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  • 简介:摘要采用PCR-DGGE技术对中华成虫肠道细菌多样进行研究,共检测到12条16SrRNA基因序列。在系统发育地位上主要归入3个细菌纲丙型变形纲、黄杆菌纲和放线纲,其中有59.8%的细菌属于丙型变形纲,占绝对优势,成为中肠主要细菌群落。从而显示出中华成虫肠道细菌的复杂多样

  • 标签: 中华按蚊,PCR-DGGE,肠道菌群,多样性
  • 简介:目的探讨溃疡结肠炎对大鼠胃肠道微生物多样影响,为治疗溃疡结肠炎提供可靠依据。方法采用2,4-二硝基氯苯乙酸复合法对健康SD大鼠进行溃疡结肠炎造模;运用CTAB—SDS法提取肠道微生物总DNA,通过PCRDGGE分析溃疡结肠炎大鼠之间胃肠道微生物多样差异。结果溃疡组、用药组和正常组大鼠的消化道中,不同部位细菌Shannon~数变化较大(1.64-3.05),结肠中Shannon指数最高,其次是胃,小肠最低。在结肠,不同组的细菌多样Shannon指数变化幅度不大,以用药组最高(3.05),其次溃疡组(2.98),正常组2.95,说明大鼠结肠在健康状态下细菌多样最低,结肠炎后会发生一定的变化。此外,发现病变后的大鼠胃中拟杆菌属、梭属、普氏属、紫单胞属等厌氧细菌增加,病变后的结肠中乳杆菌属细菌明显减少,紫单胞属和梭属细菌明显增加;病变后小肠中部分乳杆菌种类消失,同时梭属和紫单胞属等不常见的出现。结论溃疡结肠炎大鼠胃、小肠、结肠中有益菌乳杆菌明显减少,普氏属、紫单胞属、梭属等明显增多,这些属可作为条件致病菌引起内源性感染,可能是造成溃疡结肠炎的重要原因。

  • 标签: 溃疡性结肠炎 微生物多样性 聚合酶链反应-变性梯度凝胶电泳(PCR-DGGE) 2 4-二硝基氯苯乙酸复合法
  • 作者: 焦晨
  • 学科: 经济管理 > 企业管理
  • 创建时间:2014-07-17
  • 出处:《价值工程》 2014年第7期
  • 机构:ApplicationofPCR-DGGEMethodintheStudyofMicrobialDiversityinWater焦晨淤JIAOChen曰夏甜于XIATian(淤内蒙古化工职业学院材料工程系,呼和浩特010070;于内蒙古化工职业学院思政理论教研部,呼和浩特010070)(淤DepartmentofMaterialsEngineering,InnerMongoliaVocationalCollegeofChemicalEngineering,Hohhot010070,China;于IdeologicalandPoliticalTheoryTeachingandResearchDepartment,InnerMongoliaVocationalCollegeofChemicalEngineering,Hohhot010070,China)
  • 简介:目的:应用PCR-变性梯度凝胶电泳技术(denaturinggradientgelelectrophoresis,DGGE)技术检测早期儿童龋治疗前后唾液中微生物多样的变化。方法:选取北京大学燕东幼儿园22名3-5岁儿童进行口腔检查,在龋齿治疗前和治疗后2周分别取样,采用PCR-DGGE技术检测受试儿童唾液样本,分析治疗前后唾液微生物多样的变化。结果:治疗前唾液样本DGGE条带数为23±2.9,治疗后唾液样本DGGE条带数为28±4.1,差异有显著(P〈0.01);在同一时期内各唾液样本DGGE图谱的相似高于不同时期样本之间。结论:PCRDGGE技术可用于与龋病相关细菌的生物多样的研究以及监测微生物群落组成的动态变化。

  • 标签: 早期儿童龋 变性梯度凝胶电泳 菌群多样性
  • 作者: 焦晨夏甜
  • 学科: 经济管理 > 企业管理
  • 创建时间:2014-09-19
  • 出处:《价值工程》 2014年第9期
  • 机构:焦晨淤JIAOChen曰夏甜于XIATian(淤内蒙古化工职业学院材料工程系,呼和浩特010070;于内蒙古化工职业学院思政理论教研部,呼和浩特010070)(淤DepartmentofMaterialsEngineering,InnerMongoliaVocationalCollegeofChemicalEngineering,Hohhot010070,China;于IdeologicalandPoliticalTheoryTeachingandResearchDepartment,InnerMongoliaVocationalCollegeofChemicalEngineering,Hohhot010070,China)
  • 简介:摘要:本论文探讨了肠道多样与免疫相关疾病之间的关系,介绍了肠道的重要,讨论了不同检测方法及其应用,并以临床疾病案例为基础,分析了多样与疾病发展的关联。通过研究发现,肠道多样与免疫相关疾病密切相关,为疾病预防和治疗提供了新的思路。

