简介：摘要目的探讨幽门螺旋杆菌（HP）细胞毒素相关基因A（HP-CagA）、HP分离株空泡形成毒素基因A（HP-VacA）与胃癌发生及临床病理因素的关系。方法选取安徽医科大学附属宿州医院2018年1月至2020年1月胃癌患者88例作为观察组，另选择同期良性胃部病变患者80例作为良性对照组，健康体检者80例作为健康对照组。比较三组临床资料、HP-CagA、HP-VacA阳性表达率，分析胃癌发生的危险因素，评价HP-CagA、HP-VacA与胃癌临床病理因素的关系。结果有胃癌家族史、高盐饮食、喜好烫食、胃蛋白酶原（PG）Ⅰ/PGⅡ降低、合并脂肪肝及三酰甘油（TG）、总胆固醇（TC）、低密度脂蛋白胆固醇（LDL-C）水平升高、吸烟、情绪抑郁是胃癌发生的危险因素（P<0.05）。观察组HP-CagA、HP-VacA阳性表达率高于良性对照组、健康对照组[82.93%（73/88）比62.50%（50/80）和26.25%（21/80）、30.68%（27/88）比7.50%（6/80）和0]（P<0.05）。HP-CagA、HP-VacA与胃癌患者年龄、病理类型、分化程度存在相关性，差异有统计学意义（P<0.05）；Kaplan-Meier曲线分析结果显示，HP-CagA、HP-VacA阳性患者1年生存率低于阴性患者（P<0.05）。结论HP-CagA、HP-VacA阳性HP感染与胃癌关系密切，加强对HP-CagA、HP-VacA阳性的HP感染患者的治疗，对切断胃癌早期发生环节、改善预后具有重要临床价值及社会意义。

简介：摘要目的探讨幽门螺旋杆菌（HP）细胞毒素相关基因A（HP-CagA）、HP分离株空泡形成毒素基因A（HP-VacA）与胃癌发生及临床病理因素的关系。方法选取安徽医科大学附属宿州医院2018年1月至2020年1月胃癌患者88例作为观察组，另选择同期良性胃部病变患者80例作为良性对照组，健康体检者80例作为健康对照组。比较三组临床资料、HP-CagA、HP-VacA阳性表达率，分析胃癌发生的危险因素，评价HP-CagA、HP-VacA与胃癌临床病理因素的关系。结果有胃癌家族史、高盐饮食、喜好烫食、胃蛋白酶原（PG）Ⅰ/PGⅡ降低、合并脂肪肝及三酰甘油（TG）、总胆固醇（TC）、低密度脂蛋白胆固醇（LDL-C）水平升高、吸烟、情绪抑郁是胃癌发生的危险因素（P<0.05）。观察组HP-CagA、HP-VacA阳性表达率高于良性对照组、健康对照组[82.93%（73/88）比62.50%（50/80）和26.25%（21/80）、30.68%（27/88）比7.50%（6/80）和0]（P<0.05）。HP-CagA、HP-VacA与胃癌患者年龄、病理类型、分化程度存在相关性，差异有统计学意义（P<0.05）；Kaplan-Meier曲线分析结果显示，HP-CagA、HP-VacA阳性患者1年生存率低于阴性患者（P<0.05）。结论HP-CagA、HP-VacA阳性HP感染与胃癌关系密切，加强对HP-CagA、HP-VacA阳性的HP感染患者的治疗，对切断胃癌早期发生环节、改善预后具有重要临床价值及社会意义。

简介：目的对2006—2009年上海市Staphylococcusaureus（S.aureus）食品分离株进行肠毒素基因检测和基因分型研究,以了解肠毒素基因的分布规律及S.aureus的流行特点。方法利用PCR方法检测食品中金黄色葡萄球菌肠毒素基因,包括5种传统肠毒素基因（SEA-SEE）和4种新型肠毒素基因（SEG-SEJ）;利用脉冲场凝胶电泳法对49株食品分离株进行基因分型。结果本研究发现49株食品分离株中有19株含有肠毒素基因,16株含有传统肠毒素SEA和SEC,且SEC占93.8%,并检测到新型肠毒素SEG、SEI、SEJ和SEH。PFGE法基因分型显示5株菌不能被分型,其余44株可分为28个基因型,表现为基因型的多样性,且分离自不同时间的菌株具有相同的带型。结论应加强食品中S.aureus的监测分析,为其引起的食物中毒的预防和控制提供科学依据。

