焦磷酸测序法和Sanger测序法在低病毒载量检出率对比上存在明显差异性(P<0.05)。结论焦磷酸测序法对丙型肝炎患者开展病毒基因,检测结果可靠、准确,与Sanger测序法相比,焦磷酸测序法敏感度更高。

  • 标签: 焦磷酸测序 Sanger测序 丙型肝炎 病毒基因分型
  • 简介:目的:建立并改良磁珠提取基因DNA的方法,以应用于HLA常规测序。方法:使用磁珠法自动提取系统从全血中提取基因组DNA,利用DNA定量仪测定DNA浓度与纯度,利用测序仪对PCR扩增产物进行测序及相关的分析软件进行HLA结果分析。比较改良前后DNA浓度与纯度、HLA结果成功率、信噪比及测序胶图的反应格局。结果:改良后96份DNA浓度的均一性、纯度均优于改良前;32份HLA结果中HLA-A、B位成功率改良后高于改良前,差异有统计学意义(P〈0.01);改良后32人份HLA-B第二外显子信噪比(N/S)合格率均高于改良前,差异有统计学意义(P〈0.01);改良后32份胶图反应格局均优于改良前。结论:改良磁珠提取DNA法能稳定、可靠地应用于HLA测序,具有快速、高通量化的特点和广泛的应用前景。

  • 标签: 脱氧核糖核酸 标本 基因分型 测序分型
  • 简介:摘要目的探讨1例ABO血型血清学正、反定型不符的血样标本的分子遗传学基础。方法采用试管法对此例血样进行ABO血型正、反定型,应用直接测序及单倍测序的方法确定其基因。结果此例样本血型血清学结果显示,其正定型为AwB,反定型为B;直接测序及单倍测序最终结果显示,其中一条等位基因为O01,另一条等位基因与A101标准序列相比,存在c.297A>G、c.657C>T、c.796C>A、c.803G>C及c.930G>A碱基突变。结论经基因测序证实,此例血清学定型困难的样本基因为O01/B(A)new,此突变类型的B(A)既往未见报道。

  • 标签: ABO亚型 B(A)型 血型血清学 基因测序 分子生物学
  • 简介:“分类游戏”是一堂通过游戏形式培养分类能力的课。许多学生认为分类仅是一种游戏的方法,而不懂得它是人们认识周围物体的手段之一,不能认识理解到分类的意义和作用。怎样才能让学生认识到这一呢?靠列举许多事例说明分类的意义和作用,小学生往往不能理解接受,因此,可在学生的分类练习中,增加一个内容:将自

  • 标签: 意义和作用 分类方法 多事例 游戏 认识理解 小学生
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  • 简介:日子一叶一叶地从生命之树飘落,不经意间,才蓦然发现岁月已给它套上了十三圈年轮,同时也围住了一个青春少年的心。五天与家人见一面的生活已经习惯,只是妈妈还像以前那样整天没完没了地问:“作业都写完了吧?

  • 标签: 中学 语文教学 作文 《21点40分的闹铃》
  • 简介:她来这儿是想早一看到他从竖井里上到地面上来,她男人在坡下的煤窑里工作,在日日提心吊胆的张望中

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  • 简介:我时常留意到报章杂志上的钟表广告,发现大部分的钟表都指在一个接近的时间上,10845秒是最普遍的,也有1090秒的,也有101030秒的。不管指的时间是多少,时针和分针一定是呈v字形。

  • 标签: 报章杂志 钟表 时间
  • 简介:爬上一个土冈,急转一个弯儿,穿过一条窄窄的土街,在一个突然出现的开阔地上,半截车就像一个终于找到自家圈棚的牲口,抖了抖身子,熟练地来了个一百八十度转弯,之后,喘息着停了下来。"嘿这老哥,像上自个家,倍儿熟。"孔宪林并非在夸司机,而是下意识在向身边的小高强调一个事实:这地场他们太熟了,搞了四年生态移民,他和司机来了六次,每一次,都是在这家门口停车。也是怪了,这户人家仿佛早就知道会有这么一天似的,把门口山泉

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  • 简介:2011年11月8日中午12半,阳光照在刚满18周岁的丁某身上,丁某在父亲和法律援助中心指定律师的陪同下,来到大连市中山区法院少年法庭。事情要从7个月前的一天晚上说起。刘某酒后与丁某工作的比萨店店长贾某发生口角。正准备下班的丁某闻讯赶来,与其他4名店员一起对刘某进行殴打,致刘某两枚牙齿脱落,后经鉴定属轻伤。

  • 标签: 感化 起诉 法律援助中心 少年法庭 中山区 大连市
  • 简介:写数要从高位起,哪位是几就写几。哪一位上无单位,用“0”顶位要牢记。

  • 标签: 写法 位数 写数
  • 简介:<正>沃尔特是麻省理工大学的教授,一年多以来,他每天回家都要乘坐下午522进站的那列火车到林肯车站。每天,沃尔特总会在月台上遇见一个女人,他俩同一站等车也同一站下车,每次都会朝对方点点头,但从未说过一句话。沃尔特注意到,这个女

  • 标签: 沃尔特 一个女人 梅尔 麻省理工大学 摇摇头 我不知道
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  • 简介:"李小碗",朱艳阳说话时矮胖的身体倚在卫生间的门框上,眼睛瞧着背对着她、正在镜子前化妆的小碗,"有件事想跟你说说。"这是七月的早晨,挤压在玻璃窗上的阳光从窗纱没合严的缝隙钻进房间,闪着晃眼的白亮,这说明外面的天气已经炙热得不得了。但房间是凉爽的,即使在小小的卫生间里,抹在脸上的粉底也是服帖的。如果不是朱艳阳胖胖的身体堵在门口,说了句有件事说说的话,如果不是小碗从镜子里看见朱艳阳郁郁的神情,也不会突然有了闷和出汗的感觉。

  • 标签: 约会 卫生间 身体 镜子 房间 门框