  • 标签: 肠道菌群 多样性 免疫相关疾病 检测方法 临床案例
  • 简介:摘要目的探讨脓毒症患者发病过程中肠道多样和结构变化情况。方法对2015年11月至2016年3月期间于北京市多家三甲医院急诊科就诊并符合Sepsis3.0诊断标准的脓毒症患者25例和同时期30例非脓毒症患者的粪便样本进行检测,利用16S rRNA(16S ribosomal RNA)测序技术对肠道进行测序,使用Uparse、Qiime、R及LEfSe软件等分析多样及其结构变化。结果脓毒症组和非脓毒症组患者在性别、年龄以及慢性基础疾病方面比较差异无统计学意义。两组在肠道多样方面比较差异无统计学意义(P>0.05)。两组在肠道结构方面比较,差异有统计学意义(P<0.05),即脓毒症组患者肠道中Negativicutes纲、Selenomonadales目、Veillonellaceae科、Lachnospiraceae科、Faecalibacterium属、Hafnia属、Lachnoclostridium属、Blautia属及Ruminococcus种的丰度明显降低;而Bacilli纲、Coriobacteriia纲、Lactobacillales目、Coriobacteriales目、Clostridiaceae科、Coriobacteriaceae科、Clostridium_sensu_stricto属、Collinsella属及Collinsella_aerofaciens种的丰度明显增加。结论脓毒症组与非脓毒症组患者相比较,肠道多样无改变;而脓毒症组的患者存在肠道群组成结构改变。

  • 标签: 脓毒症 肠道菌群 粪便 16S rRNA
  • 简介:摘要目的利用高通量测序技术,研究老年人肠道多样随年龄变化的特点。方法招募90例健康志愿者为研究对象,年龄进行分组,其中<60岁(中青年组)为基线对照Age A组,年龄≥60岁者以每10岁为一个年龄段分为Age B、Age C、Age D、Age E 4组。采集研究对象粪便样本,提取DNA,采用二代高通量基因测序技术,对16S rDNA V3~V4高变区进行扩增测序、生物信息学分析,比较不同年龄老年人群肠道和功能基因的差异。结果在门水平上,不同年龄组肠道群组成包括厚壁门、拟杆菌门、变形门、放线门4个主要门,其中占比最高的是厚壁门,占60%以上,其次为拟杆菌门;从属水平上,粪杆菌属(Faecalibacterium)随着年龄增加丰度不断降低。α多样分析显示,不同年龄老年人肠道的丰度较高,均匀度较好,各组间无明显差异性;但是β多样分析发现,Age A组和Age B组群落结构组成差异较大;Age B组和Age C组群落结构相似最高。结论从中青年过渡到60岁以上,肠道的群落结构发生了变化,在60~80岁趋于相对稳定,年龄超过80岁其结构再次发生变化,老年人慢性炎症性疾病、代谢性疾病和肿瘤多发可能与Faecalibacterium的降低有关。

  • 标签: 老年人 肠道菌群 高通量测序 PICRUSt功能预测
  • 简介:摘要PCR-DGGE技术目前已被广泛应用于环境微生物领域。介绍了PCR-DGGE技术的原理及其优点,概述了PCR-DGGE技术在环境工程废水微生物处理中的应用,分析了PCR-DGGE技术用于生物处理系统中微生物群落多样和动态研究的现状,并展望了其应用前景。