简介：目的了解皮肤软组织及创伤感染的金葡菌携带的杀白细胞素（Panton-ValentineLeukocidin，PVL）基因、表皮剥脱性毒素（ETs）基因、中毒性休克综合征毒素-1（TSST-1）的州基因的特点。方法对连续收集的皮肤软组织感染中分离的90株金葡菌，采用多重PCR同时检测金葡菌特异性16SrRNA基因、mecA基因、PVL基因，采用PCR法检测TSST-1及EtsA、B基因。结果金葡菌mecA基因阳性47株（占金葡菌52．2％）为耐甲氧西林金葡菌（MRSA）。有1株MRSA的EtsB基因阳性，1株MRSA的TSST-1阳性，有7株金葡菌携带PVL基因，其中3株为mecA基因阳性株（MRSA）。结论金葡菌可分泌多种毒索，携带PVL毒素的金葡菌常可以引起严重的侵袭性感染，尤其对产毒的MRSA感染引起足够的重视，是防控的重点。

简介：目的分离汉坦病毒并采用分子生物学方法进行基因鉴定.方法组织细胞培养法和RT-PCR法.结果在黑线姬鼠体内分离出一株汉坦病毒,分别用HTN型和SEO型的特异引物对其进行基因扩增,同时以76-118株和L99株作对照,结果分离株经HTN型引物扩增出一条明亮带并同76-118株结果一致.结论分离株经基因鉴定为HTN型病毒.

简介：摘要目的了解青海省流行风疹病毒(Rubella virus，RV)基因型及基因特征。方法2010年和2019年分别采集2个市州疑似风疹病例的咽拭子标本，经核酸检测和病毒分离后，扩增并测定阳性病毒分离株基因分型靶基因序列，即E1基因的739个核苷酸片段，然后与世界卫生组织(World Health Organization, WHO)推荐的13个基因型的32株参考株序列进行比对以确定基因型别，同时与我国其他省份流行RV株序列进行基因亲缘性关系分析。结果本研究分离获得4株RV病毒株，经基因亲缘性关系分析显示，这些病毒株分属于1E-Cluster A基因亚型和2B-Cluster C基因亚型，与我国同期其他省份RV流行趋势基本一致。青海省4株病毒株在氨基酸水平高度保守，但也存在地区特异性的突变位点。结论本研究为青海省风疹防控策略的制定提供了一定的实验室数据。

简介：由于广西一些养殖场频繁发生以母猪流产、死胎、木乃伊、仔猪呼吸道症状等为特征的流行性传染病，怀疑为猪繁殖与呼吸综合征病毒（PRRSV）感染所致．广西大学动物科学技术学院黄伟坚等从病猪中采集材料，经RT—PCR检测为硝、性后，接种于Marc-145细胞，经过六代盲传，发现典型的细胞病理变化（CPE），经鉴定为PRRSV，命名为GXA株，其毒价为105．33TCID50／mL．参考VR-2332和CH-la株基因序列，设计了3对特异性引物。分别对GXA株的E、M、N基因同时进行了RT—PCR扩增、克隆和测序．应用DNAstar生物学软件拼接得到GX丸株的E，M和N3个基因片段共长为1473bp．同源性分析表明。GXA株与VR-233、MLV和RJ-4的同源性为99.7％-100％，而与欧洲型代袭株LV的同源性只有66．4％．表明GXA与VR-233、MLV和RJ-4株亲缘关系比较密切；与欧洲代表株LV亲缘关系较最远。属于美洲型毒株，有可能来源于疫苗株．

简介：目的了解结核分枝杆菌临床分离株相关基因型的分布情况，并分析北京家族菌株与耐药的相关性。方法收集浙江省结核分枝杆菌临床分离株，常规罗氏培养基培养，应用Spoligotyping进行基因分型研究，聚类分析采用BioNumerics软件，统计学分析采用卡方检验。结果70株浙江省结核分枝杆菌临床分离株可分为2个基因群，即北京家族（Beijingfamily）和非北京家族（Non-Beijingfamily），分别占70％（49／70）和30％（21／70），18种基因型，其中12株为独特类型，剩余58株分为6簇。北京家族菌株中，89．8％（44／49）为典型北京家族（typicalBeijingfamily），非北京家族菌株表现为高度的基因多态性，可分为13个基因型，9株为独特的基因型。北京家族菌株中表现为全敏感者71．4％（35／49），表现为耐药者为28．6％（14／49）；而非北京家族菌株中表现为全敏感者为66．7％，表现为耐药者为33．3％，经卡方检验，两者问的差异无统计学意义（X^2=0．158，P〉0．05）。结论北京家族菌株为浙江的流行优势菌株。北京基因犁与耐药无明显相关性。