  • 标签: PCR-DGGE技术 微生物 应用
  • 简介:摘要目的分析学龄肥胖儿童和正常体重儿童肠道多样差异,识别肥胖儿童肠道特征属,为后续相关机制研究和学龄儿童肥胖的防治提供依据。方法基于2016年在上海市嘉定区某小学建立的研究队列人群,将2016-2018年3年均处肥胖状态的儿童共63名纳入肥胖组,其中男生43名,女生20名。在3年均为正常体重的儿童中,根据年龄、性别和所在班级,将其与肥胖组儿童进行1∶1匹配,共选择63名纳入对照组。采用问卷收集儿童基本信息、饮食状况、母乳喂养等情况,收集两组儿童的粪便样本并进行16S rDNA测序。对质量优化后的测序序列按照97%相似进行可操作分类单元聚类及物种注释。分析肥胖组和对照组儿童肠道多样属丰度差异。计算肠道的Ace、Chao1、Shannon、Simpson 4种α多样指数,并利用主坐标分析,在非加权Unifrac距离和加权Unifrac距离的基础上表示β多样。使用相似分析(ANOSIM)比较两组β多样的差异。利用STAMP软件挑选出两组儿童共有属中的差异细菌,并利用广义线性模型(GLM)分析肥胖与α多样以及显著差异属的关联。结果肥胖组的Ace和Chao1指数低于对照组,差异有统计学意义(P值分别为0.026和0.039),Shannon和Simpson指数差异无统计学意义(P值分别为0.879和0.922)。ANOSIM分析结果显示,两组儿童肠道差异有统计学意义(R>0),但是组别贡献不显著(非加权Unifrac距离:R=0.006,P=0.223;加权Unifrac距离:R=0.010,P=0.134)。在肥胖组的特有属中,普雷沃属(Prevotella)和八叠球菌属(Sarcina)的相对丰度较高。STAMP分析结果显示,共有属中,15个属的相对丰度在两组儿童中差异有统计学意义(P<0.05)。GLM分析结果显示,在调整年龄、性别、SBP、饮食频次、近一周内抗生素使用情况、分娩方式、母乳喂养时间后,与对照组儿童相比,肥胖组的Ace指数和阿克曼属(Akkermansia muciniphila)的相对丰度显著较低,粪球菌属(Coprococcus_3)、瘤胃球菌属(Ruminococcus)、不动杆菌属(Agathobacter)、柯林斯属(Collinsella)的相对丰度较高。根据性别分层之后,在肥胖男生中,发现Chao1指数低于正常体重男生。但是,在肥胖女生中,仅发现粪球菌属高于正常体重女生。结论与正常体重儿童相比,肥胖儿童肠道α多样较低、优势益生菌属相对丰度较低,但是与代谢紊乱、炎症促进、胆固醇降低有关的属相对丰度较高。

  • 标签: 学龄儿童 肥胖 肠道菌群 多样性
  • 简介:摘要目的探讨先天性巨结肠(Hirschsprung disease,HD)与巨结肠小肠结肠炎(Hirschsprung-associated enterocolitis, HAEC)患儿肠道微生物的差异及口服益生菌对肠道的优化和预防HAEC的作用。方法收集2017年10月至2020年10月在上海交通大学医学院附属上海儿童医学中心住院的35例患儿共62份肠道内容物样本。将具有便秘、腹胀等症状、钡剂灌肠检查提示并通过病理诊断为HD的27例患儿作为HD术前组,其中男24例,女3例,年龄为(13.0±19.6)个月。将已诊断为HD且术前已出现发热、腹泻、腹胀、粪便奇臭等临床表现被确诊为HAEC的8例患儿作为HAEC术前组,其中男6例,女2例,年龄为(6.8±4.5 )个月。将HD术前组患儿根据术后是否摄入益生菌分为HD术后益生菌组(15例)和HD术后对照组(12例)。利用宏基因组学技术进行DNA测序以评价各组样本肠道微生物的多样及构成分布,并分析HD术后益生菌组和HD术后对照组的HAEC发病率、复发率等。结果HAEC术前组患儿肠道多样明显低于无HAEC的HD术前组患儿,HD术前组的shannon指数明显高于HAEC术前组(2.049比1.226),差异具有统计学意义(P= 0.047),simpson指数在两组之间的差异无统计学意义(0.320比0.527,P=0.07)。在门水平上,变形门丰度在HAEC术前组比HD术前组高(45.3%比31.3%),但差异无统计学意义(P=0.76);放线门丰度在HAEC术前组比HD术前组更少(8.7%比14.1%),差异具体统计学意义(P= 0.047 );拟杆菌门丰度在两组的差异无统计学意义(P=0.100 )。在HD术后对照组及HD术后益生菌组中,变形门丰度在HD术后对照组较多(39.1%比10.3%),差异无统计学意义(P=0.085 );放线门丰度HD术后益生菌组显著高于HD术后对照组(50.4%比11.8%),差异具有统计学意义(P= 0.003 )。在属水平上,HD术前组患儿其肠道中双歧杆菌属的丰度明显较HAEC术前组高(4.3%比0.3%),差异具有统计学意义(P=0.004),HD术后益生菌组与HD术后对照组相比双歧杆菌属的优势更加明显(48.2%比11.1%),差异具有统计学意义(P=0.004 )。克雷伯属在HAEC术前组中的丰度显著高于HD术前组,且在中占较大优势(0.2%比37.5%),差异具有统计学意义(P=0.013)。在术后HAEC的发病率方面,HD术后对照组高于HD术后益生菌组(41.7%比13.3%),益生菌的摄入可能会减少HAEC的发病率,差异无统计学意义(P=0.185)。结论HD、HAEC患儿的存在差异,益生菌制剂的使用可能是一种保护因素,能够减少HAEC的发生。

  • 标签: Hirschsprung病 小肠结肠炎 宏基因组学 肠道菌群 益生菌
  • 简介:【摘要】目的:探讨年龄与肠道息肉患者肠道相关。方法:青年组、中年组、老年组肠道息肉患者均接受粪便微生物培养,记录并对比三组粪便中双歧杆菌、乳酸杆菌、大肠杆菌、肠球菌计数情况。结果:青年组双歧杆菌、乳酸杆菌计数最高,老年组大肠杆菌、肠球菌计数最高(P

  • 标签: 年龄因素 肠道息肉 肠道菌群构成 多样性
  • 简介:Soilmicrobialbiomassandcommunitystructuresarecommonlyusedasindicatorsforsoilqualityandfertility.Ainvestigationwasperformedtostudytheeffectsoflong-termnaturalrestoration,cropping,andbarefallowmanagementsonthesoilmicrobialbiomassandbacterialcommunitystructuresindepthsof0–10,20–30,and40–50cminablacksoil(Mollisol).Microbialbiomasswasestimatedfromchloroformfumigation-extraction,andbacterialcommunitystructuresweredeterminedbyanalysisof16SrDNAusingpolymerasechainreaction-denaturinggradientgelelectrophoresis(PCR-DGGE).Experimentalresultsshowedthatmicrobialbiomasssignificantlydeclinedwithsoildepthinthemanagementsofrestorationandcropping,butnotinthebarefallow.DGGEprofilesindicatedthatthebandnumberintop0–10cmsoilswaslessthanthatindepthof20–30or40–50cm.Thesesuggestedthatthemicrobialpopulationwashighbutthebacterialcommunitystructurewassimpleinthetopsoil.ClusterandprinciplecomponentanalysisbasedonDGGEbandingpatternsshowedthatthebacterialcommunitystructurewasa?ectedbysoildepthmoreprimarilythanbymanagements,andthesuccessionofbacterialcommunityasincreaseofsoildepthhasasimilartendencyinthethreemanagements.FourteenpredominatingDGGEbandswereexcisedandsequenced,inwhich6bandswereidentifiedasthetaxaofVerrucomicrobia,2bandsasActinobacteria,2bandsasα-Proteobacteria,andtheother4bandsasδ-Proteobacteria,Acidobacteria,Nitrospira,andunclassifiedbacteria.Inaddition,thesequencesof11DGGEbandswerecloselyrelatedtounculturedbacteria.Thus,thebacterialcommunitystructureinblacksoilwasstable,andthepredominatingbacterialgroupswereuncultured.