简介：摘要目的从福建省2016年输入性黄热病病例标本中分离黄热病毒(YFV)并分析其生物学特征。方法将16份黄热病毒核酸阳性血清、尿液、唾液样品分别接种C6/36细胞，YFV实时荧光RT-PCR法鉴定检测培养物中特异性病毒核酸，通过高通量测序获得病毒全基因序列并绘制系统进化树。结果从1例患者发病后3天的血清样品分离到一株病毒，通过YFV实时荧光RT-PCR鉴定为YFV病毒；BLAST分析显示该毒株全基因序列与2016年我国首例输入性黄热病病例中分离得到的毒株CNYF01R/2016(KX268355)序列完全一致；系统进化树显示该毒株与1971年安哥拉流行株Angola71分属同一进化树分支，与疫苗株17D vaccine strain(X03700)存在明显的差异，表明本研究分离到的YFV毒株是属于安哥拉型YFV野毒株。结论福建省成功从2016年输入性黄热病病例样品分离到一株安哥拉型YFV毒株。

简介：目的：了解手足口病暴发高峰时段临床患者的咽拭子标本中分离出的人肠道病毒71型（EV71）和柯萨奇病毒A16型（CA16）的基因型,为手足口病的防治提供依据。方法：将手足口病高峰时期收集的咽拭子标本109份进行病毒分离鉴定,对分离到的4株EV71型病毒株的227bpVP3-VP1基因序列和3株CA16株的736bpVP1-2A基因序列进行基因测序,并进行系统进化分析。结果：检测到的4株EV71分离毒株均属C4a亚群,3株CA16分离毒株均属于B1b亚群。结论：2013年黄梅县手足口病暴发高峰时段的EV71流行株为C4a亚群,CA16流行株为B1b亚群。

简介：摘要目的研究耐药铜绿假单胞菌临床分离株β-内酰胺酶基因的携带状况，及其对β-内酰胺类抗菌药物耐药性的作用。方法收集2018年3月至2019年5月浙江省杭州市和宁波市两个地区6所医院住院患者首次发现感染时临床分离的98株耐药铜绿假单胞菌，其中宁波地区39株，杭州地区59株。所有菌株采用琼脂稀释法对14种抗菌药物进行敏感性试验，采用聚合酶链反应(PCR)及序列分析的方法分析A、B、C、D四类共39种β-内酰胺酶基因携带情况，阳性基因测序后作BLAST比对。采用SPSS 24.0软件对数据进行分析。结果98株耐药铜绿假单胞菌中，多重耐药(MDR)菌占81.63%，广泛耐药(XDR)菌占12.25%。所有菌株对多黏菌素B敏感，对亚胺培南和美罗培南的耐药率分别为94.90%和82.65%，宁波地区分离株对阿米卡星、妥布霉素和庆大霉素的耐药率高于杭州地区分离株(χ2＝31.962、22.440和29.671，P<0.01)，杭州地区分离株对氨曲南和亚胺培南的耐药率均高于宁波地区分离株(χ2＝4.181和5.543，P<0.05)。共检出7种β-内酰胺酶基因，其中PDC和OXA-50群的检出率最高，均为100.00%，TEM、GES和OXA-10群只在宁波地区分离株中检出，KPC只在杭州地区分离株中检出。β-内酰胺酶基因阳性模式有7种，所有菌株均携带PDC和OXA-50群，55株(56.12%)只检出PDC和OXA-50群。检出PDC、OXA-50群基因为国内首次报道。结论携带PDC和OXA-50群基因是导致铜绿假单胞菌对β-内酰胺类抗菌药物耐药的重要原因。