  • 标签: 细菌群体 群落结构 DGGE PCR 自然修复 种植
  • 作者: 陶芹 郑亮 罗辉 石鑫 吴谦 潘阳林
  • 学科: 医药卫生 >
  • 创建时间:2022-12-13
  • 出处:《中华消化内镜杂志》 2022年第10期
  • 机构:西安交通大学医学部公共卫生学院,西安 710061 空军军医大学第一附属医院消化内科,西安 710032,中国人民解放军32145部队卫生连,新乡 453000,空军军医大学第一附属医院消化内科,西安 710032,西安交通大学医学部公共卫生学院,西安 710061
  • 简介:摘要目的比较不同类型胆总管结石患者胆汁的群情况。方法纳入2017年8月—2018年1月在空军军医大学第一附属医院消化内科经腹部超声、腹部CT和(或)磁共振胰胆管成像术诊断为胆总管结石,并接受经内镜逆行胰胆管造影术(endoscopic retrograde cholangiopancreatography,ERCP)治疗的45例患者,根据既往病史和ERCP术中情况将患者分为无结石(non-stone,NS)组、初发胆固醇结石(primary cholesterol stone,PCS)组、初发胆色素结石(primary pigmental stone,PPS)组和复发性结石(recurrent stone,RS)组。在注射造影剂之前收集胆汁行16S rRNA测序,分析胆汁中的结构及多样。结果非RS组为33例(包括NS组8例、PCS组8例、PPS组17例),RS组12例。RS组中憩室内乳头患者[41.67%(5/12)比 3.03%(1/33),χ2=8.27,P=0.004]、松软结石患者[91.67%(11/12)比 36.36%(12/33),χ2=10.77,P=0.001]及色素结石患者[100.00%(12/12)比51.52%(17/33),χ2=7.04,P=0.008]的比例均高于非RS组,其余基线资料差异均无统计学意义(P>0.05)。在门、属水平,RS组与PPS组的丰度相当。Alpha及Beta多样分析显示,RS组与PPS组相比差异无统计学意义,但两者多样均显著低于NS组、PCS组(P<0.05)。MetaStat分析显示,幽门螺杆菌种为RS组患者的胆道优势,而变形门和大肠杆菌种为RS组和PPS组患者的胆道优势。结论RS组与PPS组的丰度相当。RS组和PPS组胆汁多样明显低于PCS组和NS组。幽门螺杆菌种为RS组的胆道优势

  • 标签: 胆总管结石病 复发 胰胆管造影术,内窥镜逆行 胆汁 微生物组
  • 简介:生物多样是生命系统的基本特征也是人类赖以生存的物质基础:人类受化的多样可以认为是生物多样的一部分。“生物多样一文化多样”是紧密相连、相生相长的整体。

  • 标签: 生物多样性 文化多样性 物质基础 生命系统 人类
  • 简介:2006—2011年间对中国广东省的木材腐朽资源进行了7次调查,期间共采集木材腐朽标本900余号,经鉴定,共发现多孔219种。文中提供了这些多孔的名录,其中包括寄主和采集号。

  • 标签: 多样性 多孔菌目 分类
  • 简介:中华文明是一种以农耕文明为主轴,以草原游牧文明与山林农牧文明为两翼,并借助传统商业、手工业予以维系,通过现代工业、现代农业、现代服务业予以提升的多样、复合型文明。对于中国、中华民族、中华文明这样一个巨型国家、巨型民族、巨型文明来说,简单化地套用别国现成的模式是不行的。借鉴和吸取所有外来文明的成功经验,归根结底,都必须使之能和中国的根柢、中华民族的根柢、中华文明的根柢相容、相融,而不是相悖、相害。

  • 标签: 中华文明 多样性 伟大复兴 现代转型
  • 简介:

  • 标签:
  • 简介:为阐明内蒙古白粉区系组成特点、探讨其起源和演化,对其区系多样进行了分析。区系中含有10种以上的属为白粉属(Erysiphe)、单囊白粉属(Podosphaera)和高氏白粉属(Golovinomyces),3属共104种,占总种数的84.55%。根据地理分布资料,内蒙古白粉可划分为世界广布种(13.82%)、北温带成分(26.83%)、旧世界温带成分(17.07%)、温带亚洲成分(5.69%)、地中海—西亚及中亚成分(2.44%)、东亚—北美成分(4.88%)、东亚成分(18.70%)、中国特有种(8.12%)和北美成分(2.44%)等9个分布型;内蒙古白粉区系表现出明显的温带区系特征,并且东亚成分占有重要地位;在区系亲缘关系上与甘肃、吉林和新疆较为接近,与暖温带和亚热带的区系较为疏远。

  • 标签: 白粉菌科 地理分布 相似性系数
  • 简介:2006—2011年间对中国广东省的木材腐朽资源进行了7次调查,期间共采集木材腐朽标本900余号,经鉴定,共发现多孔219种。文中提供了这些多孔的名录,其中包括寄主和采集号。

  • 标签: 多样性 多孔菌目 分类