简介：为比较斑点热黑龙江立克次体054株与从病人血液分离的H-5株，采用微量免疫荧光方法和聚合酶链反应／限制性片段长度多态性分析技术。结果表明，二者间的血清反应模式一致，表明有相同的抗原结构。同时，用立克次体190kD抗原基因设计的一对引物扩增两株立克次体DNA后，用PstⅠ消化经PAGE，其电泳图谱的酶切带的数量和迁移完全一致，说明基因组相同。结论：从抗原性和基因型两方面证实斑点热054株与H-5株二者一致。

简介：摘要目的对2018年青海省一例流感样病例中分离得到的柯萨奇病毒B组5型(coxsackievirus B5, CV-B5)分离株QH/CVB5/2018进行全基因组测序及遗传特性分析。方法采用二代高通量测序对QH/CVB5/2 018分离株进行全基因组序列测定，利用SPAdes、DNAStar 7.1、MEGA 6.0、Simplot 3.5.1以及RDP4软件对病毒进行全基因组序列拼接以及遗传进化、基因重组和氨基酸突变分析。结果QH/CVB5/2018全基因组核苷酸序列长度为7 369 bp，编码含2 185个氨基酸残基的多聚蛋白。基于基因组的序列同源性和系统进化分析，显示QH/CVB5/2018与417/JS/CHN/2013同源性最高，核苷酸序列一致性为96.9%(氨基酸序列同源性为99.5%)；基于VP1序列的系统进化分析显示QH/CVB5/2018处于CVB5-C基因型；重组分析显示QH/CVB5/2018可能为CHN_SH/CVB5/2008和CHN_YN-CVB3/2009的重组株，重组发生在6 114～7 199 bp；氨基酸突变位点分析显示，相比于其他CVB5毒株，139S、864S、1086R、1693C、1814D和1819N为QH/CVB5/2018特异突变位点。结论QH/CVB5/2018分离株属于柯萨奇病毒B组5型的C组基因型，可能为重组株。

简介：设计合成两对覆盖PCV2基因组奎长的引物，对PCV2分离株S2、P11、L进行全基因测序。将所测序列与GenBank上已公布的PCV2毒株序列进行同泺性比较，并绘制系统发育进化树。结果显示。所测毒株与其它地城的24株PCV2分离株的基因组序列同源性很高。3个分离株之问的奎基因核苷酸同源性在95.4％-99.3％。序列分析表明欧洲分离株和美洲分离株分别构成PCV2的两个夫的分支：欧洲系和美洲系。S2、P11属于欧洲系，L属于美洲系。

简介：摘要目的分析基因芯片法检测耐多药结核分离株的临床意义。方法采用分层抽样检测方法从上海同济大学附属上海市肺科医院、北京胸科医院、广州市胸科医院的临床菌株库中的敏感组和耐药组，随机抽取耐药株利福平400株，异烟肼363株．耐多342株，利福平／异烟胼双敏感180株。用基因芯片法检测基因的511、513、516、526、531、533位点、katG的315位点以及inhA的-15位点的耐药突变。计算出基因中的芯片法的特异度、敏感度以及符合率。还要对核酸扩增产物进行测序，通过验证基因芯片对核酸序列检测的准确性。结果在利福平基因芯片检测中，突变频率最高的位点是531，突变率为63.4％。在katG／inhA突变菌株中，基因芯片检测为ktG315单突变的为76．3％。与测序结果基本一致，有4例菌株中不相符。结论基因芯片法能够检测结核临床分离株利福平和异烟肼的耐药性．可以在临床诊断中应用。

简介：摘要目的分析临床分离菌株的生物膜形成能力，检测其相关基因。方法以临床分离的金黄色葡萄球菌87株、鲍曼不动杆菌48株为研究对象，测定其生物膜形成能力，利用PCR检测其相关基因。结果87株金黄色葡萄球菌生物膜形成率100%，但具体菌株形成能力存在差别；48株鲍曼不动杆菌生物膜形成率68.8%，均具有较强的形成能力。87株金黄色葡萄球菌中，存在ica基因7占85.1%，存在sarA基因占100.0%；48株鲍曼不动杆菌中，存在abaⅠ基因占79.2%。结论临床分离出的金黄色葡萄球菌与鲍曼不动杆菌均具有一定的生物膜形成能力，且分别与ica基因、sarA基因及abaⅠ基因密切相关，临床治疗时有必要做出干预，以提升治疗效果。

简介：摘要目的分析赣州市流行的麻疹病毒的基因特征。方法采集麻疹疑似病例咽拭子标本，应用荧光RT-PCR方法检测麻疹病毒核酸；用Vero/SLAM细胞对麻疹病毒核酸检测阳性标本进行病毒分离培养，并将麻疹病毒分离株进行核蛋白N基因和血凝素蛋白H基因扩增、测序；运用DNAStar、Bioedit和MEGA 5.0等分子生物学软件对N基因和H基因进行序列特征分析。结果978份疑似麻疹病例咽拭子标本中，检出47份麻疹病毒核酸阳性，阳性率为4.81%，分离到25株毒株；扩增的13株毒株均为H1基因型的H1a亚型，与H1a基因型代表株（CHN/93/2）N基因核苷酸、氨基酸的同源性分别98.0%~98.5%、97.9%~99.6%，与H基因核苷酸、氨基酸的同源性分别为98.2%~98.9%、97.4%~98.5%。各分离株N基因与中国疫苗株Shanghai-191之间核苷酸、氨基酸的同源性分别为93.7%~95.2%、95.2%~96.8%；H基因与Shanghai-191之间核苷酸、氨基酸的同源性为94.2%~96.5%、94.2%~96.6%。结论2013—2016年赣州市麻疹病毒流行株为H1a亚型，疫苗株对现流行株有保护性，但仍需持续监测麻疹病毒基因的变异情况。

简介：摘要目的了解2014年湖南省C亚属人腺病毒(HAdV-C)分离株的基因特征。方法2014年从湖南省长沙市严重急性呼吸道感染儿童病例咽拭子标本中分离到一株HAdV-C病毒株(Hunan2014-s024)，分段扩增目的基因片段，拼接后获得全基因组序列，同时下载GenBank数据库中国内外流行的HAdV-C代表株全基因组序列构建HAdV-C数据库，使用生物信息学软件进行全基因组序列特征分析。结果Hunan2014-s024株与2006年山西省健康儿童粪便标本中分离到的HAdV-C病毒株(MK041244-CHN-2006)的同源性最高，并以该病毒基因组元件为主要骨架，在penton base基因上交换了2012年湖南省急性下呼吸道感染患儿分离株(MK041246-CHN-2012)的基因片段。结论2014湖南株(Hunan2014-s024)为2006年山西省病毒株(MK041244-CHN-2006)与2012年湖南株(MK041246-CHN-2012)的重组病毒，由于其致病性可能发生了改变，因此有必要加强HAdV-C的分子流行病学监测，以了解其潜在疾病负担和公共卫生意义。

简介：摘要从657例泻便标本分离出弧菌属细菌73株，分离率为11.1％，以致伤弧菌(24株32.8%)、副溶血弧菌(19株26%)和河弧菌(9株9.6%)为主。0-1群霍乱弧菌9株(5.5%)经血清学鉴定均为小川型，患者呈散在发病。

简介：摘要目的了解云南省蝙蝠体表寄生蛛蝇中肯科伊病毒(Kaeng Khoi virus，KKV)的感染情况。方法2014年在保山市和2017年在瑞丽市采集蝙蝠体表寄生蛛蝇标本并进行鉴定，应用细胞组织培养法进行病毒分离，对阳性分离物进行序列扩增测序，对病毒全基因序列进行同源性和系统进化分析。结果用蛛蝇标本研磨上清液接种BHK-21细胞，从瑞丽市和保山市蛛蝇标本分离到3株阳性分离物(WDBC1704、WDBC1710和BSBC1406)，均能使BHK-21细胞出现圆缩、脱落的细胞病变。经RT-PCR和高通量测序扩增后，获得3株阳性分离物的全基因组序列。系统进化分析显示3株阳性分离物的S、M、L基因均与泰国分离的KKV原型株PSC-19在同一进化支。本次分离的3株KKV与云南省既往分离株WDBC1403亲缘关系最近，其中BSBC1406株又形成一个独立的小分支。序列对比显示3株分离株之间在M基因上存在较大差异，BSBC1406与其他2株相似度仅为78.0%~78.1%，开放阅读框区中Gc蛋白的氨基酸相似度均为85.3%。结论从云南蝙蝠寄生蛛蝇中新分离的3株KKV与原型株有较大差异，特别是BSBC1406株与其他分离株存在一定差异，可能已发生了变异，应加强云南省媒介昆虫携带KKV的监测及其与人类疾病关系的研究。